Липидом (желтый) как часть метаболома и общего интерактома клетки.Количественный липидом (на уровне классов липидов) дрожжей Saccharomyces cerevisiae в разных фазах роста. [1]
Липидом относится к совокупности липидов в клетках . Липиды являются одним из четырех основных молекулярных компонентов биологических организмов, наряду с белками , сахарами и нуклеиновыми кислотами . Липидом — это термин, введенный в контексте омики в современной биологии , в области липидомики . [2] Его можно изучать с помощью масс-спектрометрии и биоинформатики , а также традиционных лабораторных методов. [3] [4] Липидом клетки можно разделить на мембранно-липидомный и медиаторно-липидомный. [5]
Первый опубликованный клеточный липидом был у мышиного макрофага в 2010 году. [6] Липидом дрожжей Saccharomyces cerevisiae был охарактеризован с предполагаемым 95% покрытием; [7] исследования человеческого липидома продолжаются. [2] [6] Например, человеческий липидом плазмы состоит из почти 600 различных молекулярных видов. [8] Исследования показывают, что липидом человека может быть способен указывать на риски рака, связанные с диетическими жирами, в частности рака молочной железы . [9] [10]
^ Klose, C; Surma, MA.; Gerl, MJ.; Meyenhofer, F; Shevchenko, A; Simons, K (апрель 2012 г.). "Гибкость эукариотического липидома – выводы из липидомики дрожжей". PLOS ONE . 7 (4): e35063. Bibcode :2012PLoSO...735063K. doi : 10.1371/journal.pone.0035063 . PMC 3329542 . PMID 22529973.
^ ab Quehenberger O, Armando AM, Brown AH, et al. (Ноябрь 2010 г.). «Lipidomics обнаруживает замечательное разнообразие липидов в плазме человека». J. Lipid Res . 51 (11): 3299–305. doi : 10.1194/jlr.M009449 . PMC 2952570. PMID 20671299 .
^ Subramaniam S; Fahy E; Gupta S; Sud M; Byrnes RW; Cotter D; Dinasarapu AR; Maurya MR (2011). «Биоинформатика и системная биология липидома». Chemical Reviews . 111 (10): 6452–6490. doi :10.1021/cr200295k. PMC 3383319. PMID 21939287 .
^ Seppänen-Laakso T, Oresic M (март 2009). «Как изучать липидомы». J. Mol. Endocrinol . 42 (3): 185–90. doi : 10.1677/JME-08-0150 . PMID 19060177.
^ "Lipidomics". BioSoft . Получено 7 мая 2011 г.
^ ab "Описан первый функционирующий "липидом" макрофага мыши". ScienceDaily . Получено 7 мая 2011 г.
^ Ejsing CS, Sampaio JL, Surendranath V и др. (февраль 2009 г.). «Глобальный анализ липидома дрожжей с помощью количественной масс-спектрометрии дробовика». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 106 (7): 2136–41. doi : 10.1073/pnas.0811700106 . PMC 2650121. PMID 19174513 .
^ Квенбергер, Освальд; Деннис, Эдвард А. (10.11.2011). «Липидом плазмы человека». The New England Journal of Medicine . 365 (19): 1812–1823. doi :10.1056/NEJMra1104901. ISSN 1533-4406. PMC 3412394. PMID 22070478 .
^ Bougnoux P, Hajjaji N, Couet C (2008). «Липидом как составной биомаркер модифицируемой части риска рака молочной железы». Prostaglandins Leukot. Essent. Fatty Acids . 79 (3–5): 93–6. doi :10.1016/j.plefa.2008.09.004. PMID 18930643.
^ Bougnoux P, Giraudeau B, Couet C (март 2006 г.). «Диета, рак и липидом». Cancer Epidemiol. Biomarkers Prev . 15 (3): 416–21. doi :10.1158/1055-9965.EPI-05-0546. PMC 2755770. PMID 16537692 .
Дальнейшее чтение
Mutch DM, Fauconnot L, Grigorov M, Fay LB (2006). «Включение „Оме“ в метаболизм липидов». Biotechnol Annu Rev. Ежегодный обзор биотехнологии. 12 : 67–84. doi :10.1016/S1387-2656(06)12003-7. PMID 17045192.
ван дер Меер-Янссен Ю.П., ван Гален Дж., Батенбург Дж.Дж., Хелмс Дж.Б. (январь 2010 г.). «Липиды во взаимодействии хозяин-патоген: патогены используют сложность липидома клетки-хозяина». Прог. Липидный Рес . 49 (1): 1–26. doi :10.1016/j.plipres.2009.07.003. ПМК 7112618 . ПМИД 19638285.
Гаспар М.Л., Арегуллин М.А., Йеш С.А., Нуньес Л.Р., Вилла-Гарсия М., Генри С.А. (март 2007 г.). «Появление дрожжевой липидомики». Биохим. Биофиз. Акта . 1771 (3): 241–54. дои : 10.1016/j.bbalip.2006.06.011. ПМИД 16920401.
