stringtranslate.com

Clostridioides difficile

Clostridioides difficile ( син. Clostridium difficile ) — бактерия , известная тем, что вызывает серьезные диарейные инфекции, а также может вызывать рак толстой кишки . [ 4] [5] Она также известна как C. difficile или C. diff ( / s iːdɪf / ), и является грамположительным видом спорообразующих бактерий. [6] Clostridioides spp. — анаэробные , подвижные бактерии, повсеместно распространенные в природе и особенно распространенные в почве. Ее вегетативные клетки имеют форму палочек, плеоморфны и встречаются парами или короткими цепочками. Под микроскопом они выглядят как длинные, нерегулярные (часто в форме барабанных палочек или веретена) клетки с выпуклостью на их конечных концах (образует субтерминальные споры). При окрашивании по Граму клетки C. difficile являются грамположительными и демонстрируют оптимальный рост на кровяном агаре при температуре человеческого тела в отсутствие кислорода . C. difficile является каталазо- и супероксиддисмутазоотрицательным и продуцирует до трех типов токсинов: энтеротоксин А , цитотоксин В и трансферазу Clostridioides difficile. [7] В условиях стресса бактерии продуцируют споры , которые способны переносить экстремальные условия, которые активные бактерии переносить не могут. [8]

Clostridioides difficile является важным новым патогеном человека ; по данным CDC , в 2017 году в Соединенных Штатах было зарегистрировано 223 900 случаев среди госпитализированных пациентов и 12 800 смертей. [9] Хотя C. difficile широко известен как патоген, связанный с больницами и антибиотиками, не более трети случаев заражения можно проследить до передачи от инфицированного человека в больницах, [10] и только небольшое количество антибиотиков напрямую связано с повышенным риском развития инфекции C. difficile (CDI), а именно ванкомицин , клиндамицин , фторхинолоны и цефалоспорины . [11] [12] [13] Большинство инфекций приобретаются за пределами больниц, и большинство антибиотиков имеют аналогичный повышенный риск заражения наравне со многими факторами риска, не связанными с антибиотиками, такими как использование размягчителей стула и клизм . [ 14]

Clostridioides difficile также может поселиться в толстой кишке человека , не вызывая заболевания. [15] Хотя ранние оценки показали, что C. difficile присутствует у 2–5% взрослого населения, [8] более поздние исследования показывают, что колонизация тесно связана с историей не связанных с диареей заболеваний, таких как пищевое отравление или злоупотребление слабительными . [16] Лица без истории желудочно-кишечных расстройств, по-видимому, вряд ли станут бессимптомными носителями. Эти носители считаются основным резервуаром инфекции. [17]

Таксономия

Вид был перенесен из рода Clostridium в Clostridioides в 2016 году, таким образом дав ему биномиальное название Clostridioides difficile . [18] [19] [20] Это новое название отражает таксономические различия между этим видом и представителями рода Clostridium , при этом общее название C. diff сохраняется . [19] По состоянию на 2018 год единственным другим видом в этом новом роде является Clostridioides mangenotii (ранее известный как Clostridium mangenotii ). [21]

Человеческий патоген

Патогенные штаммы C. difficile продуцируют множество токсинов . [22] Наиболее изученными являются энтеротоксин ( токсин A C. difficile ) и цитотоксин ( токсин B C. difficile ), оба из которых могут вызывать диарею и воспаление у инфицированных пациентов ( колит C. difficile ), хотя их относительный вклад обсуждается. Диарея может варьироваться от нескольких дней потери кишечной жидкости до опасного для жизни псевдомембранозного колита , который связан с интенсивным воспалением толстой кишки и образованием псевдомембран на поверхности слизистой оболочки кишечника. [8] Это может прогрессировать до токсического мегаколона , тяжелой формы растяжения толстой кишки, которая может подвергнуть пациента риску перфорации толстой кишки, сепсиса и шока. Токсины A и B представляют собой глюкозилтрансферазы, которые нацелены на семейство Rho ГТФаз и инактивируют их . Токсин B (цитотоксин) вызывает деполимеризацию актина посредством механизма, коррелирующего с уменьшением АДФ-рибозилирования низкомолекулярных ГТФ-связывающих Rho-белков. [23] Существует также бинарный токсин ( токсин AB ), но его роль в заболевании до конца не изучена. [24]

Дополнительные факторы вирулентности включают фактор адгезии, который опосредует связывание с клетками толстой кишки человека, и гиалуронидазу . [25] Бактерия также вырабатывает химическое вещество пара -крезол , которое подавляет рост других микробов в непосредственной близости и позволяет ей вытеснять нормальную флору кишечника человека. [26]

Устойчивость к противомикробным препаратам

Лечение антибиотиками инфекций C. diff может быть затруднено как из-за устойчивости к антибиотикам , так и из-за физиологических факторов бактерии (образование спор, защитные эффекты псевдомембраны). [8] В 2005 году сообщалось о появлении нового, высокотоксичного штамма C. difficile , устойчивого к фторхинолоновым антибиотикам, таким как ципрофлоксацин и левофлоксацин , который, как говорят, вызывает географически распределенные вспышки в Северной Америке. [27] Центры США по контролю и профилактике заболеваний в Атланте предупредили о появлении эпидемического штамма с повышенной вирулентностью, устойчивостью к антибиотикам или обоими этими факторами. [28] Устойчивость к другим антибиотикам, таким как метронидазол, противомикробный препарат первого выбора при лечении ИКД, наблюдалась у 12% клинических изолятов, поэтому по мере продолжения лечения различными антибиотиками в популяциях C. difficile будут продолжать развиваться более разнообразные и сильные виды устойчивости , что еще больше усложнит попытки эффективного лечения. [29]

Дезинфекция поверхностей в больницах также может быть сложной задачей, поскольку споры C. difficile устойчивы ко многим дезинфицирующим средствам , [30] включая высокие концентрации отбеливателя . [31]

Передача инфекции

Окрашенные по Граму C. diff среди другой микрофлоры из суспензии образцов фекалий инфицированного пациента.

Clostridioides difficile передается от человека или животного к человеку фекально-оральным путем , выделяясь с фекалиями. Организм образует термостойкие аэротолерантные споры, которые не убиваются спиртосодержащими очистителями для рук или обычной очисткой поверхностей, поэтому эти споры выживают в клинических условиях в течение длительного времени. [32] Любая поверхность, устройство или материал (например, туалеты, ванны и электронные ректальные термометры), которые загрязняются фекалиями, могут служить резервуаром для спор C. difficile , а споры C. difficile могут жить в течение длительного времени на поверхностях. [33] Благодаря этому бактерию можно культивировать практически с любой поверхности. После попадания спор в организм их кислотоустойчивость позволяет им проходить через желудок невредимыми. Они прорастают и размножаются в вегетативные клетки в толстой кишке при воздействии желчных кислот. Следовательно, Всемирная организация здравоохранения рекомендует использовать мыло в дополнение к спиртовым растворам для ограничения распространения спор. [34] Было показано, что споруляция значительно снижается после инактивации ДНК-метилтрансферазы CamA C. difficile , [35] что повышает перспективы разработки препарата, который может подавлять эту бактерию определенным образом.

Восприимчивость к колонизации, по-видимому, вызвана диарейными заболеваниями, такими как пищевое отравление , болезнь Крона или злоупотребление слабительными; люди без истории диарейных заболеваний, которые подвергаются воздействию спор C. difficile, не обязательно станут носителями. [16] После того, как люди колонизируются C. difficile , они остаются носителями в течение года, но суточная численность C. difficile значительно колеблется - от уровня ниже предела обнаружения до высокого уровня выделения изо дня в день. Расстройства ЖКТ у носителей, по-видимому, вызывают периоды повышенного выделения, что может быть важным фактором для передачи. [ необходима цитата ]

Диапазон хостов

Clostridioides difficile поражает свиней, телят и людей и обитает в естественных резервуарах почвы, фекалиях домашних животных и людей, сточных водах, желудочно-кишечном тракте человека и мясе, продаваемом в розницу. [36]

Исследование CDC, проведенное в 2015 году, показало, что C. difficile поразил почти полмиллиона американцев и стал причиной 29 000 смертей в 2011 году. Исследование показало, что 40% случаев заболевания начались в домах престарелых или общественных медицинских учреждениях, а 24% произошли в больницах. [37]

Clostridioides difficile распространен в пищеварительной системе человека. Однако он является слабым конкурентом и часто уступает другим бактериям пищеварительной системы в борьбе за питательные вещества. В результате количество C. difficile поддерживается на управляемом уровне. Если внезапное введение антибиотика нарушает микробиом, C. difficile может размножаться в результате уничтожения многих своих конкурентов. Инкубационный период составляет 5–10 дней, с диапазоном от 1 дня до нескольких недель после лечения антибиотиками диареи, связанной с антибиотиками. Кроме того, носительство C. difficile с высоким уровнем токсинов часто встречается у маленьких детей, в то время как заболевание встречается редко. Выработка одного или даже обоих токсинов не всегда достаточна для возникновения симптомов. [38]

Признаки и симптомы

Симптомы инфекции C. difficile включают диарею (не менее трех жидких испражнений в день), обезвоживание, боли в животе , которые могут быть сильными, потерю аппетита и тошноту. [39]

Патофизиология

C. difficile передается орально-фекальным путем, и многие размножаются через споры. Прорастание этих спор зависит от способности ощущать первичные желчные кислоты в печени, такие как таурохолат, которые ощущаются герминантным рецептором CspC. Вторичные желчные кислоты могут ингибировать эти процессы в толстой кишке. Споры могут расти и колонизировать кишечник за счет вызванных антибиотиками сдвигов в микробиоте хозяина. C. difficile секретирует муколитические ферменты, такие как CWp84, для разрушения слизистой оболочки толстой кишки. Эти споры также способны прилипать к клеткам толстой кишки. Кроме того, C. difficile является подвижной бактерией, которая может переключаться между подвижной и сидячей фазами, процесс регулируется циклическим ди-ГМФ. Кроме того, C. difficile способна образовывать биопленки и передавать сигналы от клетки к клетке. [40] C. difficile часто передается от других пациентов через руки медицинских работников или из общей больничной среды и приобретается при приеме патогена внутрь. Споры устойчивы к кислотности желудка и прорастают в вегетативную форму в тонком кишечнике. C. difficile может вызывать широкий спектр клинических проявлений: от бессимптомного течения до тяжелого колита и смерти. [41] Таким образом, C. difficile является наиболее распространенной инфекцией в здравоохранении США, создавая серьезные риски для здоровья и значительные расходы на лечение. [42]

Иммунный ответ хозяина

Секретируемые C. difficile токсины A (TcdA) и B (TcdB) содержат иммуногенные антигены, которые распознаются антителами и Т-клетками. Однако уровни антител IgG против TcdA и -TcdB не позволяют отличить здоровых людей от пациентов с инфекцией C. difficile , что означает, что они имеют ограниченное клиническое применение. [43] [44] Недавние исследования показали, что эти токсины также распознаются хелперными CD4+ Т-клетками, в основном хелперными клетками T h 17 , которые важны для поддержания здоровой среды кишечника, хотя у пациентов с тяжелой инфекцией эти клетки повреждены. [45] Интересно, что у людей с тяжелой инфекцией C. difficile было значительно больше токсин-специфических Т-клеток по сравнению с людьми с легкой инфекцией, что указывает на то, что Т-клетки играют ключевую роль в борьбе с этой инфекцией. Этот иммунный ответ может дополнительно нарушить регуляцию экспрессии микроРНК . [46] Это дополнительно подтверждается восстановлением токсин-специфических клеток Th17 и экспрессией микроРНК после трансплантации фекальной микробиоты у пациентов с тяжелым заболеванием. [46] [47] Новые данные показывают, что потеря интерлейкина-10 соответствует более высоким уровням интерлейкина-22, который, как было обнаружено, важен в реакции хозяина на инфекцию C.difficile. Таким образом, дефицит IL-10 может усилить защиту хозяина от патогена. Это может представлять особый интерес для будущих исследований методов лечения. [48]

Диагноз

Инфекцию C. difficile часто подозревают из-за зловонной диареи, но это не подтверждает, есть ли у пациента CDI. Для подтверждения CDI анализ цитотоксинов обнаруживает цитотоксичность клеточного токсина B (ToxB) в фекальном элюате. Присутствие токсина C. difficile подтверждается нейтрализацией цитотоксического эффекта антитоксиновыми антителами. Штаммы C. difficile также можно культивировать перед проведением анализа цитотоксинов. Эти культуры обнаруживают штамм C. difficile, который может продуцировать токсины. [49] Однако эти иммуноферментные анализы более широко используются из-за их быстроты, низкой стоимости и простоты. Кроме того, они показывают более низкую чувствительность, чем токсикогенные культуры кала. Анализы ПЦР имеют более короткое время выполнения и более высокий диапазон чувствительности, чем токсикогенные культуры кала. Использование анализа на основе ПЦР помогает избежать обнаружения бессимптомных пациентов. [41]

Уход

Пациенты, принимающие антибиотики, при появлении симптомов должны прекратить их прием, если это возможно. Такой перерыв в антибактериальной терапии иногда может привести к спонтанному разрешению симптомов. Пациенты, которые не реагируют на прекращение приема антибиотиков широкого спектра действия, должны будут лечиться антибиотиками, способными убивать споры C. difficile . Первичные инфекции обычно лечатся ванкомицином с обычной дозировкой 125 мг каждые 6 часов. [50] Режим приема ванкомицина заменил традиционное использование метронидазола из-за его большей эффективности, профиля безопасности и более низкой частоты рецидивов. У пациентов, которые не переносят ванкомицин, приемлемым вариантом является фидаксомицин с аналогичной эффективностью и даже более низкой частотой рецидивов, чем ванкомицин. [51] В случаях фульминантной ИКД предлагается адъювантная терапия парентеральным метронидазолом плюс пероральный ванкомицин или фидаксомицин. [52]

Приблизительно у 15–30% [53] пациентов, успешно завершивших терапию первичной инфекции метронидазолом или ванкомицином, возникнет рецидив . Около 40% этих пациентов будут продолжать иметь рецидивирующую инфекцию C. difficile . Первый рецидив C. difficile обычно лечат тем же антибиотиком, который использовался для лечения первичной инфекции. Любые последующие инфекции не следует лечить метронидазолом. Иногда стандартный 10-дневный курс перорального ванкомицина не работает. В этих случаях предпочтительным лечением является постепенное снижение дозы ванкомицина. Пациенты принимают уменьшающиеся дозы ванкомицина в течение периода до 3 месяцев в зависимости от тяжести инфекции. [39]

Каждый последующий рецидив C. difficile имеет тенденцию быть более тяжелым, чем предыдущие инфекции. Длительное лечение с постепенным снижением дозы ванкомицина, дополненное пробиотиками, особенно Saccharomyces boulardii , связано с более высоким уровнем успеха. [54]

После трех рецидивов пациенты могут лечиться пероральным фидаксомицином , антибиотиком узкого спектра действия. Обычная дозировка составляет 200 мг два раза в день перорально в течение 10 дней. Фидаксомицин считается более эффективным, чем ванкомицин при тяжелой форме CDI. [55] Основным недостатком лечения фидаксомицином является стоимость лекарств. 10-дневный курс может стоить до 3500 долларов США. [ необходима цитата ] Когда состояние пациента ухудшается или прогрессирует до тяжелого осложненного заболевания, заслуживает рассмотрения добавление внутривенного тигециклина. [56] [57] Пациенты с высоким риском рецидива также могут получить пользу от добавления моноклонального антитела безлотоксумаба к стандарту лечения. [58]

Пациенты, которые не реагируют на традиционную антибактериальную терапию, могут иметь право на трансплантацию фекальной микробиоты (FMT). Медицинские работники могут перенести кал здорового человека в толстую кишку пациента с рецидивирующей CDI. Этот процесс является наиболее успешным лечением тяжелой CDI с показателем излечения около 93%. Трансплантация фекалий также оказалась эффективным и безопасным вариантом лечения для детей и молодых людей. [59] Частота рецидивов CDI у пациентов, получавших лечение с помощью FMT, как правило, низкая, около 19%, что делает ее очень эффективной при лечении хронических случаев CDI. Однако в некоторых случаях возможным побочным эффектом лечения являются вспышки воспалительного заболевания кишечника. [60] Состояние иммунной системы хозяина важно при рассмотрении успеха лечения на основе микробиоты в устранении инфекции. [61] Долгосрочные эффекты FMT неизвестны, поскольку процедура была одобрена FDA для рецидивирующей CDI только с 2013 года, и было проведено относительно мало процедур. Если трансплантация невозможна, удаление инфицированной части толстой кишки может вылечить ИКД. [55] [39]

В апреле 2023 года FDA одобрило первый пероральный микробиомный терапевтический препарат VOWST для лечения рецидивирующей ИКД.

Прогнозирование рецидива C. difficile представляло большой интерес, однако не было достигнуто единого мнения относительно значимо связанных с этим факторов риска. [62]

Профилактика

Инфекция C. difficile распространяется фекально-оральным путем через пищу и кислотоустойчивые споры. Соответствующая гигиена рук медицинских работников имеет жизненно важное значение для удаления спор, что включает тщательное мытье рук с мылом и теплой водой. Кроме того, изоляция пациентов с острой диареей может предотвратить распространение спор в больнице. [63] Еще одним способом профилактики ИКД является ношение средств индивидуальной защиты при взаимодействии с пациентами с C. difficile. Кроме того, передачу ИКД можно предотвратить путем ежедневной спороцидной дезинфекции окружающей среды в палатах пациентов. Кроме того, сокращение продолжительности антибактериальной терапии снижает показатели ИКД в больницах. [64]

Штаммы

В 2005 году молекулярный анализ привел к идентификации штамма C. difficile , характеризуемого как группа BI с помощью анализа эндонуклеазы рестрикции , как североамериканский тип импульсного поля NAP1 с помощью электрофореза в пульсирующем поле и как риботип 027; отличающаяся терминология отражает преобладающие методы, используемые для эпидемиологического типирования. Этот штамм обозначается как C. difficile BI/NAP1/027. [49]

По состоянию на 2016 год штамм NAP1 был заменен новыми штаммами в некоторых районах Британской Колумбии. Эти новые штаммы включают NAP2 и NAP4, а также некоторые штаммы, которые не имеют обозначения NAP. Частота этих новых штаммов увеличилась с 2008 по 2013 год в одном изучаемом регионе, вытеснив изначально более распространенные и узнаваемые бактерии NAP1. [65]

Два штамма, риботипы RT078 и RT027, могут жить при низких концентрациях сахара трегалозы ; оба штамма стали более распространенными после того, как трегалоза была введена в качестве пищевой добавки в начале 2000-х годов, тем самым увеличив потребление трегалозы в рационе. [66]

Геном

Первая полная последовательность генома штамма C. difficile была опубликована в 2005 году Институтом Сэнгера в Великобритании. Это был штамм 630, вирулентный и множественно лекарственно-устойчивый штамм, выделенный в Швейцарии в 1982 году. Ученые Института Сэнгера секвенировали геномы около 30 изолятов C. difficile , используя технологии секвенирования следующего поколения от 454 Life Sciences и Illumina . [67]

Исследователи из Университета Макгилла в Монреале секвенировали геном высоковирулентного штамма Квебека C. difficile в 2005 году с использованием технологии сверхвысокой пропускной способности секвенирования. Тесты включали проведение 400 000 реакций параллельного секвенирования ДНК генома бактерии, который был фрагментирован для секвенирования. Эти последовательности были собраны вычислительным путем для формирования полной последовательности генома. [27] [68]

В 2012 году ученые Оксфордского университета секвенировали геномы C. difficile из 486 случаев, зарегистрированных в течение четырех лет в Оксфордшире, используя технологии секвенирования нового поколения от Illumina. [69]

Эпигеном

Clostridioides difficile имеет очень разнообразный эпигеном, с 17 мотивами метилирования высокого качества, зарегистрированными на данный момент, большинство из которых относится к типу 6mA. Было показано, что метилирование в одном из этих мотивов - CAAAA A, влияет на споруляцию, ключевой этап в передаче заболевания C. difficile , а также на длину клеток, образование биопленки и колонизацию хозяина. [35]

Бактериофаг

По крайней мере восемь преимущественно умеренных бактериофагов были выделены из C. difficile , с размером генома от около 30 до около 60 т.п.н. [70] Как экологические , так и клинически полученные  штаммы C. difficile  несут разнообразный и распространенный набор профагов [70 ]

Этимология и произношение

Ссылки

  1. ^ Холл IC, О'Тул E (1935). «Кишечная флора у новорожденных: с описанием нового патогенного анаэроба, Bacillus difficilis ». Американский журнал детских болезней . 49 (2): 390–402. doi :10.1001/archpedi.1935.01970020105010.
  2. ^ Прево А.Р. (1938). «Этюды системных бактериальных бактерий. IV. Критика актуальной концепции жанра Clostridium». Анналы Института Пастера . 61 (1): 84. Архивировано из оригинала 28 июля 2020 года . Проверено 15 декабря 2018 г.
  3. ^ Страница Виды: Clostridioides difficile в «LPSN - Список названий прокариот, имеющих место в номенклатуре». Deutsche Sammlung von Mikroorganismen und Zellkulturen . Архивировано из оригинала 8 ноября 2022 года . Проверено 8 ноября 2022 г.
  4. ^ Drewes JL, Chen J, Markham NO, Knippel RJ, Domingue JC, Tam AJ и др. (август 2022 г.). «Штамм Clostridioides difficile, полученный от рака толстой кишки, вызывает развитие опухолей толстой кишки у мышей». Cancer Discovery . 12 (8): 1873–1885. doi :10.1158/2159-8290.CD-21-1273. PMC 9357196 . PMID  35678528. 
  5. ^ «Врачи Университета Джонса Хопкинса обнаружили, что распространенная инфекция может вызывать рак». 24 августа 2022 г. Архивировано из оригинала 26 мая 2023 г. Получено 29 августа 2022 г.
  6. ^ Moreno MA, Furtner F, Rivara FP (июнь 2013 г.). «Clostridium difficile: причина диареи у детей». JAMA Pediatrics . 167 (6): 592. doi :10.1001/jamapediatrics.2013.2551. PMID  23733223.
  7. ^ Kordus SL, Thomas AK, Lacy DB (май 2022 г.). «Токсины Clostridioides difficile: механизмы действия и антитоксиновая терапия». Nature Reviews. Microbiology . 20 (5): 285–298. doi :10.1038/s41579-021-00660-2. PMC 9018519. PMID  34837014 . 
  8. ^ abcd Райан К.Дж., Рэй К.Г., ред. (2004). Sherris Medical Microbiology (4-е изд.). McGraw Hill. стр. 322–4. ISBN 978-0-8385-8529-0.
  9. ^ "Инфекция Clostridioides difficile | HAI | CDC". www.cdc.gov . 2 января 2020 г. Архивировано из оригинала 8 марта 2020 г. Получено 10 марта 2020 г.
  10. ^ Eyre DW, Cule ML, Wilson DJ, Griffiths D, Vaughan A, O'Connor L, et al. (сентябрь 2013 г.). «Различные источники инфекции C. difficile, выявленные при секвенировании всего генома». The New England Journal of Medicine . 369 (13): 1195–1205. doi :10.1056/NEJMoa1216064. PMC 3868928. PMID  24066741 . 
  11. ^ Guh AY, Adkins SH, Li Q, Bulens SN, Farley MM, Smith Z и др. (1 октября 2017 г.). «Факторы риска инфекции Clostridium difficile, связанной с сообществом, у взрослых: исследование случай-контроль». Открытый форум по инфекционным заболеваниям . 4 (4): ofx171. doi :10.1093/ofid/ofx171. PMC 5903408. PMID  29732377 . 
  12. ^ Brown KA, Khanafer N, Daneman N, Fisman DN (май 2013 г.). «Метаанализ антибиотиков и риск инфекции Clostridium difficile, связанной с сообществом». Antimicrobial Agents and Chemotherapy . 57 (5): 2326–2332. doi :10.1128/AAC.02176-12. PMC 3632900. PMID  23478961 . 
  13. ^ Рафей А., Джахан С., Фарук У., Ахтар Ф., Иршад М., Низамуддин С. и др. (май 2023 г.). «Антибиотики, связанные с инфекцией Clostridium difficile». Cureus . 15 (5): e39029. doi : 10.7759/cureus.39029 . PMC 10266117 . PMID  37323360. 
  14. ^ McFarland LV, Surawicz CM, Stamm WE (сентябрь 1990 г.). «Факторы риска носительства Clostridium difficile и диареи, связанной с C. difficile, у группы госпитализированных пациентов». Журнал инфекционных заболеваний . 162 (3): 678–684. doi :10.1093/infdis/162.3.678. PMID  2387993.
  15. ^ McFarland LV, Mulligan ME, Kwok RY, Stamm WE (январь 1989). «Нозокомиальное приобретение инфекции Clostridium difficile». The New England Journal of Medicine . 320 (4): 204–210. doi :10.1056/NEJM198901263200402. PMID  2911306.
  16. ^ ab VanInsberghe D, Elsherbini JA, Varian B, Poutahidis T, Erdman S, Polz MF (апрель 2020 г.). «Диарейные события могут вызвать долгосрочную колонизацию Clostridium difficile с повторяющимся цветением». Nature Microbiology . 5 (4): 642–650. doi :10.1038/s41564-020-0668-2. PMID  32042128. S2CID  211074075.
  17. ^ Eyre DW, Griffiths D, Vaughan A, Golubchik T, Acharya M, O'Connor L, et al. (12 ноября 2013 г.). Chang YF (ред.). "Асимптоматическая колонизация Clostridium difficile и дальнейшая передача". PLOS ONE . ​​8 (11): e78445. Bibcode :2013PLoSO...878445E. doi : 10.1371/journal.pone.0078445 . PMC 3827041 . PMID  24265690. 
  18. ^ Oren A, Garrity GM (сентябрь 2017 г.). «Список новых названий и новых комбинаций, ранее эффективно, но не валидно опубликованных». International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology . 67 (9): 3140–3143. doi :10.1099/ijsem.0.002278. PMC 5817221 . PMID  28891789. 
  19. ^ ab Lawson PA, Citron DM, Tyrrell KL, Finegold SM (август 2016 г.). «Реклассификация Clostridium difficile как Clostridioides difficile (Hall and O'Toole 1935) Prévot 1938». Anaerobe . 40 : 95–99. doi :10.1016/j.anaerobe.2016.06.008. PMID  27370902.
  20. ^ Zhu D, Sorg JA, Sun X (2018). «Биология Clostridioides difficile: споруляция, прорастание и соответствующие методы лечения инфекции C. difficile». Frontiers in Cellular and Infection Microbiology . 8 : 29. doi : 10.3389/fcimb.2018.00029 . PMC 5809512. PMID  29473021 . 
  21. ^ Гальперин М.Ю., Бровер В., Толстой И., Ютин Н. (декабрь 2016 г.). «Филогеномный анализ семейства Peptostreptococcaceae (Clostridium cluster XI) и предложение по реклассификации Clostridium litorale (Fendrich et al. 1991) и Eubacterium acidaminophilum (Zindel et al. 1989) как Peptoclostridium litorale gen. nov. comb. nov. и Peptoclostridium acidaminophilum comb. nov». Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 66 (12): 5506–5513. doi :10.1099/ijsem.0.001548. PMC 5244501. PMID  27902180 . 
  22. ^ Di Bella S, Ascenzi P, Siarakas S, Petrosillo N, di Masi A (май 2016 г.). "Токсины Clostridium difficile A и B: взгляд на патогенные свойства и внекишечные эффекты". Toxins . 8 (5): 134. doi : 10.3390/toxins8050134 . PMC 4885049 . PMID  27153087. 
  23. ^ Just I, Selzer J, von Eichel-Streiber C, Aktories K (март 1995). «Низкомолекулярный белок Rho, связывающий ГТФ, подвержен влиянию токсина А из Clostridium difficile». Журнал клинических исследований . 95 (3): 1026–1031. doi :10.1172/JCI117747. PMC 441436. PMID  7883950 . 
  24. ^ Barth H, Aktories K, Popoff MR, Stiles BG (сентябрь 2004 г.). «Бинарные бактериальные токсины: биохимия, биология и применение общих белков Clostridium и Bacillus». Microbiology and Molecular Biology Reviews . 68 (3): 373–402, оглавление. doi :10.1128/MMBR.68.3.373-402.2004. PMC 515256. PMID  15353562. 
  25. ^ [Медицинская микробиология, пятое издание, Патрик Мюррей, Elsevier Mosby, 2005, стр. 412]
  26. ^ "Химическое оружие, которое помогает бактериям наносить ущерб кишечнику" . Nature . 561 (7723): 288. 14 сентября 2018 г. Bibcode : 2018Natur.561S.288.. doi : 10.1038/d41586-018-06650-4. S2CID  52297840. Архивировано из оригинала 28 июля 2020 г. Получено 8 октября 2018 г.
  27. ^ ab Loo VG, Poirier L, Miller MA, Oughton M, Libman MD, Michaud S, et al. (декабрь 2005 г.). «Преимущественно клональная многоучрежденческая вспышка диареи, связанной с Clostridium difficile, с высокой заболеваемостью и смертностью». The New England Journal of Medicine . 353 (23): 2442–2449. doi : 10.1056/NEJMoa051639 . PMID  16322602. S2CID  14818750.
  28. ^ McDonald LC (август 2005 г.). «Clostridium difficile: ответ на новую угрозу от старого врага». Инфекционный контроль и госпитальная эпидемиология . 26 (8): 672–675. doi : 10.1086/502600 . PMID  16156321.
  29. ^ Banawas SS (21 февраля 2018 г.). «Инфекции Clostridium difficile: глобальный обзор механизмов лекарственной чувствительности и устойчивости». BioMed Research International . 2018 : 8414257. doi : 10.1155/2018/8414257 . PMC 5841113. PMID  29682562 . 
  30. ^ Рашид Т., Хагиги Ф., Хасан И., Бассер Э., Алам М.Дж., Шарма С.В. и др. (декабрь 2019 г.). «Активность больничных дезинфицирующих средств против вегетативных клеток и спор Clostridioides difficile, встроенных в биопленки». Антимикробные агенты и химиотерапия . 64 (1). doi :10.1128/AAC.01031-19. PMC 7187568. PMID 31611365  . 
  31. ^ «Отбеливатель не убивает распространенные супербактерии, согласно исследованию». BBC News . 22 ноября 2023 г. Архивировано из оригинала 22 ноября 2023 г. Получено 22 ноября 2023 г.
  32. ^ Di Bella S, Sanson G, Monticelli J, Zerbato V, Principe L, Giuffrè M и др. (29 февраля 2024 г.). Staley C (ред.). "Инфекция Clostridioides difficile: история, эпидемиология, факторы риска, профилактика, клинические проявления, лечение и будущие варианты" . Clinical Microbiology Reviews . 37 (2). Mayuresh Abhyankar: e0013523. doi :10.1128/cmr.00135-23. ISSN  0893-8512. PMID  38421181. Архивировано из оригинала 4 марта 2024 г. . Получено 4 марта 2024 г. .
  33. ^ "Информация об инфекции Clostridium difficile для пациентов". Инфекции, связанные с оказанием медицинской помощи (HAI) . Центры по контролю и профилактике заболеваний США. Архивировано из оригинала 30 марта 2017 г. Получено 22 мая 2017 г.
  34. ^ "Руководство ВОЗ по гигиене рук в здравоохранении: резюме" (PDF) . Всемирная организация здравоохранения . 2009. стр. 31. Архивировано (PDF) из оригинала 9 мая 2020 г. . Получено 18 июня 2018 г. .
  35. ^ ab Oliveira PH, Ribis JW, Garrett EM, Trzilova D, Kim A, Sekulovic O и др. (январь 2020 г.). «Эпигеномная характеристика Clostridioides difficile обнаруживает консервативную ДНК-метилтрансферазу, которая опосредует споруляцию и патогенез». Nature Microbiology . 5 (1): 166–180. doi :10.1038/s41564-019-0613-4. PMC 6925328 . PMID  31768029. 
  36. ^ Gould LH, Limbago B (сентябрь 2010 г.). «Clostridium difficile в пищевых продуктах и ​​домашних животных: новый пищевой патоген?». Clinical Infectious Diseases . 51 (5): 577–582. doi : 10.1086/655692 . PMID  20642351.
  37. ^ Belluck P (25 февраля 2015 г.). «Увеличено число смертей от C. Difficile». The New York Times . Архивировано из оригинала 29 сентября 2017 г. Получено 25 февраля 2015 г.
  38. ^ Мюррей П. (2005). Медицинская микробиология (Пятое издание). Elsevier Mosby. стр. 412.
  39. ^ abc "Может ли у вас быть смертельная диарея (C. Diff)?". 4 января 2019 г. Архивировано из оригинала 30 марта 2017 г. Получено 22 мая 2017 г.
  40. ^ Smits WK, Lyras D, Lacy DB, Wilcox MH и Kuijper EJ (7 апреля 2017 г.). "Инфекция Clostridium difficile". Nature Reviews Disease Primers . 2 : 16020. doi : 10.1038/nrdp.2016.20 . PMC 5453186. PMID  27158839. 
  41. ^ ab Lessa FC, Gould CV, McDonald LC (1 августа 2012 г.). «Текущее состояние эпидемиологии инфекции Clostridium difficile». Клинические инфекционные заболевания . 55 (Приложение 2): S65–S70. doi : 10.1093/cid/cis319 . PMC 3388017. PMID  22752867 . 
  42. ^ Cymbal M, Chatterjee A, Baggott B, Auron M (март 2024 г.). «Лечение инфекции Clostridioides difficile: диагностика, лечение и перспективы на будущее». Am J Med . 137 (7): 571–576. doi : 10.1016/j.amjmed.2024.03.024 . PMID  38508330.
  43. ^ Monaghan TM, Negm OH, MacKenzie B, Hamed MR, Shone CC, Humphreys DP и др. (июль 2017 г.). «Высокая распространенность связывающих и нейтрализующих антител подкласса против токсинов Clostridium difficile в сыворотке взрослых больных муковисцидозом: возможный режим иммунозащиты против симптоматической инфекции C. difficile». Клиническая и экспериментальная гастроэнтерология . 10 : 169–175. doi : 10.2147/CEG.S133939 . PMC 5525456. PMID  28765714 . 
  44. ^ Wullt M, Norén T, Ljungh A, Åkerlund T (сентябрь 2012 г.). «Реакция антител IgG на токсины A и B у пациентов с инфекцией Clostridium difficile». Clinical and Vaccine Immunology . 19 ( 9): 1552–1554. doi : 10.1128/CVI.00210-12 . PMC 3428380. PMID  22787196. 
  45. ^ Кук Л., Риз В. Д., Вонг М. К., Квок В. В., Левингс М. К., Штайнер Т. С. (март 2021 г.). «Рецидивирующая инфекция Clostridioides difficile связана с нарушением иммунитета Т-хелперов типа 17 к токсину B C. difficile». Гастроэнтерология . 160 (4): 1410–1413.e4. doi : 10.1053/J.GASTRO.2020.11.043 . PMID  33253683.
  46. ^ ab Bocchetti M, Ferraro MG, Melisi F, Grisolia P, Scrima M, Cossu AM и др. (июнь 2023 г.). «Обзор современных методов обнаружения и потенциала микроРНК в скрининге инфекции Clostridioides difficile». World Journal of Gastroenterology . 29 (22): 3385–3399. doi : 10.3748/wjg.v29.i22.3385 . PMC 10303512. PMID  37389232. 
  47. ^ Кук Л., Риз В. Д., Вонг М. К., Питерс Х., Левингс М. К., Штайнер Т. С. (май 2021 г.). «Трансплантация фекальной микробиоты при рецидивирующей инфекции Clostridioides difficile усиливает адаптивный иммунитет к токсину B C. difficile». Гастроэнтерология . 160 (6): 2155–2158.e4. doi : 10.1053/J.GASTRO.2021.01.009. hdl : 11343/289863 . PMID  33444574. S2CID  231611318.
  48. ^ Cribas ES, Denny JE, Maslanka JR, Abt MC (16 апреля 2021 г.). «Потеря сигнала интерлейкина-10 (ИЛ-10) способствует ИЛ-22-зависимой защите хозяина от острой инфекции Clostridioides difficile». Инфекция и иммунитет . 89 (5): e00730–20. doi :10.1128/IAI.00730-20. ISSN  1098-5522. PMC 8091099. PMID 33649048  . 
  49. ^ ab Rupnik M, Wilcox MH, Gerding DN (июль 2009 г.). «Инфекция Clostridium difficile: новые разработки в эпидемиологии и патогенезе». Nature Reviews. Microbiology . 7 (7): 526–536. doi :10.1038/nrmicro2164. PMID  19528959. S2CID  23376891.
  50. ^ McDonald LC, Gerding DN, Johnson S, Bakken JS, Carroll KC, Coffin SE и др. (март 2018 г.). «Клинические практические рекомендации по инфекции Clostridium difficile у взрослых и детей: обновление 2017 г., подготовленное Американским обществом инфекционных заболеваний (IDSA) и Американским обществом эпидемиологии здравоохранения (SHEA)». Clinical Infectious Diseases . 66 (7): e1–e48. doi :10.1093/cid/cix1085. PMC 6018983 . PMID  29462280. 
  51. ^ Mullane KM, Miller MA, Weiss K, Lentnek A, Golan Y, Sears PS и др. (сентябрь 2011 г.). «Эффективность фидаксомицина по сравнению с ванкомицином в качестве терапии инфекции Clostridium difficile у лиц, принимающих сопутствующие антибиотики для других сопутствующих инфекций». Клинические инфекционные заболевания . 53 (5): 440–447. doi :10.1093/cid/cir404. PMC 3156139 . PMID  21844027. 
  52. ^ Shane AL, Mody RK, Crump JA, Tarr PI, Steiner TS, Kotloff K и др. (ноябрь 2017 г.). «Клинические практические рекомендации Американского общества инфекционных заболеваний по диагностике и лечению инфекционной диареи 2017 г.». Clinical Infectious Diseases . 65 (12): e45–e80. doi :10.1093/cid/cix669. PMC 5850553 . PMID  29053792. 
  53. ^ Song JH, Kim YS (январь 2019 г.). «Рецидивирующая инфекция Clostridium difficile: факторы риска, лечение и профилактика». Кишечник и печень . 13 (1): 16–24. doi :10.5009/gnl18071. PMC 6346998. PMID  30400734 . 
  54. ^ "Лечение рецидивирующего колита Clostridium difficile с помощью ванкомицина и Saccharomyces boulardii" (PDF) . Американский журнал гастроэнтерологии . Архивировано из оригинала (PDF) 9 августа 2017 г. . Получено 28 апреля 2018 г. .
  55. ^ ab Surawicz CM, Brandt LJ, Binion DG, Анантакришнан AN, Карри SR, Гиллиган PH и др. (апрель 2013 г.). «Руководство по диагностике, лечению и профилактике инфекций Clostridium difficile». Американский журнал гастроэнтерологии . 108 (4): 478–98, викторина 499. doi : 10.1038/ajg.2013.4 . PMID  23439232. S2CID  54629762.
  56. ^ van Prehn J, Reigadas E, Vogelzang EH, Bouza E, Hristea A, Guery B и др. (декабрь 2021 г.). «Европейское общество клинической микробиологии и инфекционных заболеваний: обновление 2021 г. руководства по лечению инфекции Clostridioides difficile у взрослых» (PDF) . Клиническая микробиология и инфекции . 27 (Приложение 2): S1–S21. doi : 10.1016/j.cmi.2021.09.038 . PMID  34678515. S2CID  239473944.
  57. ^ Di Bella S, Nisii C, Petrosillo N (июль 2015 г.). «Является ли тигециклин подходящим вариантом для лечения инфекции Clostridium difficile? Данные из литературы». Международный журнал антимикробных агентов . 46 (1): 8–12. doi :10.1016/j.ijantimicag.2015.03.012. PMID  25982915.
  58. ^ Giacobbe DR, Dettori S, Di Bella S, Vena A, Granata G, Luzzati R и др. (сентябрь 2020 г.). «Безлотоксумаб для профилактики рецидивирующей инфекции Clostridioides difficile: обзор повествования от патофизиологии до клинических исследований». Инфекционные заболевания и терапия . 9 (3): 481–494. doi :10.1007/s40121-020-00314-5. PMC 7452994. PMID  32632582 . 
  59. ^ AKAGAWA S, AKAGAWA Y, YAMANOUCHI S, KIMATA T, TSUJI S, KANEKO K (25 августа 2020 г.). «Развитие микробиоты кишечника и дисбактериоз у детей». Bioscience of Microbiota, Food and Health . 40 (1): 12–18. doi :10.12938/bmfh.2020-034. PMC 7817514. PMID  33520564 . 
  60. ^ Chen T, Zhou Q, Zhang D, Jiang F, Wu J, Zhou JY и др. (Май 2018 г.). «Эффект трансплантации фекальной микробиоты для лечения инфекции Clostridium difficile у пациентов с воспалительным заболеванием кишечника: систематический обзор и метаанализ когортных исследований». Журнал Crohn's & Colitis . 12 (6): 710–717. doi : 10.1093/ecco-jcc/jjy031 . PMID  29528385. S2CID  3841585.
  61. ^ Littmann ER, Lee JJ, Denny JE, Alam Z, Maslanka JR, Zarin I и др. (2 февраля 2021 г.). «Иммунитет хозяина модулирует эффективность трансплантации микробиоты для лечения инфекции Clostridioides difficile». Nature Communications . 12 (1): 755. Bibcode :2021NatCo..12..755L. doi :10.1038/s41467-020-20793-x. ISSN  2041-1723. PMC 7854624 . PMID  33531483. 
  62. ^ Stewart DB, Berg A, Hegarty J (январь 2013 г.). «Предсказание рецидива колита, вызванного C. difficile, с использованием факторов бактериальной вирулентности: бинарный токсин — ключ» . Журнал гастроинтестинальной хирургии . 17 (1): 118–125. doi :10.1007/s11605-012-2056-6. PMID  23086451. Архивировано из оригинала 21 марта 2024 г. Получено 20 марта 2024 г.
  63. ^ Burke KE, Lamont JT (29 января 2014 г.). «Инфекция Clostridium difficile: всемирное заболевание». Gut Liver . 8 (1): 1–6. doi : 10.5009/gnl.2014.8.1.1 . PMC 3916678 . PMID  24516694. 
  64. ^ Tschudin-Sutter S, Kuijper EJ, Durovic A, Vehreschild MJ, Barbut F, Eckert C и др. (октябрь 2018 г.). «Руководящий документ по профилактике инфекции Clostridium difficile в условиях неотложной медицинской помощи». Клиническая микробиология и инфекции . 24 (10): 1051–1054. doi : 10.1016/j.cmi.2018.02.020 . PMID  29505879.
  65. ^ Jassem AN, Prystajecky N , Marra F, Kibsey P, Tan K, Umlandt P, et al. (29 марта 2016 г.). «Характеристика штаммов Clostridium difficile в Британской Колумбии, Канада: переход от большинства штаммов NAP1 (2008 г.) к новым типам штаммов (2013 г.) в одном регионе». Канадский журнал инфекционных заболеваний и медицинской микробиологии . 2016 г. : 8207418. doi : 10.1155/2016/8207418 . PMC 4904575 . PMID  27366181. 
  66. ^ Collins J, Robinson C, Danhof H, Knetsch CW, van Leeuwen HC, Lawley TD и др. (январь 2018 г.). «Диетическая трегалоза усиливает вирулентность эпидемического Clostridium difficile». Nature . 553 (7688): 291–294. Bibcode :2018Natur.553..291C. doi :10.1038/nature25178. PMC 5984069 . PMID  29310122. 
  67. ^ He M, Sebaihia M, Lawley TD, Stabler RA, Dawson LF, Martin MJ и др. (апрель 2010 г.). «Эволюционная динамика Clostridium difficile в краткосрочной и долгосрочной перспективе». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 107 (16): 7527–7532. Bibcode : 2010PNAS..107.7527H. doi : 10.1073/pnas.0914322107 . PMC 2867753. PMID  20368420 . 
  68. ^ Ученые картируют штамм C. difficile. Архивировано 22 мая 2022 г. в Wayback Machine – Институт общественных дел, Монреаль.
  69. ^ Дидело X, Эйр Д. В., Куле М., Ип КЛ, Ансари МА, Гриффитс Д. и др. (декабрь 2012 г.). «Микроэволюционный анализ геномов Clostridium difficile для изучения передачи». Genome Biology . 13 (12): R118. doi : 10.1186/gb-2012-13-12-r118 . PMC 4056369 . PMID  23259504. 
  70. ^ ab Hargreaves KR, Clokie MR (2014). " Фаги Clostridium difficile: все еще сложные?". Frontiers in Microbiology . 5 : 184. doi : 10.3389/fmicb.2014.00184 . PMC 4009436. PMID  24808893. 

Внешние ссылки