Автономные белковые домены
Домены Kringle — это автономные белковые домены , которые складываются в большие петли , стабилизированные 3 дисульфидными связями. Они важны во взаимодействиях белок -белок с факторами свертывания крови . Их название отсылает к Kringle , скандинавскому печенью, которое они чем-то напоминают.
Домены крингла были обнаружены в плазминогене , факторах роста гепатоцитов , протромбине и аполипопротеине(а) .
Кринглы встречаются во всех белках свертывания крови и фибринолитических белках. Считается, что домены крингла играют роль в связывании медиаторов (например, мембран, других белков или фосфолипидов) и в регуляции протеолитической активности. [1] [2] [3] Домены крингла [4] [5] [6] характеризуются тройной петлей, структурой из 3-дисульфидных мостиков, конформация которой определяется рядом водородных связей и небольшими фрагментами антипараллельного бета-слоя. Они встречаются в различном количестве копий в некоторых белках плазмы, включая протромбин и активатор плазминогена урокиназного типа, которые являются сериновыми протеазами, принадлежащими к семейству пептидаз MEROPS S1A.
Белки человека, содержащие этот домен
АТФ ; Ф12 ; Ф2 ; НАБП2 ; ХГФ ; ХГФАК ; КРЕМЕН1 ; КРЕМЕНЬ2; ЛПА ; ЛПАЛ2; МСТ1 ; ПИК3ИП1 ; ПЛАТ ; ПЛАУ ; ПЛГ ; ПРСС12; РОР1 ; РОР2 ;
Ссылки
- ^ Фудзикава К, МакМаллен БА (1985). "Аминокислотная последовательность тяжелой цепи человеческого альфа-фактора XIIa (активированного фактора Хагемана)". J. Biol. Chem . 260 (9): 5328–5341. doi : 10.1016/S0021-9258(18)89026-3 . PMID 3886654.
- ^ Patthy L, Trexler M, Banyai L, Varadi A, Vali Z (1984). «Кринглы: модули, специализированные для связывания белков. Гомология желатин-связывающей области фибронектина со структурами кринглов протеаз». FEBS Lett . 171 (1): 131–136. doi : 10.1016/0014-5793(84)80473-1 . PMID 6373375. S2CID 12669742.
- ^ Atkinson RA, Williams RJ (1990). «Структура раствора домена kringle 4 из человеческого плазминогена с помощью спектроскопии ядерного магнитного резонанса 1H и геометрии расстояний». J. Mol. Biol . 212 (3): 541–552. doi :10.1016/0022-2836(90)90330-O. PMID 2157850.
- ^ Кастеллино Ф.Дж., Билс Дж.М. (1987). «Генетические связи между доменами крингл человеческого плазминогена, протромбина, тканевого активатора плазминогена, урокиназы и фактора свертывания XII». J. Mol. Evol . 26 (4): 358–369. Bibcode :1987JMolE..26..358C. doi :10.1007/BF02101155. PMID 3131537. S2CID 22249781.
- ^ Патти Л. (1985). «Эволюция протеаз свертывания крови и фибринолиза путем сборки из модулей». Cell . 41 (3): 657–663. doi :10.1016/S0092-8674(85)80046-5. PMID 3891096. S2CID 32104232.
- ^ Takahashi K, Ikeo K, Gojobori T (1991). «Эволюционное происхождение многочисленных кринглов в человеческом и обезьяньем аполипопротеине(а)». FEBS Lett . 287 (1): 146–148. doi : 10.1016/0014-5793(91)80036-3 . PMID 1879523. S2CID 13366195.
Внешние ссылки
- Домен Kringle Архивировано 28 мая 2020 г. на Wayback Machine в PROSITE
- Запись домена KR в базе данных SMART
- Мультфильм домена Kringle, под структурой протромбина