Белкокодирующий ген у вида Homo sapiens
Тирозин-протеинфосфатаза дзета рецепторного типа, также известная как фосфакан, представляет собой фермент , который у человека кодируется геном PTPRZ1 . [5] [6] [7]
Функция
Этот ген является членом семейства рецепторных тирозинфосфатаз и кодирует однопроходной мембранный белок типа I с двумя цитоплазматическими доменами тирозинпротеинфосфатазы, доменом альфа-карбоангидразы и доменом фибронектина типа III . Описаны альтернативные варианты сплайсинга, кодирующие разные изоформы белка, но их полноразмерная природа не определена. [7]
Клиническое значение
Экспрессия этого гена индуцируется в клетках рака желудка , в ремиелинизирующих олигодендроцитах поражений рассеянного склероза и в клетках эмбриональных почек человека в условиях гипоксии . И белок, и транскрипт сверхэкспрессируются в клетках глиобластомы , способствуя их гаптотактической миграции. [7]
Рекомендации
- ^ abc GRCh38: выпуск Ensembl 89: ENSG00000106278 - Ensembl , май 2017 г.
- ^ abc GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000068748 - Ensembl , май 2017 г.
- ^ "Ссылка на Human PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ Арияма Т., Хасегава К., Инадзава Дж., Мизуно К., Огимото М., Катагири Т., Якура Х. (июнь 1995 г.). «Присвоение гена человеческой протеинтирозинфосфатазы рецепторного типа дзета (PTPRZ) полосе хромосомы 7q31.3». Цитогенетический клеточный генетик . 70 (1–2): 52–4. дои : 10.1159/000133990. ПМИД 7736789.
- ^ Леви Дж.Б., Канолл П.Д., Силвеннойнен О, Барнеа Г., Морс Б., Онеггер А.М., Хуанг Дж.Т., Канниццаро Л.А., Парк Ш., Драк Т. (июнь 1993 г.). «Клонирование протеина тирозинфосфатазы рецепторного типа, экспрессируемого в центральной нервной системе». J Биол Хим . 268 (14): 10573–81. дои : 10.1016/S0021-9258(18)82237-2 . ПМИД 8387522.
- ^ abc «Ген Entrez: протеин-тирозинфосфатаза PTPRZ1, рецепторного типа, Z-полипептид 1» .
дальнейшее чтение
- Крюгер NX, Сайто Х (1992). «Человеческая трансмембранная протеин-тирозин-фосфатаза, PTP-дзета, экспрессируется в головном мозге и имеет N-концевой рецепторный домен, гомологичный карбоангидразам». Учеб. Натл. акад. наук. США . 89 (16): 7417–21. Бибкод : 1992PNAS...89.7417K. дои : 10.1073/pnas.89.16.7417 . ПМК 49721 . ПМИД 1323835.
- Каплан Р., Морс Б., Хюбнер К., Кроче С., Хоук Р., Равера М., Рикка Г., Джей М., Шлессингер Дж. (1990). «Клонирование трех тирозинфосфатаз человека обнаруживает мультигенное семейство рецептор-связанных протеинтирозинфосфатаз, экспрессируемых в мозге». Учеб. Натл. акад. наук. США . 87 (18): 7000–4. Бибкод : 1990PNAS...87.7000K. дои : 10.1073/pnas.87.18.7000 . ПМК 54670 . ПМИД 2169617.
- Крюгер NX, Штрёули М, Сайто Х (1990). «Структурное разнообразие и эволюция человеческих рецептороподобных протеинтирозинфосфатаз». ЭМБО Дж . 9 (10): 3241–52. doi :10.1002/j.1460-2075.1990.tb07523.x. ПМК 552056 . ПМИД 2170109.
- Мортон С.М., Вейл Р.А., Хелмс С., Ли М., Куо В.Л., Грей Дж., Донис-Келлер Х. (1998). «Субрегиональная локализация 21 специфичной для хромосомы 7 метки экспрессируемых последовательностей (EST) с помощью FISH с использованием недавно идентифицированных YAC и P1». Геномика . 46 (3): 491–4. дои : 10.1006/geno.1997.5051. ПМИД 9441757.
- Оньянго П., Лубёва Б., Гарделлин П., Курцбауэр Р., Вейт А. (1998). «Молекулярное клонирование и анализ экспрессии пяти новых генов в хромосоме 1p36». Геномика . 50 (2): 187–98. дои : 10.1006/geno.1997.5186 . ПМИД 9653645.
- Центр Сэнгера T, Центр секвенирования генома Вашингтонского университета (1999). «На пути к полной последовательности генома человека». Геном Рез . 8 (11): 1097–108. дои : 10.1101/гр.8.11.1097 . ПМИД 9847074.
- Маэда Н., Итихара-Танака К., Кимура Т., Кадомацу К., Мурамацу Т., Нода М. (1999). «Рецептороподобный протеин-тирозинфосфатаза PTPzeta/RPTPbeta связывает гепарин-связывающий фактор роста мидкин. Участие аргинина 78 мидкина в высокоаффинном связывании с PTPzeta». Ж. Биол. Хим . 274 (18): 12474–9. дои : 10.1074/jbc.274.18.12474 . ПМИД 10212223.
- Кавачи Х., Тамура Х., Ватакабе И., Синтани Т., Маэда Н., Нода М. (1999). «Протеин тирозинфосфатаза дзета/RPTPbeta взаимодействует с семейством PSD-95/SAP90». Мозговой Рес. Мол. Мозговой Рес . 72 (1): 47–54. дои : 10.1016/S0169-328X(99)00204-1. ПМИД 10521598.
- Мэн К., Родригес-Пенья А., Димитров Т., Чен В., Ямин М., Нода М., Деуэль Т.Ф. (2000). «Плейотрофин сигнализирует об увеличении тирозинового фосфорилирования бета-бета-катенина за счет инактивации внутренней каталитической активности белка тирозинфосфатазы бета / зета рецепторного типа». Учеб. Натл. акад. наук. США . 97 (6): 2603–8. Бибкод : 2000PNAS...97.2603M. дои : 10.1073/pnas.020487997 . ПМК 15975 . ПМИД 10706604.
- Кавачи Х., Фудзикава А., Маэда Н., Нода М. (2001). «Идентификация GIT1 / Cat-1 как молекулы-субстрата протеинтирозинфосфатазы дзета / бета с помощью дрожжевой системы захвата субстрата». Учеб. Натл. акад. наук. США . 98 (12): 6593–8. Бибкод : 2001PNAS...98.6593K. дои : 10.1073/pnas.041608698 . ПМК 34398 . ПМИД 11381105.
- Томаиду Д., Кокилья Д., Мейнтанис С., Нода М., Ругон Г., Матсас Р. (2001). «Растворимые формы молекул адгезии нейрональных клеток NCAM и F3 способствуют миграции шванновских клеток: идентификация протеинтирозинфосфатаз дзета/бета как предполагаемых рецепторов F3 на шванновских клетках». Дж. Нейрохем . 78 (4): 767–78. дои : 10.1046/j.1471-4159.2001.00454.x. PMID 11520897. S2CID 24682985.
- Харрох С., Фуртадо Г.К., Брюк В., Розенблут Дж., Лафай Дж., Чао М., Буксбаум Дж.Д., Шлессингер Дж. (2002). «Критическая роль рецептора протеинтирозинфосфатазы типа Z в функциональном восстановлении после демиелинизирующих поражений». Нат. Жене . 32 (3): 411–4. дои : 10.1038/ng1004. PMID 12355066. S2CID 19800079.
- Мюллер С., Кункель П., Ламшус К., Ульбрихт У., Лоренте Г.А., Нельсон А.М., фон Шак Д., Чин Д.Д., Лор С.К., Вестфаль М., Мельчер Т. (2003). «Роль рецептора тирозинфосфатазы-дзета в миграции клеток глиомы». Онкоген . 22 (43): 6661–8. дои : 10.1038/sj.onc.1206763 . ПМИД 14555979.
- Бонора Э, Лэмб Дж.А., Барнби Дж., Сайкс Н., Моберли Т., Бейер К.С., Клаук С.М., Пустка Ф., Бачелли Е., Блази Ф., Маэстрини Э., Батталья А., Харакопос Д., Педерсен Л., Исагер Т., Эриксен Г., Вискум Б. , Соренсен ЕС, Брондум-Нильсен К., Коттерилл Р., ван Энгеланд Х., де Йонге М., Кемнер С., Стеггехейс К., Шерпенисс М., Раттер М., Болтон П.Ф., Парр Дж.Р., Пустка А., Бэйли А.Дж., Monaco AP (2005). «Скрининг мутаций и анализ ассоциаций шести генов-кандидатов на аутизм на хромосоме 7q». Евро. Дж. Хум. Жене . 13 (2): 198–207. дои : 10.1038/sj.ejhg.5201315 . ПМИД 15523497.
- Поликратис А., Катсорис П., Корти Дж., Пападимитриу Э. (2005). «Характеристика передачи сигналов регуляторного пептида, аффинного гепарина, в эндотелиальных клетках человека». Ж. Биол. Хим . 280 (23): 22454–61. дои : 10.1074/jbc.M414407200 . ПМИД 15797857.
- Ван В., Дэвис Д.А., Хак М., Хуанг Л.Е., Ярчоан Р. (2005). «Дифференциальная активация генов с помощью индуцируемого гипоксией фактора-1альфа и индуцируемого гипоксией фактора-2альфа в клетках HEK293T». Рак Рез . 65 (8): 3299–306. doi : 10.1158/0008-5472.CAN-04-4130. ПМИД 15833863.
- Лу К.В., Чон К.А., Ким Г.И., Сингх Дж., Диа Э.К., Ёсимото К., Ван М.Ю., Клоузи Т.Ф. , Нельсон С.Ф., Мишель П.С. (2005). «Дифференциальная индукция миграции и роста глиобластомы двумя формами плейотрофина». Ж. Биол. Хим . 280 (29): 26953–64. дои : 10.1074/jbc.M502614200 . ПМИД 15908427.