Артробактерия лютеус

Виды бактерий семейства Micrococcaceae

Arthrobacter luteus (ALU) — вид грамположительных бактерий рода Arthrobacter . A. luteus — факультативно анаэробный , плеоморфный , ветвящийся, неподвижный , не образующий спор , некислотоустойчивый , каталаза -положительный и палочковидный (0,6–1,0 мкм × 0,8–10,0 мкм) микроорганизм. ^[1]

Фермент рестриктазы извлекается из бактерии и действует в центре палиндромной тетрануклеотидной последовательности, образуя четные дуплексные фрагменты ДНК, фосфорилированные на 5'-конце . Сам сайт рестрикции Alu-I является 4-основным резаком: AG/CT. ^[2] Alu - ретротранспозон назван в честь аббревиатуры бактерии. Бактерия также используется для получения зимолиазы , ^[3] которая может разрушать клеточную стенку дрожжей.

Фон

Arthrobacter luteus был выделен из сточных вод пивоваренного завода в ходе исследования, проведенного в Такасаки, Япония, в 1969 году. Группа изучила выделенные бактерии таксономически и обнаружила, что они являются грамположительными, факультативно анаэробными, плеоморфными, ветвящимися, неподвижными, неспорулирующими, некислотоустойчивыми и каталазоположительными палочками. Бактерии также восстанавливали нитрат, гидролизовали крахмал и разжижали желатин, а также производили кислоты из углеводов. Затем они сравнили выделенные бактерии с 18 другими цепями подобных микроорганизмов и обнаружили, что они относятся к роду Arthrobacter , но не было обнаружено никаких конкретных видов. Таким образом, изолятам было дано название « Arthrobacter luteus ». ^[4]

Исследовать

Была выделена эндонуклеаза рестрикции, которая представляет собой белок, вырабатываемый бактериями, расщепляющий ДНК в определенных участках вдоль молекулы, ^[5] , которая происходит из Arthrobacter luteus , и выделена нуклеотидная последовательность в месте расщепления рестрикции. Расщепление происходит в центре палиндромной тетрануклеотидной последовательности, что дает четные концевые дуплексные фрагменты ДНК, фосфорилированные на 5'-конце. Палиндромный тетрануклеотид представляет собой последовательность с 4 нуклеотидами, которые могут быть прочитаны одинаково как в прямом, так и в обратном направлении. ^[6] Рестрикционная эндонуклеаза расщепляет ДНК формы I SV40 на 32 фрагмента, что довольно необычно, поскольку большинство других расщепляют гораздо меньше. Затем Alu будет использоваться для расщепления ДНК SV40. Фрагменты удалось расположить таким образом, чтобы можно было показать физическую карту расщепления генома SV40. ^[7]

ХарактеристикиАртробактерия лютеус

Морфологические, физиологические и биохимические характеристики Arthrobacter luteus представлены в таблице ниже.

Примечание:

+ = Положительный

- = Отрицательно

± = Незначительное производство

Ссылки

1. Канеко Т., Китамура К., Ямамото Й. (1969). "Arthrobacter luteus nov. sp. Выделенный из сточных вод пивоваренного завода". Журнал общей и прикладной микробиологии . 15 (3): 317–326. doi : 10.2323/jgam.15.317 .
2. Абдурашитов, Мурат А.; Томилов, Виктор Н.; Чернухин, Валерий А.; Дегтярев, Сергей (2008). "Физическая карта расщепления человеческих Alu-повторов эндонуклеазами рестрикции". BMC Genomics . 9 : 305. doi : 10.1186/1471-2164-9-305 . PMC 2443384 . PMID  18578890. 
3. Китамура, Кумпей; Канеко, Тацухико; Ямамото, Ясуши (1974). «Лизис жизнеспособных дрожжевых клеток ферментами Arthrobacter luteus». Журнал общей и прикладной микробиологии . 20 (6): 323–344. doi : 10.2323/jgam.20.323 .
4. Канеко, Тацухико (8 февраля 1969 г.). «Arthrobacter luteus nov. sp. Выделен из сточных вод пивоваренного завода». J. Gen. Appl. Microbiol . 15 (3): 317–326. doi : 10.2323/jgam.15.317 . S2CID  84431009 – через J-Stage.
5. "рестрикционный фермент | Определение, функция и типы | Britannica". www.britannica.com . Получено 21.04.2022 .
6. "Определение ПАЛИНДРОМ". www.merriam-webster.com . Получено 2022-03-12 .
7. Эрнест, Джей (26 февраля 2022 г.). «Анализ нуклеотидной последовательности ДНК. 28. Последовательность распознавания эндонуклеазы рестрикции Arthrobacter luteus и ее карта расщепления ДНК SV40». Биохимия . 15 (16): 3612–3620. doi :10.1021/bi00661a032. PMID  182213 – через ACS Publications.