Субвирусный агент, репликация которого зависит от вируса-помощника
Сателлит — это субвирусный агент , репликация которого зависит от коинфекции клетки-хозяина с вирусом-помощником . Сателлиты можно разделить на два основных класса: вирусы-сателлиты и нуклеиновые кислоты-сателлиты . [1] Вирусы -сателлиты , которые чаще всего ассоциируются с растениями, также встречаются у млекопитающих, членистоногих и бактерий. Они кодируют структурные белки, чтобы заключить в них свой генетический материал, который, таким образом, отличается от структурных белков вирусов-помощников. [1] Нуклеиновые кислоты -сателлиты , напротив, не кодируют свои собственные структурные белки, а вместо этого инкапсулируются белками, кодируемыми вирусами-помощниками. [1] [2] Геномы сателлитов варьируются от 359 нуклеотидов в длину для РНК вируса кольцевой пятнистости табака-сателлита (STobRV). [3]
Большинство вирусов обладают способностью использовать ферменты хозяина или свой собственный репликационный аппарат для независимой репликации собственной вирусной РНК. Сателлиты, напротив, полностью зависят от вируса-помощника для репликации. Симбиотическая связь между сателлитом и вирусом-помощником для катализа репликации генома сателлита также зависит от хозяина, который предоставляет компоненты, такие как репликазы [4], для осуществления репликации. [5]
Вирус-сателлит мамавируса , который подавляет репликацию своего хозяина, был назван вирофагом . [6] Однако использование этого термина остается спорным из-за отсутствия фундаментальных различий между вирофагами и классическими вирусами-сателлитами. [7]
История и открытия
Вирус некроза табака был вирусом, который привел к открытию первого вируса-сателлита в 1962 году. Ученые обнаружили, что первый сателлит имел компоненты для создания собственной белковой оболочки. Несколько лет спустя, в 1969 году, ученые обнаружили еще одну симбиотическую связь с неповирусом кольцевой пятнистости табака (TobRV) и другим вирусом-сателлитом. [8] Говорят, что возникновение сателлитной РНК произошло либо из генома хозяина, либо из его коинфицирующих агентов, а также любых векторов, ведущих к передаче. [9]
Вирус-сателлит, важный для здоровья человека, который демонстрирует необходимость коинфекции для репликации и заражения хозяина, — это вирус, вызывающий гепатит D. Гепатит D или дельта-вирус (HDV) был открыт в 1977 году Марио Риццетто [10] и отличается от гепатита A, B и C, поскольку для репликации и заражения клеток печени ему требуются вирусные частицы вируса гепатита B (HBV). HBV обеспечивает поверхностный антиген HBsAg , который используется HDV для создания суперинфекции, приводящей к печеночной недостаточности. [11] HDV встречается по всему миру, но наиболее распространен в Африке, на Ближнем Востоке и на юге Италии. [11]
Спутник в сравнении с вирусом
Классификация
Классификация субвирусных агентов продолжается. Ниже используется схема для субвирусных агентов из отчета ICTV 2011 года. [1] Многим таксонам с тех пор были присвоены более формальные названия в 2019 году, поэтому они включены, когда это возможно.
Вирусы-сателлиты
Некоторым вирусам-сателлитам был присвоен таксон. Ниже приведены результаты предложения 2015 года, которое с тех пор было принято (Taxoprop 2015.009a). [12]
- Вирусы -сателлиты с одноцепочечной РНК
- (не назначено ни одной семье)
- Семейство Sarthroviridae
- (безымянный род) - комменсальный X-вирус Nilaparvata lugens.
- (род неизвестен) – Вирус-спутник хронического паралича пчел
- Вирусы-сателлиты с двухцепочечной ДНК
- Вирусы-сателлиты с одноцепочечной ДНК
Сателлитные нуклеиновые кислоты
Нижеследующее может быть неполным в своем охвате ICTV. Номенклатура для сателлитных РНК заключается в добавлении префикса «sat» к названию вируса-хозяина.
Сателлитные нуклеиновые кислоты напоминают сателлитные нуклеиновые кислоты, поскольку они реплицируются с помощью вирусов-помощников. Однако они отличаются тем, что могут кодировать функции, которые могут способствовать успеху их вирусов-помощников; хотя их иногда считают геномными элементами их вирусов-помощников, они не всегда обнаруживаются внутри их вирусов-помощников.
- Одноцепочечные сателлитные ДНК
- Двухцепочечные сателлитные РНК
- Вирус-сателлит Saccharomyces cerevisiae M
- Вирус-сателлит Saccharomyces cerevisiae M1
- Вирус-сателлит Saccharomyces cerevisiae M2
- Вирус-сателлит Saccharomyces cerevisiae M28
- Ustilago maydis вирус H спутник M
- Ustilago maydis M-P1 вирус спутник
- Ustilago maydis M-P4 вирус спутник
- Ustilago maydis M-P6 вирус спутник
- Спутник вируса Trichomonas vaginalis T1
- Partitiviridae ассоциированные вирусные спутники
- Вирус Zygosaccharomyces bailii сателлит М / Zybavirus balii сателлит М
- Одноцепочечные сателлитные РНК
- Большие линейные сателлитные РНК
- Большая сателлитная РНК вируса мозаики арабиса
- Сателлитная РНК вируса бамбуковой мозаики (satBaMV)
- Большая сателлитная РНК вируса желтой крапчатости цикория
- Сателлитная РНК латентного вируса виноградной лозы в Болгарии
- РНК-сателлит вируса веерообразного винограда
- РНК-сателлит вируса латентной кольцевой пятнистости миробалана
- РНК-сателлит вируса черного кольца томата
- РНК-сателлит вируса кольцевой пятнистости свеклы
- Вирус некротического желтого пятна на жилках свеклы РНК5
- Малые линейные сателлитные РНК
- РНК-сателлит вируса мозаики огурца
- РНК-сателлит вируса кольцевой пятнистости цимбидиума
- Спутниковая РНК вируса мозаики гороха
- РНК-сателлит вируса розетковидной формы арахиса
- Малая сателлитная РНК вируса мозаики паники
- РНК-сателлит вируса арахисовой карликовости
- РНК-сателлит вируса морщинистости репы
- РНК-сателлит вируса кустистой карликовости томата, B10
- РНК-сателлит вируса кустистой карликовости томата, B1
- РНК-сателлит вируса кустистости табака
- Кольцевые сателлитные РНК или « вирусоиды »
- Малая сателлитная РНК вируса мозаики арабиса
- РНК-сателлит вируса кольцевой пятнистости табака (satTRsV) выше двух образует кладу
- РНК-сателлит вируса желтой крапчатости цикория (satCYMoV)
- РНК-сателлит вируса крапчатости Solanum nodiflorum
- РНК-сателлит вируса подземной крапчатости клевера
- РНК-сателлит вируса бархатной табачной крапчатости, указанная выше, образует кладу
- РНК-сателлит вируса транзиторной полосатости люцерны (satLTSV)
- РНК-сателлит вируса желтой карликовости злаков-RPV
- Вишневая маленькая круглая вироидоподобная РНК
- Царство Ribozyviria / Семейство Kolmioviridae – дельтавирусоподобные сателлитные РНК
- РНК, ассоциированные с полеровирусом
Смотрите также
Ссылки
- ^ abcd "3 – Спутники и другие вирусозависимые нуклеиновые кислоты – Субвирусные агенты – Субвирусные агенты (2011)". Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV) .(более новая версия; не упоминает спутники [ мертвая ссылка ] )
- ^ Баез, Джон. «Субклеточные формы жизни». Калифорнийский университет, Риверсайд . Получено 4 июня 2020 г.
- ^ Уэйн Л. Герлах; Джамал М. Бузаян; Ирвинг Р. Шнайдер; Джордж Брюнинг (1986). «Сателлитная РНК вируса кольцевой пятнистости табака: биологическая активность клонов ДНК и их транскриптов in vitro». Вирусология . 151 (2): 172–185. doi :10.1016/0042-6822(86)90040-1. PMID 18640636.
- ^ Ху, Чунг-Чи; Сюй, Яу-Хейу; Линь, На-Шэн (18 декабря 2009 г.). «Сателлитные РНК и сателлитные вирусы растений». Вирусы . 1 (3): 1325–1350. дои : 10.3390/v1031325 . ПМК 3185516 . ПМИД 21994595.
- ^ Крупович, Март; Кун, Йенс Х.; Фишер, Маттиас Г. (1 января 2016 г.). «Система классификации вирофагов и вирусов-сателлитов». Архивы вирусологии . 161 (1): 233–247. doi : 10.1007/s00705-015-2622-9 . hdl : 11858/00-001M-0000-0028-DC34-F . ISSN 0304-8608. PMID 26446887.
- ^ Бернар Ла Скола; Кристель Десню; Изабель Панье; Кэтрин Роберт; Лина Баррасси; Гислен Фурнус; Мишель Мерша; Мари Сюзан-Монти; Патрик Фортер ; Евгений Кунин и Дидье Рауль (2008). «Вирофаг как уникальный паразит гигантского мимивируса». Природа . 455 (7205): 100–4. Бибкод :2008Natur.455..100L. дои : 10.1038/nature07218. PMID 18690211. S2CID 4422249.
- ^ Крупович М; Цвиркайте-Крупович В (2011). «Вирофаги или вирусы-сателлиты?». Nat Rev Microbiol . 9 (11): 762–763. doi :10.1038/nrmicro2676. PMID 22016897. S2CID 41271832.
- ^ Руссинк, М. Дж.; Слит, Д.; Палукайтис, П. (июнь 1992 г.). «Сателлитные РНК вирусов растений: структуры и биологические эффекты». Microbiological Reviews . 56 (2): 265–279. doi :10.1128/MMBR.56.2.265-279.1992. ISSN 0146-0749. PMC 372867 . PMID 1620065.
- ^ Ху, Чунг-Чи; Сю, Яу-Хэйу; Линь, На-Шенг (2009). «Сателлитные РНК и сателлитные вирусы растений». Вирусы . 1 (3): 1325–1350. doi : 10.3390/v1031325 . PMC 3185516. PMID 21994595 .
- ^ "Вирус гепатита D". web.stanford.edu . Получено 1 декабря 2017 г. .
- ^ ab "Гепатит D: Предыстория, Этиология, Эпидемиология". Medscape . Получено 1 декабря 2017 г. .
- ^ Крупович, Март; Кун, Йенс Х.; Фишер, Маттиас Г. (7 октября 2015 г.). «Система классификации вирофагов и вирусов-сателлитов». Архивы вирусологии . 161 (1): 233–247. doi : 10.1007/s00705-015-2622-9 . hdl : 11858/00-001M-0000-0028-DC34-F . PMID 26446887.
- ^ Таксопроп 2017.004P
- ^ Таксопроп 2016.021a-kP
Внешние ссылки
На Викискладе есть медиафайлы по теме «Спутниковые вирусы» .
Wikispecies содержит информацию, связанную с
сателлитами и другими вирусозависимыми нуклеиновыми кислотами .
- ИКТВ
- «Субклеточный».Субклеточные формы жизни