Лиссавирус (от греческого λύσσα lyssa «ярость, ярость, бешенство» и латинского вируса ) [1] [2] — род РНК-вирусов семейства Rhabdoviridae , порядка Mononegavirales . Млекопитающие, включая человека, могут служить естественными хозяевами . [3] [4] Род Lyssavirus включает возбудителя ( вирус бешенства ) бешенства . [5]
Лиссавирионы имеют оболочку и имеют пулевидную форму. Эти вирионы имеют ширину около 75 нм и длину 180 нм. [3] Лиссавирионы обладают спиральной симметрией, поэтому их инфекционные частицы имеют приблизительно цилиндрическую форму. Это типично для вирусов, поражающих растения. Вирионы вирусов, инфицирующих человека, чаще имеют кубическую симметрию и принимают форму, приближающуюся к правильным многогранникам . [ нужна цитата ]
Структура состоит из шипованной внешней оболочки , средней области, состоящей из матриксного белка М, и внутренней области рибонуклеокапсидного комплекса, состоящей из генома, связанного с другими белками. [ нужна цитата ]
Геномы лиссавирусов состоят из одноцепочечной молекулы РНК с отрицательным смыслом, которая кодирует пять вирусных белков: полимеразу L, матричный белок M, фосфопротеин P, нуклеопротеин N и гликопротеин G. Геномы линейные, длиной около 11 КБ. [3]
На основании недавних филогенетических данных лиссавирусы были разделены на семь основных видов . Кроме того, недавно были обнаружены еще пять видов: вирус западно-кавказских летучих мышей, вирус Араван, вирус Худжанд, вирус Иркут и вирус летучих мышей Шимони. [8] [9] Род лиссавирусов можно разделить на четыре филогруппы на основе гомологии последовательностей ДНК. Филогруппа I включает вирусы, такие как вирус бешенства, вирус Дювенхаге, лиссавирус европейских летучих мышей типов 1 и 2, лиссавирус австралийских летучих мышей, вирус Худжанд, лиссавирус летучих мышей Бокело, вирус Иркут и вирус Араван. Филогруппа II содержит вирус летучих мышей Лагос, вирус Мокола и вирус летучих мышей Шимони. Лиссавирус западнокавказских летучих мышей — единственный вирус, входящий в филогруппу III. Лиссавирус Ikoma и лиссавирус летучей мыши Lleida являются примерами филогруппы IV. Лиссавирус летучих мышей Западного Кавказа был отнесен к отдельной филогруппе, поскольку это наиболее дивергентный лиссавирус из всех обнаруженных. [10]
Филогенетические исследования показывают, что первоначальными хозяевами этих вирусов были летучие мыши. [11] Однако недавнее открытие последовательностей лиссавирусов у амфибий и рептилий ставит под сомнение происхождение лиссавирусов у млекопитающих. [12] [13] Большее антигенное разнообразие лиссавирусов из Африки привело к предположению, что Африка была источником этих вирусов. Вместо этого исследование 153 вирусов, собранных в период с 1956 по 2015 год из различных географических мест, предположило палеарктическое происхождение этих вирусов (вероятность 85%). [14] Оценки дат (вероятность 95%) для самого недавнего общего предка были очень широкими – между 3995 и 166 820 годами ранее – что предполагает, что в этой области предстоит провести дальнейшую работу. Хотя летучие мыши эволюционировали в Палеарктике, [15] их происхождение предшествует происхождению лиссавирусов на миллионы лет, что свидетельствует против их совместного видообразования. Скорость эволюции гена N в линии Africa 2 оценивается в 3,75×10 -3 замен на сайт в год. [16] Эта скорость аналогична скорости других РНК-вирусов.
Репликация вируса цитоплазматическая. Проникновение в клетку-хозяина достигается путем прикрепления вирусных G-гликопротеинов к рецепторам хозяина, что опосредует клатрин-опосредованный эндоцитоз . Репликация соответствует модели репликации вируса с отрицательной цепью РНК. Транскрипция вируса с отрицательной цепью РНК с использованием заикания полимеразы - это метод транскрипции. Вирус покидает клетку-хозяина путем почкования и движения вируса по канальцам. Дикие млекопитающие, особенно летучие мыши и некоторые хищники, служат естественными хозяевами. Пути передачи обычно происходят через укушенные раны. [3]
По состоянию на 2018 год тест на прямые флуоресцентные антитела (DFA) по-прежнему остается золотым стандартом для выявления лиссавирусной инфекции. С начала нового тысячелетия были разработаны тесты ПЦР с обратной транскрипцией (ОТ-ПЦР) на бешенство, но они использовались только в качестве подтверждающего теста. Тесты на основе ПЦР в реальном времени , которые имеют более высокую чувствительность и объективные диагностические пороги и позволяют хранить образцы при комнатной температуре, являются многообещающими с 2005 года, но требуют аппарата для ПЦР в реальном времени и квалифицированных работников с опытом молекулярной диагностики. По данным международной оценки, один анализ TaqMan LN34 позволил обнаружить лиссавирус с высокой чувствительностью (99,90%) по всему роду и высокой специфичностью (99,68%) по сравнению с тестом DFA. Там, где это возможно, он станет основным посмертным диагностическим тестом на бешенство. [17]
Классический вирус бешенства распространен на большей части мира и может переноситься любым теплокровным млекопитающим. Остальные лиссавирусы имеют гораздо меньшее разнообразие носителей. Только избранные хозяева могут переносить каждый из этих видов вирусов . Кроме того, эти другие виды характерны только для определенной географической области. Известно, что летучие мыши являются животными- переносчиками всех идентифицированных лиссавирусов, за исключением вируса Мокола . [18]