FCB суперфилум

Тип бактерий

Группа FCB — это суперфилум бактерий , названный в честь основных членов фил Fibrobacterota , Chlorobiota и Bacteroidota . Члены считаются образующими кладу из-за ряда сохранившихся сигнатурных инделей . ^[2]

Кавальер-Смит называет эквивалентную группировку филюмом по имени Sphingobacteria . Она содержит классы Chlorobiota , Fibrobacterota , Bacteroidota и Flavobacteria . Однако эта мегаклассификация не поддерживается широким научным сообществом. ^{[3] [4] [5]}

Аналогичная ситуация наблюдается с группой ПВХ/Планктобактерий .

Группа Bacteroidota–Chlorobiota, выделенная коричневым цветом, видна на этом дереве жизни 2016 года с использованием последовательностей рибосомных белков ^[14]

Примечания

Смотрите также

• Список бактериальных отрядов
• Список родов бактерий

Ссылки

1. Кавальер-Смит, Т. (1987). Происхождение клеток: симбиоз между генами, катализаторами и мембранами. Симпозиумы по количественной биологии в Колд-Спринг-Харбор 52, 805-24, [1], [2].
2. Gupta, RS (2004). «Филогения и характеристики сигнатурных последовательностей Fibrobacteres, Chlorobi и Bacteroidetes». Критические обзоры по микробиологии . 30 (2): 123–143. doi :10.1080/10408410490435133. PMID  15239383. S2CID  24565648.
3. Кавальер-Смит Т. (2006). «Укоренение древа жизни с помощью анализа переходов». Biol. Direct . 1 : 19. doi : 10.1186/1745-6150-1-19 . PMC 1586193. PMID  16834776 . 
4. Krieg, NR; Ludwig, W.; Whitman, WB; Hedlund, BP; Paster, BJ; Staley, JT; Ward, N.; Brown, D.; Parte, A. (24 ноября 2010 г.) [1984 (Williams & Wilkins)]. George M. Garrity (ред.). Bacteroidetes, Spirochaetes, Tenericutes (Mollicutes), Acidobacteria, Fibrobacteres, Fusobacteria, Dictyoglomi, Gemmatimonadetes, Lentisphaerae, Verrucomicrobia, Chlamydiae и Planctomycetes. Руководство Берджи по систематической бактериологии. Том 4 (2-е изд.). Нью-Йорк: Springer. стр. 908. ISBN 978-0-387-95042-6. Британская библиотека № GBA561951.
5. Классификация в LPSN ; Parte, Aidan C.; Sardà Carbasse, Joaquim; Meier-Kolthoff, Jan P.; Reimer, Lorenz C.; Göker, Markus (1 ноября 2020 г.). «Список названий прокариот со стоянием в номенклатуре (LPSN) перемещается в DSMZ». Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 70 (11): 5607–5612. doi : 10.1099/ijsem.0.004332 .
6. Эмили А. Элоэ-Фадрош и др. 2017, Глобальное метагеномное исследование выявило новый бактериальный кандидатный тип в геотермальных источниках. Nature Communications 7 · Январь 2016 DOI: 10.1038/ncomms1047
7. Киркегор, Расмус Хансен; Дюхольм, Мортен Симонсен; Макилрой, Саймон Джон; Нерихло, Марта; Карст, Сорен Михаэль; Альбертсен, Мэдс; Нильсен, Пер Халкьер (октябрь 2016 г.). «Геномная информация о членах типа кандидатов Hyd24-12, распространенных в мезофильных анаэробных ферментерах». Журнал ISME . 10 (10): 2352–2364. дои : 10.1038/ismej.2016.43 . ISSN  1751-7370. ПМК 5030696 . ПМИД  27058503. 
8. "The LTP" . Получено 23 февраля 2021 г. .
9. "Дерево LTP_all в формате newick" . Получено 23 февраля 2021 г. .
10. "LTP_12_2021 Release Notes" (PDF) . Получено 23 февраля 2021 г. .
11. "GTDB release 07-RS207". База данных таксономии генома . Получено 20 июня 2022 г.
12. "ar53_r207.sp_label". База данных таксономии генома . Получено 20 июня 2022 г.
13. "История таксона". База данных таксономии генома . Получено 20 июня 2022 г.
14. Hug, Laura A.; Baker, Brett J.; Anantharaman, Karthik; Brown, Christopher T.; Probst, Alexander J.; Castelle, Cindy J.; Butterfield, Cristina N.; Hernsdorf, Alex W.; Amano, Yuki; Ise, Kotaro; Suzuki, Yohey; Dudek, Natasha; Relman, David A.; Finstad, Kari M.; Amundson, Ronald; Thomas, Brian C.; Banfield, Jillian F. (11 апреля 2016 г.). "Новый взгляд на древо жизни". Nature Microbiology . 1 (5): 16048. doi : 10.1038/nmicrobiol.2016.48 . PMID  27572647.