stringtranslate.com

Полимерная основа

Определение ИЮПАК

Главная цепь или остов
— линейная цепь, по отношению к которой все остальные цепи, длинные или короткие, или и те, и другие,
могут рассматриваться как подвесные.

Примечание : Если две или более цепей
можно в равной степени считать основной цепью,
выбирается та, которая приводит к простейшему представлению молекулы
. [1]

В полимерной науке полимерная цепь или просто скелет полимера является главной цепью полимера. Полимеры часто классифицируются в соответствии с элементами в главных цепях. Характер скелета, т. е. его гибкость, определяет свойства полимера (такие как температура стеклования ). Например, в полисилоксанах ( силикон) основная цепь очень гибкая, что приводит к очень низкой температуре стеклования -123 °C (-189 °F; 150 K). [2] Полимеры с жесткими скелетами склонны к кристаллизации (например, политиофены ) в тонких пленках и в растворе . Кристаллизация, в свою очередь, влияет на оптические свойства полимеров, их оптическую запрещенную зону и электронные уровни. [3]

Органические полимеры

Образование полистирола — полимера с органической основой.

Обычные синтетические полимеры имеют основные цепи, состоящие из углерода, т. е. CCCC.... Примерами являются полиолефины , такие как полиэтилен ((CH 2 CH 2 ) n ) и многие замещенные производные ((CH 2 CH(R)) n ), такие как полистирол (R = C 6 H 5 ), полипропилен (R = CH 3 ) и акрилаты (R = CO 2 R').

Другие основные классы органических полимеров - это полиэфиры и полиамиды . Они имеют соответственно группы -C(O)-O- и -C(O)-NH- в своих основных цепях в дополнение к цепям углерода. Основные коммерческие продукты - полиэтилентерефталат ("ПЭТ"), ((C 6 H 4 CO 2 C 2 H 4 OC(O)) n ) и нейлон-6 ((NH(CH 2 ) 5 C(O)) n ).

Неорганические полимеры

Полидиметилсилоксан классифицируется как « неорганический полимер », поскольку в его основной цепи отсутствует углерод.

Силоксаны являются ярким примером неорганического полимера, хотя они имеют обширные органические заместители. Их обратная связь состоит из чередующихся атомов кремния и кислорода, то есть Si-O-Si-O... Атомы кремния несут два заместителя, обычно метил , как в случае полидиметилсилоксана . Некоторые необычные, но показательные неорганические полимеры включают политиазил ((SN)x) с чередующимися атомами S и N и полифосфаты ((PO 3 ) n ).

Биополимеры

Основные семейства биополимеров — это полисахариды (углеводы), пептиды и полинуклеотиды . Известно много вариантов каждого из них. [4]

Белки и пептиды

Белки характеризуются амидными связями (-N(H)-C(O)-), образованными конденсацией аминокислот . Последовательность аминокислот в полипептидном остове известна как первичная структура белка. Как и почти все полимеры, белок сворачивается и скручивается, образуя вторичную структуру , которая укрепляется водородными связями между карбонильными кислородами и амидными водородами в остове, то есть C=O---HN. Дальнейшие взаимодействия между остатками отдельных аминокислот формируют третичную структуру белка . По этой причине первичная структура аминокислот в полипептидном остове является картой окончательной структуры белка, и, следовательно, указывает на его биологическую функцию. [5] [4] Пространственные положения атомов остова могут быть реконструированы из положений альфа-углеродов с использованием вычислительных инструментов для реконструкции остова. [6]

Упрощенный пример конденсации, показывающий классификацию альфа и бета . Глюкоза и фруктоза образуют сахарозу . Синтез гликогена в организме осуществляется ферментом гликогенсинтазой , которая использует уходящую группу уридиндифосфата (УДФ).

Углеводы

Углеводы возникают путем конденсации моносахаридов , таких как глюкоза . Полимеры можно разделить на олигосахариды (до 10 остатков) и полисахариды (до примерно 50 000 остатков). Основная цепь характеризуется эфирной связью между отдельными моносахаридами. Эта связь называется гликозидной связью . [7] Эти основные цепи могут быть неразветвленными (содержащими одну линейную цепь) или разветвленными ( содержащими несколько цепей). Гликозидные связи обозначаются как альфа или бета в зависимости от относительной стереохимии аномерного (или наиболее окисленного ) углерода. В проекции Фишера , если гликозидная связь находится на той же стороне или грани, что и углерод 6 обычного биологического сахарида, углевод обозначается как бета , а если связь находится на противоположной стороне, то она обозначается как альфа . В традиционной проекции " структуры кресла ", если связь находится в той же плоскости (экваториальной или аксиальной), что и углерод 6, она обозначается как бета , а в противоположной плоскости обозначается как альфа . Это иллюстрируется сахарозой (столовый сахар), которая содержит связь, которая является альфа- связью с глюкозой и бета- связью с фруктозой . Как правило, углеводы, которые расщепляются нашим организмом, являются альфа -связанными (пример: гликоген) , а те, которые имеют структурную функцию, являются бета -связанными (пример: целлюлоза ). [4] [8]

Нуклеиновые кислоты

Конденсация аденина и гуанина приводит к образованию фосфодиэфирной связи , трифосфорилированная рибоза входящего нуклеотида подвергается атаке 3'- гидроксила полимера, высвобождая пирофосфат .

Дезоксирибонуклеиновая кислота (ДНК) и рибонуклеиновая кислота (РНК) являются основными примерами полинуклеотидов . Они возникают путем конденсации нуклеотидов. Их остовы образуются путем конденсации гидроксильной группы на рибозе с фосфатной группой на другой рибозе. Эта связь называется фосфодиэфирной связью . Конденсация катализируется ферментами, называемыми полимеразами . ДНК и РНК могут иметь длину в миллионы нуклеотидов, что обеспечивает генетическое разнообразие жизни. Основания выступают из пентозофосфатного полимерного остова и попарно связаны водородными связями со своими комплементарными партнерами (A с T и G с C). Это создает двойную спираль с пентозофосфатными остовами с обеих сторон, таким образом образуя вторичную структуру . [9] [4] [10]

Ссылки

  1. ^ IUPAC , Compendium of Chemical Terminology , 2nd ed. («Золотая книга») (1997). Онлайн-исправленная версия: (2006–) «главная цепь (остов) полимера». doi :10.1351/goldbook.M03694
  2. ^ "Полимеры". Архивировано из оригинала 2015-10-02 . Получено 2015-09-17 .
  3. ^ Brabec, CJ; Winder, C.; Scharber, MC; Sarıçiftçi, SN ; Hummelen, JC; Svensson, M.; Andersson, MR (2001). "Влияние беспорядка на фотоиндуцированные возбуждения в фенилзамещенных политиофенах" (PDF) . Journal of Chemical Physics . 115 (15): 7235. Bibcode : 2001JChPh.115.7235B. doi : 10.1063/1.1404984.
  4. ^ abcd Voet, Donald; Voet, Judith G.; Pratt, Charlotte W. (2016). Основы биохимии: жизнь на молекулярном уровне (5-е изд.). Wiley. ISBN 978-1-118-91840-1.В
  5. ^ Берг Дж. М., Тимочко Дж. Л., Страйер Л. (2002). "3.2 Первичная структура: аминокислоты связаны пептидными связями с образованием полипептидных цепей". Биохимия (5-е изд.). WH Freeman. ISBN 0-7167-3051-0. НБК22364.
  6. ^ Бадачевска-Давид, Александра Э.; Колински, Анджей; Кмиецик, Себастьян (2020). «Вычислительная реконструкция атомистических структур белков из крупнозернистых моделей». Computational and Structural Biotechnology Journal . 18 : 162–176. doi : 10.1016/j.csbj.2019.12.007. ISSN  2001-0370. PMC 6961067. PMID  31969975. 
  7. ^ Бушиаццо, Алехандро (2004). «Кристаллическая структура гликогенсинтазы: гомологичные ферменты катализируют синтез и деградацию гликогена». Журнал EMBO . 23 (16): 3196–3205. doi :10.1038/sj.emboj.7600324. PMC 514502. PMID 15272305  . 
  8. ^ Bertozzi CR, Rabuka D (2009). «Структурная основа разнообразия гликанов». В Varki A, Cummings RD, Esko JD, et al. (ред.). Essentials of Glycobiology (2-е изд.). Cold Spring Harbor Laboratory Press. ISBN 9780879697709. PMID  20301274.
  9. ^ Альбертс Б., Джонсон А., Льюис Дж. и др. (2002). «Механизмы репликации ДНК». Молекулярная биология клетки (4-е изд.). Garland Science. ISBN 0-8153-3218-1. НБК26850.
  10. ^ Lodish H, Berk A, Zipursky SL, et al. (2000). "4.1, Структура нуклеиновых кислот". Молекулярная клеточная биология (4-е изд.). WH Freeman. ISBN 0-7167-3136-3. НБК21514.

Смотрите также