stringtranslate.com

эЭФ-1

eEF-1 — это два эукариотических фактора удлинения . Он образует два комплекса: гомолог EF-Tu EF-1A и гомолог EF-Ts EF-1B , фактор обмена гуанида первого. [1] Оба также обнаружены в археях . [2]

Структура

Номенклатура субъединиц eEF-1 несколько изменилась примерно в 2001 году, поскольку было признано, что комплексы EF-1A и EF-1B в некоторой степени независимы друг от друга. [1] В настоящее время признаны и названы следующие компоненты: [3]

Точный способ присоединения субъединицы eEF1B к eEF1A различается в зависимости от органа и вида. [3] eEF1A также связывает актин . [3]

Другие виды

Различные виды зеленых водорослей , красных водорослей , хромальвеолят и грибов не имеют гена EF-1α, но вместо этого обладают родственным геном, называемым EFL (elongation factor-like). Хотя его функция не была изучена подробно, он, по-видимому, похож на EF-1α.

По состоянию на 2009 год известно только о двух организмах, имеющих как EF-1α, так и EFL: гриб Basidiobolus и диатомовая водоросль Thalassiosira . Эволюционная история EFL неясна. Он мог возникнуть один или несколько раз, за ​​которыми последовала потеря EFL или EF-1α. Предполагается, что присутствие в трех различных группах эукариот (грибы, хромальвеоляты и архепластиды ) является результатом двух или более событий горизонтального переноса генов , согласно обзору 2009 года. [5] В отчете 2013 года обнаружено еще 11 видов с обоими генами и представлена ​​альтернативная гипотеза о том, что предок-эукариот может иметь оба гена. Во всех известных организмах, где присутствуют оба гена, EF-1α имеет тенденцию быть транскрипционно репрессированным. Если эта гипотеза верна, ученые ожидают найти организм, который имеет репрессированный EFL и полностью функционирующий EF-1α. [6]

Обзор 2014 года, посвященный эукариотам, обладающим EF-1α/EFL, считает, что оба объяснения сами по себе недостаточны для объяснения сложного распределения этих двух белков у эукариот. [7]

У эукариот родственная GTPase, называемая eRF3, участвует в терминации трансляции. С другой стороны, архейный EF-1α выполняет все функции, которые несут эти субфункциональные варианты. [8]

Смотрите также

Ссылки

  1. ^ ab Andersen GR, Nyborg J (2001). «Структурные исследования эукариотических факторов удлинения». Симпозиумы Cold Spring Harbor по количественной биологии . 66 : 425–37. doi :10.1101/sqb.2001.66.425. PMID  12762045.
  2. ^ Vitagliano L, Masullo M, Sica F, Zagari A, Bocchini V (октябрь 2001 г.). «Кристаллическая структура фактора удлинения 1альфа Sulfolobus solfataricus в комплексе с GDP раскрывает новые особенности связывания и обмена нуклеотидов». The EMBO Journal . 20 (19): 5305–11. doi : 10.1093/emboj/20.19.5305 . PMC 125647 . PMID  11574461. 
  3. ^ abcde Sasikumar AN, Perez WB, Kinzy TG (2011). «Множественные роли комплекса фактора удлинения эукариот 1». Wiley Interdisciplinary Reviews: RNA . 3 (4): 543–55. doi :10.1002/wrna.1118. PMC 3374885. PMID  22555874 . 
  4. ^ Kaminska M, Havrylenko S, Decottignies P, Gillet S, Le Maréchal P, Negrutskii B, Mirande M (март 2009). «Раскрытие структурной организации комплекса аминоацил-тРНК-синтетазы». Журнал биологической химии . 284 (10): 6053–60. doi : 10.1074/jbc.M809636200 . PMID  19131329.
  5. ^ Эллен Кокуит; Хероэн Вербрюгген; Фредерик Лелиарт; Фредерик В. Зехман; Коэн Саббе; Оливье Де Клерк (2009), «Приобретение и потеря генов фактора элонгации у зеленых водорослей», BMC Evol. Биол. , 9 (1): 39, Bibcode : 2009BMCEE...9...39C, doi : 10.1186/1471-2148-9-39 , PMC 2652445 , PMID  19216746 
  6. ^ Камикава Р., Браун М. В., Нишимура И., Сако И., Хейсс А. А., Юбуки Н. и др. (июнь 2013 г.). «Параллельное ремоделирование функции EF-1α: расходящиеся гены EF-1α встречаются совместно с генами EFL у различных отдаленно родственных эукариот». BMC Evolutionary Biology . 13 (1): 131. Bibcode :2013BMCEE..13..131K. doi : 10.1186/1471-2148-13-131 . PMC 3699394 . PMID  23800323. 
  7. ^ Михайлов К.В., Янушковец Ю., Тихоненков Д.В., Мирзаева Г.С., Дякин А.Ю., Симдянов Т.Г. и др. (сентябрь 2014 г.). «Сложное распределение GTPases семейства элонгации EF1A и EFL в базальных альвеолятных линиях». Геномная биология и эволюция . 6 (9): 2361–7. дои : 10.1093/gbe/evu186 . ПМК 4217694 . ПМИД  25179686. 
  8. ^ Saito K, Kobayashi K, Wada M, Kikuno I, Takusagawa A, Mochizuki M и др. (ноябрь 2010 г.). «Всемогущая роль фактора удлинения архей 1 альфа (EF1α) в трансляционном удлинении и терминации, а также контроль качества синтеза белка». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 107 (45): 19242–7. Bibcode : 2010PNAS..10719242S. doi : 10.1073/pnas.1009599107 . PMC 2984191. PMID  20974926 . 

Внешние ссылки