stringtranslate.com

Комплекс микобактерий туберкулеза

Комплекс Mycobacterium tuberculosis ( MTC или MTBC ) представляет собой генетически родственную группу видов Mycobacterium , которые могут вызывать туберкулез у людей и других животных.

Включает в себя:

Кроме того, существуют две ветви, которые имеют филогенетическое сходство, но не полностью описаны: палочки dassie и oryx. Палочки Oryx недавно были переклассифицированы в отдельный подвид, orygis. [1]

Члены MTC могут быть отличимы от всех других бактерий по наличию 63 консервативных сигнатурных инделей (CSI), присутствующих в различных белках, которые являются общими исключительно для этих патогенов. [4] Благодаря их исключительности для комплекса MTC и присутствию в высококонсервативных областях белков, эти CSI предоставляют новые средства для функциональных и диагностических исследований (включая потенциальные цели для разработки новых терапевтических средств). [4]

С 2018 года все члены этого комплекса видов считаются синонимами M. tuberculosis в том, что касается бактериальной номенклатуры. В статье IJSEM сообщается, что M. africanum , M. bovis , M. caprae , M. pinnipedii на 99,21–99,92% идентичны M. tuberculosis на уровне всего генома, что не соответствует критериям, позволяющим считать их независимыми видами. То же самое относится к «M. canetti», «M. mungi» и «M. orygis», видам, которые не были опубликованы валидно. Вариация даже ниже принятого уровня для подвидов. Авторы статьи отмечают, что эти названия действительно относятся к стабильным линиям со значимыми клиническими различиями, и рекомендуют, чтобы они стали вариантами: например, M. bovis станет M. tuberculosis var. bovis . [5]

Филогенетика

По мере того, как MTBC разделялся на различные линии, также разделялась и экспрессия ключевых и метаболических патогенных генов в результате мутаций, вводящих новые TANNNT Pribnow boxs и мутаций, которые нарушают функцию транскрипционных репрессоров. Это дает четкое доказательство того, что линии MTBC, вероятно, отражают адаптацию к различным популяциям человека. Фактически, изменение экспрессии генов может быть быстрым механизмом для физиологической адаптации к новой среде без необходимости существенного изменения генома. [6]

Это можно увидеть в том, как различные клады MTBC имеют свою собственную транскриптомную сигнатуру. Даже единичные мутации могут полностью изменить транскрипционный профиль штамма. Примером является штамм N1177, который несет одну мутацию в гене rpoB, которая придает устойчивость к рифампицину, что изменило уровни транскрипции нескольких генов. [6]

Роль метилирования более неуловима, паттерн инактивации мутаций, по-видимому, подтверждает, что метилазы не сохраняются на протяжении mtBC. Транскрипционная адаптация может позволить изолятам M. tuberculosis оптимизировать свою инфекционность и передачу в тонко различающихся средах, предоставляемых различными популяциями человека-хозяина. [6]

Смотрите также

Ссылки

  1. ^ ab van Ingen J, Rahim Z, Mulder A, Boeree MJ, Simeone R, Brosch R, van Soolingen D (апрель 2012 г.). «Характеристика Mycobacterium orygis как подвида комплекса M. tuberculosis». Emerging Infectious Diseases . 18 (4): 653–5. doi :10.3201/eid1804.110888. PMC  3309669 . PMID  22469053.
  2. ^ Паттерсон, С., Дрю, JA, Пфайффер, DU, Клаттон-Брок, TH (2017). «Социальные и экологические факторы влияют на смертность от туберкулеза у диких сурикатов». Журнал экологии животных . 86 (3): 442–450. Bibcode : 2017JAnEc..86..442P. doi : 10.1111/1365-2656.12649. PMC 5413830. PMID  28186336 . 
  3. ^ Vasconcellos SE, Huard RC, Niemann S, Kremer K, Santos AR, Suffys PN, Ho JL (март 2010 г.). «Отдельные генотипические профили двух основных клад Mycobacterium africanum». BMC Infectious Diseases . 10 : 80. doi : 10.1186/1471-2334-10-80 . PMC 2859774. PMID  20350321 . 
  4. ^ ab Gupta, Radhey S. (2018-10-02). "Влияние геномики на выяснение эволюционных связей между микобактериями: идентификация молекулярных сигнатур, специфичных для туберкулезного комплекса бактерий с потенциальным применением для новых диагностических и терапевтических средств". High-Throughput . 7 (4): 31. doi : 10.3390/ht7040031 . ISSN  2571-5135. PMC 6306742. PMID 30279355  . 
  5. ^ Риохас, Марко А.; Макгоф, Катя Дж.; Райдер-Риохас, Кристин Дж.; Растоги, Налин; Хасбон, Манзур Эрнандо (1 января 2018 г.). «Филогеномный анализ видов комплекса Mycobacterium tuberculosis показывает, что Mycobacterium africanum, Mycobacterium bovis, Mycobacterium caprae, Mycobacterium microti и Mycobacterium pinnipedii являются более поздними гетеротипическими синонимами Mycobacterium tuberculosis». Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 68 (1): 324–332. doi : 10.1099/ijsem.0.002507 . PMID  29205127.
  6. ^ abc Chiner-Oms Á, Berney M, Boinett C, González-Candelas F, Young DB, Gagneux S, et al. (сентябрь 2019 г.). "Genome-wide mutational biases fuel transcriptional variation in the Mycobacterium tuberculosis complex". Nature Communications . 10 (1): 3994. Bibcode :2019NatCo..10.3994C. doi :10.1038/s41467-019-11948-6. PMC 6728331 . PMID  31488832.  Материал скопирован из этого источника, который доступен по лицензии Creative Commons Attribution 4.0 International.
  • в
  • т
  • е