АТГ12

Белкокодирующий ген у вида Homo sapiens

Связанный с аутофагией 12 — это белок , который у человека кодируется геном ATG12 . ^{[5] [6]}

Аутофагия — это процесс массовой деградации белков, при котором цитоплазматические компоненты, включая органеллы, заключаются в двухмембранные структуры, называемые аутофагосомами, и доставляются в лизосомы или вакуоли для деградации. ATG12 является человеческим гомологом дрожжевого белка, участвующего в аутофагии (Mizushima et al., 1998). [предоставлено OMIM] ^[6]

Аутофагия требует ковалентного присоединения белка Atg12 к ATG5 через убиквитин -подобную систему конъюгации. Конъюгат Atg12-Atg5 затем способствует конъюгации ATG8 с липидом фосфатидилэтаноламином . ^[7]

Было обнаружено, что Atg12 участвует в апоптозе . Этот белок способствует апоптозу посредством взаимодействия с антиапоптотическими членами семейства Bcl-2 . ^[8]

Рекомендации

1. GRCh38: выпуск Ensembl 89: ENSG00000145782 - Ensembl , май 2017 г.
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000032905 - Ensembl , май 2017 г.
3. "Ссылка на Human PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
5. Мизусима Н., Сугита Х., Ёсимори Т., Осуми Ю. (январь 1999 г.). «Новая система конъюгации белков у человека. Аналог дрожжевой системы конъюгации Apg12p, необходимый для аутофагии». J Биол Хим . 273 (51): 33889–33892. дои : 10.1074/jbc.273.51.33889 . ПМИД  9852036.
6. «Ген Entrez: ATG12 ATG12, связанный с аутофагией 12 гомолог (S. cerevisiae)» .
7. Дж. Генг и DJ Клионски, «Убиквитиноподобные системы конъюгации Atg8 и Atg12 в макроаутофагии». «Модификации белка: серия обзоров за пределами обычных подозреваемых», EMBO Rep, 9 (2008), 859-64.
8. А. Д. Рубинштейн, М. Эйзенштейн, Ю. Бер, С. Бялик и А. Кимчи, «Белок аутофагии Atg12 связывается с антиапоптотическими членами семейства Bcl-2, способствуя митохондриальному апоптозу», Mol Cell, 44 (2011), 698- 709

Внешние ссылки

• Расположение генома человека ATG12 и страница сведений о гене ATG12 в браузере генома UCSC .

дальнейшее чтение

• Приджионе А., Кортопасси Дж. (2007). «Делеции митохондриальной ДНК и лечение хлорамфениколом стимулируют аутофагический транскрипт ATG12». Аутофагия . 3 (4): 377–80. дои : 10.4161/авто.4239 . ПМИД  17457038.
• Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф., Ли Х., Тейлор П., Клими С. и др. (2007). «Крупномасштабное картирование белок-белковых взаимодействий человека методом масс-спектрометрии». Мол. Сист. Биол . 3 (1): 89. дои : 10.1038/msb4100134. ПМЦ  1847948 . ПМИД  17353931.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хиродзан-Кисикава Т., Дрико А., Ли Н. и др. (2005). «К карте сети белок-белковых взаимодействий человека в масштабе протеома». Природа . 437 (7062): 1173–1178. Бибкод : 2005Natur.437.1173R. дои : 10.1038/nature04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А., Шенмен С.М., Граус Л.Х., Шулер Г. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта полноразмерной кДНК Национального института здравоохранения: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Геном Рез . 14 (10Б): 2121–2127. дои : 10.1101/гр.2596504. ПМК  528928 . ПМИД  15489334.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т., Оцуки Т., Сугияма Т., Ири Р. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Нат. Жене . 36 (1): 40–45. дои : 10.1038/ng1285 . ПМИД  14702039.
• Мизушима Н., Кума А., Кобаяши Ю., Ямамото А., Мацубаэ М., Такао Т. и др. (2004). «Мышиный Apg16L, новый белок с WD-повторами, нацелен на мембрану аутофагической изоляции с помощью конъюгата Apg12-Apg5». Дж. Клеточная наука . 116 (Часть 9): 1679–1688. дои : 10.1242/jcs.00381 . ПМИД  12665549.
• Мизусима Н., Ёсимори Т., Осуми Ю. (2003). «Мышиный Apg10 как фермент, конъюгирующий Apg12: анализ с помощью двухгибридного метода дрожжей, опосредованного конъюгацией». ФЭБС Летт . 532 (3): 450–454. дои : 10.1016/S0014-5793(02)03739-0 . PMID  12482611. S2CID  37247321.
• Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Гроуз Л.Х., Дерге Дж.Г., Клаузнер Р.Д., Коллинз Ф.С. и др. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–16903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M. дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК  139241 . ПМИД  12477932.
• Танида И., Нишитани Т., Немото Т., Уэно Т., Коминами Е. (2002). «Apg12p млекопитающих, но не конъюгат Apg12p.Apg5p, облегчает обработку LC3». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 296 (5): 1164–1170. дои : 10.1016/S0006-291X(02)02057-0. ПМИД  12207896.
• Танида И., Танида-Мияке Э., Нишитани Т., Комацу М., Ямадзаки Х., Уэно Т. и др. (2002). «Мышиный Apg12p отдает предпочтение субстрату мышиного Apg7p перед тремя гомологами Apg8p». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 292 (1): 256–262. дои : 10.1006/bbrc.2002.6645. ПМИД  11890701.
• Танида И, Танида-Мияке Э, Комацу М, Уэно Т, Коминами Э (2002). «Человеческий гомолог Apg3p/Aut1p является подлинным ферментом E2 для нескольких субстратов, GATE-16, GABARAP и MAP-LC3, и способствует конъюгации hApg12p с hApg5p». Ж. Биол. Хим . 277 (16): 13739–13744. дои : 10.1074/jbc.M200385200 . ПМИД  11825910.
• Уэно К., Кумагай Т., Кидзима Т., Кишимото Т., Хосоэ С. (1998). «Клонирование и тканевая экспрессия кДНК хромосомы 5q21-22, которая часто удаляется при распространенном раке легких». Хм. Жене . 102 (1): 63–68. дои : 10.1007/s004390050655. PMID  9490301. S2CID  36201527.
• Бональдо М.Ф., Леннон Дж., Соарес М.Б. (1997). «Нормализация и вычитание: два подхода к облегчению открытия генов». Геном Рез . 6 (9): 791–806. дои : 10.1101/гр.6.9.791 . ПМИД  8889548.