stringtranslate.com

Номенклатура олигосахаридов

Олигосахариды и полисахариды — важный класс полимерных углеводов, встречающихся практически во всех живых организмах. [1] Их структурные особенности усложняют их номенклатуру, а их роль в живых системах делает их номенклатуру важной.

Олигосахариды

Олигосахариды — это углеводы , состоящие из нескольких остатков моносахаридов , соединенных гликозидной связью , которые могут гидролизоваться ферментами или кислотой с образованием составляющих их моносахаридных единиц. [2] Хотя строгое определение олигосахарида не установлено, общепринято считать, что углевод, состоящий из двух-десяти остатков моносахаридов с определенной структурой, является олигосахаридом. [2]

Некоторые олигосахариды, например, мальтоза , сахароза и лактоза , были названы тривиально до того, как был определен их химический состав, и эти названия используются до сих пор. [2]

Однако тривиальные названия бесполезны для большинства других олигосахаридов, и поэтому были разработаны систематические правила номенклатуры углеводов . Чтобы полностью понять номенклатуру олигосахаридов и полисахаридов , необходимо понимать, как называются моносахариды.

Олигосахарид имеет как восстанавливающий, так и невосстанавливающий конец. Восстанавливающий конец олигосахарида представляет собой остаток моносахарида с полуацетальной функциональностью, тем самым способный восстанавливать реагент Толленса, в то время как невосстанавливающий конец представляет собой остаток моносахарида в ацетальной форме, тем самым неспособный восстанавливать реагент Толленса. [2] Восстанавливающий и невосстанавливающий концы олигосахарида обычно изображаются так, что остаток моносахарида на восстанавливающем конце находится дальше всего справа, а невосстанавливающий (или терминальный) конец — дальше всего слева. [2]

Наименование олигосахаридов осуществляется слева направо (от невосстанавливающего конца к восстанавливающему) как гликозил [гликозил] n гликозы или гликозил [гликозил] n гликозиды, в зависимости от того, является ли восстанавливающий конец свободной полуацетальной группой. [3] В скобках между названиями остатков моносахаридов указаны номер аномерного атома углерода, символ стрелки и номер атома углерода, несущего связующий кислород следующей моносахаридной единицы. [3] Соответствующие символы используются для обозначения стереохимии гликозидных связей (α или β), конфигурации остатка моносахарида ( D или L ) и замещений у атомов кислорода ( O ). [2] Мальтоза и производное сахарозы иллюстрируют эти концепции:

Мальтоза
Мальтоза
Мальтоза: α- D -глюкопиранозил-(1→4)-β- D -глюкопираноза.
Метил 2,3,4-три-O-бензил-6-дезокси-6-фтор-α-D-галактопиранозил-(1→4)-2,3,6-три-O-ацетил-β-D-глюкопиранозид
Метил 2,3,4-три- O -бензил-6-дезокси-6-фтор-α-D-галактопиранозил-(1→4)-2,3,6-три- O -ацетил-β-D-глюкопиранозид
Метил 2,3,4-три- O -бензил-6-дезокси-6-фтор-α- D -галактопиранозил-(1→4)-2,3,6-три- O -ацетил-β- D -глюкопиранозид

В случае разветвленных олигосахаридов, что означает, что структура содержит по крайней мере один остаток моносахарида, связанный с более чем двумя другими остатками моносахарида, термины, обозначающие ответвления, должны быть перечислены в квадратных скобках, при этом самая длинная линейная цепь (исходная цепь) должна быть написана без квадратных скобок. [3] Следующий пример поможет проиллюстрировать эту концепцию:

Аллил α-L-фукопиранозил-(1→3)-[α-D-галактопиранозил-(1→4)]-α-D-глюкопиранозил-(1→3)-α-D-галактопиранозид
Аллил α- L -фукопиранозил-(1→3)-[α- D -галактопиранозил-(1→4)]-α- D -глюкопиранозил-(1→3)-α- D -галактопиранозид
Аллил α- L -фукопиранозил-(1→3)-[α- D -галактопиранозил-(1→4)]-α- D -глюкопиранозил-(1→3)-α- D -галактопиранозид

Эти систематические названия весьма полезны, поскольку они предоставляют информацию о структуре олигосахарида. Однако они требуют много места, поэтому, когда это возможно, используются сокращенные формы. [4] В этих сокращенных формах названия моносахаридных единиц сокращаются до соответствующих им трехбуквенных сокращений, за которыми следует p для пиранозных или f для фуранозных кольцевых структур, с сокращенным агликоновым спиртом, помещенным в конце названия. [2] Используя эту систему, предыдущий пример имел бы сокращенное название α- L -Fuc p -(1→3)-[α- D -Gal p -(1→4)]-α- D -Glc p -(1→3)-α- D -Gal p OAll (общая формула: . структурная формула ).

Полисахариды

Полисахариды считаются полимерами моносахаридов, содержащими десять или более остатков моносахаридов. [2] Полисахариды получили тривиальные названия, которые отражают их происхождение. [2] Два распространенных примера — целлюлоза , основной компонент клеточной стенки растений, и крахмал, название которого произошло от англосаксонского stercan, что означает «придавать жесткость». [2]

Чтобы назвать полисахарид, состоящий из одного типа моносахарида, то есть гомополисахаридом, окончание «-оза» моносахарида заменяется на «-ан». [3] Например, полимер глюкозы называется глюкан , полимер маннозы называется маннан , а полимер галактозы называется галактан . Когда гликозидные связи и конфигурации моносахаридов известны, их можно включить в качестве префикса к названию, с обозначением гликозидных связей, предшествующим символам, обозначающим конфигурацию. [3] Следующий пример поможет проиллюстрировать эту концепцию:

(1→4)-β-D-глюкан
(1→4)-β-D-глюкан
(1→4)-β- D -глюкан

Гетерополисахарид — это полимер, содержащий более одного вида моносахаридных остатков. [3] Родительская цепь содержит только один тип моносахарида и должна быть указана последней с окончанием «-an», а другие типы моносахаридов должны быть перечислены в алфавитном порядке с префиксами «глико-». [3] Если родительская цепь отсутствует, все различные моносахаридные остатки должны быть перечислены в алфавитном порядке с префиксами «глико-», а название должно заканчиваться на «-glycan». [3] Следующий пример поможет проиллюстрировать эту концепцию:

((1→2)-α-D-галакто)-(1→4)-β-D-глюкан
((1→2)-α-D-галакто)-(1→4)-β-D-глюкан
((1→2)-α- D -галакто)-(1→4)-β- D -глюкан

Смотрите также

Ссылки

  1. ^ (a) RW Bailey, Олигосахариды, MacMillan (Pergamon), Нью-Йорк, 1965; (b) S. Tsuiki, Y. Hashimoto и W. Pigman, в Comprehensive Biochemistry, M. Florkin и EH Stotz, Eds., Vol,. 5, Elsevier, Амстердам, 1963, стр. 153; (c) J. Stanek, M. Cerny и J. Pacak, Олигосахариды, Academic Press, Нью-Йорк, 1965.
  2. ^ abcdefghij JH Pazur, Углеводы: химия и биохимия, 2-е издание, Academic Press, Нью-Йорк, 1970.
  3. ^ abcdefgh DC Baker; J. Defaye; D. Horton; EF Hounsell; JP Kamerling; AS Serianni (1997). «Номенклатура углеводов». Carbohydrate Research . 297 (1): 1–92. doi :10.1016/S0008-6215(97)83449-0. PMID  9042704.
  4. ^ "Объединенная комиссия IUPAC-IUB по биохимической номенклатуре. Сокращения и символы для химических названий, представляющих особый интерес в биологической химии. Пересмотренные предварительные правила (1965)". Биохимия . 5 (5): 1445–53. 1966. doi :10.1021/bi00869a001. PMID  5961269.