stringtranslate.com

Электропереключаемая биоповерхность

Электропереключаемая биоповерхность — это биосенсор , основанный на электроде (часто золотом), к которому привязан слой биомолекул (часто молекул ДНК ). К электроду прикладывается переменный или фиксированный электрический потенциал, который вызывает изменения в структуре и положении (движении) заряженных биомолекул. Биосенсор используется в науке, например, в биомедицинских и биофизических исследованиях или при разработке лекарств , для оценки взаимодействий между биомолекулами и кинетики связывания, а также изменений в размере или конформации биомолекул.

Технологический фон

Общий принцип биоповерхности — это твердая поверхность с дополнительным слоем биологических макромолекул. Поскольку этот молекулярный слой обратимо реагирует на изменения в среде поверхности, его также называют «монослоем, реагирующим на стимулы». Внешними стимулами могут быть, например, изменения температуры, изменения магнитных полей, механические силы или изменения электрических полей. [1] Для прикрепления монослоя биомолекул к поверхности могут использоваться различные стратегии, например, осаждение атомного слоя или послойное осаждение . Другим вариантом является изготовление самоорганизующихся монослоев (SAM). [2] Поверхность, используемая чаще всего с этой стратегией, — это золотой электрод. SAM образуются путем спонтанной организации молекул, например, алкантиолятов, на подложке. SAM могут использоваться в качестве поверхностных слоев для наночастиц, например, в контрастных агентах МРТ, они могут защищать металлические пленки от коррозии и иметь множество других применений в электрохимии и нанонауке. [3] Для их применения в качестве биосенсора одной из наиболее часто используемых молекул, самоорганизующихся на золотых электродах, является ДНК. Благодаря своей молекулярной структуре двухцепочечные молекулы ДНК отрицательно заряжены и жесткие. Прикладывая переменный потенциал к биоповерхности, прикрепленные нити ДНК могут систематически перемещаться, поскольку они будут переключаться между вертикальным и плоским положением. [4] [5] Это позволяет использовать биоповерхность в качестве биосенсора.

Приложения

Возможность контролировать потенциал электрода для электропереключаемых биоповерхностей облегчает несколько различных применений. [6] Одним из примеров является область молекулярной электроники , например, исследование переноса заряда, опосредованного ДНК. [7] [8]

Другое применение — анализ молекулярных взаимодействий. Для этого цепь ДНК метится флуоресцентным красителем . Возбужденные флуоресцентные красители могут передавать энергию металлу. Следовательно, флуоресценция гасится вблизи металлического электрода. [9] [10] Для измерения взаимодействий лиганд дополнительно присоединяется к головке молекулы ДНК, а взаимодействующее аналит пропускается через биосенсор. С помощью биосенсора можно выполнять два различных режима измерения: статический и динамический. В статическом режиме потенциал, приложенный к электроду, фиксируется, удерживая молекулу ДНК в вертикальном положении. Связывание аналита с лигандом изменит локальное окружение флуоресцентного красителя и тем самым гасит его флуоресценцию. Статический режим также можно использовать для измерения активности ферментов, таких как полимеразы , которые влияют на структуру молекулы ДНК. [11] В динамическом режиме потенциал, приложенный к электроду, колеблется, таким образом, молекула ДНК переключается между вертикальным и горизонтальным положением. Связывание аналита изменит размер присоединенного комплекса. Следовательно, гидродинамическое трение изменится, и молекула ДНК будет двигаться через буфер с другой скоростью. Это изменение скорости можно использовать для исследования изменений размера или конформационных изменений, вызванных связыванием аналита. Применение электропереключаемых биоповерхностей в качестве датчика молекулярных взаимодействий также известно как технология switchSENSE. [12] [13] [14] [15] [16] Он относится к категории микрофлюидных поверхностно-связанных методов измерения молекулярных взаимодействий.

На рисунке схематически изображен статический режим измерения, в котором потенциал электрода отрицательный, а молекула ДНК находится в вертикальном положении. Кроме того, на нем показан динамический режим измерения с колеблющейся молекулой ДНК из-за переменного потенциала, приложенного к электроду. В-третьих, на нем показана молекула ДНК, которая удлиняется ферментом, в результате чего расстояние красителя от поверхности электрода увеличивается.
Электропереключаемые биоповерхности, снабженные цепями ДНК, могут использоваться для анализа связывания аналита с лигандом, конформаций или ферментативной активности. V = напряжение, приложенное к электроду.

Аналогичным применением в этой категории является поверхностный плазмонный резонанс (SPR) , где тонкая золотая пленка на стеклянном слайде является сенсорной поверхностью. В SPR золотая пленка может быть дополнительно модифицирована SAM или другими специальными слоями. Одним из отличий от электропереключаемых биоповерхностей является то, что к поверхности SPR не прикладывается потенциал. [17] В отличие от методов, связанных с поверхностью, существуют также методы измерения молекулярных взаимодействий в растворе, например, изотермическая титрационная калориметрия (ITC).

Электрический потенциал может использоваться не только для управления движением цепей ДНК, но и для управления высвобождением молекул в раствор. Это может найти применение в области генной терапии , поскольку может обеспечить доставку генетического материала в определенные места. [6]

Смотрите также

Ссылки

  1. ^ Химабинду Нандивада, Афтин М. Росс, Йорг Лаханн, Реагирующие на стимулы монослои для биотехнологии, Progress in Polymer Science, том 35, выпуски 1–2, 2010, страницы 141–154, ISSN 0079-6700, https://doi.org/10.1016/j.progpolymsci.2009.11.001
  2. ^ Ларомейн, А. и Мейс, К. Р. (2013). Самоорганизующиеся монослои как модельные биоповерхности. В органических наноматериалах (ред. Т. Торрес и Г. Боттари). https://doi.org/10.1002/9781118354377.ch17
  3. ^ Love JC, Estroff LA, Kriebel JK, Nuzzo RG, Whitesides GM. Самоорганизующиеся монослои тиолятов на металлах как форма нанотехнологии. Chem Rev. 2005;105(4):1103-1169. doi:10.1021/cr0300789
  4. ^ Ориентация спиралей ДНК на золоте с использованием приложенных электрических полей. Шана О. Келли, Жаклин К. Бартон, Николь М. Джексон, Ли Д. Макферсон, Аарон Б. Поттер, Эйлин М. Спейн, Майкл Дж. Аллен и Майкл Г. Хилл. Ленгмюр 1998 14 (24), 6781-6784. DOI: 10.1021/la980874n
  5. ^ Динамическое электрическое переключение слоев ДНК на металлической поверхности. Ульрих Рант, Кендзи Аринага, Шозо Фудзита, Наоки Ёкояма, Герхард Абштрайтер и Марк Торнов. Nano Letters 2004 4 (12), 2441-2445. DOI: 10.1021/nl0484494
  6. ^ ab Shoseyov, O. & Levy, Ilan. (2008). NanoBioTechnology: BioInspired устройства и материалы будущего. 10.1007/978-1-59745-218-2.
  7. ^ Келли SO, Джексон NM, Хилл MG, Бартон JK. Перенос электронов на большие расстояния через пленки ДНК. Angew Chem Int Ed Engl. 1999;38(7):941-945. doi:10.1002/(SICI)1521-3773(19990401)38:7<941::AID-ANIE941>3.0.CO;2-7
  8. ^ Muren NB, Olmon ED, Barton JK. Раствор, поверхность и одиночные молекулярные платформы для изучения ДНК-опосредованного переноса заряда. Phys Chem Chem Phys. 2012;14(40):13754-13771. doi:10.1039/c2cp41602f
  9. ^ Chance, RR, Prock, A. и Silbey, R. (1978). Молекулярная флуоресценция и перенос энергии вблизи интерфейсов. В Advances in Chemical Physics (редакторы I. Prigogine и SA Rice). https://doi.org/10.1002/9780470142561.ch1
  10. ^ Перссон, Бо. (2001). Теория затухания возбужденных молекул, расположенных над металлической поверхностью. Журнал физики C: Физика твердого тела. 11. 4251. 10.1088/0022-3719/11/20/020.
  11. ^ Бек Г., Эннифар Э. Технология switchSENSE для анализа кинетики ДНК-полимеразы. Методы Mol Biol. 2021;2247:145-153. doi:10.1007/978-1-0716-1126-5_8
  12. ^ Rant U (2012). «Ощущение с помощью электропереключаемых биоповерхностей». Bioanalytical Reviews. 4 (2–4): 97–114. doi:10.1007/s12566-012-0030-0. S2CID 97122344.
  13. ^ Штрассер Р., Шолль Д., Хампель П. и др. Молекулярное взаимодействие с динамическими датчиками. Биоспектр 18, 724–726 (2012). https://doi.org/10.1007/s12268-012-0252-2
  14. ^ Сенднер, К., Ким, И. В., Рант, У., Аринага, К., Торнов, М. и Нетц, Р. Р. (2006), Динамика молекул ДНК с привитыми концами и возможные применения в биосенсорах. Phys. stat. sol. (a), 203: 3476-3491. https://doi.org/10.1002/pssa.200622444
  15. ^ Клери А, Сохье TJM, Вельте Т, Лангер А, Аллен FHT. switchSENSE: новая технология изучения взаимодействий белок-РНК. Методы. 2017;118-119:137-145. doi:10.1016/j.ymeth.2017.03.004
  16. ^ Велюр, К., Омон-Никез, М., Юбель, С. и др. Макромолекулярные взаимодействия in vitro, сравнение классических и новых подходов. Eur Biophys J 50, 313–330 (2021). https://doi.org/10.1007/s00249-021-01517-5
  17. ^ Дрозд М., Карон С., Малиновска Э. Последние достижения в области проектирования рецепторных слоев для применения в иммунодиагностике на основе SPR. Датчики (Базель). 2021;21(11):3781. Опубликовано 29 мая 2021 г. doi:10.3390/s21113781