Руди Эберсолд

Швейцарский биолог (родился в 1954 году)

Рудольф Эберсольд (более известный как Руди Эберсольд ; родился 12 сентября 1954 г. ^[1] ) — швейцарский биолог, считающийся пионером в области протеомики и системной биологии . Он в основном исследовал методы измерения белков в сложных образцах, во многих случаях с помощью масс-спектрометрии . Руди Эберсольд — профессор системной биологии в Институте молекулярной системной биологии (IMSB) в Швейцарской высшей технической школе Цюриха . ^[2] Он был одним из основателей Института системной биологии в Сиэтле, штат Вашингтон, США, где ранее у него была исследовательская группа. ^[3]

Эберсолд известен разработкой и применением методов целевой протеомики в области биомедицинских исследований для понимания функции, взаимодействия и локализации каждого белка в клетке и его изменений при болезненных состояниях. ^{[4] [5] [6]} С этой целью Руди Аберсолд внес значительный вклад в разработку и применение методов целевой протеомики, включая мониторинг выбранных реакций ^{[7] [8] [9]} и получение данных, не зависящих от данных. ^{[10] [11]} Руди Эберсолд также известен своим вкладом в разработку стандартных форматов и программного обеспечения с открытым исходным кодом для анализа и хранения данных масс-спектрометрии и протеомики, ^[12] и он является одним из изобретателей метода Isotope-Coded Affinity Tag (ICAT) для количественной протеомики, метода, который измеряет относительное количество белков между двумя образцами с помощью меток, содержащих стабильные изотопы разных масс. ^{[13] [14]}

Эберсолд является соучредителем и научным консультантом компаний ProteoMediX ^[15] и Biognosys. ^[16]

Почести и награды

• 2005 – Премия HUPO ^[1]
• 2006 – Медаль Бюхнера ^[1]
• 2008 г. – В знак признания его вклада в область белковых наук и протеомики Ассоциация биомолекулярных ресурсных учреждений (ABRF) выбрала его для получения премии ABRF 2008. ^[1]
• 2010 – Лекторская деятельность Герберта А. Трезвого ^[17]
• 2010 - Премия Отто Нэгели ^{[17] [18]}
• 2012 – Медаль Томсона ^[19]
• В 2014 году он стал членом Немецкой академии наук Леопольдина . ^[20]
• 2015 – занял 1-е место в списке «самых влиятельных людей в аналитических науках» 2015 года (по версии журнала Analytical Scientist) ^[21]
• 2018 - Медаль Биджвоет Центра биомолекулярных исследований Биджвоет Утрехтского университета ^[22]
• 2020 – Премия Марселя Бенуа ^[23]

Ссылки

1. "Curriculum Vitae – Ruedi Aebersold" (PDF) . Получено 2 декабря 2012 г. .
2. "ETH – IMSB Prof. Ruedi Aebersold" . Получено 2011-07-26 .
3. "Институт системной биологии: Aebersold Group". Архивировано из оригинала 2011-07-20 . Получено 26-07-2011 .
4. Aebersold R, Mann M (март 2003 г.). «Протеомика на основе масс-спектрометрии». Nature . 422 (6928): 198–207. Bibcode :2003Natur.422..198A. doi :10.1038/nature01511. PMID  12634793. S2CID  118260.
5. Aebersold R, Mann M (сентябрь 2016 г.). «Масс-спектрометрическое исследование структуры и функции протеома». Nature . 537 (7620): 347–55. Bibcode :2016Natur.537..347A. doi :10.1038/nature19949. PMID  27629641. S2CID  4448087.
6. Bensimon A, Heck AJ, Aebersold R (2012). «Протеомика на основе масс-спектрометрии и сетевая биология». Annual Review of Biochemistry . 81 : 379–405. doi :10.1146/annurev-biochem-072909-100424. PMID  22439968.
7. Пикотти П., Боденмиллер Б., Мюллер Л.Н., Домон Б., Эберсолд Р. (август 2009 г.). «Полный динамический диапазон протеомного анализа S. cerevisiae с помощью целевой протеомики». Cell . 138 (4): 795–806. doi :10.1016/j.cell.2009.05.051. PMC 2825542 . PMID  19664813. 
8. Пикотти П., Риннер О., Шталлмах Р., Даутел Ф., Фарра Т., Домон Б., Веншу Х., Эберсолд Р. (январь 2010 г.). «Высокопроизводительное поколение выбранных анализов мониторинга реакций для белков и протеомов». Nature Methods . 7 (1): 43–6. doi :10.1038/nmeth.1408. PMID  19966807. S2CID  193432.
9. Пикотти П., Боденмиллер Б., Эберсолд Р. (январь 2013 г.). «Протеомика встречается с научным методом». Nature Methods . 10 (1): 24–7. doi :10.1038/nmeth.2291. PMID  23269373. S2CID  1362416.
10. Gillet LC, Navarro P, Tate S, Röst H, Selevsek N, Reiter L, Bonner R, Aebersold R (июнь 2012 г.). "Целевое извлечение данных спектров MS/MS, полученных путем получения данных, независимых от данных: новая концепция для последовательного и точного анализа протеома". Molecular & Cellular Proteomics . 11 (6): O111.016717. doi : 10.1074/mcp.O111.016717 . PMC 3433915 . PMID  22261725. 
11. Schubert OT, Gillet LC, Collins BC, Navarro P, Rosenberger G, Wolski WE, Lam H, Amodei D, Mallick P, MacLean B, Aebersold R (март 2015 г.). «Создание высококачественных библиотек анализов для целевого анализа данных SWATH MS». Nature Protocols . 10 (3): 426–41. doi :10.1038/nprot.2015.015. PMID  25675208. S2CID  21543665.
12. Pedrioli PG, Eng JK, Hubley R, Vogelzang M, Deutsch EW, Raught B, Pratt B, Nilsson E, Angeletti RH, Apweiler R, Cheung K, Costello CE, Hermjakob H, Huang S, Julian RK, Kapp E, McComb ME, Oliver SG, Omenn G, Paton NW, Simpson R, Smith R, Taylor CF, Zhu W, Aebersold R (ноябрь 2004 г.). «Общее открытое представление данных масс-спектрометрии и его применение в исследованиях протеомики». Nature Biotechnology . 22 (11): 1459–66. doi :10.1038/nbt1031. PMID  15529173. S2CID  25734712.
13. Yan W, Lee H, Deutsch EW, Lazaro CA, Tang W, Chen E, Fausto N, Katze MG, Aebersold R (октябрь 2004 г.). «Набор данных белков печени человека, идентифицированных с помощью профилирования белков с помощью изотопно-кодированной аффинной метки (ICAT) и тандемной масс-спектрометрии». Молекулярная и клеточная протеомика . 3 (10): 1039–41. doi : 10.1074/mcp.D400001-MCP200 . PMID  15269248.
14. Gygi SP, Rist B, Gerber SA, Turecek F, Gelb MH, Aebersold R (октябрь 1999 г.). «Количественный анализ сложных белковых смесей с использованием изотопно-кодированных аффинных меток». Nature Biotechnology . 17 (10): 994–9. doi :10.1038/13690. PMID  10504701. S2CID  16273431.
15. "ProteoMediX AG - Advisors - Цюрих, Швейцария" . Получено 2 декабря 2012 г.
16. "Наша команда | Biognosys AG" . Получено 2 декабря 2012 г.
17. "A major honor" . Получено 26 декабря 2017 .
18. "Пионер дер Eiweissforschung gehrt" . 30 апреля 2010 года . Проверено 2 декабря 2012 г.
19. "The 2014 Thomson Medal Award IMSC 2014" . Получено 8 апреля 2014 г. .
20. "Ruedi Aebersold". Немецкая академия наук Леопольдина . Получено 26 мая 2021 г.
21. "Powerlist – The Analytical Scientist" . Получено 4 ноября 2015 г. .
22. "Медаль Биджвоет". Центр биомолекулярных исследований Биджвоет . Проверено 24 апреля 2018 г.
23. Премия Марселя Бенуа 2020 г.