stringtranslate.com

Малые РНК, кодируемые вирусом Эпштейна-Барр

Малые РНК, кодируемые вирусом Эпштейна-Барр (EBER), представляют собой небольшие некодирующие РНК, локализованные в ядре клеток человека, инфицированных вирусом Эпштейна-Барр (ВЭБ). Впервые обнаруженные в 1981 году, EBER являются наиболее распространенными РНК, присутствующими в инфицированных клетках. [1] EBER взаимодействуют с несколькими белками хозяина, образуя комплексы рибонуклеопротеинов (РНП). Хотя точная функция EBER остается неясной, предлагаются их роли в трансформации и онкогенезе . Также было показано, что они присутствуют в экзосомах, высвобождаемых инфицированными клетками, и могут участвовать во взаимодействии клеток. [2] [3]

Фон

EBER1 и EBER2 — короткие, 167 и 172 нуклеотида в длину соответственно, обогащенные ядром некодирующие РНК . Эти две РНК транскрибируются РНК-полимеразой III хозяина во время латентной инфекции EBV. [4] [5]

EBER 1 и 2 могут быть удалены из вирусного генома без заметных фенотипических изменений, хотя в природе это никогда не было обнаружено. [4] Экспрессия EBER сама по себе может вызывать опухоли у мышей с тяжелым комбинированным иммунодефицитом . [6] [7]

ЭБЕР1

EBER1 ассоциируется с человеческим рибосомным белком L22 [8] и заставляет этот белок перемещаться из ядрышка в нуклеоплазму . [9] EBER1 также специфически взаимодействует по крайней мере с тремя hnRNP хозяина (A1, A2/B1 и D/ AUF1 ). [10]

ЭБЕР2

Консенсусная вторичная структура для EBER2

Подобно EBER1, EBER2 очень сильно экспрессируется в латентно инфицированных клетках. В отличие от EBER1, последовательность EBER2 менее консервативна в родственных герпесвирусах (~50% консервации). Однако вторичная структура EBER2 высоко консервативна (см. Рисунок 1). Известно, что EBER2 связывает клеточные белки (в частности, домен La ) только на своем конечном участке повторяющихся уридинов ; однако считается, что другие особенности EBER2, в частности его две длинные и высококонсервативные петли-стебли , также могут служить сайтами связывания для пока неизвестных белков. [11]

Ричард Эмбиндер был пионером в применении гибридизации EBER in situ для обнаружения вируса Эпштейна-Барр в клинических образцах в 1990 году. [12] Обилие мишеней EBER в клетках с латентной инфекцией EBV и простота неизотопной методологии в фиксированных формалином и залитых парафином тканевых срезах сделали гибридизацию EBER in situ исключительно подходящей для клинической практики. [13] [14] [15] Обнаружение EBER стало неотъемлемым компонентом рутинной диагностической гистопатологии. [16] [17]

Ссылки

  1. ^ Lerner MR, Andrews NC, Miller G, Steitz JA (февраль 1981 г.). «Две малые РНК, кодируемые вирусом Эпштейна-Барр и комплексированные с белком, преципитируются антителами от пациентов с системной красной волчанкой». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 78 (2): 805–809. doi : 10.1073/pnas.78.2.805 . PMC  319891. PMID  6262773 .
  2. ^ Ахмед, Вакар; Тарик, Саид; Хан, Гульфараз (18.10.2018). «Отслеживание РНК, кодируемых вирусом Эпштейна-Барр (EBER), от ядра до выделяемых экзосом В-лимфоцитов». Scientific Reports . 8 (1): 15438. doi :10.1038/s41598-018-33758-4. ISSN  2045-2322. PMC 6193935 . PMID  30337610. 
  3. ^ Ахмед, Вакар; Филипп, Претти С.; Аттуб, Самир; Хан, Гульфараз (декабрь 2015 г.). «Клетки, инфицированные вирусом Эпштейна-Барр, высвобождают лиганд Fas в экзосомальных фракциях и вызывают апоптоз в клетках-реципиентах через внешний путь». Журнал общей вирусологии . 96 (12): 3646–3659. doi :10.1099/jgv.0.000313. ISSN  1465-2099. PMID  26467838.
  4. ^ ab Conrad NK, Fok V, Cazalla D, Borah S, Steitz JA (2006). «Проблема вирусных snRNP». Симпозиумы Cold Spring Harbor по количественной биологии . 71 : 377–384. doi : 10.1101/sqb.2006.71.057 . PMID  17381320.
  5. ^ Moss WN, Lee N, Pimienta G, Steitz JA (2014). «Семейства РНК в вирусе Эпштейна-Барр». RNA Biology . 11 (1): 10–17. doi :10.4161/rna.27488. PMC 3929418. PMID  24441309 . 
  6. ^ Комано Дж., Маруо С., Куродзуми К., Ода Т., Такада К. (декабрь 1999 г.). «Онкогенная роль РНК, кодируемых вирусом Эпштейна-Барра, в клеточной линии лимфомы Беркитта Аката». Журнал вирусологии . 73 (12): 9827–9831. doi :10.1128/JVI.73.12.9827-9831.1999. ПМЦ 113031 . ПМИД  10559294. 
  7. ^ Ямамото Н., Такидзава Т., Иванага Ю., Симидзу Н., Ямамото Н. (ноябрь 2000 г.). «Злокачественная трансформация клеточной линии B-лимфомы BJAB с помощью малых РНК, кодируемых вирусом Эпштейна-Барр». Письма ФЭБС . 484 (2): 153–158. дои : 10.1016/S0014-5793(00)02145-1. PMID  11068051. S2CID  35288002.
  8. ^ Fok V, Mitton-Fry RM, Grech A, Steitz JA (май 2006 г.). «Множественные домены EBER 1, некодирующей РНК вируса Эпштейна-Барр, рекрутируют человеческий рибосомальный белок L22». RNA . 12 (5): 872–882. ​​doi :10.1261/rna.2339606. PMC 1440895 . PMID  16556938. 
  9. ^ Toczyski DP, Matera AG, Ward DC, Steitz JA (апрель 1994 г.). «Малая РНК вируса Эпштейна-Барр (EBV) EBER1 связывает и перемещает рибосомальный белок L22 в инфицированных EBV человеческих В-лимфоцитах». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 91 (8): 3463–3467. doi : 10.1073/pnas.91.8.3463 . PMC 43597. PMID  8159770 . 
  10. ^ Lee N, Pimienta G, Steitz JA (ноябрь 2012 г.). «AUF1/hnRNP D — новый белковый партнер некодирующей РНК EBER1 вируса Эпштейна-Барр». РНК . 18 (11): 2073–2082. doi :10.1261/rna.034900.112. PMC 3479396 . PMID  23012480. 
  11. ^ Moss WN, Lee N, Pimienta G, Steitz JA (20 декабря 2013 г.). «Семейства РНК в вирусе Эпштейна-Барр». RNA Biology . 11 (1): 10–17. doi :10.4161/rna.27488. PMC 3929418. PMID  24441309 . 
  12. ^ Wu, Tzyy-Choou; Mann, Risa B.; Charache, Patricia; Hayward, S. Diane; Staal, Steve; Lambe, Beverly C.; Ambinder, Richard F. (1990-11-15). "Обнаружение экспрессии гена ebv в клетках Рид-Штернберга при болезни Ходжкина". International Journal of Cancer . 46 (5): 801–804. doi :10.1002/ijc.2910460509. PMID  2172169. S2CID  22788289.
  13. ^ Barletta, Janet M.; Kingma, Douglas W.; Ling, Yun; Charache, Patricia; Mann, Risa B.; Ambinder, Richard F. (апрель 1993 г.). «Быстрая гибридизация in situ для диагностики латентной инфекции вируса Эпштейна-Барр». Molecular and Cellular Probes . 7 (2): 105–109. doi : 10.1006/mcpr.1993.1014 . PMID  8391639.
  14. ^ Хан, Г.; Коутс, П. Дж.; Кангро, Х. О.; Славин, Г. (июль 1992 г.). «Вирус Эпштейна-Барр (ВЭБ) кодировал малые РНК: цели для обнаружения с помощью гибридизации in situ с олигонуклеотидными зондами». Журнал клинической патологии . 45 (7): 616–620. doi :10.1136/jcp.45.7.616. ISSN  0021-9746. PMC 495191. PMID 1325480  . 
  15. ^ Хан, Г.; Коутс, П. Дж.; Гупта, Р. К.; Кангро, Х. О.; Славин, Г. (апрель 1992 г.). «Присутствие вируса Эпштейна-Барр при болезни Ходжкина не является исключительным для клеток Рида-Штернберга». Американский журнал патологии . 140 (4): 757–762. ISSN  0002-9440. PMC 1886366. PMID 1314022  . 
  16. ^ Хан, Гульфараз (2009). «Скрининг вируса Эпштейна-Барр при лимфоме Ходжкина». Методы в молекулярной биологии . 511 : 311–322. doi :10.1007/978-1-59745-447-6_13. ISSN  1064-3745. PMID  19347303.
  17. ^ Вайс, Лоуренс М.; Чэнь, Юань-Юань (2013-01-01). "Гибридизация EBER in situ для вируса Эпштейна-Барр". Методы в молекулярной биологии . 999 : 223–30. doi :10.1007/978-1-62703-357-2_16. PMID  23666702.

Внешние ссылки