stringtranslate.com

Аквифекс пирофилус

Aquifex pyrophilus — это грамотрицательная , не образующая спор , палочковидная бактерия . Это один из немногих видов в типе Aquificota , представляющем собой группу термофильных бактерий, которые встречаются вблизи подводных вулканов или горячих источников . [1] [2]

Этимология

Aquifex pyrophilus имеет название, которое ссылается на его дыхание и среду обитания . Название «Aquifex» означает «водотворец» на латыни . Название было присвоено A. pyrophilus , потому что он обычно использует кислород для своего дыхания и воду в качестве побочного продукта . [3] Название «Pyrophilus» можно разбить на «Pyro» и «Philus». «Pyro» на латыни означает огонь, тепло или высокую температуру, а «Philus» — латинское слово, означающее «любящий». Поэтому термин «pyrophilus» можно интерпретировать как «любящий тепло», что относится к среде обитания A. pyrophilus , в которой он обычно встречается. [ требуется ссылка ]

Место обитания

Хребет Кольбейнсей находится между Гренландией , Исландией и микроконтинентом Ян-Майен . Это место, где был обнаружен Aquifex pyrophilus . Это подводный хребет с высокой вулканической активностью.

Род Aquifex содержит некоторые из самых термофильных бактерий из всех известных бактерий. A. pyrophilus — это водный микроб, который обычно встречается вблизи подводных вулканов , морских гидротермальных источников и/или горячих источников , где температуры чрезвычайно высоки, а давление может быть огромным. [4] A. pyrophilus показал устойчивость к ультрафиолетовому свету и ионизирующему излучению . [4] Род Aquifex довольно непереносим к кислороду, поэтому он встречается только в средах с низким содержанием кислорода . Несмотря на это, Aquifex остается одним из немногих известных аэробных бактерий- гипертермофилов . [5] Кислород ограничен вблизи этих гидротермальных источников и подводных вулканов из-за чрезвычайно высокой температуры и восстановительной силы вулканических газов, таких как H2S . A. pyrophilus процветает там, где встречаются кислородные и бескислородные зоны в этих средах из-за высокой доступности водорода и тиосульфата . [6]

Aquifex pyrophilus был обнаружен на хребте Кольбейнсей , к северу от Исландии, Робертом Хубером и Карлом Штеттером в 1992 году. [6] В первом анализе бактерий Хубер и Штеттер обнаружили, что A. pyrophilus имеет оптимальный pH 6,8, но может варьироваться от 5,4 до 7,5, растет при температуре от 67 °C до 95 °C с оптимумом при 85 °C и имеет оптимальный рост при концентрации NaCl 3% (диапазон 1-5%). [6]

A. pyrophilus имеет длину от 2 до 6 микрометров и диаметр около половины микрометра. Он имеет восемь политрихически вставленных жгутиков, что делает его подвижным. [6] A. pyrophilus может расти поодиночке, парами и/или образовывать большие клеточные конгломераты , включающие до 100 отдельных клеток. [6] [7]

Метаболизм

Цепь переноса электронов Aquifex при выращивании в аэробной среде.

A. pyrophilus является строго хемолитоавтотрофным . [6] Он способен использовать кислород для своего дыхания , но может также расти анаэробно за счет восстановления нитрата. [6] В аэробных условиях A. pyrophilus окисляет молекулярный водород и производит H 2 O и АТФ . Другими донорами электронов, которые A. pyrophilus использует в аэробных условиях, являются S° и S 2 O 3 2- . [6] Побочные продукты включают серную кислоту из S° и S 2 O 3 2- и сероводород из S° и H 2. [ 6]

Родословная и филогения

A. pyrophilus имеет относительно небольшой геном . Из известных геномов термофилов A. pyrophilus является самым маленьким. [8] Благодаря своему небольшому геному, способности выживать в условиях экстремальной жары, устойчивости к ультрафиолетовому излучению и ионизирующему излучению , а также благодаря филогенетическому анализу гена малой субъединицы 16S рРНК , A. pyrophilus считается одним из древнейших видов в области бактерий. [9] [10]

Исследования филогенетического положения Aquificales использовали конкатенированные белки, общие для порядка Aquificales и A. pyrophilus . [11] Результаты показывают, что Aquificales наиболее тесно связаны с Thermotogales при наблюдении за информацией о полном геноме. [11] Кроме того, было обнаружено, что Aquificales несколько тесно связаны с ε-протеобактериями на филогенетических деревьях . [11] Эта небольшая двусмысленность в размещении Aquificales на филогенетическом дереве оставляет место для некоторых дополнительных исследований в этой области. Несмотря на это, существуют неопровержимые доказательства того, что Aquificales, включая A. pyrophilus , являются одними из самых ранних бактерий, ответвившихся от архей. [10] Это привело к гипотезе, что эти бактерии эволюционировали, когда Земля была еще горячей и имела тонкую атмосферу . [4]

Ссылки

  1. ^ "aquifex". 2005-03-12. Архивировано из оригинала 2005-03-12 . Получено 2022-09-13 .
  2. ^ Бебло, Кристина; Дуки, Тьерри; Шмальц, Готфрид; Рэйчел, Рейнхард; Вирт, Рейнхард; Хубер, Харальд; Рейтц, Гюнтер; Реттберг, Петра (2011-11-01). «Выживание термофильных и гипертермофильных микроорганизмов после воздействия УФ-С, ионизирующего излучения и высушивания». Архив микробиологии . 193 (11): 797–809. doi :10.1007/s00203-011-0718-5. ISSN  1432-072X. PMID  21638055. S2CID  2281391.
  3. ^ "Aquifex pyrophilus - microbewiki". microbewiki.kenyon.edu . Получено 2022-09-12 .
  4. ^ abc "4.5: Глубоко ветвящиеся бактерии". Biology LibreTexts . 2016-07-10 . Получено 2022-10-11 .
  5. ^ PRATT, C (1997). "£24.95Майкл Т. Мэдиган, Джон М. Мартинко и Джек Паркер, Getting the bug for Micros (8-е изд.), Prentice Hall (1997) ISBN 0 13 571 2254, стр. 986". Trends in Cell Biology . 7 (9): 375–376. doi :10.1016/s0962-8924(97)83479-4. ISSN  0962-8924.
  6. ^ abcdefghi Хубер, Роберт; Вильгарм, Томас; Хубер, Дагмар; Тринконе, Антонио; Бургграф, Зигфрид; Кёниг, Хельмут; Рейнхард, Рэйчел; Рокингер, Ингрид; Фрике, Ганс; Штеттер, Карл О. (1992). "Aquifex pyrophilus gen. nov. sp. nov., представляет новую группу морских гипертермофильных водородоокисляющих бактерий". Систематическая и прикладная микробиология . 15 (3): 340–351. doi :10.1016/S0723-2020(11)80206-7.
  7. ^ Дворкин, Мартин (1999). Прокариоты: развивающийся электронный ресурс для микробиологического сообщества. Springer-Verlag. ISBN 0-387-14254-1. OCLC  421690865.
  8. ^ Шао, З.; Магес, В.; Шмитт, Р. (1994). «Физическая карта хромосомы гипертермофильной бактерии Aquifex pyrophilus». Журнал бактериологии . 176 (21): 6776–6780. doi :10.1128/jb.176.21.6776-6780.1994. ISSN  0021-9193. PMC 197038. PMID 7961434  . 
  9. ^ Декерт, Джерард; Уоррен, Патрик В.; Гаастерланд, Терри; Янг, Уильям Г.; Ленокс, Анна Л.; Грэм, Дэвид Э.; Овербик, Росс; Снид, Марджори А.; Келлер, Мартин; Оджей, Монетт; Хубер, Роберт; Фельдман, Роберт А.; Шорт, Джей М.; Олсен, Гэри Дж.; Свенсон, Рональд В. (1998). «Полный геном гипертермофильной бактерии Aquifex aeolicus». Nature . 392 (6674): 353–358. doi : 10.1038/32831 . ISSN  1476-4687. PMID  9537320. S2CID  4413967.
  10. ^ ab Burggraf, S.; Olsen, GJ; Stetter, KO; Woese, CR (1992-08-01). "Филогенетический анализ Aquifex pyrophilus". Systematic and Applied Microbiology . 15 (3): 352–356. doi :10.1016/S0723-2020(11)80207-9. ISSN  0723-2020.
  11. ^ abc Осима, Кенро; Чиба, Йоко; Игараси, Ясуо; Араи, Хироюки; Исии, Масахару (2012-07-12). "Филогенетическое положение Aquificales на основе полных геномных последовательностей шести видов Aquificales". Международный журнал эволюционной биологии . 2012 : 859264. doi : 10.1155/2012/859264 . ISSN  2090-8032. PMC 3403428. PMID 22844640  . 

Внешние ссылки