stringtranslate.com

Нуклеозид

Два соответствующих нуклеозида, дезоксирибонуклеозид , дезоксиаденозин, и рибонуклеозид , аденозин. Молекулярное представление в виде линии-угла подразумевает атомы углерода в каждом углу, каждый с достаточным количеством атомов водорода, чтобы заполнить его валентность с четырьмя связями.

Нуклеозиды — это гликозиламины , которые можно рассматривать как нуклеотиды без фосфатной группы . Нуклеозид состоит просто из нуклеиновой основы (также называемой азотистым основанием) и пятиуглеродного сахара ( рибозы или 2'-дезоксирибозы), тогда как нуклеотид состоит из нуклеиновой основы, пятиуглеродного сахара и одной или нескольких фосфатных групп. В нуклеозиде аномерный углерод связан через гликозидную связь с N9 пурина или N1 пиримидина . Нуклеотиды — это молекулярные строительные блоки ДНК и РНК .

Список нуклеозидов и соответствующих им азотистых оснований

В этот список не включены модифицированные азотистые основания и соответствующие нуклеозиды.

Каждое химическое вещество имеет короткий символ, полезный, когда химическое семейство ясно из контекста, и более длинный символ, если требуется дальнейшее устранение неоднозначности. Например, длинные последовательности азотистых оснований в геномах обычно описываются символами CATG, а не Cyt-Ade-Thy-Gua (см. Последовательность нуклеиновой кислоты § Обозначение ).

Источники

Нуклеозиды могут быть получены из нуклеотидов de novo , особенно в печени, но они более обильно поставляются через прием и переваривание нуклеиновых кислот в рационе, при этом нуклеотидазы расщепляют нуклеотиды (такие как тимидинмонофосфат ) на нуклеозиды (такие как тимидин ) и фосфат. Нуклеозиды, в свою очередь, впоследствии расщепляются в просвете пищеварительной системы нуклеозидазами на нуклеиновые основания и рибозу или дезоксирибозу. Кроме того, нуклеотиды могут расщепляться внутри клетки на азотистые основания и рибозо-1-фосфат или дезоксирибозо-1-фосфат.

Использование в медицине и технике

В медицине несколько аналогов нуклеозидов используются в качестве противовирусных или противораковых средств. [1] [2] [3] [4] Вирусная полимераза включает эти соединения с неканоническими основаниями. Эти соединения активируются в клетках, превращаясь в нуклеотиды. Их вводят в виде нуклеозидов, поскольку заряженные нуклеотиды не могут легко пересекать клеточные мембраны.

В молекулярной биологии существует несколько аналогов сахарного остова. Из-за низкой стабильности РНК, которая склонна к гидролизу, используются несколько более стабильных альтернативных аналогов нуклеозидов/нуклеотидов, которые правильно связываются с РНК. Это достигается использованием другого сахара остова. К этим аналогам относятся закрытые нуклеиновые кислоты (LNA), морфолино и пептидные нуклеиновые кислоты (PNA).

При секвенировании используются дидезоксинуклеотиды . Эти нуклеотиды обладают неканоническим сахаром дидезоксирибозой, в которой отсутствует 3'-гидроксильная группа (которая принимает фосфат). ДНК-полимеразы не могут отличить их от обычных дезоксирибонуклеотидов, но при включении дидезоксинуклеотид не может связаться со следующим основанием, и цепь обрывается.

Пребиотический синтез рибонуклеозидов

Чтобы понять, как возникла жизнь , необходимо знание химических путей, которые позволяют формировать ключевые строительные блоки жизни в вероятных пребиотических условиях . Согласно гипотезе мира РНК, в примитивном бульоне присутствовали свободно плавающие рибонуклеозиды и рибонуклеотиды. Молекулы, столь сложные, как РНК, должны были возникнуть из небольших молекул, реакционная способность которых регулировалась физико-химическими процессами. РНК состоит из пуриновых и пиримидиновых нуклеотидов, оба из которых необходимы для надежной передачи информации, и, таким образом, дарвиновского естественного отбора и эволюции . Нам и др. [5] продемонстрировали прямую конденсацию азотистых оснований с рибозой с образованием рибонуклеозидов в водных микрокаплях, что является ключевым шагом, ведущим к образованию РНК. Кроме того, вероятный пребиотический процесс синтеза пиримидиновых и пуриновых рибонуклеозидов и рибонуклеотидов с использованием циклов «влажный-сухой» был представлен Беккером и др. [6].

Смотрите также

Ссылки

  1. ^ Рамеш, Дипти; Виджаякумар, Баладжи Гоуривел; Каннан, Тараниккарасу (декабрь 2020 г.). «Терапевтический потенциал урацила и его производных в борьбе с патогенными и физиологическими расстройствами». Европейский журнал медицинской химии . 207 : 112801. doi : 10.1016/j.ejmech.2020.112801. PMID  32927231. S2CID  221724578.
  2. ^ Гальмарини, Карлос М.; Макки, Джон Р.; Дюмонте, Чарльз (2002). «Аналоги нуклеозидов и азотистые основания в лечении рака». The Lancet Oncology . 3 (7): 415–424. doi :10.1016/S1470-2045(02)00788-X. PMID  12142171.
  3. ^ Jordheim, Lars Petter; Durantel, David; Zoulim, Fabien; Dumontet, Charles (2013). «Достижения в разработке аналогов нуклеозидов и нуклеотидов для лечения рака и вирусных заболеваний». Nature Reviews Drug Discovery . 12 (6): 447–464. doi :10.1038/nrd4010. PMID  23722347. S2CID  39842610.
  4. ^ Ramesh, Deepthi; Vijayakumar, Balaji Gowrivel; Kannan, Tharanikkarasu (12 февраля 2021 г.). «Достижения в области аналогов нуклеозидов и нуклеотидов в борьбе с инфекциями вируса иммунодефицита человека и вируса гепатита». ChemMedChem . 16 (9): 1403–1419. doi :10.1002/cmdc.202000849. PMID  33427377. S2CID  231576801. Архивировано из оригинала 14 декабря 2021 г. Получено 13 марта 2021 г.
  5. ^ Нам, Инхо; Нам, Хонг Гил; Заре, Ричард Н. (2018-01-02). «Абиотический синтез пуриновых и пиримидиновых рибонуклеозидов в водных микрокаплях». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 115 (1): 36–40. Bibcode : 2018PNAS..115...36N. doi : 10.1073/pnas.1718559115 . PMC 5776833. PMID  29255025. 
  6. ^ Беккер, Сидней; Фельдманн, Йонас; Видеманн, Стефан; Окамура, Хиденори; Шнайдер, Кристина; Иван, Катарина; Крисп, Энтони; Росса, Мартин; Аматов, Тынчтык; Карелл, Томас (2019-10-04). "Unified prebiotically plausible synthesis of pyrimidine and purine RNA ribonucleotides" (PDF) . Science . 366 (6461): 76–82. Bibcode :2019Sci...366...76B. doi :10.1126/science.aax2747. PMID  31604305. S2CID  203719976. Архивировано (PDF) из оригинала 2022-10-09.

Внешние ссылки