Микропроцессорный комплексный субблок DGCR8

Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens

Субъединица микропроцессорного комплекса DGCR8 ( критическая область 8 синдрома ДиДжорджи ) — это белок , который у людей кодируется геном DGCR8 . ^[4] У других животных, в частности, у распространенных модельных организмов Drosophila melanogaster и Caenorhabditis elegans , этот белок известен как Pasha (партнер Drosha ). ^[5] Он является необходимым компонентом пути РНК-интерференции .

Функция

Субъединица DGCR8 локализована в ядре клетки и необходима для обработки микроРНК (miRNA). Она связывается с другой субъединицей Drosha , ферментом РНКазы III , для формирования комплекса микропроцессора , который расщепляет первичный транскрипт, известный как pri-miRNA, на характерную структуру стебля-петли, известную как pre-miRNA, которая затем далее обрабатывается до фрагментов miRNA ферментом Dicer . DGCR8 содержит домен связывания РНК и, как полагают, связывает pri-miRNA, чтобы стабилизировать ее для обработки Drosha. ^[6]

DGCR8 также требуется для некоторых типов репарации ДНК. Удаление фотопродуктов ДНК, вызванных УФ-излучением , во время транскрипционно-связанной репарации нуклеотидов (TC-NER) зависит от фосфорилирования JNK DGCR8 на серине 153. ^[7] Хотя известно, что DGCR8 функционирует в биогенезе микроРНК, эта активность не требуется для DGCR8-зависимого удаления фотопродуктов, вызванных УФ-излучением. ^[7] Нуклеотидная репарация эксцизии также необходима для восстановления окислительного повреждения ДНК, вызванного перекисью водорода ( H ₂ O ₂ ), и клетки с истощенным DGCR8 чувствительны к H ₂ O ₂ . ^[7]

Ссылки

1. GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000128191 – Ensembl , май 2017 г.
2. "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
3. "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
4. "Ген Энтреза: DGCR8, ген критической области синдрома ДиДжорджи 8".
5. Denli AM, Tops BB, Plasterk RH, Ketting RF, Hannon GJ (ноябрь 2004 г.). «Обработка первичных микроРНК микропроцессорным комплексом». Nature . 432 (7014): 231–5. Bibcode :2004Natur.432..231D. doi :10.1038/nature03049. PMID  15531879. S2CID  4425505.
6. Yeom KH, Lee Y, Han J, Suh MR, Kim VN (2006). «Характеристика DGCR8/Pasha, основного кофактора для Drosha в первичной обработке miRNA». Nucleic Acids Research . 34 (16): 4622–9. doi :10.1093/nar/gkl458. PMC 1636349. PMID  16963499 . 
7. Calses PC, Dhillon KK, Tucker N, Chi Y, Huang JW, Kawasumi M, Nghiem P, Wang Y, Clurman BE, Jacquemont C, Gafken PR, Sugasawa K, Saijo M, Taniguchi T (2017). "DGCR8 опосредует восстановление повреждений ДНК, вызванных УФ-излучением, независимо от обработки РНК". Cell Rep . 19 (1): 162–174. doi :10.1016/j.celrep.2017.03.021. PMC 5423785. PMID  28380355 . 

Дальнейшее чтение

• Simpson JC, Wellenreuther R, Poustka A, Pepperkok R, Wiemann S (сентябрь 2000 г.). «Систематическая субклеточная локализация новых белков, идентифицированных с помощью крупномасштабного секвенирования кДНК». EMBO Reports . 1 (3): 287–92. doi :10.1093/embo-reports/kvd058. PMC  1083732. PMID  11256614 .
• Shiohama A, Sasaki T, Noda S, Minoshima S, Shimizu N (апрель 2003 г.). «Молекулярное клонирование и анализ экспрессии нового гена DGCR8, расположенного в хромосомной области синдрома ДиДжорджи». Biochemical and Biophysical Research Communications . 304 (1): 184–90. doi :10.1016/S0006-291X(03)00554-0. PMID  12705904.
• Грегори Р.И., Ян КП, Амутхан Г, Чендримада Т, Доратотай Б, Куч Н, Шихаттар Р (ноябрь 2004 г.). «Микропроцессорный комплекс опосредует генезис микроРНК». Природа . 432 (7014): 235–40. Бибкод : 2004Natur.432..235G. дои : 10.1038/nature03120. PMID  15531877. S2CID  4389261.
• Han J, Lee Y, Yeom KH, Kim YK, Jin H, Kim VN (декабрь 2004 г.). «Комплекс Drosha-DGCR8 в первичной обработке микроРНК». Genes & Development . 18 (24): 3016–27. doi :10.1101/gad.1262504. PMC  535913. PMID  15574589 .
• Landthaler M, Yalcin A, Tuschl T (декабрь 2004 г.). «Ген 8 критической области синдрома ДиДжорджи у человека и его гомолог D. melanogaster необходимы для биогенеза miRNA». Current Biology . 14 (23): 2162–7. Bibcode :2004CBio...14.2162L. doi :10.1016/j.cub.2004.11.001. hdl : 11858/00-001M-0000-0012-EB83-3 . PMID  15589161. S2CID  13266269.
• Han J, Lee Y, Yeom KH, Nam JW, Heo I, Rhee JK, Sohn SY, Cho Y, Zhang BT, Kim VN (июнь 2006 г.). «Молекулярная основа распознавания первичных микроРНК комплексом Drosha-DGCR8». Cell . 125 (5): 887–901. doi : 10.1016/j.cell.2006.03.043 . PMID  16751099.
• Faller M, Matsunaga M, Yin S, Loo JA, Guo F (январь 2007 г.). «Гем участвует в обработке микроРНК». Nature Structural & Molecular Biology . 14 (1): 23–9. doi :10.1038/nsmb1182. PMID  17159994. S2CID  17463646.
• Sohn SY, Bae WJ, Kim JJ, Yeom KH, Kim VN, Cho Y (сентябрь 2007 г.). «Кристаллическая структура ядра человеческого DGCR8». Nature Structural & Molecular Biology . 14 (9): 847–53. doi :10.1038/nsmb1294. PMID  17704815. S2CID  18561478.