Chaetomium thermophilum — термофильный нитчатый гриб . Растет на навозе или компосте (гнилой органике). Примечателен тем, что является эукариотом с высокой температурной устойчивостью (60 °C). Оптимальная температура роста — 50–55 °C. [1]
Поскольку грибы являются эукариотами и не далеки от животных, они являются хорошими моделями для сравнительного и легкого в манипуляции исследования, а в случае с C. thermophilum это имеет особое значение. Во-первых, учитывая тот факт, что он термофильный, белки, полученные из этого гриба, являются термостабильными и, таким образом, с ними легче работать. Белки из C. thermophilum являются термофильными и, таким образом, лучше подходят для исследований (структурных и биохимических), чем сопоставимые мезофильные грибы. Изучая белки комплекса ядерной поры, было обнаружено, что изоляция белка была более обильной и более растворимой, чем у дрожжей (дрожжевые белки осаждаются при более низкой температуре). [2]
Геном C. thermophilum полностью секвенирован. Он охватывает 28,3 Мб и кодирует 7227 предсказанных генов, кодирующих белки. [1] [3] Saccharomyces cerevisiae , модельные дрожжи, имеют 73% гомологии белков с этим грибком.
Был изучен протеом C. thermophilum и идентифицировано 27 отдельных белковых сообществ, включая 108 взаимосвязанных комплексов. [4]
Первое наблюдение метаболона в метаболизме жирных кислот с высоким разрешением было получено в результате криоэлектронного микроскопического анализа клеточных гомогенатов C. thermophilum . Другие белковые комплексы и взаимодействия более высокого порядка были предсказаны и подтверждены с использованием новой интеграции экспериментальных и вычислительных методов, которые включают протеомику, сшивающую масс-спектрометрию, вычислительную структурную биологию и электронную микроскопию. Клеточные гомогенаты C. thermophilum использовались для получения структур белковых комплексов с высоким разрешением, с чистотой нативного белкового комплекса < 40%. [4]