Группировка ДНК Y-хромосомы человека, указывающая на общее происхождение
Гаплогруппа CT — это гаплогруппа Y-хромосомы человека . CT имеет две базальные ветви, CF и DE . DE делится на преимущественно распространенную в Азии гаплогруппу D-CTS3946 и преимущественно распространенную в Африке гаплогруппу E-M96 , в то время как CF делится на восточноазиатскую, индейскую и океанийскую гаплогруппу C-M130 и гаплогруппу F-M89 , которая доминирует в большинстве неафриканских популяций.
Распределение
Мужчины, которые являются носителями клада CT, имеют хромосомы Y с мутацией SNP M168, а также P9.1 и M294. Эти мутации присутствуют во всех современных человеческих мужских линиях, за исключением A и B-M60 , которые обе встречаются почти исключительно в Африке .
Самый последний общий предок по мужской линии (TMRCA) всех мужчин CT сегодня, вероятно, предшествовал недавнему африканскому происхождению современных людей , миграции, в которой участвовали некоторые из его потомков. Поэтому считается, что он жил в Африке до этой предполагаемой миграции. [1] [5] [4] В соответствии с концепцией « Y-хромосомного Адама », данной отцовскому предку всех ныне живущих людей, CT-M168 поэтому также упоминается в популярных сообщениях как линия «Евразийского Адама» или «Адама из Африки»; потому что, наряду со многими африканскими Y-линиями, все неафриканские Y-линии происходят от него. [8] [7] [6]
Ни один мужчина в парагруппе CT* никогда не был обнаружен в современных популяциях. Это означает, что все мужчины, несущие эту гаплогруппу, также определяются как принадлежащие к одной из нескольких основных ветвей кладов . Все известные выжившие потомки CT находятся в одном из двух основных субкладов, CF и DE . В свою очередь, DE делится на преимущественно распространенную в Азии гаплогруппу D-CTS3946 и преимущественно распространенную в Африке гаплогруппу E-M96 , в то время как CF делится на восточноазиатскую, индейскую и океанийскую гаплогруппу C-M130 и гаплогруппу F-M89 , которая доминирует в большинстве неафриканских популяций. [6]
Субклады
CF
Гаплогруппа CF является субкладом гаплогруппы CT.
ДЕ
Гаплогруппа DE является субкладом гаплогруппы CT.
Филогенетические деревья
- Гаплогруппа CT (M168/PF1416)
- CF (P143/PF2587, CTS3818/M3690/PF2668, CTS6376/M3711/PF2697) Шаньский народ
- C (M130/Page51/RPS4Y711, M216) Азия , Океания и Северная Америка
- F (M89, M213) Встречается по всей Евразии , Океании и Америке.
- Ф1 (П91, П104)
- Ф2 (М427, М428)
- Ф3 (П96)
- Ф4 (М481)
- GHIJK F1329/M3658/PF2622/YSC0001299, CTS2254/M3680/PF2657, FGC2045/Z12203 По всей Евразии ; также в Америке ; на низком уровне/среди меньшинств в Африке и Океании
- G M201, P257 В основном на Кавказе ; также в низких количествах/среди меньшинств в Европе, Северной Африке, Юго-Западной Азии и Центральной Азии
- HIJK По всей Евразии; также в Америке; на низком уровне/среди меньшинств в Африке и Океании
- H M69, M370 Южная Азия , Центральная Азия и Юго-Западная Азия
- IJK L15/S137, L16/S138 Евразия, Северная Африка, Океания, Америка и Восточная Африка
- IJ M429/P125 Европа , Западная Азия , Северная Африка и Восточная Африка
- K M9 Встречается по всей Евразии ; также значительно в Америке и Океании ; в более низких количествах в Северной Африке и Восточной Африке
- ЛТ ( К1 ) Л298/П326
- L M11, M20, M22, M61, M185, M295 Индийский субконтинент
- T M70, M184/USP9Y+3178, M193, M272 (ранее K2) Юго-Западная Азия , Южная Азия , Северная Африка , Африканский Рог , бассейн Чада и Южная Европа
- K2 M526 Евразия , Океания , Америка , некоторые коренные жители Австралии и некоторые меньшинства в Африке
- NO ( K2a ) M214 По имеющимся данным, встречается у небольшого количества мужчин племени буйи и японцев .
- K2b ранее MPS P331 Евразия, Америка, Океания и меньшинства в Африке
- K2b1 ранее MS P397/P399 меланезийцы, микронезийцы , коренные австралийцы и полинезийцы.
- P ( K2b2 ) 92R7, M45, M74/N12, P27.1/P207 По всей Евразии , в Америке и у некоторых меньшинств в Африке
- Q M242 Америка и Евразия
- R M207/UTY2, M306/S1 Европа, Ближний Восток, Южная Азия, бассейн Чада, Канарские острова
- Низкие уровни K2c P261 на Бали
- K2d P402/P403 Низкие уровни в Java
- K2e M147 Низкие уровни в Южной Азии
- Гаплогруппа DE (M1/YAP, M145/P205, M203/Page36, P144, P153, P165, P167, P183) Азия, Африка, Южная и Восточная Европа; также в небольших количествах в Океании
- Гаплогруппа D (M174) В основном Япония , Тибет и жители Андаманских островов ; также в небольшом количестве/среди меньшинств в Восточной Азии, Центральной Азии, Микронезии и Меланезии.
- Гаплогруппа D1 (CTS11577) В основном Тибет; меньшинства в Центральной Азии, Восточной Азии и Юго-Восточной Азии
- Гаплогруппа D1a Z27276 Восточная и Центральная Азия
- D1a1 (M15) (бывший D1) народ цян ; также в небольших количествах по всей Восточной и Центральной Азии
- Гаплогруппа D1a2 P99 (ex-D3) Тибет и Центральная Азия
- Гаплогруппа D1b (ex-D2) (M64.1/Page44.1, M55, M57, M179/Page31, M359.1/P41.1, P37.1, P190, 12f2.2) В основном Япония; также на низком уровне/среди меньшинств в Корее, Китае, Микронезии и Меланезии
- Гаплогруппа D2 L1366 (ex-D1a) Филиппины
- Гаплогруппа E (M40, M96) Африка, Ближний Восток, Южная и Восточная Европа
- Гаплогруппа E1 (P147) В высоких уровнях по всей Африке; в более низких уровнях на Ближнем Востоке и в Европе
- Гаплогруппа E2 (M75) Восточная Африка
Источники
- ИСООГГ :
- Дерево гаплогруппы Y-ДНК 2015
- Y-ДНК Гаплогруппа C и ее субклады - 2015
- Y-ДНК гаплогруппа F и ее субклады - 2015
Смотрите также
На Викискладе есть медиафайлы по теме Гаплогруппа CT Y-ДНК .
Генетика
- Субклады Y-ДНК C
Ссылки
- ^ ab Karafet et al. (2008) дают «70 000», ссылаясь на «68 500 ± 6000 лет» из Hammer и Zegura (2002). Karafet TM, Mendez FL, Meilerman MB, Underhill PA, Zegura SL, Hammer MF (2008). «Новые бинарные полиморфизмы изменяют форму и повышают разрешение человеческого Y-хромосомного гаплогруппового дерева». Genome Research . 18 (5): 830–8. doi :10.1101/gr.7172008. PMC 2336805 . PMID 18385274.. Раскол между CF и DE (который при отсутствии парагруппы CT* эквивалентен возрасту CT) датируется 70 000–75 000 лет назад в геноме Сибири эпохи верхнего палеолита, что свидетельствует о двойном происхождении коренных американцев, Nature 505, 87–91 (02 января 2014 г.)
- ^ ab Kamin M, Saag L, Vincente M и др. (апрель 2015 г.). «Недавнее узкое место разнообразия Y-хромосомы совпадает с глобальным изменением в культуре». Genome Research . 25 (4): 459–466. doi :10.1101/gr.186684.114. PMC 4381518 . PMID 25770088.
- ^ Хабер М., Джонс А. Л., Коннел Б. А., Асан, Арсиеро Э., Хуанминг И., Томас М. Г., Сюэ И., Тайлер-Смит К. (июнь 2019 г.). «Редкая глубоко укоренившаяся африканская Y-хромосомная гаплогруппа D0 и ее значение для экспансии современных людей из Африки». Генетика . 212 (4): 1421–1428. doi :10.1534/genetics.119.302368. PMC 6707464. PMID 31196864 .
- ^ ab Underhill и Kivisild; Kivisild, T (2007). «Использование популяционной структуры Y-хромосомы и митохондриальной ДНК при отслеживании миграций человека». Annu. Rev. Genet . 41 (1): 539–64. doi :10.1146/annurev.genet.41.110306.130407. PMID 18076332. S2CID 24904955.
- ^ ab Stone, Linda; Paul F. Lurquin; Luigi Luca Cavalli-Sforza (2007). «Путешествия, доисторические человеческие экспансии». Гены, культура и эволюция человека . Wiley. стр. 187. ISBN 978-1-4051-5089-7.
- ^ abc Karafet; et al. (2008). «Новые бинарные полиморфизмы изменяют форму и повышают разрешение дерева гаплогруппы Y-хромосомы человека». Genome Research . 18 (5): 830–8. doi :10.1101/gr.7172008. PMC 2336805. PMID 18385274 .
- ^ ab Дарвиновские детективы: Раскрытие естественной истории генов и геномов, Норман А. Джонсон, 2007, ISBN 0-19-530675-9 , ISBN 978-0-19-530675-0
- ^ Гены, культура и эволюция человека: синтез, Линда Стоун, Пол Ф. Люрквин, 2007, ISBN 1-4051-5089-0 , стр. 187
- ^ Перейра и др. (2010), Связывание генофондов к югу от Сахары и Западной Евразии: материнское и отцовское наследие кочевников туарегов из африканского Сахеля, Европейский журнал генетики человека (2010) 18, 915–923; doi :10.1038/ejhg.2010.21