Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens
Белок якоря А-киназы 13 — это белок , который у людей кодируется геном AKAP13 . [5] [6] [7] Этот белок также называется AKAP-Lbc, поскольку он кодирует онкоген бластного кризиса лимфоцитов (Lbc) , и ARHGEF13/RhoGEF13, поскольку он содержит домен фактора обмена гуаниновых нуклеотидов (GEF) для малого ГТФ-связывающего белка RhoA .
Функция
A-киназный якорный белок 13/Rho фактор обмена гуаниновыми нуклеотидами 13 является фактором обмена гуаниновыми нуклеотидами (GEF) для малого белка GTPase RhoA . [8] [9] Rho является малым белком GTPase , который неактивен при связывании с гуаниновым нуклеотидом GDP . Но при воздействии белков Rho GEF, таких как AKAP13, этот GDP высвобождается и заменяется GTP , что приводит к активному состоянию Rho. В этой активной, связанной с GTP конформации Rho может связываться и активировать специфические эффекторные белки и ферменты для регулирования клеточных функций. [10] В частности, активный Rho является основным регулятором актинового цитоскелета клетки . [10]
AKAP13 является членом группы из четырех белков RhoGEF, которые, как известно, активируются рецепторами, сопряженными с G-белками, сопряженными с гетеротримерными G-белками G 12 и G 13. [8] [9] Другими являются ARHGEF1 (также известный как p115-RhoGEF), ARHGEF11 (также известный как PDZ-RhoGEF) и ARHGEF12 (также известный как LARG). [11] [8] AKAP13, регулируемый GPCR (и эти родственные белки GEF), действует как эффектор для G-белков G 12 и G 13. В отличие от трех других членов, AKAP13 не функционирует как активирующие GTPase-белки семейства RGS (GAP), чтобы увеличить скорость гидролиза GTP альфа-белков G 12 /G 13. [12]
Белки-якоря A-киназы (AKAP) представляют собой группу структурно разнообразных белков, которые имеют общую функцию связывания с регуляторной субъединицей протеинкиназы A (PKA), тем самым ограничивая голофермент дискретными локациями внутри клетки. Ген AKAP13 кодирует члена семейства AKAP, поскольку белок прочно связывается с PKA, особенно в сердце.
Альтернативный сплайсинг этого гена приводит к по крайней мере 3 вариантам транскриптов, кодирующим различные изоформы. Все три содержат домен гомологии онкогена Dbl (DH) плюс домен гомологии плекстрина (PH) (домен DH/PH), характерный для семейства GEF Rho, в то время как только две более длинные изоформы также содержат домен AKAP. [7] Следовательно, эти изоформы могут функционировать как белки-подложки для координации сигнализации Rho и сигнализации протеинкиназы A.
Взаимодействия
Было показано, что AKAP13 взаимодействует с:
Смотрите также
Ссылки
- ^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000170776 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000066406 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ ab Rubino D, Driggers P, Arbit D, Kemp L, Miller B, Coso O и др. (май 1998 г.). «Характеристика Brx, нового члена семейства Dbl, который модулирует действие рецептора эстрогена». Oncogene . 16 (19): 2513–26. doi :10.1038/sj.onc.1201783. PMID 9627117. S2CID 20906586.
- ^ Carr DW, Stofko-Hahn RE, Fraser ID, Bishop SM, Acott TS, Brennan RG, Scott JD (август 1991 г.). «Взаимодействие регуляторной субъединицы (RII) цАМФ-зависимой протеинкиназы с RII-якорными белками происходит через мотив связывания амфипатической спирали». Журнал биологической химии . 266 (22): 14188–92. doi : 10.1016/S0021-9258(18)98665-5 . PMID 1860836.
- ^ ab "Ген Entrez: якорный белок киназы AKAP13 A (PRKA) 13".
- ^ abc Diviani D, Soderling J, Scott JD (ноябрь 2001 г.). «AKAP-Lbc закрепляет протеинкиназу A и стимулирует образование селективных Rho-опосредованных стрессовых волокон Galpha 12». Журнал биологической химии . 276 (47): 44247–57. doi : 10.1074/jbc.M106629200 . PMID 11546812.
- ^ abcd Dutt P, Nguyen N, Toksoz D (февраль 2004 г.). "Роль Lbc RhoGEF в сигналах, индуцированных Galpha12/13, к Rho GTPase". Cellular Signalling . 16 (2): 201–9. doi :10.1016/S0898-6568(03)00132-3. PMID 14636890.
- ^ ab Thumkeo D, Watanabe S, Narumiya S (октябрь–ноябрь 2013 г.). «Физиологическая роль Rho и эффекторов Rho у млекопитающих». European Journal of Cell Biology . 92 (10–11): 303–15. doi :10.1016/j.ejcb.2013.09.002. PMID 24183240.
- ^ Fukuhara S, Chikumi H, Gutkind JS (март 2001 г.). «RGS-содержащие RhoGEF: недостающее звено между трансформирующими G-белками и Rho?». Oncogene . 20 (13): 1661–8. doi : 10.1038/sj.onc.1204182 . PMID 11313914.
- ^ Kozasa T (апрель 2001 г.). «Регулирование передачи сигнала, опосредованного G-белком, белками RGS». Life Sciences . 68 (19–20): 2309–17. doi :10.1016/S0024-3205(01)01020-7. PMID 11358341.
- ^ Парк Б., Нгуен Н.Т., Датт П., Мердек К.Д., Башар М., Стерпетти П. и др. (ноябрь 2002 г.). «Ассоциация фактора обмена гуаниновых нуклеотидов Lbc Rho с белком, родственным альфа-катенину, альфа-катулин / CTNNAL1, поддерживает активацию фактора ответа сыворотки». Журнал биологической химии . 277 (47): 45361–70. дои : 10.1074/jbc.M202447200 . ПМИД 12270917.
- ^ Alto NM, Soderling SH, Hoshi N, Langeberg LK, Fayos R, Jennings PA, Scott JD (апрель 2003 г.). «Биоинформатическое проектирование белка закрепления А-киназы in silico: мощный и селективный пептидный антагонист закрепления протеинкиназы А типа II». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 100 (8): 4445–50. Bibcode : 2003PNAS..100.4445A. doi : 10.1073/pnas.0330734100 . PMC 153575. PMID 12672969.
- ^ Carr DW, Hausken ZE, Fraser ID, Stofko-Hahn RE, Scott JD (июль 1992 г.). «Связь цАМФ-зависимой протеинкиназы типа II с белком, заякоривающим RII щитовидной железы человека. Клонирование и характеристика домена связывания RII». Журнал биологической химии . 267 (19): 13376–82. doi : 10.1016/S0021-9258(18)42221-1 . PMID 1618839.
Внешние ссылки
- Расположение генома человека AKAP13 и страница с подробностями гена AKAP13 в браузере геномов UCSC .
- Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : Q12802 (белок-якорь А-киназы 13) на сайте PDBe-KB .
Дальнейшее чтение
- Hausken ZE, Coghlan VM, Hastings CA, Reimann EM, Scott JD (сентябрь 1994 г.). "Для регуляторной субъединицы II типа (RII) взаимодействия цАМФ-зависимой протеинкиназы с якорными белками А-киназы требуются изолейцины 3 и 5". Журнал биологической химии . 269 (39): 24245–51. doi : 10.1016/S0021-9258(19)51074-2 . PMID 7929081.
- Toksoz D, Williams DA (февраль 1994). «Новый человеческий онкоген lbc, обнаруженный путем трансфекции с различными областями гомологии для продуктов сигнальной трансдукции». Oncogene . 9 (2): 621–8. PMID 8290273.
- Sterpetti P, Hack AA, Bashar MP, Park B, Cheng SD, Knoll JH и др. (февраль 1999 г.). «Активация протоонкогена фактора обмена Lbc Rho путем усечения расширенного C-конца, который регулирует трансформацию и нацеливание». Молекулярная и клеточная биология . 19 (2): 1334–45. doi :10.1128/mcb.19.2.1334. PMC 116062. PMID 9891067.
- Sagi SA, Seasholtz TM, Kobiashvili M, Wilson BA, Toksoz D, Brown JH (май 2001 г.). «Физические и функциональные взаимодействия Galphaq с Rho и его факторами обмена». Журнал биологической химии . 276 (18): 15445–52. doi : 10.1074/jbc.M008961200 . PMC 1761691. PMID 11278452 .
- Newlon MG, Roy M, Morikis D, Carr DW, Westphal R, Scott JD, Jennings PA (апрель 2001 г.). «Новый механизм закрепления PKA, выявленный с помощью структур растворов закрепляющих комплексов». The EMBO Journal . 20 (7): 1651–62. doi :10.1093/emboj/20.7.1651. PMC 145475. PMID 11285229 .
- Klussmann E, Edemir B, Pepperle B, Tamma G, Henn V, Klauschenz E и др. (Ноябрь 2001 г.). "Ht31: первый белок, закрепляющий протеинкиназу A, для интеграции протеинкиназы A и сигнализации Rho". FEBS Letters . 507 (3): 264–8. doi : 10.1016/S0014-5793(01)02995-7 . PMID 11696353.
- Tan YC, Wu H, Wang WN, Zheng Y, Wang ZX (ноябрь 2002 г.). «Характеристика взаимодействий между малой ГТФазой RhoA и ее факторами обмена гуаниновых нуклеотидов». Аналитическая биохимия . 310 (2): 156–62. doi :10.1016/S0003-2697(02)00382-2. PMID 12423633.
- Спирингс Э., Брикнер А.Г., Колдуэлл Дж.А., Зегвельд С., Тацис Н., Блокланд Э. и др. (июль 2003 г.). «Малый антиген гистосовместимости HA-3 возникает в результате дифференциального протеасомного расщепления онкопротеина лимфоидного бластного кризиса (Lbc)». Кровь . 102 (2): 621–9. doi : 10.1182/blood-2003-01-0260. PMID 12663445. S2CID 17864975.
- Hornemann T, Kempa S, Himmel M, Hayess K, Fürst DO, Wallimann T (сентябрь 2003 г.). «Креатинкиназа мышечного типа взаимодействует с центральными доменами белков М-полосы миомезина и М-белка». Журнал молекулярной биологии . 332 (4): 877–87. doi :10.1016/S0022-2836(03)00921-5. PMID 12972258.
- Chen LY, Zuraw BL, Ye RD, Pan ZK (февраль 2004 г.). «Фактор обмена Rho опосредует активацию NF-kappaB, вызванную fMet-Leu-Phe, в моноцитах периферической крови человека». Журнал биологической химии . 279 (8): 7208–12. doi : 10.1074/jbc.M309542200 . PMID 14660653.