stringtranslate.com

Человеческий коронавирус OC43

Человеческий коронавирус OC43 [1] ( HCoV-OC43 ) является представителем вида Betacoronavirus 1 , который заражает людей и крупный рогатый скот. [2] [3] Инфицирующий коронавирус представляет собой оболочечный одноцепочечный РНК-вирус с положительным смыслом , который проникает в клетку-хозяина путем связывания с рецептором N-ацетил-9-O-ацетилнейраминовой кислоты . [4] OC43 — один из семи коронавирусов, которые, как известно, заражают человека. Это один из вирусов, вызывающих простуду [ 5] [6] и, возможно, ответственный за пандемию 1889–1890 годов . [7] Как и другие коронавирусы из рода Betacoronavirus , подрода Embecovirus , он имеет дополнительный белок с более короткими шипами, называемый гемагглютинин-эстеразой (HE). [8] [2]

Вирусология

Были идентифицированы четыре генотипа HCoV-OC43 (от A до D), причем генотип D, скорее всего, возник в результате генетической рекомбинации . Полное секвенирование генома генотипов C и D и бутскан-анализ показывают события рекомбинации между генотипами B и C в генерации генотипа D. Из 29 выявленных вирусных вариантов ни один не принадлежит к более древнему генотипу A. Анализ молекулярных часов с использованием генов спайка и нуклеокапсида . датирует самого последнего общего предка всех генотипов 1950-ми годами. Генотипы B и C датируются 1980-ми годами. Генотип B — к 1990-м годам, а генотип C — к концу 1990-х — началу 2000-х годов. Рекомбинантные варианты генотипа D были обнаружены еще в 2004 году [5].

Сравнение HCoV-OC43 с наиболее близким штаммом вида бетакоронавируса 1, бычьим коронавирусом BCoV, показало, что у них был самый последний общий предок в конце 19 века, при этом несколько методов дали наиболее вероятные даты около 1890 года, что привело авторов к предположению, что введение первого штамма человеческому населению могло вызвать пандемию 1889–1890 годов , которую в то время приписывали гриппу . [9] Пандемия COVID-19 предоставила дополнительные доказательства связи, поскольку пандемия 1889–1890 годов вызывала симптомы, более близкие к симптомам, связанным с COVID-19 (инфекцией, вызванной бетакоронавирусом SARS-CoV-2 ), чем с гриппом. [10] Брюссов в августе 2021 года назвал доказательства того, что OC43 вызвал вспышку 1889–1890 годов, как «косвенные, хотя и слабые» и «предположительные», однако эпидемия 1889 года была лучшим историческим показателем, позволяющим делать прогнозы относительно текущего COVID. -19 путь из-за схожих «клинико-эпидемиологических характеристик». [11]

Происхождение HCoV-OC43 неясно, но предполагается, что он мог возникнуть у грызунов, а затем передаться крупному рогатому скоту в качестве промежуточных хозяев. [12] Делеция из BCoV в HCoV-OC43 могла иметь место в случае межвидовой передачи от крупного рогатого скота к человеку. [9]

Патогенез

Наряду с HCoV-229E , разновидностью рода Alphacoronavirus , HCoV-OC43 входит в число вирусов, вызывающих простуду . Оба вируса могут вызывать тяжелые инфекции нижних дыхательных путей , включая пневмонию , у младенцев, пожилых людей и людей с ослабленным иммунитетом , например, у тех, кто проходит химиотерапию , и у людей с ВИЧ/СПИДом . [13] [14] [15]

Если бы HCoV-OC43 действительно был возбудителем, ответственным за пандемию 1889–1890 годов, которая напоминала пандемию COVID-19 , то тяжелое заболевание было бы гораздо более распространенным, а смертность была бы намного выше в популяциях, которые ранее не подвергались воздействию вируса. [16]

Эпидемиология

Коронавирусы распространены по всему миру, вызывая 10–15% случаев простуды (чаще всего причиной простуды является риновирус , обнаруживаемый в 30–50% случаев). [17] Инфекции имеют сезонный характер: большинство случаев приходится на зимние месяцы в умеренном климате и летом и весной в теплом климате. [18] [17] [19] [20]

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ Ли, Пол (2007). Молекулярная эпидемиология коронавируса человека OC43 в Гонконге (Диссертация). Библиотеки Гонконгского университета. дои : 10.5353/th_b4501128. hdl : 10722/131538.
  2. ^ ab «Браузер таксономии (бетакоронавирус 1)» . www.ncbi.nlm.nih.gov . Проверено 29 февраля 2020 г.
  3. ^ Лим, Ивонн Синьи; Нг, Ян Лин; Тэм, Джеймс П.; Лю, Дин Сян (25 июля 2016 г.). «Коронавирусы человека: обзор взаимодействия вируса и хозяина». Болезни . 4 (3): 26. doi : 10.3390/diseases4030026 . ПМЦ 5456285 . PMID  28933406. См. таблицу 1. 
  4. ^ Ли, Фанг (29 сентября 2016 г.). «Структура, функции и эволюция шиповых белков коронавируса». Ежегодный обзор вирусологии . 3 (1): 237–261. doi : 10.1146/annurev-virology-110615-042301. ПМЦ 5457962 . PMID  27578435. BCoV S1-NTD не распознает галактозу, как галектины. Вместо этого он распознает 5-N-ацетил-9-O-ацетилнейраминовую кислоту (Neu5,9Ac2) (30, 43). Тот же рецептор сахара распознается человеческим коронавирусом OC43 (43, 99). OC43 и BCoV генетически тесно связаны, и OC43 мог возникнуть в результате зоонозного распространения BCoV (100, 101). 
  5. ^ Аб Лау, Сюзанна КП; Ли, Пол; Цанг, Алан К.Л.; Да, Кирилл Сай; Це, Герман; Ли, Родни А.; Итак, Лок-Йи; Лау, Ю.-Л.; Чан, Квок-Хунг; Ву, Патрик Сай; Юэнь, Квок-Юнг (2011). «Молекулярная эпидемиология коронавируса человека OC43 показывает эволюцию различных генотипов с течением времени и недавнее появление нового генотипа вследствие естественной рекомбинации». Журнал вирусологии . 85 (21): 11325–37. дои : 10.1128/JVI.05512-11. ПМК 3194943 . ПМИД  21849456. 
  6. ^ Гонт, скорая помощь; Харди, А.; Клаас, Европейский суд; Симмондс, П.; Темплтон, Кентукки (2010). «Эпидемиология и клинические проявления четырех коронавирусов человека 229E, HKU1, NL63 и OC43, обнаруженных за 3 года с использованием нового метода мультиплексной ПЦР в реальном времени». J Clin Микробиол . 48 (8): 2940–7. дои : 10.1128/JCM.00636-10. ПМК 2916580 . ПМИД  20554810. 
  7. ^ Брюссов, Харальд; Брюссов, Лютц (13 июля 2021 г.). «Клинические доказательства того, что пандемия 1889–1891 годов, обычно называемая русским гриппом, могла быть более ранней пандемией коронавируса». Микробная биотехнология . 14 (5): 1860–1870. дои : 10.1111/1751-7915.13889. ПМЦ 8441924 . ПМИД  34254725. 
  8. ^ Ву, Патрик Сай; Хуан, И; Лау, Сюзанна КП; Юэнь, Квок-Юнг (24 августа 2010 г.). «Геномика и биоинформатический анализ коронавируса». Вирусы . 2 (8): 1804–20. дои : 10.3390/v2081803 . ПМК 3185738 . PMID  21994708. У всех представителей подгруппы A бетакоронавирусов ген гемагглютининэстеразы (HE), который кодирует гликопротеин с активностью нейрамината-О-ацетилэстеразы и активным центром FGDS, присутствует ниже ORF1ab и выше гена S (рис. 1). ). 
  9. ^ аб Виджген, Лин; Кейартс, Элс; Моэс, Элиен; Толен, Инге; Воллантс, Эльке; Леми, Филипп; Вандам, Анн-Мик; Ван Ранст, Марк (2005). «Полная геномная последовательность коронавируса человека OC43: анализ молекулярных часов предполагает относительно недавнее событие передачи зоонозного коронавируса». Журнал вирусологии . 79 (3): 1595–1604. doi :10.1128/JVI.79.3.1595-1604.2005. ПМК 544107 . ПМИД  15650185. 
  10. ↑ Кнудсен, Йеппе Кюне (13 августа 2020 г.). «Overraskende opdagelse: Coronavirus har tidligere lagt verden ned» [Удивительное открытие: ранее коронавирус обрушивал мир]. ДР (на датском языке) . Проверено 13 августа 2020 г. . Предполагаемая пандемия гриппа в 1889 году на самом деле была вызвана коронавирусом, как показывают датские исследования.
  11. ^ Брюссов, Харальд (2021). «Чему мы можем научиться из динамики пандемии «русского гриппа» 1889 года для будущей траектории распространения COVID-19». Микробная биотехнология . 14 (6): 2244–2253. дои : 10.1111/1751-7915.13916. ПМК 8601188 . ПМИД  34464023. 
  12. ^ Форни, Диего; Кальяни, Рашель; Клеричи, Марио; Сирони, Мануэла (2017). «Молекулярная эволюция геномов коронавируса человека». Тенденции в микробиологии . 25 (1): 35–48. дои : 10.1016/j.tim.2016.09.001 . ISSN  0966-842X. ПМК 7111218 . ПМИД  27743750. 
  13. ^ Веверс, Бриджит А.; Ван дер Хук, Лия (2009). «Недавно обнаруженные коронавирусы человека». Клиники лабораторной медицины . 29 (4): 715–724. дои : 10.1016/j.cll.2009.07.007 . ПМЦ 7131583 . ПМИД  19892230. 
  14. ^ Махони, Джеймс Б. (2007). "Коронавирусы". В Мюррее, Патрик Р.; Барон, Эллен Джо; Йоргенсен, Джеймс Х.; Ландри, Мария Луиза; Пфаллер, Майкл А. (ред.). Руководство по клинической микробиологии (9-е изд.). Вашингтон, округ Колумбия: ASM Press. стр. 1414–23. ISBN 978-1-55581-371-0.
  15. ^ Пирк, К.; Берхаут, Б.; Ван дер Хук, Л. (2007). «Противовирусные стратегии против коронавирусов человека». Цели лечения инфекционных заболеваний . 7 (1): 59–66. дои : 10.2174/187152607780090757. ПМИД  17346212.
  16. ^ Брюссов, Харальд; Брюссов, Лютц (13 июля 2021 г.). «Клинические доказательства того, что пандемия 1889–1891 годов, обычно называемая русским гриппом, могла быть более ранней пандемией коронавируса». Микробная биотехнология . 14 (5): 1860–1870. дои : 10.1111/1751-7915.13889. ПМЦ 8441924 . ПМИД  34254725. 
  17. ^ Аб Ват, Деннис (2004). «Простуда: обзор литературы». Европейский журнал внутренней медицины . 15 (2): 79–88. дои : 10.1016/j.ejim.2004.01.006. ПМК 7125703 . ПМИД  15172021. 
  18. ^ Ван дер Хук, L (2007). «Коронавирусы человека: что они вызывают?». Противовирусная терапия . 12 (4 части Б): 651–8. дои : 10.1177/135965350701200S01.1 . PMID  17944272. S2CID  31867379.
  19. ↑ Кисслер, Стивен М. (14 апреля 2020 г.). «Прогнозирование динамики передачи SARS-CoV-2 в постпандемический период». Наука . 368 (6493): 860–868. Бибкод : 2020Sci...368..860K. дои : 10.1126/science.abb5793 . ПМК 7164482 . ПМИД  32291278. 
  20. ^ Берри, Майкл (2015). «Идентификация новых респираторных вирусов в новом тысячелетии». Вирусы . 7 (3): 996–1019. дои : 10.3390/v7030996 . ПМЦ 4379558 . ПМИД  25757061. 

Внешние ссылки

На Викискладе есть медиафайлы, связанные с человеческим коронавирусом OC43 .
Wikispecies содержит информацию, связанную с человеческим коронавирусом OC43 .