stringtranslate.com

Ксантомонас

Xanthomonas (от греч. xanthos – «желтый»; monas – «сущность») – род бактерий , многие из которых вызывают заболевания растений . [1] Существует по крайней мере 27 видов Xanthomonas spp. , связанных с растениями, которые в общей сложности заражают по крайней мере 400 видов растений. Различные виды обычно имеют определенный диапазон хозяев и/или тканей, а также стратегии колонизации. [1]

Таксономия

Род Xanthomonas был предметом многочисленных таксономических и филогенетических исследований и впервые был описан как Bacterium vesicatorium как патоген перца и томата в 1921 году. [2] Доусон [3] позже переклассифицировал бактерию как Xanthomonas campestris и предложил род Xanthomonas . [4] Xanthomonas был впервые описан как монотипный род , и дальнейшие исследования привели к разделению на две группы, A и B. [5] [6] Более поздняя работа с использованием гибридизации ДНК:ДНК послужила основой для общей классификации видов Xanthomonas . [7] [8] Другие инструменты, включая анализ мультилокусной последовательности и полиморфизм амплифицированных фрагментов, использовались для классификации внутри клад. [9] [10] Хотя предыдущие исследования иллюстрировали сложность рода Xanthomonas , недавние исследования, по-видимому, привели к более ясной картине. Недавно проведенный полногеномный анализ нескольких штаммов Xanthomonas в основном подтвердил предыдущие филогении. [11] Xanthomonas spp . эволюционно связаны с условно-патогенным человеческим патогеном Stenotrophomonas maltophilia , который ранее назывался Xanthomonas maltophilia . [12] Существует предложение реорганизовать патотипы банана и кукурузы Xanthomonas в соответствии с последними филогенетическими данными. [13]

Морфология и рост

Индивидуальные характеристики клеток включают:

Характеристики роста колонии включают:

Результаты биохимических и физиологических тестов:


Ксантомонасвозбудители болезней растений

Симптомы заболеваний, вызываемых Xanthomonas [1]

Виды Xanthomonas могут вызывать бактериальные пятна и ожоги листьев, стеблей и плодов у самых разных видов растений. [15] Патогенные виды демонстрируют высокую степень специфичности, и некоторые из них подразделяются на несколько патоваров — обозначение видов, основанное на специфичности хозяина.

Рак цитрусовых , вызываемый Xanthomonas citri subsp. citri, является экономически важным заболеванием многих видов цитрусовых (лайм, апельсин, лимон, памело и т. д.) [11]

Бактериальная пятнистость листьев на протяжении многих лет вызывала значительные потери урожая. Причинами этого заболевания являются Xanthomonas euvesicatoria и Xanthomonas perforans = [ Xanthomonas axonopodis (syn. campestris ) pv. vesicatoria ], Xanthomonas vesicatoria и Xanthomonas gardneri . В некоторых районах, где заражение начинается вскоре после пересадки, в результате этого заболевания может быть потерян весь урожай. [16] Xanthomonas campestris pv. punicae вызывает бактериальный ожог граната.

Бактериальная гниль риса, вызываемая Xanthomonas oryzae pv. oryzae , — это заболевание, распространенное во всем мире и особенно разрушительное в регионах Азии, где выращивают рис. [17]

Патогенез растений и борьба с болезнями

Жизненный цикл Xanthomonas spp. [1]

Основным путем передачи являются зараженные семена, сорняки, зараженные растительные остатки. Инфекция начинается с эпифитной стадии, то есть бактерии растут на воздушных тканях растения-хозяина (листья, плоды и т. д.), за которой следует эндофитная стадия, когда бактерии проникают и колонизируют ткани хозяина через раны или естественные отверстия. Когда популяция бактерий увеличивается, они снова появляются на поверхности и передаются в основном ветром, дождем или через семена или сельскохозяйственную технику, в то время как животные и насекомые-переносчики, по-видимому, играют второстепенную роль. [1]

Xanthomonas использует поверхностные полисахариды, адгезионные белки и пили типа IV для прикрепления к поверхности и может образовывать биопленки для выдерживания абиотических стрессов (УФ, засуха и т. д.). Xanthomonas вырабатывает ксантомонадины — желтые пигменты, которые защищают от радиации, вызванной естественным светом. Устойчивость к УФ в основном обеспечивается генами, связанными с окислительным стрессом и репарацией ДНК. Реакция на свет важна для патогенности этих бактерий и регулирует поверхностное прикрепление и образование биопленки. [1]

Xanthomonas обладают почти всеми известными системами секреции (типы I–VI), которые играют различные роли в жизненном цикле и цикле болезни, при этом система секреции типа III ( T3SS ) является ключевым фактором патогенности. [12] Обычно T3SS Xanthomonas вводит коктейль из 20–30 эффекторных белков, которые вмешиваются в иммунную систему растений и различные клеточные процессы хозяина. Многие из эффекторов, по-видимому, избыточны, поскольку отдельные делеции эффекторных генов не ухудшают вирулентность, однако мутации в аппарате T3SS оказывают сильное воздействие. Секреция эффекторов координируется с экспрессией других факторов вирулентности через общие регуляторные сети. [12] Было предложено, что репертуар эффекторов является определяющим фактором специфичности хозяина. [18] Xanthomonas активно уничтожает другие бактерии, используя систему секреции типа IV, и защищает себя от амеб, используя систему секреции типа VI. [19] [20] [1]

Для предотвращения инфекций ключевым моментом является ограничение проникновения бактерий. Некоторые устойчивые сорта определенных видов растений доступны, поскольку это может быть наиболее экономичным способом борьбы с этим заболеванием. Для химического контроля лучше всего подходят профилактические применения, чтобы снизить потенциал развития бактерий. Медьсодержащие продукты обеспечивают некоторую защиту наряду с полевыми антибиотиками, такими как окситетрациклин , который маркирован для использования на некоторых продовольственных культурах в Соединенных Штатах. Лечебное применение химических пестицидов может замедлить или сократить распространение бактерий, но не вылечит уже больные растения. [21] Важно ознакомиться с этикетками химических пестицидов при попытке борьбы с бактериальными заболеваниями, поскольку разные виды Xanthomonas могут по-разному реагировать на эти применения. Чрезмерная зависимость от методов химического контроля также может привести к выбору устойчивых изолятов, поэтому такие применения следует рассматривать как последнее средство.

Также рассматривается возможность использования бактериофагов, однако основными ограничивающими факторами являются их чувствительность к условиям окружающей среды и, в частности, к УФ-излучению. Полезные для растений микроорганизмы или ослабленные штаммы Xanthomonas тестируются в качестве биоконтроля, поскольку они могут конкурировать, занимая ту же нишу, и даже искоренять патогенный штамм. Создание видов растений, устойчивых к Xanthomonas, является еще одной потенциальной стратегией. [1]

Промышленное использование

Виды Xanthomonas производят съедобный полисахарид , называемый ксантановой камедью , который имеет широкий спектр промышленного применения, включая продукты питания, нефтепродукты и косметику. Ксантан также играет роль в цикле болезней Xanthomonas . [1] В частности, ксантановая камедь является одним из основных компонентов матрицы биопленки. Биопленки помогают этим бактериям выдерживать абиотические стрессы на поверхности листьев. Гены биосинтеза ксантановой камеди включают оперон камеди ( gumB-gymM ), кодирующий 12 ферментов. [1] Производство ксантана Xanthomonas spp ., которые процветают в сосудистых системах растений, может блокировать поток воды растения и, как следствие, вызывать увядание. [12]

Ксантомонасресурсы

Изоляты большинства видов Xanthomonas доступны в Национальной коллекции фитопатогенных бактерий в Соединенном Королевстве и других международных коллекциях культур, таких как ICMP в Новой Зеландии, CFBP во Франции и VKM в России. Также их можно получить в MTCC India.

Было секвенировано несколько геномов Xanthomonas , а дополнительные наборы данных/инструменты доступны на сайтах The Xanthomonas Resource [22] и PhytoBacExplorer. [23]

Смотрите также

Ссылки

  1. ^ abcdefghijkl An SQ, Potnis N, Dow M, Vorhölter FJ, He YQ, Becker A и др. (октябрь 2019 г.). «Механистические взгляды на адаптацию хозяина, вирулентность и эпидемиологию фитопатогена Xanthomonas». FEMS Microbiology Reviews . 44 (1): 1–32. doi : 10.1093/femsre/fuz024 . PMC  8042644. PMID  31578554 .
  2. ^ Doidge EM (1921). «Томатный рак». Annals of Applied Biology . 7 (4): 407–30. doi :10.1111/j.1744-7348.1921.tb05528.x.
  3. ^ Доусон WJ (1939). «О систематическом положении и родовых названиях грамотрицательных бактерий-возбудителей растений». Zentralblatt für Bakteriologie, Parasitenkunde, Infektionskrankheiten und Hygiene : 177–193.
  4. ^ Young JM, Dye DW, Bradbury JF, Panagopoulos CG, Robbs CF (1978). «Предлагаемая номенклатура и классификация фитопатогенных бактерий». New Zealand Journal of Agricultural Research . 21 (1): 153–177. Bibcode : 1978NZJAR..21..153Y. doi : 10.1080/00288233.1978.10427397 . ISSN  0028-8233.
  5. ^ Stall RE, Beaulieu C, Egel DS (1994). «Две генетически различные группы штаммов включены в Xanthomonas campestris pv. vesicatoria». Int J Syst Bacteriol . 44 : 47–53. doi : 10.1099/00207713-44-1-47 .
  6. ^ Vauterin L, Swings J, Kersters K, Gillis M, Mew TW, Schroth MN и др. (1990). «К улучшенной таксономии Xanthomonas». Int J Syst Bacteriol . 40 (3): 312–316. doi : 10.1099/00207713-40-3-312 .
  7. ^ Rademaker JL, Louws FJ, Schultz MH, Rossbach U, Vauterin L, Swings J, de Bruijn FJ (сентябрь 2005 г.). «Комплексная структура таксономии видов для штамма xanthomonas». Фитопатология . 95 (9): 1098–111. doi :10.1094/phyto-95-1098. PMID  18943308.
  8. ^ Vauterin L, Hoste B, Kersters K, Swings J (1995). «Переклассификация Xanthomonas». Int J Syst Evol Microbiol . 45 (3): 472–489. doi : 10.1099/00207713-45-3-472 .
  9. ^ Ah-You N, Gagnevin L, Grimont PA, Brisse S, Nesme X, Chiroleu F, et al. (Февраль 2009). «Полифазная характеристика ксантомонад, патогенных для представителей Anacardiaceae, и их связь с видами Xanthomonas». Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 59 (Pt 2): 306–18. doi : 10.1099/ijs.0.65453-0 . PMID  19196770.
  10. ^ Young JM, Wilkie JP, Park DS, Watson DR (2010). «Новозеландские штаммы фитопатогенных бактерий, классифицированные с помощью анализа многолокусной последовательности; предложение Xanthomonas dyei sp. nov». Plant Pathol . 59 (2): 270–281. doi : 10.1111/j.1365-3059.2009.02210.x .
  11. ^ ab Rodriguez-R LM, Grajales A, Arrieta-Ortiz ML, Salazar C, Restrepo S, Bernal A (март 2012 г.). "Филогения рода Xanthomonas на основе геномов". BMC Microbiology . 12 : 43. doi : 10.1186/1471-2180-12-43 . PMC 3359215. PMID  22443110 . 
  12. ^ abcd Büttner D, Bonas U (март 2010). «Регулирование и секреция факторов вирулентности Xanthomonas». FEMS Microbiology Reviews . 34 (2): 107–33. doi : 10.1111/j.1574-6976.2009.00192.x . PMID  19925633.
  13. ^ Studholme, David J.; Wicker, Emmanuel; Abrare, Sadik Muzemil; Aspin, Andrew; Bogdanove, Adam; Broders, Kirk; Dubrow, Zoe; Grant, Murray; Jones, Jeffrey B.; Karamura, Georgina; Lang, Jillian; Leach, Jan; Mahuku, George; Nakato, Gloria Valentine; Coutinho, Teresa; Smith, Julian; Bull, Carolee T. (2020). «Передача Xanthomonas campestris pv. arecae и X. campestris pv. musacearum в X. vasicola (Vauterin) как X. vasicola pv. arecae comb. nov. и X. vasicola pv. musacearum comb. nov. и описание X. vasicola pv. vasculorum pv. nov». Фитопатология . 110 (6). Американское фитопатологическое общество : 1153–1160. doi : 10.1094/phyto-03-19-0098-le . hdl : 10871/40555 . ISSN  0031-949X. PMID  31922946.
  14. ^ abc Schaad NW, Jones JB, Chun W (2001). «Лабораторное руководство по идентификации фитопатогенных бактерий, 3-е изд.»: 175–199. {{cite journal}}: Цитировать журнал требует |journal=( помощь )
  15. ^ Boch J, Bonas U (сентябрь 2010 г.). «Эффекторы семейства Xanthomonas AvrBs3 III типа: открытие и функция». Annual Review of Phytopathology . 48 : 419–36. doi :10.1146/annurev-phyto-080508-081936. PMID  19400638.
  16. ^ Ritchie DF (2000). «Бактериальная пятнистость перца и томата». The Plant Health Instructor . doi :10.1094/PHI-I-2000-1027-01.
  17. ^ Mew TW, Alvarez AM, Leach JE, Swings J (1993). «В центре внимания — бактериальная гниль риса». Plant Disease . 77 : 5–13. doi :10.1094/pd-77-0005.
  18. ^ Hajri A, Brin C, Hunault G, Lardeux F, Lemaire C, Manceau C, et al. (август 2009 г.). Yang CH (ред.). "Гипотеза "репертуара для репертуара": репертуары эффекторов третьего типа являются потенциальными детерминантами специфичности хозяина у Xanthomonas". PLOS ONE . ​​4 (8): e6632. Bibcode :2009PLoSO...4.6632H. doi : 10.1371/journal.pone.0006632 . PMC 2722093 . PMID  19680562. 
  19. ^ Souza DP, Oka GU, Alvarez-Martinez CE, Bisson-Filho AW, Dunger G, Hobeika L и др. (март 2015 г.). «Уничтожение бактерий с помощью системы секреции типа IV». Nature Communications . 6 (1): 6453. Bibcode :2015NatCo...6.6453S. doi : 10.1038/ncomms7453 . PMID  25743609.
  20. ^ Bayer-Santos E, Lima LD, Ceseti LM, Ratagami CY, de Santana ES, da Silva AM и др. (апрель 2018 г.). «Xanthomonas citri T6SS опосредует устойчивость к хищничеству Dictyostelium и регулируется фактором ECF σ и родственной Ser/Thr киназой». Environmental Microbiology . 20 (4): 1562–1575. Bibcode :2018EnvMi..20.1562B. doi :10.1111/1462-2920.14085. PMID  29488354. S2CID  3579518.
  21. ^ Эллис SD, Бем MJ, Коплин D (2008). «Бактериальные заболевания растений». Информационный бюллетень Университета штата Огайо .
  22. ^ Koebnik R (7 августа 2012 г.), Ресурс Xanthomonas
  23. ^ "PhytoBacExplorer". phytobacexplorer.warwick.ac.uk . Получено 20.10.2023 .