Кластер 5 — обозначение, используемое Датским государственным институтом сывороток для варианта вируса, описанного институтом осенью 2020 года в связи с исследованиями инфекции SARS-CoV-2 среди норок и людей на севере Ютландии , Дания. [1]
3 ноября 2020 года институт представил оценку риска, в которой предварительный эксперимент с этим вариантом вируса, описанный на полутора страницах, [2] стал основой для оценки эффективности будущих вакцин от COVID-19. [3] Ссылаясь на эту оценку риска, датское правительство 4 ноября 2020 года распорядилось об уничтожении всех норок в стране . [4] А в семи муниципалитетах Северной Ютландии был введен карантин с ужесточением ограничений.
На момент принятия решения об уничтожении всех датских норок последний раз этот вариант вируса был обнаружен 15 сентября 2020 года. [5] [6] После последующего тестирования и секвенирования положительных образцов в семи муниципалитетах Северной Ютландии датой последнего обнаружения по-прежнему было 15 сентября 2020 года. [7] Всемирная организация здравоохранения написала 6 ноября 2020 года со ссылкой на предварительный эксперимент, что «необходимы дальнейшие научные и лабораторные исследования для проверки полученных предварительных результатов и понимания любых потенциальных последствий этого открытия с точки зрения диагностики, терапии и разрабатываемых вакцин». [8]
Датскому агентству по лекарственным средствам было поручено провести оценку варианта вируса на следующий день после того, как правительство приняло решение об уничтожении всех норок в стране. [9] В своей оценке агентство пришло к выводу, что мутации, характерные для варианта вируса, вряд ли окажут существенное влияние на эффективность вакцин первого поколения. [10]
В 2019 году Дания была крупнейшим производителем меха норки в мире, [11] при этом подавляющее большинство датских ферм располагалось в северной и западной Ютландии . [12] В последние годы отрасль в стране в целом находилась в упадке. [13] Наряду с летучими мышами, панголинами и людьми, норки являются одним из многих видов млекопитающих , которые могут быть инфицированы коронавирусами . [14]
Хотя роль панголинов в распространении COVID-19 постепенно отвергалась учеными, [15] [16] в нескольких статьях утверждалось, что китайские норковые фермы могли сыграть определенную роль в появлении COVID-19 . [17] [18] [19] [20] [21] В партнерстве с научным журналистом Ивом Сьямой они провели расследование для Reporterre в период с ноября по декабрь 2020 года. [22] [23] [24] На следующий день передача вируса от норок к человеку и мутации, связанные с норками, были задокументированы в журнале Science , [25] что побудило правительство Нидерландов перенести на конец 2020 года запрет на разведение норок, ранее запланированный на 2024 год. [26] После открытия в Нидерландах власти Дании инициировали широкомасштабную программу наблюдения за всеми норковыми фермами в стране с регулярным тестированием и геномным секвенированием. [27] Последовательности вирусов, связанных с датскими и голландскими норками, были помещены в базу данных GISAID . [28] Министерство сельского хозяйства США (USDA) подтвердило, что случаи заболевания норок COVID-19 были зарегистрированы в штате Юта в августе 2020 года. [29] Дополнительные вспышки были обнаружены в Мичигане , Висконсине и Орегоне . [30] По состоянию на 29 ноября 2020 года случаи заражения норок COVID-19 были зарегистрированы в Дании, Италии, Нидерландах, Испании, Швеции и США. [31] [32]
В Дании было пять кластеров вариантов SARS-CoV-2 у норок; Датский государственный институт сыворотки (SSI) обозначил их как кластеры 1–5 (датский: кластер 1–5 ). В кластере 5, также называемом SSI ΔFVI-spike , [33] было подтверждено несколько различных мутаций в белке шипа вируса. Конкретные мутации включают 69–70deltaHV (делеция остатков гистидина и валина в 69-й и 70-й позициях в белке), Y453F (изменение тирозина на фенилаланин в позиции 453 внутри рецептор-связывающего домена белка-шипа), I692V ( изолейцин на валин в позиции 692), M1229I ( метионин на изолейцин в позиции 1229) и неконсервативную замену S1147L. [34] [33] [1]
Мутации, связанные с норкой, которые частично напоминают мутации, обнаруженные в Дании, хотя и являются частью отдельной геномной группы, известны в Нидерландах. [25] [35]
5 ноября BBC News сообщило, что было выявлено 12 случаев заражения людей штаммом кластера 5. [36] Неделю спустя в отчете ECDC по быстрой оценке риска было указано, что произошло 214 случаев заражения людей штаммом кластера 5, [35] однако считается, что лишь немногие из них, если таковые вообще были, были дополнительными случаями, связанными со вспышкой штамма кластера 5. [37] К 20 ноября не было выявлено никаких дополнительных случаев заражения людей штаммом кластера 5, несмотря на широко распространенное генетическое секвенирование, которое выявило 750 случаев, связанных с норками, и было установлено, что штамм кластера 5 больше не циркулирует среди людей. [38]
К 2 ноября 2020 года датский государственный независимый исследовательский институт Statens Serum Institut (SSI) обнаружил мутировавшие варианты SARS-CoV-2, которые могут инфицировать людей и иметь опасные последствия на норковых фермах; человеческие инфекции были связаны со 191 положительной норковой фермой. Они публично сообщили об этом 3 ноября, назвав варианты с известной связью с тремя фермами «Кластером 5». [3] 4 ноября 2020 года премьер-министр Дании Метте Фредериксен заявила, что мутировавший коронавирус передается людям через норок, в основном связанных с норковыми фермами в Северной Ютландии . В отчете SSI было обнаружено, что было 12 случаев заражения людей (8 напрямую связанных с норковыми фермами, 4 в близлежащем сообществе), связанных с этой мутацией в Северной Ютландии (называемой «кластером 5»), и его реакция антител была слабее. Хотя институт заявил, что мутация, по-видимому, не более опасна, чем другие коронавирусы сами по себе, Каре Мёльбак и Тайра Гроув Краузе из SSI предупредили, что мутация потенциально может снизить эффективность вакцин от COVID-19 , которые в настоящее время находятся в стадии разработки, хотя вряд ли сделает их бесполезными. [1] [39] [40] Кроме того, было показано, что более слабый ответ антител снижает иммунитет, приобретенный в результате предыдущей инфекции. [3] SSI отметили, что, хотя кластер 5 вызывает некоторую обеспокоенность, они также обеспокоены потенциальными будущими мутациями, которые могут появиться у норок, что привело к их рекомендации закрыть все фермы в стране. [41]
В качестве превентивной меры Фредериксен объявил, что страна уже находится в процессе уничтожения популяции норок, составляющей около 14 миллионов особей (первоначальные сообщения о 15–17 миллионах были основаны на оценках более ранних лет, когда отрасль была крупнее). [42] [43] Чтобы предотвратить распространение мутации, 5 ноября также было объявлено, что в муниципалитетах Северной Ютландии: Брондерслев, Фредериксхавн, Йёрринг, Яммербугт, Лесё, Тистед и Вестиммерланд с 6 ноября будут введены карантин и ограничения на передвижение. [ 1] [44] Все культурные учреждения, кинотеатры, театры, спортивные и развлекательные заведения, а также рестораны с едой были закрыты, а въезд и выезд из муниципалитетов был запрещен. Общественный транспорт был приостановлен 9 ноября. [45] [46] Было начато массовое тестирование (в Дании уже был один из самых высоких показателей тестирования в мире ), а программы отслеживания были еще больше расширены. Первоначально планировалось, что ограничения в Северной Ютландии продлятся до 3 декабря, но их можно будет снять раньше в зависимости от скорости отстрела норок и массового тестирования людей, а также если не будет обнаружено новых случаев кластера 5. [47]
ВОЗ опубликовала заявление о вариантах SARS-CoV-2 6 ноября. [8] В нем поясняется, что этот кластер имел комбинацию мутаций, которые ранее не наблюдались. Вариант умеренно снизил чувствительность к нейтрализующим антителам, но потребуются дальнейшие исследования, чтобы понять последствия в отношении диагностики, терапии и вакцин. [8] Позднее это было отражено в оценке риска, опубликованной Европейским центром профилактики и контроля заболеваний (ECDC), в которой отмечается, что риск для вариантов, связанных с норками, аналогичен общему риску COVID-19, но может быть переоценен, если подтвердятся опасения, высказанные в отношении иммунитета , повторного заражения , вакцинации и лечения, в частности, в отношении кластера 5, а также отмечается, что циркуляция вируса на фермах по разведению норок может создать другие проблемы в будущем, и предоставляются рекомендации по управлению риском. [35] [48] В конце ноября было забито более 10 миллионов особей. [49]
6 ноября Соединенное Королевство объявило, что Дания будет исключена из «коридорного» белого списка стран, из которых путешественники могут вернуться без самоизоляции в течение 14 дней, сославшись на вариант кластера-5. [50] 7 ноября Соединенное Королевство объявило, что оно также запретит въезд нерезидентам, путешествующим из Дании, и нерезидентам, которые были в Дании в течение последних 14 дней. Гражданам Великобритании по-прежнему разрешено возвращаться домой, но они, как и все другие члены их домохозяйств, должны были самоизолироваться в течение 14 дней. Этот запрет на поездки должен был быть пересмотрен через неделю. [51] [52] Ограничения были в конечном итоге сняты 28 ноября. [53]
После массового тестирования SSI объявила 19 ноября 2020 года, что новых случаев кластера 5 не обнаружено, и, по всей вероятности, он вымер. Особые ограничения, наложенные на некоторые муниципалитеты Северной Ютландии, были сняты 19–20 ноября (они по-прежнему подчиняются стандартным ограничениям COVID-19, которые распространяются на всю страну и не связаны с мутациями норок). [7]
В конце ноября стало известно, что министр сельского хозяйства Могенс Йенсен и еще пять министров были уведомлены в сентябре о том, что уничтожение всей популяции норок в стране, а не только в зараженных районах, будет незаконным. Столкнувшись с призывами к отставке со стороны парламентской оппозиции и резкой общественной критикой, [54] премьер-министр Фредериксен признал, что приказ об уничтожении всех норок был незаконным, и Йенсен ушел в отставку 18 ноября. [55] Позднее было достигнуто соглашение о том, чтобы сделать постановление правительства законным задним числом. [56] 21 декабря 2020 года в парламенте Дании правительство и левые партии парламента приняли законопроект, запрещающий любое производство норок в течение 2021 года. [57] Законопроект не содержит положений, устраняющих юридическую ответственность за предыдущую выбраковку, но легализует задним числом выплату бонусов за более быструю выбраковку. [57] Оппозиционные партии ( V , C , O , NB , LA ) выступили против. [58] 25 января 2021 года [59] большинство в датском парламенте достигло соглашения о выплате компенсаций датским фермерам, занимающимся разведением норок, и другим лицам, зарабатывающим на жизнь разведением норок, в размере от 15,6 млрд до 18,8 датских крон [60] ( около 2,1 млрд евро – около 2,5 млрд евро).
{{cite news}}
: CS1 maint: multiple names: authors list (link)Италия, Нидерланды, Испания и Швеция — другие страны, в которых SARS-CoV-2 был обнаружен у норок, говорится в заявлении ВОЗ.
По данным ВОЗ, шесть стран сообщили о случаях заболевания SARS-CoV-2 у выращиваемых на фермах норок, включая Данию, Нидерланды, Испанию, Швецию, Италию и США.
...] (далее именуется как ΔFVI-шип). [...] К ним относятся: i) 69-70deltaHV — делеция гистидина и валина в аминокислотных позициях 69 и 70 в N-концевом домене субъединицы S1; ii) I692V — консервативная замена в позиции 692, которая расположена на семь аминокислот ниже сайта расщепления фурином; iii) S1147L — неконсервативная замена в позиции 1147 в субъединице S2; и iv) M1229I – консервативная замена, расположенная в трансмембранном домене