stringtranslate.com

Мозговые Карты

Окрашенный по Нисслю мозг Chlorocebus aethiops на сайте BrainMaps.org.
a : выбор из нескольких сотен коронарных срезов .
b : показан определенный коронарный срез.
c : увеличенное изображение островковой коры .
d : еще большее увеличение островковой коры. Видны окрашенные по Нисслю нейроны . Доступ к этому срезу можно получить по этой ссылке. [1]

BrainMaps — это финансируемый Национальным институтом здравоохранения интерактивный масштабируемый цифровой атлас мозга высокого разрешения и виртуальный микроскоп , который основан на более чем 140 миллионах мегапикселей (140 терабайт) отсканированных изображений серийных срезов мозга как приматов, так и неприматов и интегрирован с высокоскоростной базой данных для запроса и извлечения данных о структуре и функциях мозга через Интернет.

В настоящее время представлены полные наборы данных атласа мозга 16 видов; некоторые из них: Macaca mulatta , Chlorocebus aethiops , Felis silvestris catus , Mus musculus , Rattus norvegicus и Tyto alba .

Главным исследователем проекта с 2005 по 2011 год был нейробиолог из Калифорнийского университета в Дэвисе Тед Джонс , после чего эту роль взял на себя У. Мартин Усрей.

Описание

BrainMaps использует форматы изображений с различным разрешением для представления больших изображений мозга, а также интерфейс пользователя dHTML/Javascript для навигации по изображениям. Оба эти подхода аналогичны принципам работы Google Maps с геопространственными данными.

BrainMaps — одна из самых крупных онлайн-баз данных нейронауки и хранилищ изображений, а также атлас всего мозга с самым высоким разрешением из когда-либо созданных. [2] [3]

Расширения для интерактивной 3D-визуализации были разработаны с помощью настольных приложений на основе OpenGL . [4] Свободно доступные инструменты анализа изображений позволяют конечным пользователям извлекать данные из онлайн-изображений на субнейронном уровне. BrainMaps использовался как в исследовательских [5] [6] , так и в дидактических целях.

Дополнительные изображения

Смотрите также

Ссылки

  1. ^ Условия использования, BrainMaps.org Дата доступа: 2014-02-11
  2. ^ Микула, С.; Троттс И.; Стоун Дж. М.; Джонс Э. Г. (2007). «Интернет-совместимое картирование мозга высокого разрешения и виртуальная микроскопия». NeuroImage . 35 (1): 9–15. doi :10.1016/j.neuroimage.2006.11.053. PMC  1890021 . PMID  17229579.
  3. ^ Микула, С.; Стоун Дж. М.; Джонс Э. Г. (2008). «BrainMaps.org — интерактивные цифровые атласы мозга высокого разрешения и виртуальная микроскопия». Brains Minds Media . 3 : bmm1426. PMC 2614326. PMID 19129928  . 
  4. ^ Троттс, И; Микула С; Джонс Э.Г. (2007). «Интерактивная визуализация стеков изображений с различным разрешением в 3D». NeuroImage . 35 (3): 1038–43. doi :10.1016/j.neuroimage.2007.01.013. PMC 2492583 . PMID  17336095. 
  5. ^ Mikula, S; Manger PR; Jones EG (2007). «Таламус однопроходных: цито- и миелоархитектура и химическая нейроанатомия». Philos Trans R Soc Lond B Biol Sci . 363 (1502): 2415–40. doi :10.1098/rstb.2007.2133. PMC 2606803. PMID  17553780 . 
  6. ^ Микула, С.; Пэрриш СК; Триммер ДЖ.С.; Джонс Э.Г. (2009). «Полная трехмерная визуализация стриосом приматов с помощью иммуноокрашивания KChIP1». J Comp Neurol . 514 (5): 507–17. doi :10.1002/cne.22051. PMC 2737266. PMID  19350670 . 

Внешние ссылки

На Викискладе есть медиафайлы по теме BrainMaps .