Анкирин-1

Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens

Анкирин 1 , также известный как ANK-1 и эритроцитарный анкирин , представляет собой белок , который у людей кодируется геном ANK1 . ^{[5] [6]}

Распределение в тканях

Белок , кодируемый этим геном, анкирин 1, является прототипом семейства анкиринов , впервые был обнаружен в эритроцитах , но с тех пор был также обнаружен в мозге и мышцах. ^[6]

Генетика

Были описаны сложные модели альтернативного сплайсинга в регуляторном домене, дающие начало различным изоформам анкирина 1, однако точные функции различных изоформ неизвестны. Также сообщалось об альтернативном полиаденилировании , объясняющем различные размеры эритроцитарных мРНК анкирина 1. Также были идентифицированы укороченные мышечно-специфические изоформы анкирина 1, возникающие в результате использования альтернативного промотора . ^[6]

Связь с заболеванием

Мутации в эритроцитарном анкирине 1 были связаны примерно с половиной всех пациентов с наследственным сфероцитозом . ^[6]

ANK1 демонстрирует измененное метилирование и экспрессию при болезни Альцгеймера. ^{[7] [8]} Исследование экспрессии генов в посмертном мозге показало, что ANK1 взаимодействует с сигнализацией интерферона-γ . ^[9]

Функция

Белок ANK1 принадлежит к семейству анкиринов , которые, как полагают, связывают интегральные мембранные белки с лежащим в основе спектрин - актиновым цитоскелетом и играют ключевые роли в таких видах деятельности, как подвижность клеток, активация, пролиферация, контакт и поддержание специализированных мембранных доменов. Множественные изоформы анкирина с различным сродством к различным целевым белкам экспрессируются тканеспецифичным, регулируемым развитием образом. Большинство анкиринов обычно состоят из трех структурных доменов: аминоконцевого домена, содержащего множественные анкириновые повторы; центральной области с высококонсервативным спектрин-связывающим доменом; и карбоксиконцевого регуляторного домена, который является наименее консервативным и подверженным вариациям. ^[6]

Небольшие варианты сплайсинга белка ANK1 (sAnk1) контактируют с обскурином , гигантским белком, окружающим сократительный аппарат в поперечно-полосатых мышцах . ^[10]

Взаимодействия

Было показано, что ANK1 взаимодействует с белком 1, вызывающим инвазию и метастазирование Т-клеточной лимфомы , ^[11] титином , ^[12] RHAG ^[13] и OBSCN . ^[14]

Смотрите также

• Анкырин

Ссылки

1. GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000029534 – Ensembl , май 2017 г.
2. GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000031543 – Ensembl , май 2017 г.
3. "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
4. "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
5. Lambert S, Yu H, Prchal JT, Lawler J, Ruff P, Speicher D и др. (март 1990 г.). "cDNA sequence for human erythrocyte ankyrin". Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 87 (5): 1730–1734. Bibcode : 1990PNAS...87.1730L. doi : 10.1073/pnas.87.5.1730 . PMC 53556. PMID  1689849 . 
6. "Ген Entrez: ANK1 анкирин 1, эритроцитарный".
7. De Jager PL, Srivastava G, Lunnon K, Burgess J, Schalkwyk LC, Yu L и др. (сентябрь 2014 г.). «Болезнь Альцгеймера: ранние изменения в метилировании ДНК мозга в ANK1, BIN1, RHBDF2 и других локусах». Nature Neuroscience . 17 (9): 1156–1163. doi :10.1038/nn.3786. PMC 4292795 . PMID  25129075. 
8. Lunnon K, Smith R, Hannon E, De Jager PL, Srivastava G, Volta M и др. (сентябрь 2014 г.). «Methylomic profiling implicates cortical deregulation of ANK1 in Alzheimer's disease» (Метиломичное профилирование указывает на кортикальную дерегуляцию ANK1 при болезни Альцгеймера). Nature Neuroscience . 17 (9): 1164–1170. doi :10.1038/nn.3782. PMC 4410018 . PMID  25129077. 
9. Лискович Н., Френч Л. (2014). «Дифференциальная коэкспрессия между сигнальными генами α-синуклеина и IFN-γ в процессе развития и при болезни Паркинсона». PLOS ONE . 9 (12): e115029. Bibcode : 2014PLoSO...9k5029L. doi : 10.1371/journal.pone.0115029 . PMC 4262449. PMID  25493648 . 
10. Borzok MA, Catino DH, Nicholson JD, Kontrogianni-Konstantopoulos A, Bloch RJ (ноябрь 2007 г.). «Картирование сайта связывания на малом анкирине 1 для обскурина». Журнал биологической химии . 282 (44): 32384–32396. doi : 10.1074/jbc.M704089200 . PMID  17720975.
11. Bourguignon LY, Zhu H, Shao L, Chen YW (июль 2000 г.). «Взаимодействие Ankyrin-Tiam1 способствует передаче сигнала Rac1 и инвазии и миграции клеток метастатической опухоли молочной железы». Журнал клеточной биологии . 150 (1): 177–191. doi :10.1083/jcb.150.1.177. PMC 2185563. PMID 10893266  . 
12. Kontrogianni-Konstantopoulos A, Bloch RJ (февраль 2003 г.). «Гидрофильный домен малого анкирина-1 взаимодействует с двумя N-концевыми иммуноглобулиновыми доменами тайтина». Журнал биологической химии . 278 (6): 3985–3991. doi : 10.1074/jbc.M209012200 . PMID  12444090.
13. Nicolas V, Le Van Kim C, Gane P, Birkenmeier C, Cartron JP, Colin Y и др. (июль 2003 г.). «Rh-RhAG/ankyrin-R, новый сайт взаимодействия между мембранным бислоем и скелетом эритроцитов, нарушается мутацией, связанной с Rh(null)». Журнал биологической химии . 278 (28): 25526–25533. doi : 10.1074/jbc.M302816200 . PMID  12719424.
14. Kontrogianni-Konstantopoulos A, Jones EM, Van Rossum DB, Bloch RJ (март 2003 г.). «Обскурин — лиганд для малого анкирина 1 в скелетных мышцах». Молекулярная биология клетки . 14 (3): 1138–1148. doi :10.1091/mbc.E02-07-0411. PMC 151585. PMID  12631729 . 

Дальнейшее чтение

• Bennett V, Baines AJ (июль 2001 г.). «Пути на основе спектрина и анкирина: изобретения метазоа для интеграции клеток в ткани». Physiological Reviews . 81 (3): 1353–1392. doi :10.1152/physrev.2001.81.3.1353. PMID  11427698. S2CID  15307181.
• Беннетт В. (октябрь 1979 г.). «Иммунореактивные формы анкирина эритроцитов человека присутствуют в различных клетках и тканях». Nature . 281 (5732): 597–599. Bibcode :1979Natur.281..597B. doi :10.1038/281597a0. PMID  492324. S2CID  263106.
• Lambert S, Yu H, Prchal JT, Lawler J, Ruff P, Speicher D и др. (март 1990 г.). "cDNA sequence for human erythrocyte ankyrin". Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 87 (5): 1730–1734. Bibcode : 1990PNAS...87.1730L. doi : 10.1073 /pnas.87.5.1730 . PMC  53556. PMID  1689849.
• Фудзимото Т., Ли К., Мива С., Огава К. (ноябрь 1991 г.). «Иммуноцитохимическая локализация фодрина и анкирина в хромаффинных клетках быка in vitro». Журнал гистохимии и цитохимии . 39 (11): 1485–1493. doi : 10.1177/39.11.1833445 . PMID  1833445.
• Lux SE, John KM, Bennett V (март 1990 г.). «Анализ кДНК для анкирина эритроцитов человека указывает на повторяющуюся структуру с гомологией с белками дифференцировки тканей и контроля клеточного цикла». Nature . 344 (6261): 36–42. Bibcode :1990Natur.344...36L. doi :10.1038/344036a0. PMID  2137557. S2CID  4351060.
• Davis LH, Bennett V (июнь 1990). «Картирование участков связывания анкирина эритроцитов человека для анионообменника и спектрина». Журнал биологической химии . 265 (18): 10589–10596. doi : 10.1016/S0021-9258(18)86987-3 . PMID  2141335.
• Korsgren C, Cohen CM (июль 1988). "Ассоциации полосы 4.2 эритроцитов человека. Связывание с анкирином и цитоплазматическим доменом полосы 3". Журнал биологической химии . 263 (21): 10212–10218. doi : 10.1016/S0021-9258(19)81500-4 . PMID  2968981.
• Cianci CD, Giorgi M, Morrow JS (июль 1988 г.). «Фосфорилирование анкирина подавляет его кооперативное взаимодействие со спектрином и белком 3». Журнал клеточной биохимии . 37 (3): 301–315. doi :10.1002/jcb.240370305. PMID  2970468. S2CID  42349239.
• Steiner JP, Bennett V (октябрь 1988 г.). «Независимые от анкирина сайты связывания мембранных белков для спектрина мозга и эритроцитов». Журнал биологической химии . 263 (28): 14417–14425. doi : 10.1016/S0021-9258(18)68236-5 . PMID  2971657.
• Hargreaves WR, Giedd KN, Verkleij A, Branton D (декабрь 1980 г.). «Реассоциация анкирина с полосой 3 в мембранах эритроцитов и липидных везикулах». Журнал биологической химии . 255 (24): 11965–11972. doi : 10.1016/S0021-9258(19)70228-2 . PMID  6449514.
• Bourguignon LY, Lokeshwar VB, Chen X, Kerrick WG (декабрь 1993 г.). «Трансдукция сигнала лимфоцитов, вызванная гиалуроновой кислотой, и взаимодействие рецептора HA (GP85/CD44) с цитоскелетом». Журнал иммунологии . 151 (12): 6634–6644. doi : 10.4049/jimmunol.151.12.6634 . PMID  7505012. S2CID  25287008.
• Маруяма К, Сугано С (январь 1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Gene . 138 (1–2): 171–174. doi :10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Morgans CW, Kopito RR (август 1993 г.). «Связь мозгового анионообменника AE3 с повторяющимся доменом анкирина». Journal of Cell Science . 105. 105 (4): 1137–1142. doi :10.1242/jcs.105.4.1137. PMID  8227202.
• Bourguignon LY, Jin H, Iida N, Brandt NR, Zhang SH (апрель 1993 г.). «Участие анкирина в регуляции внутреннего высвобождения Ca2+, опосредованного рецептором инозитол-1,4,5-трифосфата, из везикул хранения Ca2+ в клетках мышиной Т-лимфомы». Журнал биологической химии . 268 (10): 7290–7297. doi : 10.1016/S0021-9258(18)53175-6 . PMID  8385102.
• Eber SW, Gonzalez JM, Lux ML, Scarpa AL, Tse WT, Dornwell M и др. (июнь 1996 г.). «Мутации Ankyrin-1 являются основной причиной доминантного и рецессивного наследственного сфероцитоза». Nature Genetics . 13 (2): 214–218. doi :10.1038/ng0696-214. PMID  8640229. S2CID  10946374.
• Lanfranchi G, Muraro T, Caldara F, Pacchioni B, Pallavicini A, Pandolfo D и др. (январь 1996 г.). «Идентификация 4370 экспрессируемых последовательностей тегов из библиотеки ДНК, специфичной для 3'-конца, скелетных мышц человека с помощью секвенирования ДНК и гибридизации фильтров». Genome Research . 6 (1): 35–42. doi : 10.1101/gr.6.1.35 . PMID  8681137.
• del Giudice EM, Hayette S, Bozon M, Perrotta S, Alloisio N, Vallier A и др. (июнь 1996 г.). «Ankyrin Napoli: de novo делеционная мутация со сдвигом рамки считывания в экзоне 16 гена ankyrin (ANK1), связанная со сфероцитозом». British Journal of Haematology . 93 (4): 828–834. doi :10.1046/j.1365-2141.1996.d01-1746.x. PMID  8703812. S2CID  28906962.
• Zhou D, Birkenmeier CS, Williams MW, Sharp JJ, Barker JE, Bloch RJ (февраль 1997 г.). «Маленькие, связанные с мембраной, альтернативно сплайсированные формы анкирина 1, связанные с саркоплазматическим ретикулумом скелетных мышц млекопитающих». Журнал клеточной биологии . 136 (3): 621–631. doi :10.1083/jcb.136.3.621. PMC 2134284.  PMID 9024692  .
• Gallagher PG, Tse WT, Scarpa AL, Lux SE, Forget BG (август 1997 г.). «Структура и организация гена человеческого анкирина-1. Основа сложности обработки пре-мРНК». Журнал биологической химии . 272 ​​(31): 19220–19228. doi : 10.1074/jbc.272.31.19220 . PMID  9235914.
• Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (октябрь 1997 г.). «Конструирование и характеристика библиотеки ДНК с полной длиной и обогащенной 5'-концом». Gene . 200 (1–2): 149–156. doi :10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID  9373149.

Внешние ссылки

• ANK1+белок,+человек в рубриках медицинских предметов Национальной медицинской библиотеки США (MeSH)
• Расположение генома человека ANK1 и страница с подробностями гена ANK1 в браузере геномов UCSC .

В данной статье использован текст из Национальной медицинской библиотеки США , являющийся общественным достоянием .