Пероксисомальный сигнал нацеливания

Узнаваемая аминокислотная последовательность

В биохимическом таргетинге белков сигнал пероксисомального таргетинга ( PTS ) представляет собой область пероксисомального белка , которую рецепторы распознают и связывают. Он отвечает за указание того, что белки, содержащие этот мотив, локализуются в пероксисоме. ^[1]

Обзор

Все пероксисомальные белки синтезируются в цитоплазме и должны быть направлены в пероксисому. ^[2] Первым шагом в этом процессе является связывание белка с рецептором. Затем рецептор направляет комплекс в пероксисому. Рецепторы распознают и связываются с областью пероксисомального белка, называемой сигналом нацеливания пероксисомы , или PTS.

Пероксисомы состоят из матрицы, окруженной специфической мембраной . Большинство белков пероксисомального матрикса содержат короткую последовательность, обычно три аминокислоты на крайнем карбоксильном хвосте белка, которая служит PTS. Прототипическая последовательность (существует много вариаций) — серин — лизин — лейцин (-SKL в однобуквенном аминокислотном коде ). ^{[2] [3]} Этот мотив и его вариации известны как PTS1, а рецептор называется рецептором PTS1.

Было обнаружено, что рецептор PTS1 кодируется геном PEX5 . ^[4] PEX5 импортирует свернутые белки в пероксисому, перемещаясь между пероксисомой и цитозолем. ^[2] PEX5 взаимодействует с большим количеством других белков, включая Pex8p, 10p, 12p, 13p, 14p.

Несколько белков пероксисомального матрикса имеют другую и менее консервативную последовательность на своих аминоконцах. Этот сигнал PTS2 распознается рецептором PTS2 , кодируемым геном PEX7.

«PEX» относится к группе генов, которые были идентифицированы как важные для пероксисомального синтеза. Числовые обозначения, такие как PEX5, обычно относятся к порядку, в котором они были впервые обнаружены.

Отдельный мотив используется для белков, предназначенных для пероксисомальной мембраны, называемый мотивом «mPTS», который определен хуже и может состоять из прерывистых субдоменов. ^[2] Один из них обычно представляет собой кластер основных аминокислот ( аргининов и лизинов) внутри петли белка (т. е. между мембранными промежутками), которая будет обращена к матрице. Рецептор mPTS является продуктом PEX19 . ^[2]

Ссылки

1. "Идентификация пероксисомального целевого сигнала на карбоксильном конце люциферазы светлячков -- Gould et al. 105 (6): 2923 -- The Journal of Cell Biology". www.jcb.org . Получено 13 мая 2008 г.
2. Поллард, Томас Д.; Эрншоу, Уильям К.; Липпинкотт-Шварц, Дженнифер; Джонсон, Грэм Т., ред. (2017-01-01), "Глава 18 - Посттрансляционное нацеливание белков", Cell Biology (третье издание) , Elsevier, стр. 303–315, doi :10.1016/b978-0-323-34126-4.00018-9, ISBN 978-0-323-34126-4, получено 2020-11-23
3. Aubourg, Patrick; Wanders, Ronald (2013-01-01), Dulac, Olivier; Lassonde, Maryse; Sarnat, Harvey B. (ред.), "Глава 163 - Пероксисомальные расстройства", Handbook of Clinical Neurology , Pediatric Neurology Part III, 113 , Elsevier: 1593–1609, doi :10.1016/b978-0-444-59565-2.00028-9, ISBN 9780444595652, PMID  23622381, S2CID  13023065 , получено 2020-11-23
4. Kiel JA, Emmrich K, Meyer HE, Kunau WH (январь 2005 г.). «Убиквитинирование рецептора пероксисомального целевого сигнала типа 1, Pex5p, предполагает наличие механизма контроля качества во время импорта белка пероксисомального матрикса». J. Biol. Chem . 280 (3): 1921–30. doi : 10.1074/jbc.M403632200 . PMID  15536088.

Внешние ссылки

Класс мотива ресурса эукариотического линейного мотива TRG_PTS1