Сайт с маркировкой последовательности (или STS ) представляет собой короткую (от 200 до 500 пар оснований) последовательность ДНК , которая встречается в геноме один раз и местоположение и последовательность оснований которой известны. [1]
STS можно легко обнаружить с помощью полимеразной цепной реакции (ПЦР) с использованием специфических праймеров . По этой причине они полезны для построения генетических и физических карт на основе данных о последовательностях, полученных из многих различных лабораторий. Они служат ориентирами на развивающейся физической карте генома.
Когда локусы STS содержат генетические полиморфизмы (например, полиморфизмы длины простой последовательности, SSLP , полиморфизмы отдельных нуклеотидов), они становятся ценными генетическими маркерами, то есть локусами, которые можно использовать для различения людей.
Они используются в дробовом секвенировании , в частности, для облегчения сборки последовательности .
STS очень полезны для обнаружения микроделеций в некоторых генах. Например, некоторые STS могут использоваться в скрининге методом ПЦР для обнаружения микроделеций в генах азооспермии (AZF) у бесплодных мужчин.