stringtranslate.com

Дезоксирибоза

Дезоксирибоза , или, точнее, 2-дезоксирибоза , представляет собой моносахарид с идеализированной формулой H-(C=O)-(CH 2 )-(CHOH) 3 -H. Его название указывает на то, что это дезоксисахар , то есть он образуется из сахарной рибозы путем потери гидроксигруппы . Открытая в 1929 году Фебусом Левеном , [2] дезоксирибоза наиболее примечательна своим присутствием в ДНК . Поскольку пентозные сахара арабиноза и рибоза различаются только по стереохимии у C2', 2-дезоксирибоза и 2-дезоксиарабиноза эквивалентны, хотя последний термин используется редко, поскольку предшественником дезоксирибозы является рибоза, а не арабиноза.

Состав

Существует несколько изомеров с формулой H-(C=O)-(CH 2 )-(CHOH) 3 -H, но в дезоксирибозе все гидроксильные группы находятся на одной стороне в проекции Фишера . Термин «2-дезоксирибоза» может относиться к любому из двух энантиомеров : биологически важной d -2-дезоксирибозе и редко встречающемуся зеркальному изображению l -2-дезоксирибозы . [3] d -2-дезоксирибоза является предшественником нуклеиновой кислоты ДНК . 2-дезоксирибоза представляет собой альдопентозу , то есть моносахарид с пятью атомами углерода и имеющий альдегидную функциональную группу .

В водном растворе дезоксирибоза в основном существует в виде смеси трех структур: линейной формы H-(C=O)-(CH 2 )-(CHOH) 3 -H и двух кольцевых форм, дезоксирибофуранозы («C3'-эндо»). , с пятичленным кольцом, и дезоксирибопираноза («С2'-эндо»), с шестичленным кольцом. Последняя форма является преобладающей (тогда как для рибозы предпочтительна C3'-эндо-форма).

Химическое равновесие дезоксирибозы в растворе

Биологическое значение

Производные 2-дезоксирибозы как компонент ДНК играют важную роль в биологии. [4] Молекула ДНК (дезоксирибонуклеиновая кислота), которая является основным хранилищем генетической информации в жизни, состоит из длинной цепи дезоксирибозосодержащих единиц, называемых нуклеотидами , связанных через фосфатные группы. В стандартной номенклатуре нуклеиновых кислот нуклеотид ДНК состоит из молекулы дезоксирибозы с органическим основанием (обычно аденином , тимином , гуанином или цитозином ), присоединенным к 1'-углероду рибозы. 5'-гидроксил каждой дезоксирибозной единицы заменяется фосфатом ( образующим нуклеотид ), который присоединен к 3'-углероду дезоксирибозы в предыдущей единице.

Отсутствие 2'- гидроксильной группы в дезоксирибозе, по-видимому, ответственно за повышенную механическую гибкость ДНК по сравнению с РНК, что позволяет ей принимать конформацию двойной спирали, а также (у эукариотов ) компактно сворачиваться внутри мелкой клетки . ядро . Молекулы двухцепочечной ДНК также обычно намного длиннее молекул РНК. Основа РНК и ДНК структурно схожа, но РНК одноцепочечная и состоит из рибозы, а не из дезоксирибозы.

Другие биологически важные производные дезоксирибозы включают моно-, ди- и трифосфаты, а также 3'-5'-циклические монофосфаты.

Биосинтез

Дезоксирибоза образуется из рибозо-5-фосфата с помощью ферментов, называемых рибонуклеотидредуктазами . Эти ферменты катализируют процесс дезоксигенации.

Рекомендации

  1. ^ Индекс Merck: Энциклопедия химических веществ, лекарств и биологических препаратов (11-е изд.), Merck, 1989, ISBN. 091191028X, 2890
  2. ^ «Комплексная хронология биологических открытий» (PDF) . Архивировано из оригинала (PDF) 10 сентября 2016 года . Проверено 31 июля 2017 г.
  3. ^ C Бернелот-Моенс и Б. Демпл (1989), Множественная репарация ДНК для 3'-дезоксирибозных фрагментов в Escherichia coli . Исследования нуклеиновых кислот, том 17, выпуск 2, с. 587–600.
  4. ^ К.Майкл Хоган. 2010. Дезоксирибонуклеиновая кислота. Энциклопедия Земли. Национальный совет по науке и окружающей среде. ред. С.Драгган и К.Кливленд. Вашингтон