Олигопептид , часто называемый просто пептидом ( олиго- , «несколько»), состоит из двух-двадцати аминокислот и может включать дипептиды , трипептиды , тетрапептиды и пентапептиды. Некоторые из основных классов встречающихся в природе олигопептидов включают аэругинозины , цианопептолины , микроцистины , микровиридины , микрогинины, анабаенопептины и цикламиды . Микроцистины лучше всего изучены из-за их потенциального токсичного воздействия на питьевую воду. [1] Обзор некоторых олигопептидов показал, что самый большой класс — это цианопептолины (40,1%), за которыми следуют микроцистины (13,4%). [2]
Производство
Классы олигопептидов продуцируются нерибосомальными пептид- синтазами (NRPS), за исключением цикламидов и микровиридинов, которые синтезируются рибосомными путями. [3]
Примеры
Примеры олигопептидов включают: [4]
Аманитины — циклические пептиды, взятые из карпофоров нескольких разных видов грибов. Они являются мощными ингибиторами РНК-полимеразы у большинства видов эукариот, предотвращая выработку мРНК и синтез белка. Эти пептиды важны для изучения транскрипции. Альфа-аманитин — основной токсин вида Amanita phalloides , ядовитый при попадании в организм человека или животных.
Антиболь – олигопептид, вырабатываемый различными бактериями, который действует как ингибитор протеазы .
Церулетид – специфический декапептид, обнаруженный в коже Hyla caerulea , австралийской зеленой древесной лягушки . По действию и составу церулетид имеет много общего с холецистокинином . Стимулирует секрецию желудка, желчи и поджелудочной железы; и определенные гладкие мышцы . Он используется для индукции панкреатита на экспериментальных моделях животных.
Глутатион — трипептид, выполняющий множество функций в клетках. Он конъюгирует с лекарствами, делая их более растворимыми для выведения, является кофактором некоторых ферментов, участвует в перегруппировке дисульфидных связей белка и восстанавливает пероксиды.
Лейпептины — группа ацилированных олигопептидов, продуцируемых актиномицетами, которые действуют как ингибиторы протеазы. Известно, что они в различной степени ингибируют трипсин , плазмин , калликреины , папаин и катепсины .
Нетропсин — основной олигопептид, выделенный из Streptomyces netropsis . Он цитотоксичен, и его сильное специфическое связывание с АТ-областями ДНК полезно для генетических исследований.
Пепстатины – N -ацилированные олигопептиды, выделенные из культуральных фильтратов актиномицетов, которые специфически ингибируют кислые протеазы, такие как пепсин и ренин.
Пептид Т - N -( N -( N (2)-( N -( N -( N -( N - D -Аланил L -серил)- L -треонил)- L -треонил) L -треонил)- L - аспарагинил)-L - тирозил) L -треонин. Гомология последовательности октапептида с белком оболочки ВИЧ gp120. Он может быть полезен в качестве противовирусного средства при терапии СПИДа. Основная пентапептидная последовательность, TTNYT, состоящая из аминокислот 4–8 в пептиде Т, представляет собой последовательность оболочки ВИЧ, необходимую для прикрепления к рецептору CD4.
Фаллоидин - очень токсичный полипептид, выделенный главным образом из Amanita phalloides (Agaricaceae) или смертника; вызывает смертельное поражение печени, почек и ЦНС при отравлении грибами; используется при изучении повреждений печени.
Тепротид — искусственный нонапептид (Pyr-Trp-Pro-Arg-Pro-Gln-Ile-Pro-Pro), который точно такой же, как пептид из яда змеи Bothrops jararaca. Он ингибирует кининазу II и ангиотензин I и был предложен в качестве антигипертензивного средства.
Тафцин - N (2)-((1-( N (2) -L -Треонил)-L - лизил)-L - пролил)-L - аргинин. Тетрапептид, вырабатываемый в селезенке путем ферментативного расщепления лейкофильного гамма-глобулина. Стимулирует фагоцитарную активность полиморфноядерных лейкоцитов крови и, в частности, нейтрофилов. Пептид расположен в Fd-фрагменте молекулы гамма-глобулина.
^ Мартин Велкер; Ханс фон Дёрен (2006). «Цианобактериальные пептиды - собственный комбинаторный биосинтез природы». Обзоры микробиологии FEMS . 30 (4): 530–563. дои : 10.1111/j.1574-6976.2006.00022.x . ПМИД 16774586.
^ Джордж Э. Члипала; Шуньянь Мо; Джимми Орджала (2011). «Хеморазнообразие пресноводных и наземных цианобактерий - источник для открытия лекарств». Цели Curr по борьбе с наркотиками . 12 (11): 1654–73. дои : 10.2174/138945011798109455. ПМЦ 3244969 . ПМИД 21561419.
^ Рамси Ага; Самуэль Сирес; Ларс Вермер; Антонио Кесада (2013). «Ограниченная стабильность микроцистинов в олигопептидных композициях Microcystis aeruginosa (цианобактерии): значение для определения хемотипов». Токсины . 5 (6): 1089–1104. дои : 10.3390/toxins5061089 . ПМЦ 3717771 . ПМИД 23744054.
^ Аргос, Патрик. «Исследование олигопептидов, связывающих домены в третичных структурах белков, и возможных кандидатов на общее слияние генов» (PDF) . Европейская лаборатория молекулярной биологии. Архивировано из оригинала (PDF) 28 июля 2014 года . Проверено 28 июля 2014 г.
Внешние ссылки
Найдите олигопептид в Викисловаре, бесплатном словаре.
