stringtranslate.com

Номенклатурные коды

Номенклатурные коды или коды номенклатуры — это различные своды правил, которые регулируют наименование живых организмов. Стандартизация научных названий биологических организмов позволяет исследователям обсуждать результаты (в том числе открытие новых видов).

Поскольку изучение биологии становилось все более специализированным, для разных типов организмов были приняты определенные коды.

Для конечного пользователя, который имеет дело только с названиями видов, с некоторым пониманием того, что виды можно отнести к родам , семействам и другим таксонам более высоких рангов, может быть не заметно, что существует более одного кода, но за пределами этого базового уровня. они довольно разные по принципу работы.

Биноминальная номенклатура

В таксономии биномиальная номенклатура («двухчленная система наименования»), также называемая бинарной номенклатурой , представляет собой формальную систему наименования видов живых существ путем присвоения каждому имени, состоящего из двух частей, каждая из которых использует латинские грамматические формы , хотя они могут быть основаны на словах из других языков. Такое имя называется биномиальным именем (которое можно сократить до просто «биномиального»), биноменом , биноминальным именем или научным названием ; более неофициально его также исторически называют латинским именем . В МКЗН система также называется биноминальной номенклатурой , [1] «binomi'N'al» с буквой «N» перед «al», что не является опечаткой и означает «система именования с двумя именами». [2]

Первая часть названия – родовое название – идентифицирует род, к которому принадлежит вид, тогда как вторая часть – видовое название или видовой эпитет – различает вид внутри рода. Например, современные люди принадлежат к роду Homo и внутри этого рода к виду Homo sapiens . Тираннозавр рекс , вероятно, является наиболее широко известным биномом. [3]

Формальное введение этой системы наименования видов приписывают Карлу Линнею , фактически начавшему с его работы « Виды растений » в 1753 году . ), содержащее множество названий родов, позднее заимствованных Линнеем. [5] Введение Линнеем двухсоставных названий видов (биноминальная номенклатура) было долгожданным упрощением, поскольку по мере расширения наших знаний о биоразнообразии увеличивалась и длина названий, многие из которых стали громоздкими. [6]

Кодификация научных названий

Когда все натуралисты во всем мире приняли биноминальную номенклатуру, возникло несколько школ размышлений о деталях. Становилось все более очевидным, что для регулирования научных названий необходим подробный свод правил . Начиная с середины XIX века, было предпринято несколько инициатив по выработке общепринятых во всем мире сводов правил. В настоящее время номенклатурные коды регулируют наименование:

Различия между кодами

Отправная точка

Отправная точка, то есть время, с которого эти коды вступают в силу (обычно задним числом), варьируется от группы к группе, а иногда и от ранга к рангу. [7] В ботанике и микологии отправной точкой часто является 1 мая 1753 года ( Линней , Species plantarum ). В зоологии это 1 января 1758 года (Линней, Systema Naturae , 10-е издание ). С другой стороны, бактериология началась заново, сделав полную очистку в 1980 году (Скерман и др., «Утвержденные списки названий бактерий»), хотя и сохранила первоначальных авторов и даты публикации. [8]

Исключения в ботанике: [9] [10] [11]

Исключения в зоологии: [13]

Работает

Существуют также различия в способах работы кодов. Например, ICN (код водорослей, грибов и растений) запрещает таутонимы , а ICZN (код животных) разрешает их.

Терминология

Эти кодексы различаются терминологией, и существует долгосрочный проект по «гармонизации» этого. Например, ICN использует слово «действительный» в «действительной публикации имени» (= акт публикации официального имени), а «установление имени» является эквивалентом ICZN . ICZN использует слово «действительный» в «действительном имени» («правильное имя»), а «правильное имя» является эквивалентом ICN . Гармонизация продвигается весьма ограниченно.

Типы

Существуют различия в том, какие типы используются. Бактериологический код отдает предпочтение культурам живого типа, но допускает и другие виды. Продолжаются споры о том, какой тип более полезен в таком случае, как цианобактерии . [14]

Другие коды

Биокод

Более радикальный подход был применен в 1997 году, когда Международный комитет по биономенклатуре IUBS / IUMS (ICB) представил давно обсуждаемый проект Биокода , в котором предлагалось заменить все существующие Кодексы их гармонизацией. [15] [16] Первоначально запланированная дата реализации проекта Биокода была 1 января 2000 года, но соглашение о замене существующих Кодексов не было достигнуто.

В 2011 году был предложен пересмотренный Биокод , который вместо замены существующих Кодексов обеспечит для них единый контекст, ссылаясь на них при необходимости. [17] [18] [19] В предлагаемые направления постепенно вносятся изменения в существующие кодексы. [20] [21] Однако участники последнего серьезного обсуждения проекта Биокода пришли к выводу, что он, вероятно, не будет реализован при их жизни. [22]

Филокод

Многие авторы столкнулись с проблемами при использовании системы Линнея в филогенетической классификации. [23] Фактически, ранние сторонники ранговой номенклатуры, такие как Альфонс де Кандоль и авторы версии 1886 года кодекса номенклатуры Союза американских орнитологов, уже предполагали, что в будущем ранговая номенклатура должна быть заброшенный. [24] [6] Другой Кодекс , который был разработан с 1998 года, - это ФилоКодекс , который теперь регулирует имена, определенные в соответствии с филогенетической номенклатурой вместо традиционной номенклатуры Линнея . Этот новый подход требует использования филогенетических определений, которые относятся к «спецификаторам», аналогичным «типу» в ранговой номенклатуре. Такие определения разграничивают таксоны данной филогении, и такая номенклатура не требует использования абсолютных рангов. Кодекс вступил в силу в 2020 году с публикацией монографии «Филонимы», включающей список имен, установленных в соответствии с этим кодексом .

Амбирегнальные протисты

Некоторые протисты , иногда называемые амбирегнальными протистами , считаются одновременно простейшими и водорослями или простейшими и грибами , и их названия были опубликованы в рамках одной или обеих МКЗН и МКП . [25] [26] Возникшая в результате двойная формулировка в схемах классификации протистов привела к путанице. [27] [28] [29]

Группы , заявленные как протозоологами , так и фикологами , включают эвглениды , динофлагелляты , криптомонады , гаптофиты , глаукофиты , многие гетероконты (например, хризофиты , рафидофиты , силикофлагелляты , некоторые ксантофиты , протеромонады ) , некоторые монадоидные зеленые водоросли ( волвокалеи и празинофиты ), хоанофлагелляты. , бикозоециды , эбрииды и хлорарахниофиты .

Слизевики , плазмодии и другие « грибоподобные » организмы, по мнению как протозоологов, так и микологов , включают мицетозоев , плазмодиофоридов , акразидов и лабиринтуломицетов . Грибы , на которые претендуют как протозоологи, так и микологи , включают хитриды , бластоклады и кишечные грибы .

Другими проблемными группами являются цианобактерии (ICNP/ICN) и микроспоридии (ICZN/ICN).

Нерегулируемые таксоны

Зоологический кодекс не регламентирует названия таксонов ниже подвида и выше надсемейства. Есть много попыток внести некоторый порядок в номенклатуру этих таксонов, [30] [31], включая PhyloCode , Дуплостенсиональную номенклатурную систему, [32] [33] и круговую номенклатуру . [34] [35]

Ботанический кодекс применяется преимущественно к рангам надсемейства и ниже. Существуют некоторые правила для имен выше ранга надсемейства, но к ним не применяется принцип приоритета , а принцип типизации необязателен. Эти имена могут быть либо автоматически типизированными , либо описательными . [36] [37] В некоторых случаях таксон имеет два возможных названия (например, Chrysophyceae Pascher, 1914, nom. descrip.; Hibberd, 1976, nom. typificatum ). Описательные названия проблематичны, поскольку в случае разделения таксона не очевидно, какая новая группа получит существующее название. Между тем, при типизированных именах существующее имя принимается новой группой, которая все еще носит тип этого имени. Однако типизированные названия представляют для микроорганизмов особые проблемы. [29]

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ Международная комиссия по зоологической номенклатуре 1999, Глава 2, Статья 5. Принцип биноминальной номенклатуры ( «Статья 5. Принцип биноминальной номенклатуры | Международный кодекс зоологической номенклатуры». Архивировано из оригинала 29 марта 2023 года . Проверено 29 марта 2023 года .)
  2. ^ Международная комиссия по зоологической номенклатуре 1999, Глоссарий - «биномен», «номенклатура, биноминальный» ( «Глоссарий | Международный кодекс зоологической номенклатуры». Архивировано из оригинала 6 февраля 2023 года . Проверено 29 марта 2023 года .)
  3. ^ Басби, Артур III; и другие. (1997). Путеводитель по камням и окаменелостям . п. 103.
  4. ^ Кнапп, Сандра . «Что в имени? История систематики: Линней и рождение современной систематики». NHM.ac.uk. _ Музей естественной истории, Лондон . Архивировано из оригинала 18 октября 2014 года . Проверено 17 июня 2011 г.
  5. ^ Баухин, Гаспар. «Pinax theatri botanici». Библиотека Киотского университета. Архивировано из оригинала 17 октября 2016 года . Проверено 19 июня 2016 г.
  6. ^ Аб Лорен, Мишель (3 августа 2023 г.). Появление PhyloCode: продолжающаяся эволюция биологической номенклатуры. ЦРК Пресс. дои : 10.1201/9781003092827. ISBN 978-1-003-09282-7.
  7. ^ Николсон, Дэн (1991). «История ботанической номенклатуры». Анналы ботанического сада Миссури . 78 (1): 33–56. дои : 10.2307/2399589. JSTOR  2399589.
  8. ^ Скерман, ВБД; Макгоуэн, В.; Снит, PHA (1980). «Утвержденные списки названий бактерий». Межд. Дж. Сист. Бактериол . 30 : 225–420. дои : 10.1099/00207713-30-1-225 .
  9. ^ Читвуд, Б.Г. (1958). «Обозначение официальных названий высших таксонов беспозвоночных». Бык. Зоол. Номенкл . 15 : 860–895. дои : 10.5962/bhl.part.19410 .
  10. ^ Сильва, ПК (1958). «Более поздние отправные точки в водорослях» (PDF) . Таксон . 7 (7): 181–184. дои : 10.2307/1216399. JSTOR  1216399.
  11. ^ (Турланд и др. 2018, статья 13)
  12. ^ (Турланд и др. 2018, статья F.1.1)
  13. ^ ICZN - Международная комиссия по зоологической номенклатуре (1999). Международный кодекс зоологической номенклатуры . Четвертое издание. Международный фонд зоологической номенклатуры, Лондон, Великобритания. 306 стр., [1].
  14. ^ Орен, Аарон (2004). «Предложение по дальнейшей интеграции цианобактерий в Бактериологический кодекс». Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 54 (ч. 5): 1895–1902. дои : 10.1099/ijs.0.03008-0 . ПМИД  15388760.
  15. ^ «Проект биокода». 1997.
  16. Макнил, Джон (4 ноября 1996 г.). «Глава 2. Биокод: Интегрированная биологическая номенклатура для 21 века?». Материалы мини-симпозиума по биологической номенклатуре в XXI веке .
  17. ^ «Проект биокода (2011)» . Международный комитет по биономенклатуре (ICB).
  18. ^ Гройтер, В.; Гаррити, Дж.; Хоксворт, ДЛ; Ян, Р.; Кирк, премьер-министр; Кнапп, С.; Макнил, Дж.; Мишель, Э.; Паттерсон, диджей; Пайл, Р.; Тиндалл, Би Джей (2011). «Проект Биокода (2011 г.): Принципы и правила, регулирующие наименование организмов». Таксон . 60 : 201–212. дои : 10.1002/tax.601019.
  19. ^ Хоксворт, DL (2011). «Представляем проект биокода (2011 г.)». Таксон . 60 (1): 199–200. дои : 10.1002/tax.601018.
  20. ^ DL Hawksworth (2011) BioCode 2011. Введение. http://www.bionomenclature.net/biocode2011.html
  21. ^ Вернер Гройтер (2011) BioCode 2011. Пояснительный пролог. http://www.bionomenclature.net/biocode2011.html
  22. ^ Орен, Аарон (2019). в Руководстве Берджи по систематике архей и бактерий (1-е изд.). Уайли. п. 1-12. дои : 10.1002/9781118960608.bm00004.pub2. ISBN 978-1-118-96060-8. S2CID  240836383.
  23. ^ де Кейроз, К.; Готье, Дж. (декабрь 1990 г.). «Филогения как центральный принцип таксономии: филогенетические определения названий таксонов» (PDF) . Систематическая зоология . 39 (4): 307–322. дои : 10.2307/2992353. JSTOR  2992353. Архивировано из оригинала (PDF) 13 ноября 2017 года.
  24. Лорен, Мишель (23 июля 2023 г.). «Филокод: логический результат тысячелетней эволюции биологической номенклатуры?». Зоологика Скрипта . 52 (6): 543–555. дои : 10.1111/zsc.12625. ISSN  0300-3256. S2CID  260224728.
  25. ^ Корлисс, Дж.О. (1995). «Амбирегнальные протисты и коды номенклатуры: краткий обзор проблемы и предлагаемых решений». Бюллетень зоологической номенклатуры . 52 : 11–17. дои : 10.5962/bhl.part.6717 .
  26. ^ (Макнил и др. 2012, Преамбула: 8)
  27. ^ Адл, С.М. и др. Разнообразие, номенклатура и систематика протистов. Систематическая биология , с. 684-689, 2007, [2].
  28. ^ Эльбрехтер, М. и др. Разработка программы исследований известковых динофлагеллят (Thoracosphaeraceae, Dinophyceae), включая номенклатурный обзор родовых названий. Таксон 57, с. 1289–1303, 2008, [3]
  29. ^ ab (Лар и др., 2012)
  30. ^ Дюбуа, А. (2006). Предлагаемые правила включения номинаций зоологических таксонов высшего ранга в Международный кодекс зоологической номенклатуры. 2. Предлагаемые Правила и их обоснование. Зоосистема , 28 (1): 165–258, [4].
  31. ^ Фрост, Д.Р. и др. (2006). Древо жизни земноводных. Бюллетень Американского музея естественной истории 297: 1–291, [5],
  32. ^ Дюбуа, Ален (2015). «Дуплостенсиональная номенклатурная система для высшей зоологической номенклатуры». Думерилия . 5 : 1–108.
  33. ^ Дюбуа, Ален; Олер, Аннемари; Пайрон, Р. Александр (26 февраля 2021 г.). «Новые концепции и методы филогенетической таксономии и номенклатуры в зоологии на примере новой ранжированной кладономии современных амфибий (Lissamphibia)». Мегатакса . 5 (1). дои : 10.11646/мегатакса.5.1.1 . ISSN  2703-3090.
  34. ^ Клюге, Нью-Джерси (2010). Окружные названия высших таксонов Hexapoda. Биономина, 1, 15-55, [6].
  35. ^ Клюге, Нью-Джерси (1999). «Система альтернативных номенклатур надвидовых таксонов. Линнеевские и постлиннеевские принципы систематики». Энтомологический обзор . 79 (2): 133–147.
  36. ^ (Макнил и др., 2012, статья 16)
  37. ^ (Турланд и др. 2018, статья 16)

Библиография

Внешние ссылки