stringtranslate.com

Карты мозга

Окраска по Нисслю мозга Chlorocebus aethiops на сайте BrainMaps.org.
а : выбор из нескольких сотен корональных срезов .
б : показан определенный корональный срез.
c : увеличение островковой области коры .
d : дальнейшее увеличение островковой коры. Видны нейроны, окрашенные по Нисслю . Доступ к этому фрагменту можно получить по этой ссылке. [1]

BrainMaps — это финансируемый Национальным институтом здравоохранения интерактивный масштабируемый цифровой атлас мозга высокого разрешения и виртуальный микроскоп , основанный на более чем 140 миллионах мегапикселей (140 терабайт) отсканированных изображений последовательных срезов мозга как приматов, так и неприматов и интегрированный с высокоскоростная база данных для запроса и получения данных о структуре и функциях мозга через Интернет.

В настоящее время представлены полные наборы данных атласа мозга для 16 видов; некоторые из них: Macaca mulatta , Chlorocebus aethiops , Felis silvestris catus , Mus musculus , Rattus norvegicus и Tyto alba .

Главным исследователем проекта был нейробиолог из Калифорнийского университета в Дэвисе Тед Джонс с 2005 по 2011 год, после чего эту роль взял на себя У. Мартин Усри.

Описание

BrainMaps использует форматы изображений с различным разрешением для представления больших изображений мозга, а также внешний пользовательский интерфейс dHTML/Javascript для навигации по изображениям, оба похожи на то, как Google Maps работает с геопространственными данными.

BrainMaps — это одна из самых массивных онлайн-баз данных и хранилищ изображений в области нейробиологии, которая включает в себя атлас всего мозга с самым высоким разрешением, когда-либо созданный. [2] [3]

Расширения интерактивной трехмерной визуализации были разработаны с помощью настольных приложений на основе OpenGL . [4] Свободно доступные инструменты анализа изображений позволяют конечным пользователям собирать данные онлайн-изображений на субнейронном уровне. BrainMaps использовалась как в исследованиях [5] [6], так и в дидактических целях.

Дополнительные изображения

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ Условия использования, BrainMaps.org Дата доступа: 11 февраля 2014 г.
  2. ^ Микула, С; Тротц I; Стоун Дж.М.; Джонс Э.Г. (2007). «Картирование мозга высокого разрешения и виртуальная микроскопия через Интернет». НейроИмидж . 35 (1): 9–15. doi :10.1016/j.neuroimage.2006.11.053. ПМК  1890021 . ПМИД  17229579.
  3. ^ Микула, С; Стоун Дж.М.; Джонс Э.Г. (2008). «BrainMaps.org - Интерактивные цифровые атласы мозга высокого разрешения и виртуальная микроскопия». Мозги Разум Медиа . 3 : бмм1426. ПМЦ 2614326 . ПМИД  19129928. 
  4. ^ Троттс, Я; Микула С; Джонс Э.Г. (2007). «Интерактивная визуализация стеков изображений с разным разрешением в 3D». НейроИмидж . 35 (3): 1038–43. doi :10.1016/j.neuroimage.2007.01.013. ПМЦ 2492583 . ПМИД  17336095. 
  5. ^ Микула, С; Менеджер по связям с общественностью; Джонс Э.Г. (2007). «Таламус однопроходных: цито- и миелоархитектура и химическая нейроанатомия». Philos Trans R Soc Lond B Biol Sci . 363 (1502): 2415–40. дои : 10.1098/rstb.2007.2133. ПМК 2606803 . ПМИД  17553780. 
  6. ^ Микула, С; Пэрриш СК; Триммер JS; Джонс Э.Г. (2009). «Полная трехмерная визуализация стриосом приматов с помощью иммуноокрашивания KChIP1». Джей Комп Нейрол . 514 (5): 507–17. doi : 10.1002/cne.22051. ПМЦ 2737266 . ПМИД  19350670. 

Внешние ссылки