stringtranslate.com

Исследовательский кампус Джанелия

Janelia Research Campus — научно-исследовательский кампус Медицинского института Говарда Хьюза , открытый в октябре 2006 года. [1] Кампус расположен в округе Лаудон, штат Вирджиния , недалеко от города Эшберн . Он известен своими научными исследованиями и современной архитектурой. Нынешним исполнительным директором лаборатории является Рональд Вейл , который также является вице-президентом HHMI. Он сменил Джеральда М. Рубина в 2020 году. [2] До 2014 года кампус был известен как «Janelia Farm Research Campus». [3]

Исследовать

Большинство исследований, финансируемых HHMI, поддерживают исследователей, работающих в их домашних учреждениях. [4] Однако некоторые междисциплинарные проблемы трудно решать в существующих исследовательских условиях, и Janelia была создана как отдельное учреждение для решения таких проблем в нейробиологии . [5] По состоянию на ноябрь 2011 года в нем было 424 сотрудника и места для еще 150 человек. [6] Они конкретно занимаются выявлением общих принципов, управляющих обработкой информации нейронными цепями , и разработкой технологий визуализации и вычислительных методов для анализа изображений . В 2017 году было объявлено о новом исследовательском направлении — механистической когнитивной нейронауке. [7]

В любой момент времени Janelia поддерживает несколько крупных совместных проектов для удовлетворения потребностей в данных и методах, представляющих интерес для широкого научного сообщества. [5] [8] По состоянию на 2021 год они включали разработку крупномасштабных нейроанатомических данных для Drosophila (на уровнях световой и электронной микроскопии), соответствующую карту уровня освещенности мозга мыши, улучшение технологии генетически кодированных флуоресцентных датчиков и ряд более мелких проектов. Результаты включают значительно улучшенные флуоресцентные кальциевые датчики и первое полное изображение мозга Drosophila с нейронным разрешением. [9] [10]

Центр был разработан для имитации неограниченной и совместной среды в AT&T Bell Laboratories и Cambridge 's Laboratory of Molecular Biology . Исследователи работают по шестилетним контрактам и полностью финансируются изнутри, независимо от традиционного финансирования исследовательских грантов . [11]

Джеральд М. Рубин был первым исполнительным директором Janelia и руководил проектом от концепции до строительства и эксплуатации. Рональд Вейл занял пост директора в начале 2020 года. Существует около пятидесяти исследовательских лабораторий, возглавляемых старшими научными сотрудниками, включая Дженнифер Липпинкотт-Шварц , Джерри Рубина , Эрика Бетцига , Карела Свободу и Барри Диксона . [12] Предыдущими руководителями лабораторий были Шон Эдди , Тамир Гонен , Линн Риддифорд , Джеймс У. Трумэн и Роберт Тьян .

кампус

Оригинальный дом Janelia Farm занесен в Национальный реестр исторических мест [ 13] [14] , а собственность была приобретена HHMI у голландского производителя программного обеспечения Baan Companies в декабре 2000 года. [15] Главный кампус площадью 281 акр (1,14 км 2 ) включает в себя 900-футовую (270 м) длинную дугообразную лабораторию, известную как Landscape Building. [16] Здание, спроектированное Рафаэлем Виньоли , шириной 270 футов (82 м) на первом этаже, встроено в холм и спроектировано как основной исследовательский центр. Отель на 96 номеров для участников конференции выходит окнами на пруд и соединяется с Landscape Building через туннель под Helix drive. Остров Селден , бывшая ферма по выращиванию дерна на реке Потомак площадью 408 акров (1,65 км2 ), была присоединена к кампусу в 2004 году и пользуется популярностью среди сотрудников для пробежек и отдыха. [17] [18]

Многие сотрудники живут на территории кампуса. В трех многоквартирных домах в общей сложности 240 единиц — 34 односемейных таунхауса и 21 квартира-студия, в которых проживают более четверти сотрудников. [19] [18] Другие сотрудники ездят в Арлингтон на автобусе-шаттле, предоставляемом HHMI. [20] Есть обширные фитнес-центры, включая студию йоги, боулдеринговый зал, теннисные корты и футбольное поле. [20] [21] [22]

Проектирование участка и ландшафта было завершено Dewberry в 2006 году и включает в себя более четырех акров зеленых луговых насаждений на крыше, которые сливают здание с окружающей территорией. В 2006 году институт нанял ландшафтную архитектурную фирму Lewis Scully Gionet, Inc., чтобы переделать некоторые из предыдущих ландшафтных работ, которые были завершены осенью 2008 года (и получили почетную награду от отделений Американского общества ландшафтных архитекторов в Мэриленде и Потомаке). Эта работа включает в себя архитектурный водный элемент, расширенную сеть дорожек и размещение нескольких произведений искусства, а также комплексные посадки растений. Дополнительное улучшение ландшафта по всему кампусу, разработанное LSG Landscape Architecture, продолжалось до сих пор.

Научно-исследовательские учреждения

Вычислительная инфраструктура

Требования к хранению и вычислениям в современной нейронауке могут быть чрезвычайно требовательными. Некоторые двухфотонные микроскопы могут генерировать данные со скоростью более 5 ГБ/с. [23] Коннектомика электронной микроскопии может быть особенно требовательной. Один только набор данных FlyEM представляет собой 400 ТБ, 34431 x 39743 x 41407 64-битное изображение. [24] Анализ аналогичного набора данных занял около 7000 часов работы GPU. [25]

Вычислительная инфраструктура, доступная исследователям в Janelia, включает в себя высокопроизводительный кластер из 7000 ядер , 5 петабайт хранилища и внешний центр обработки данных, где каждую ночь выполняется резервное копирование данных. [26]

Помещения для животных

Аккредитованный виварий содержит лабораторных животных, включая рыбу данио-рерио, мышей и крыс. Вспомогательный персонал помогает с повседневным уходом, разведением и операциями. [27] Повседневный уход облегчается автоматизацией. Несколько роботов-переворачивателей мух помогают поддерживать запасы дрозофил , перенося их во флаконы со свежим кормом. [28] [29] Две руки робота помогают в санации клеток для мышей. Одна рука выбирает грязные клетки из стопки и вставляет их в автоклав, другая вынимает продезинфицированные клетки и складывает их. [30]

Центр передовой визуализации

Ученые со всего мира могут подать заявку на проведение своих экспериментов на микроскопах, разработанных Janelia, в Центре передовых технологий визуализации. [31]

Участие в жизни общества

Совместно с Академией наук Лаудон [ 32] HHMI ежегодно жертвует около 1 миллиона долларов на поддержку научного образования в государственных школах округа Лаудон. [33] [34] Джанелия также проводит ежеквартальные лекции для представителей общественности. [35]

Смотрите также

Ссылки

  1. ^ Кэри, Мак (9 февраля 2011 г.). «О дивный новый мир». Virginia Living . Cape Fear Publishing . Получено 27 июня 2016 г.
  2. ^ «Рон Вейл назначен следующим исполнительным директором исследовательского кампуса Джанелия и вице-президентом HHMI».
  3. ^ "История". Janelia Research Campus . Получено 23 июня 2015 г.
  4. ^ «О HHMI: Введение».
  5. ^ ab «Философия Джанелии».
  6. ^ М. Митчелл Уолдроп (17 ноября 2011 г.). «Исследования в Джанелии: жизнь на ферме. Пять лет спустя, благородный эксперимент в междисциплинарных исследованиях окупился». Nature . 479 (7373): 284–286. doi : 10.1038/479284a . PMID  22094670.
  7. ^ "Что такое механистическая когнитивная нейронаука? | Исследовательский кампус Джанелия". www.janelia.org . Получено 12 апреля 2018 г.
  8. ^ "Project Teams - Janelia Research Campus". www.janelia.org . Получено 24 января 2018 г. .
  9. ^ «В „тур де форс“ исследователи в мельчайших подробностях изображают весь мозг мухи». Наука | AAAS . 2018-07-18 . Получено 2018-10-16 .
  10. ^ Чжэн, Чжихао; Лауритцен, Дж. Скотт; Перлман, Эрик; Робинсон, Камензинд Г.; Николс, Мэтью; Милки, Дэниел; Торренс, Омар; Прайс, Джон; Фишер, Кори Б. (19 июля 2018 г.). «Полный объем электронной микроскопии мозга взрослой Drosophila melanogaster». Cell . 174 (3): 730–743.e22. doi :10.1016/j.cell.2018.06.019. ISSN  0092-8674. PMC 6063995 . PMID  30033368. 
  11. Юдхиджит Бхаттачарджи (8 декабря 2006 г.). «Нейробиология на ферме». Science . 314 (5805): 1530–1532. doi :10.1126/science.314.5805.1530. PMID  17158300. S2CID  109680345.
  12. ^ "Janelia.org".
  13. ^ "Национальная информационная система регистра". Национальный регистр исторических мест . Служба национальных парков . 9 июля 2010 г.
  14. ^ "Howard Hughes Medical Institute Breaks Ground For Janelia Farm Research Campus". Howard Hughes Medical Institute. 5 мая 2003 г. Получено 2 января 2019 г.
  15. ^ "Janelia Farm". Бюллетень HHMI . 14 (3). Медицинский институт Говарда Хьюза : 10–15. Июль 2001 г. Архивировано из оригинала 2012-07-04 . Получено 2011-06-03 .
  16. ^ «Проект кампуса, призванный вдохновлять новаторскую науку» (PDF) . Журнал R&D. 13 ноября 2007 г. Архивировано из оригинала (PDF) 2016-03-03.
  17. ^ "Биомедицинский институт захватил землю в Лаудоне на сумму 4,5 млн долларов" . Получено 20.03.2022 .
  18. ^ ab Рубин, Джеральд ; О'Ши, Эрин (7 февраля 2019 г.). «Точка зрения: оглядываясь назад и глядя вперед на Джанелию». eLife . 8 : e44826. doi : 10.7554 /eLife.44826 . PMC 6374070. PMID  30730292. 
  19. ^ "On Campus Housing". Медицинский институт Говарда Хьюза . Получено 2022-03-20 .
  20. ^ ab "Удобства кампуса" . Получено 20.03.2022 .
  21. ^ Брэнсон, Кристин [@KristinMBranson] (2022-03-07). "Новый боулдеринговый зал Janelia! https://t.co/aG09Ubny1x" ( Твит ). Архивировано из оригинала 2022-03-20 . Получено 21-12-2022 – через Twitter .
  22. ^ "Зона отдыха Джанелия" . Получено 20.03.2022 .
  23. ^ "Томографический 2-фотонный микроскоп с частотой кадров в килогерцах" . Получено 20.03.2022 .
  24. ^ "FlyEM Hemibrain Release" . Получено 2022-03-20 .
  25. ^ Янушевский, Михал; Корнфельд, Йорген; Ли, Питер Х.; Поуп, Арт; Блейкли, Тим; Линдси, Ларри; Майтин-Шепард, Джереми; Тайка, Майк; Денк, Винфрид; Джейн, Вирен (2018-06-16). "Высокоточная автоматизированная реконструкция нейронов с помощью сетей с заполнением потоками" (PDF) . Nature Methods . 15 (8): 605–610. doi :10.1038/s41592-018-0049-4. PMID  30013046. S2CID  49863171.
  26. ^ "Группы поддержки / Научные вычислительные системы" . Получено 2022-03-20 .
  27. ^ "Команды поддержки / Виварий" . Получено 20.03.2022 .
  28. ^ "Команды поддержки / Ресурсы Drosophila" . Получено 20.03.2022 .
  29. ^ HHMI | Janelia [@HHMIJanelia] (24.09.2015). «Это один из наших трех роботов-перевертышей. Они могут менять 2700–3600 акций в день и отправлять нам электронные письма, если возникнут проблемы! https://t.co/7Zf7WyRb4g» ( Твит ). Архивировано из оригинала 20.03.2022 . Получено 21.12.2022 – через Twitter .
  30. ^ Сегар, Адриан [@ASegar] (2014-06-10). "Робот для чистки клеток для мышей! (увиден во время экскурсии по исследовательскому кампусу Janelia Farm) http://t.co/kigM78uRtu" ( Твит ). Архивировано из оригинала 2022-03-20 . Получено 21-12-2022 – через Twitter .
  31. ^ "Open Science / Advanced Imaging Center" . Получено 20.03.2022 .
  32. Майкл Элисон Чандлер (30 мая 2014 г.). «Академия наук округа Лаудон демонстрирует первые набеги подростков на исследовательскую работу». Washington Post .
  33. ^ "Школы округа Лаудон и Медицинский институт Говарда Хьюза объявляют о партнерстве в области инновационного научного образования - HHMI.org". HHMI.org . Получено 23 июня 2015 г.
  34. ^ «Джанелия в сообществе — исследовательский кампус Джанелия». www.janelia.org . Получено 24 января 2018 г. .
  35. ^ «Диалоги открытия — исследовательский кампус Джанелия». www.janelia.org . Получено 24 января 2018 г. .

Дальнейшее чтение

39°04′18″N 77°27′53″W / 39.0716°N 77.4648°W / 39.0716; -77.4648