Мужская гонка на время на чемпионате мира по шоссейным велогонкам UCI 2006 года состоялась 21 сентября 2006 года в австрийском городе Зальцбург . Гонка была частью чемпионата мира по шоссейным велогонкам UCI . Швейцарский гонщик Фабиан Канчеллара выиграл золотую медаль и радужную майку чемпиона мира по шоссейным велогонкам 2006 года.
Каждой национальной федерации было разрешено выставить 2 гонщиков. В итоге для участия в гонке были отобраны 53 гонщика, при этом польский гонщик Петр Мазур не стартовал, фактически в гонке приняли участие 52 гонщика.