В биологии клеточная сигнализация ( cell signaling в британском английском ) — это процесс, посредством которого клетка взаимодействует сама с собой, другими клетками и окружающей средой. Передача сигналов в клетках является фундаментальным свойством всей клеточной жизни у прокариот и эукариот .
Обычно сигнальный процесс включает в себя три компонента: сигнал, рецептор и эффектор. [ нужна цитата ]
В биологии сигналы в основном имеют химическую природу, но также могут быть физическими сигналами, такими как давление , напряжение , температура или свет. Химические сигналы – это молекулы, способные связывать и активировать определенный рецептор . Эти молекулы, также называемые лигандами, химически разнообразны и включают ионы (например, Na+, K+, Ca++ и т. д.), липиды (например, стероиды, простагландины), пептиды (например, инсулин, АКТГ), углеводы, гликозилированные белки (протеогликаны), нуклеиновые кислоты. кислоты и т. д. Пептидные и липидные лиганды имеют особое значение, поскольку к этим классам химических веществ принадлежит большинство гормонов. Пептиды обычно представляют собой полярные гидрофильные молекулы. По существу, они не могут свободно диффундировать через билипидный слой плазматической мембраны, поэтому их действие опосредуется рецептором, связанным с клеточной мембраной. С другой стороны, жирорастворимые химические вещества, такие как стероидные гормоны, могут пассивно диффундировать через плазматическую мембрану и взаимодействовать с внутриклеточными рецепторами. Передача сигналов в клетках может происходить на коротких или больших расстояниях и может быть дополнительно классифицирована как аутокринная , интракринная , юкстакринная , паракринная или эндокринная . Аутокринная передача сигналов происходит, когда химический сигнал действует на ту же клетку, которая продуцирует сигнальное химическое вещество. [1] Интракринная передача сигналов происходит, когда химический сигнал, вырабатываемый клеткой, действует на рецепторы, расположенные в цитоплазме или ядре той же клетки. [2] Юкстакринная передача сигналов происходит между физически соседними клетками. [3] Паракринная передача сигналов происходит между соседними клетками. Эндокринное взаимодействие происходит между удаленными клетками, при этом химический сигнал обычно переносится кровью. [4]
Рецепторы представляют собой сложные белки или плотно связанные мультимеры белков, расположенные в плазматической мембране или внутри клетки, например, в цитоплазме , органеллах и ядре . Рецепторы обладают способностью обнаруживать сигнал либо путем связывания с определенным химическим веществом, либо путем изменения конформации при взаимодействии с физическими агентами. Именно специфичность химического взаимодействия между данным лигандом и его рецептором дает возможность запускать определенный клеточный ответ. Рецепторы можно разделить на рецепторы клеточной мембраны и внутриклеточные рецепторы.
Рецепторы клеточной мембраны можно далее классифицировать на рецепторы, связанные с ионными каналами, рецепторы, связанные с G-белком, и рецепторы, связанные с ферментами.
Рецепторы ионных каналов представляют собой крупные трансмембранные белки с функцией ворот, активируемой лигандом. Когда эти рецепторы активированы, они могут разрешать или блокировать прохождение определенных ионов через клеточную мембрану. Большинство рецепторов, активируемых физическими раздражителями, такими как давление или температура, относятся к этой категории.
Рецепторы G-белка представляют собой мультимерные белки, встроенные в плазматическую мембрану. Эти рецепторы имеют внеклеточные, трансмембранные и внутриклеточные домены. Внеклеточный домен отвечает за взаимодействие со специфическим лигандом. Внутриклеточный домен отвечает за инициацию каскада химических реакций, которые в конечном итоге запускают специфическую клеточную функцию, контролируемую рецептором.
Фермент-связанные рецепторы представляют собой трансмембранные белки с внеклеточным доменом, ответственным за связывание специфического лиганда, и внутриклеточным доменом, обладающим ферментативной или каталитической активностью. При активации ферментативная часть отвечает за стимулирование специфических внутриклеточных химических реакций.
Внутриклеточные рецепторы имеют другой механизм действия. Обычно они связываются с жирорастворимыми лигандами, которые пассивно диффундируют через плазматическую мембрану, например, со стероидными гормонами. Эти лиганды связываются со специфическими цитоплазматическими переносчиками, которые перемещают комплекс гормон-транспортер внутрь ядра, где активируются определенные гены и стимулируется синтез определенных белков.
Эффекторный компонент сигнального пути начинается с передачи сигнала . В этом процессе сигнал, взаимодействуя с рецептором, запускает серию молекулярных событий внутри клетки, приводящих к конечному эффекту сигнального процесса. Обычно конечный эффект состоит в активации ионного канала ( лиганд-управляемый ионный канал ) или инициировании каскада системы вторичного мессенджера , который распространяет сигнал через клетку. Системы вторичных мессенджеров могут усиливать или модулировать сигнал, при этом активация нескольких рецепторов приводит к активации нескольких вторичных мессенджеров, тем самым усиливая исходный сигнал (первый мессенджер). Последующие эффекты этих сигнальных путей могут включать дополнительные ферментативные активности, такие как протеолитическое расщепление , фосфорилирование , метилирование и убиквитинилирование .
Сигнальные молекулы могут синтезироваться различными путями биосинтеза и высвобождаться посредством пассивного или активного транспорта или даже в результате повреждения клеток .
Каждая клетка запрограммирована реагировать на определенные внеклеточные сигнальные молекулы и является основой развития , восстановления тканей , иммунитета и гомеостаза . Ошибки в сигнальных взаимодействиях могут вызывать такие заболевания, как рак , аутоиммунитет и диабет .
У многих небольших организмов, таких как бактерии , ощущение кворума позволяет особям начать деятельность только тогда, когда популяция достаточно велика. Такая передача сигналов между клетками была впервые обнаружена у морской бактерии Aliivibrio fischeri , которая излучает свет, когда популяция достаточно плотная. [5] Механизм включает производство и обнаружение сигнальной молекулы, а также регуляцию транскрипции генов в ответ. Чувство кворума действует как у грамположительных, так и у грамотрицательных бактерий, а также внутри видов и между видами. [6]
У слизевиков отдельные клетки объединяются вместе, образуя плодовые тела и, в конечном итоге, споры под воздействием химического сигнала, известного как акразин . Особи передвигаются за счет хемотаксиса , т. е. их притягивает химический градиент. Некоторые виды используют в качестве сигнала циклический АМФ ; другие, такие как Polysphondylium violaceum, используют дипептид, известный как глорин . [7]
У растений и животных передача сигналов между клетками происходит либо посредством высвобождения во внеклеточное пространство , разделенного на паракринную передачу сигналов (на короткие расстояния) и эндокринную передачу сигналов (на большие расстояния), либо путем прямого контакта, известного как юкстакринная передача сигналов , например передача сигналов Notch . [8] Аутокринная передача сигналов — это особый случай паракринной передачи сигналов, при котором секретирующая клетка обладает способностью реагировать на секретируемую сигнальную молекулу. [9] Синаптическая передача сигналов — это особый случай паракринной передачи сигналов (для химических синапсов ) или юкстакринной передачи сигналов (для электрических синапсов ) между нейронами и клетками-мишенями.
Многие клеточные сигналы передаются молекулами, которые высвобождаются одной клеткой и движутся, чтобы вступить в контакт с другой клеткой. Сигнальные молекулы могут принадлежать к нескольким химическим классам: липидам , фосфолипидам , аминокислотам , моноаминам , белкам , гликопротеинам или газам . Сигнальные молекулы, связывающие поверхностные рецепторы, обычно большие и гидрофильные (например , ТРГ , вазопрессин , ацетилхолин ), тогда как молекулы, попадающие в клетку, обычно маленькие и гидрофобные (например , глюкокортикоиды , гормоны щитовидной железы , холекальциферол , ретиноевая кислота ), но важные исключения из обоих случаев многочисленны. и одна и та же молекула может действовать как через поверхностные рецепторы, так и интракринно, вызывая разные эффекты. [9] В клетках животных специализированные клетки выделяют эти гормоны и отправляют их через систему кровообращения в другие части тела. Затем они достигают клеток-мишеней, которые могут распознавать гормоны, реагировать на них и давать результат. Это также известно как эндокринная сигнализация. Регуляторы роста растений, или растительные гормоны, движутся через клетки или диффундируют по воздуху в виде газа, чтобы достичь своих целей. [10] Сероводород вырабатывается в небольших количествах некоторыми клетками человеческого организма и выполняет ряд биологических сигнальных функций. В настоящее время известно только два других таких газа, которые действуют как сигнальные молекулы в организме человека: оксид азота и окись углерода . [11]
Экзоцитоз — это процесс, посредством которого клетка транспортирует молекулы , такие как нейротрансмиттеры и белки, из клетки. Будучи активным транспортным механизмом, экзоцитоз требует использования энергии для транспортировки материала. Экзоцитоз и его аналог, эндоцитоз , процесс, при котором вещества попадают в клетку, используются всеми клетками, поскольку большинство важных для них химических веществ представляют собой большие полярные молекулы, которые не могут пройти через гидрофобную часть клеточной мембраны путем пассивного транспорта . Экзоцитоз — это процесс, при котором высвобождается большое количество молекул; таким образом, это форма перевозки массовых грузов. Экзоцитоз происходит через секреторные порталы плазматической мембраны клетки, называемые поросомами . Поросомы представляют собой постоянные липопротеиновые структуры чашеобразной формы на плазматической мембране клетки, где секреторные пузырьки временно стыкуются и сливаются, высвобождая внутривезикулярное содержимое из клетки. [12]
При экзоцитозе мембраносвязанные секреторные везикулы переносятся на клеточную мембрану , где они стыкуются и сливаются с поросомами, а их содержимое (т.е. водорастворимые молекулы) секретируется во внеклеточную среду. Эта секреция возможна, поскольку везикула временно сливается с плазматической мембраной. В контексте нейротрансмиссии нейротрансмиттеры обычно высвобождаются из синаптических пузырьков в синаптическую щель посредством экзоцитоза; однако нейромедиаторы также могут высвобождаться путем обратного транспорта через мембранные транспортные белки . [ нужна цитата ]
Аутокринная передача сигналов включает в себя клетку, секретирующую гормон или химический мессенджер (называемый аутокринным агентом), который связывается с аутокринными рецепторами той же клетки, что приводит к изменениям в самой клетке. [13] Это можно противопоставить паракринной передаче сигналов , интракринной передаче сигналов или классической эндокринной передаче сигналов.
При интракринной передаче сигналов сигнальные химические вещества производятся внутри клетки и связываются с цитозольными или ядерными рецепторами, не секретируясь из клетки. При интракринной передаче сигналов сигналы передаются без секреции из клетки. Интракринные сигналы, не секретируемые вне клетки, отличают интракринную передачу сигналов от других клеточных механизмов передачи сигналов, таких как аутокринная передача сигналов. Как при аутокринной, так и при интракринной передаче сигналов сигнал оказывает влияние на клетку, которая его продуцирует. [14]
Юкстакринная передача сигналов представляет собой тип передачи сигналов клетка -клетка или клетка- внеклеточный матрикс в многоклеточных организмах, который требует тесного контакта. Есть три типа:
Кроме того, у одноклеточных организмов, таких как бактерии , юкстакринная передача сигналов означает взаимодействие посредством контакта с мембраной. Юкстакринная передача сигналов наблюдалась для некоторых факторов роста , цитокиновых и хемокиновых клеточных сигналов, играющих важную роль в иммунном ответе . Юкстакринная передача сигналов посредством прямых мембранных контактов также присутствует между телами нейрональных клеток и подвижными отростками микроглии как во время развития [15] , так и во взрослом мозге. [16]
При паракринной передаче сигналов клетка производит сигнал, вызывающий изменения в соседних клетках, изменяя поведение этих клеток. Сигнальные молекулы, известные как паракринные факторы, диффундируют на относительно короткое расстояние (локальное действие), в отличие от передачи сигналов клеткам эндокринными факторами , гормонами, которые перемещаются на значительно большие расстояния через систему кровообращения ; юкстакринные взаимодействия ; и аутокринная сигнализация . Клетки, продуцирующие паракринные факторы, секретируют их в непосредственную внеклеточную среду. Затем факторы перемещаются в соседние клетки, в которых градиент полученного фактора определяет результат. Однако точное расстояние, на которое могут распространяться паракринные факторы, не установлено.
Паракринные сигналы, такие как ретиноевая кислота, нацелены только на клетки, находящиеся вблизи излучающей клетки. [17] Нейротрансмиттеры представляют собой еще один пример паракринного сигнала.
Некоторые сигнальные молекулы могут функционировать и как гормон, и как нейромедиатор. Например, адреналин и норадреналин могут функционировать как гормоны, когда они высвобождаются из надпочечников и транспортируются к сердцу с током крови. Норадреналин также может вырабатываться нейронами и действовать как нейромедиатор в мозге. [18] Эстроген может высвобождаться яичником и функционировать как гормон или действовать локально посредством паракринной или аутокринной передачи сигналов. [19]
Хотя паракринная передача сигналов вызывает разнообразный набор ответов в индуцированных клетках, большинство паракринных факторов используют относительно упорядоченный набор рецепторов и путей. Фактически, известно, что разные органы тела – даже у разных видов – используют одинаковый набор паракринных факторов в дифференцированном развитии. [20] Высококонсервативные рецепторы и пути могут быть организованы в четыре основных семейства на основе сходных структур: семейство факторов роста фибробластов (FGF), семейство Hedgehog , семейство Wnt и суперсемейство TGF-β . Связывание паракринного фактора с соответствующим рецептором инициирует каскады передачи сигнала , вызывая различные ответы.
Эндокринные сигналы называются гормонами . Гормоны производятся эндокринными клетками и путешествуют по крови , достигая всех частей тела. Специфичность передачи сигналов можно контролировать, если только некоторые клетки могут реагировать на определенный гормон. Эндокринная сигнализация предполагает выброс гормонов внутренними железами организманепосредственно в систему кровообращения , регулирующую отдаленные органы-мишени. У позвоночных гипоталамус является нервным центром управления всеми эндокринными системами. У человека основными эндокринными железами являются щитовидная железа и надпочечники . Изучение эндокринной системы и ее нарушений известно как эндокринология .
Клетки получают информацию от своих соседей через класс белков, известных как рецепторы . Рецепторы могут связываться с некоторыми молекулами (лигандами) или могут взаимодействовать с физическими агентами, такими как свет, механическая температура, давление и т. д. Прием происходит, когда клетка-мишень (любая клетка с рецепторным белком, специфичным для сигнальной молекулы ) обнаруживает сигнал, обычно в Форма небольшой водорастворимой молекулы, посредством связывания с рецепторным белком на поверхности клетки или внутри клетки сигнальная молекула может связываться с внутриклеточными рецепторами , другими элементами или стимулировать активность ферментов (например, газов), например, в интракринной передаче сигналов.
Сигнальные молекулы взаимодействуют с клеткой-мишенью в качестве лиганда для рецепторов клеточной поверхности и/или путем проникновения в клетку через ее мембрану или эндоцитоза для интракринной передачи сигналов. Обычно это приводит к активации вторичных мессенджеров , что приводит к различным физиологическим эффектам. У многих млекопитающих клетки раннего эмбриона обмениваются сигналами с клетками матки . [21] В желудочно-кишечном тракте человека бактерии обмениваются сигналами друг с другом, а также с клетками эпителия и иммунной системы человека . [22] У дрожжей Saccharomyces cerevisiae во время спаривания некоторые клетки посылают пептидный сигнал ( феромоны фактора спаривания ) в окружающую среду. Пептид фактора спаривания может связываться с рецептором клеточной поверхности других дрожжевых клеток и побуждать их готовиться к спариванию. [23]
Рецепторы клеточной поверхности играют важную роль в биологических системах одно- и многоклеточных организмов, а нарушение работы или повреждение этих белков связано с раком, болезнями сердца и астмой. [24] Эти трансмембранные рецепторы способны передавать информацию снаружи клетки внутрь, поскольку они меняют конформацию , когда с ней связывается определенный лиганд. Существует три основных типа: рецепторы, связанные с ионными каналами , рецепторы, связанные с G-белком , и рецепторы, связанные с ферментами .
Рецепторы, связанные с ионными каналами, представляют собой группу трансмембранных белков ионных каналов , которые открываются, позволяя ионам, таким как Na + , K + , Ca 2+ и/или Cl - , проходить через мембрану в ответ на связывание химического посланника ( т.е. лиганд ), такой как нейромедиатор . [25] [26] [27]
Когда пресинаптический нейрон возбуждается, он высвобождает нейромедиатор из везикул в синаптическую щель . Затем нейромедиатор связывается с рецепторами, расположенными на постсинаптическом нейроне . Если эти рецепторы представляют собой ионные каналы, управляемые лигандами, в результате конформационного изменения открываются ионные каналы, что приводит к потоку ионов через клеточную мембрану. Это, в свою очередь, приводит либо к деполяризации для реакции возбуждающего рецептора, либо к гиперполяризации для тормозной реакции.
Эти рецепторные белки обычно состоят по меньшей мере из двух разных доменов: трансмембранного домена, который включает ионную пору, и внеклеточного домена, который включает место связывания лиганда (аллостерический сайт связывания). Эта модульность позволила применить подход «разделяй и властвуй» к поиску структуры белков (кристаллизация каждого домена отдельно). Функция таких рецепторов, расположенных в синапсах , заключается в прямом и очень быстром преобразовании химического сигнала пресинаптически высвобождаемого нейромедиатора в постсинаптический электрический сигнал. Многие LIC дополнительно модулируются аллостерическими лигандами , блокаторами каналов , ионами или мембранным потенциалом . LIC подразделяются на три суперсемейства, которые не имеют эволюционного родства: рецепторы цис-петли , ионотропные рецепторы глутамата и АТФ-управляемые каналы .
Рецепторы, связанные с G-белком, представляют собой большую группу эволюционно связанных белков , которые представляют собой рецепторы клеточной поверхности , которые обнаруживают молекулы вне клетки и активируют клеточные реакции. Соединяясь с G-белками , они называются семитрансмембранными рецепторами, поскольку проходят через клеточную мембрану семь раз. G-белок действует как «посредник», передавая сигнал от активированного рецептора к цели и, следовательно, косвенно регулирует этот целевой белок. [28] Лиганды могут связываться либо с внеклеточными N-концами и петлями (например, глутаматными рецепторами), либо с сайтом связывания внутри трансмембранных спиралей (семейство родопсин-подобных). Все они активируются агонистами , хотя также может наблюдаться спонтанная автоактивация пустого рецептора. [28]
Рецепторы , связанные с G-белком, обнаружены только у эукариот , включая дрожжи , хоанофлагелляты [29] и животных. Лиганды , которые связывают и активируют эти рецепторы, включают светочувствительные соединения, запахи , феромоны , гормоны и нейротрансмиттеры и различаются по размеру: от небольших молекул до пептидов и крупных белков . Рецепторы, связанные с G-белком, участвуют во многих заболеваниях.
Существует два основных пути передачи сигнала с участием рецепторов, связанных с G-белком: сигнальный путь цАМФ и сигнальный путь фосфатидилинозитола . [30] Когда лиганд связывается с GPCR, он вызывает конформационные изменения в GPCR, что позволяет ему действовать как фактор обмена гуаниновых нуклеотидов (GEF). Затем GPCR может активировать связанный G-белок путем обмена GDP , связанного с G-белком, на GTP . Субъединица α белка G вместе со связанным GTP может затем диссоциировать от субъединиц β и γ для дальнейшего воздействия на внутриклеточные сигнальные белки или целевые функциональные белки, непосредственно в зависимости от типа субъединицы α ( G αs , G αi/o , G αq/ 11 , Gα12 /13 ). [31] : 1160
Рецепторы, связанные с G-белком, являются важной мишенью для лекарств, и примерно 34% [32] всех одобренных Управлением по контролю за продуктами и лекарствами (FDA) лекарств нацелены на 108 членов этого семейства. Мировой объем продаж этих препаратов оценивается в 180 миллиардов долларов США по состоянию на 2018 год [обновлять]. [32] По оценкам, GPCRs являются мишенями для около 50% лекарств, имеющихся в настоящее время на рынке, в основном из-за их участия в сигнальных путях, связанных со многими заболеваниями, т.е. психическими, метаболическими, включая эндокринологические расстройства, иммунологические, включая вирусные инфекции, сердечно-сосудистые, воспалительные, расстройства чувств и рак. Еще одной динамично развивающейся областью фармацевтических исследований является давно обнаруженная связь между GPCR и многими эндогенными и экзогенными веществами, приводящая, например, к анальгезии. [28]
Фермент-связанные рецепторы (или каталитические рецепторы) представляют собой трансмембранные рецепторы , которые при активации внеклеточным лигандом вызывают ферментативную активность на внутриклеточной стороне. [33] Следовательно, каталитический рецептор представляет собой интегральный мембранный белок , обладающий как ферментативными , каталитическими , так и рецепторными функциями. [34]
У них есть два важных домена: внеклеточный лигандсвязывающий домен и внутриклеточный домен, который выполняет каталитическую функцию; и одна трансмембранная спираль . Сигнальная молекула связывается с рецептором снаружи клетки и вызывает конформационные изменения каталитической функции, расположенной на рецепторе внутри клетки. [ нужна цитация ] Примеры ферментативной активности включают:
Внутриклеточные рецепторы свободно существуют в цитоплазме, ядре или могут быть связаны с органеллами или мембранами. Например, хорошо известно наличие ядерных и митохондриальных рецепторов. [36] Связывание лиганда с внутриклеточным рецептором обычно вызывает ответ в клетке. Внутриклеточные рецепторы часто обладают определенным уровнем специфичности, это позволяет рецепторам инициировать определенные ответы при связывании с соответствующим лигандом. [37] Внутриклеточные рецепторы обычно действуют на жирорастворимые молекулы. Рецепторы связываются с группой ДНК-связывающих белков. При связывании комплекс рецептор-лиганд перемещается в ядро, где они могут изменять характер экспрессии генов. [38]
Рецепторы стероидных гормонов обнаруживаются в ядре , цитозоле , а также на плазматической мембране клеток-мишеней. Обычно они представляют собой внутриклеточные рецепторы (обычно цитоплазматические или ядерные) и инициируют передачу сигналов стероидных гормонов , что приводит к изменениям в экспрессии генов в течение периода времени от нескольких часов до дней. Наиболее изученными рецепторами стероидных гормонов являются представители подсемейства ядерных рецепторов 3 (NR3), в которое входят рецепторы эстрогена (группа NR3A) [39] и 3-кетостероидов (группа NR3C). [40] Помимо ядерных рецепторов, несколько рецепторов, связанных с G-белком , и ионных каналов действуют как рецепторы клеточной поверхности для определенных стероидных гормонов.
Рецепторно-опосредованный эндоцитоз является распространенным способом «выключения» рецепторов. Эндоцитарная понижающая регуляция рассматривается как средство снижения передачи сигналов рецепторов. [41] Этот процесс включает связывание лиганда с рецептором, что затем запускает образование покрытых ямок, покрытые ямки трансформируются в покрытые везикулы и транспортируются в эндосому.
Фосфорилирование рецепторов — это еще один тип подавления рецепторов. Биохимические изменения могут снизить сродство рецептора к лиганду. [42]
Снижение чувствительности рецептора является следствием длительной занятости рецепторов. Это приводит к адаптации рецептора, при которой рецептор больше не реагирует на сигнальную молекулу. Многие рецепторы обладают способностью изменяться в ответ на концентрацию лиганда. [43]
При связывании с сигнальной молекулой белок-рецептор каким-то образом изменяется и запускает процесс трансдукции, который может происходить в один этап или в виде серии изменений последовательности различных молекул (так называемый путь сигнальной трансдукции). Молекулы, составляющие эти пути, известны как молекулы-реле. Многоэтапный процесс стадии трансдукции часто состоит из активации белков путем добавления или удаления фосфатных групп или даже высвобождения других небольших молекул или ионов, которые могут действовать как посланники. Усиление сигнала является одним из преимуществ этой многоступенчатой последовательности. Другие преимущества включают в себя больше возможностей для регуляции, чем у более простых систем, и точную настройку реакции как в одноклеточных, так и в многоклеточных организмах. [10]
В некоторых случаях активация рецептора, вызванная связыванием лиганда с рецептором, напрямую связана с реакцией клетки на лиганд. Например, нейромедиатор ГАМК может активировать рецептор клеточной поверхности, который является частью ионного канала . Связывание ГАМК с рецептором ГАМК- А на нейроне открывает хлорид -селективный ионный канал, который является частью рецептора. Активация рецептора ГАМК А позволяет отрицательно заряженным ионам хлора проникать в нейрон, что подавляет способность нейрона вырабатывать потенциалы действия . Однако для многих рецепторов клеточной поверхности взаимодействия лиганд-рецептор не связаны напрямую с ответом клетки. Активированный рецептор должен сначала взаимодействовать с другими белками внутри клетки, прежде чем будет произведен окончательный физиологический эффект лиганда на поведение клетки. Часто поведение цепочки из нескольких взаимодействующих клеточных белков изменяется после активации рецептора. Весь набор клеточных изменений, вызванных активацией рецептора, называется механизмом или путем передачи сигнала . [44]
Более сложным путем передачи сигнала является путь MAPK/ERK, который включает изменения белок-белковых взаимодействий внутри клетки, индуцированные внешним сигналом. Многие факторы роста связываются с рецепторами на поверхности клеток и стимулируют клетки проходить клеточный цикл и делиться . Некоторые из этих рецепторов представляют собой киназы , которые начинают фосфорилировать себя и другие белки при связывании с лигандом. Это фосфорилирование может генерировать сайт связывания для другого белка и, таким образом, индуцировать белок-белковое взаимодействие. В этом случае лиганд (называемый эпидермальным фактором роста или EGF) связывается с рецептором (называемым EGFR ). Это активирует рецептор к фосфорилированию. Фосфорилированный рецептор связывается с белком-адаптером ( GRB2 ), который связывает сигнал с дальнейшими нижестоящими сигнальными процессами. Например, один из активируемых путей передачи сигнала называется путем митоген-активируемой протеинкиназы (МАРК). Компонент передачи сигнала, обозначенный как «MAPK» в этом пути, первоначально назывался «ERK», поэтому этот путь называется путем MAPK/ERK . Белок MAPK представляет собой фермент, протеинкиназу , которая может присоединять фосфат к белкам-мишеням, таким как фактор транскрипции MYC , и, таким образом, изменять транскрипцию гена и, в конечном итоге, ход клеточного цикла. Многие клеточные белки активируются ниже рецепторов факторов роста (таких как EGFR), которые инициируют этот путь передачи сигнала. [ нужна цитата ]
Некоторые пути сигнальной трансдукции реагируют по-разному, в зависимости от количества сигналов, полученных клеткой. Например, белок hedgehog активирует разные гены, в зависимости от количества присутствующего белка hedgehog. [ нужна цитата ]
Сложные многокомпонентные пути передачи сигнала предоставляют возможности для обратной связи, усиления сигнала и взаимодействия внутри одной клетки между несколькими сигналами и сигнальными путями. [ нужна цитата ]
Специфический клеточный ответ является результатом трансдуцированного сигнала на заключительном этапе передачи сигналов в клетках. По сути, этот ответ может представлять собой любую клеточную активность, присутствующую в организме. Это может стимулировать перестройку цитоскелета или даже катализироваться ферментом. Все эти три этапа передачи сигналов клетками гарантируют, что нужные клетки ведут себя так, как им приказано, в нужное время и синхронно с другими клетками и их собственными функциями внутри организма. В конце концов, окончание сигнального пути приводит к регуляции клеточной активности. Этот ответ может происходить в ядре или в цитоплазме клетки. Большинство сигнальных путей контролируют синтез белка, включая и выключая определенные гены в ядре. [45]
В одноклеточных организмах, таких как бактерии, передача сигналов может использоваться для «активации» партнеров из состояния покоя , повышения вирулентности , защиты от бактериофагов и т. д. [46] При ощущении кворума , которое также встречается у социальных насекомых, множественность отдельных сигналов обладает потенциалом создания петли положительной обратной связи, генерирующей скоординированную реакцию. В этом контексте сигнальные молекулы называются аутоиндукторами . [47] [48] [49] Этот сигнальный механизм мог быть вовлечен в эволюцию от одноклеточных к многоклеточным организмам. [47] [50] Бактерии также используют контактно-зависимую передачу сигналов, в частности, для ограничения своего роста. [51]
Сигнальные молекулы, используемые многоклеточными организмами, часто называют феромонами . Они могут иметь такие цели, как предупреждение об опасности, указание на наличие продовольствия или помощь в воспроизводстве. [52]
. [53] [54]
. [53] [54]
Notch — белок клеточной поверхности, выполняющий функцию рецептора. У животных есть небольшой набор генов , которые кодируют сигнальные белки, которые специфически взаимодействуют с рецепторами Notch и стимулируют ответ в клетках, экспрессирующих Notch на своей поверхности. Молекулы, которые активируют (или, в некоторых случаях, ингибируют) рецепторы, можно классифицировать как гормоны, нейротрансмиттеры , цитокины и факторы роста , обычно называемые лигандами рецепторов . Взаимодействия с рецепторами-лигандами, такие как взаимодействие с рецептором Notch, как известно, являются основными взаимодействиями, ответственными за клеточные механизмы передачи сигналов и коммуникации. [55] notch действует как рецептор для лигандов, которые экспрессируются на соседних клетках. Некоторые рецепторы представляют собой белки клеточной поверхности, другие находятся внутри клеток. Например, эстроген представляет собой гидрофобную молекулу , которая может проходить через липидный бислой мембран . Являясь частью эндокринной системы , внутриклеточные рецепторы эстрогена из различных типов клеток могут активироваться эстрогеном, вырабатываемым в яичниках . [ нужна цитата ]
В случае передачи сигналов, опосредованной Notch, механизм передачи сигнала может быть относительно простым. Как показано на рисунке 2, активация Notch может привести к изменению белка Notch под действием протеазы . Часть белка Notch высвобождается из поверхностной мембраны клетки и принимает участие в регуляции генов . Исследования клеточной сигнализации включают изучение пространственной и временной динамики как рецепторов, так и компонентов сигнальных путей, которые активируются рецепторами в различных типах клеток. [56] [57] Новые методы масс-спектрометрического анализа отдельных клеток обещают позволить изучать передачу сигнала с разрешением отдельных клеток. [58]
При передаче сигналов notch прямой контакт между клетками обеспечивает точный контроль дифференцировки клеток во время эмбрионального развития. У червя Caenorhabditis elegans каждая из двух клеток развивающейся гонады имеет равные шансы окончательно дифференцироваться или стать клеткой-предшественником матки, которая продолжает делиться. Выбор того, какая клетка продолжает делиться, контролируется конкуренцией сигналов клеточной поверхности. Одна клетка будет производить больше белка клеточной поверхности, который активирует рецептор Notch в соседней клетке. Это активирует петлю обратной связи или систему, которая снижает экспрессию Notch в клетке, которая будет дифференцироваться, и увеличивает Notch на поверхности клетки, которая продолжает развиваться как стволовая клетка . [59]