Ген, кодирующий белок у человека
Куллин 3 — это белок , который у людей кодируется геном CUL3 . [ 5] [6] [7]
Белок куллин 3 принадлежит к семейству куллинов , которое у млекопитающих содержит восемь белков (куллин 1, куллин 2, куллин 3, куллин 4A, куллин 4B, куллин 5, куллин 7 и куллин 9). [8] Белки куллинов являются эволюционно консервативным семейством белков у дрожжей, растений и млекопитающих. [9]
Функция
Куллин 3 является компонентом комплексов убиквитинлигаз Cullin -RING E3 (CRL), которые участвуют в убиквитилировании белков и представляют собой часть убиквитин-протеасомной системы (UPS). Добавленные CRL фрагменты убиквитина к остатку лизина затем направляют белок на протеасомную деградацию. [10] Убиквитинлигазы Cullin- RING E3 участвуют во многих клеточных процессах, ответственных за регуляцию клеточного цикла, реакцию на стресс, транспортировку белков, передачу сигналов, репликацию ДНК, транскрипцию, контроль качества белков, циркадные часы и развитие. [11] [12]
Удаление гена CUL3 у мышей вызывает эмбриональную гибель. [13]
Cullin 3-RING E3 убиквитинлигазы
Комплекс Cullin 3-RING состоит из белка Cullin 3, белка RING-box 1 ( RBX1 ), который рекрутирует убиквитин-конъюгирующий фермент (E2), и белка Bric-a-brac/Tramtrack/Broad (BTB), субъединицы распознавания субстрата. Белок Cullin 3 является основным белком каркаса, координирующим другие компоненты комплекса CRL. [14] Комплексы Cullin 3-RING также могут димеризоваться через свои домены BTB , что приводит к созданию двух рецепторов субстрата и двух каталитических доменов RING. [15]
Активация комплекса регулируется присоединением убиквитин-подобного белка NEDD8 к консервативному остатку Lys в домене гомологии куллина, процесс называется неддилатацией . [16] Денддилатация осуществляется комплексом CSN из восьми субъединиц, который опосредует расщепление изопептидной связи между NEDD8 и белком куллина. [17] Другим белком, который взаимодействует с куллином, является CAND1 , который связывается с денддилированной формой белка куллина и нарушает взаимодействие между куллином и другими субъединицами комплекса, что приводит к ингибированию активности убиквитинлигазы E3. [18] Следовательно, динамическая неддилатация и денддилатация куллина важны для регуляции активности комплекса CRL. [19]
Клиническое значение
Семейная гиперкалиемическая гипертензия
Мутации в гене CUL3 связаны с семейной гиперкалиемической гипертензией . [20] Комплекс CRL, содержащий Cullin 3, контролирует активность Na + Cl − котранспортера (NCC) в почках, регулируя протеасомную деградацию With-no-lysine [K] киназ WNK1 и WNK4 . Было показано, что мутации в гене CUL3 приводят к накоплению WNK. [21] Обилие этих киназ приводит к повышенному фосфорилированию NCC и его активации. Как следствие, реабсорбция Na + увеличивается, что приводит к высокому кровяному давлению. [22]
Нарушения нервно-психического развития
Куллин 3 активно участвует в регуляции центральной нервной системы. Уровни экспрессии Куллина 3 в центральной нервной системе изменяются во время внутриутробного развития, младенчества, детства и взрослой жизни, что позволяет предположить, что экспрессия белка играет решающую роль в развитии мозга. Ген CUL3 был идентифицирован как ген риска для нейроразвивающих расстройств, в частности расстройств аутистического спектра . [23]
Рак
Дерегуляция уровня экспрессии Cullin 3 наблюдалась при раке человека. Было показано, что Cullin 3 сверхэкспрессируется при инвазивном раке, а уровень экспрессии белка положительно коррелирует со стадией опухоли. При раке груди сверхэкспрессия белка Cullin 3 приводит к снижению уровня белка Nrf2 . Этот белок является фактором транскрипции, регулирующим экспрессию некоторых ферментов детоксикации и антиоксидантов. Другим субстратом комплекса CRL является потенциальный белок-супрессор опухолей RhoBTB2 . [24]
Взаимодействия
Было показано, что CUL3 взаимодействует с:
Ссылки
- ^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000036257 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000004364 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ Kipreos ET, Lander LE, Wing JP, He WW, Hedgecock EM (июнь 1996 г.). "cul-1 требуется для выхода из клеточного цикла у C. elegans и идентифицирует новое семейство генов". Cell . 85 (6): 829–839. doi : 10.1016/S0092-8674(00)81267-2 . PMID 8681378. S2CID 15805562.
- ^ Wimuttisuk W, Singer JD (март 2007 г.). «Убиквитинлигаза Cullin3 функционирует как гетеродимер, связанный с Nedd8». Молекулярная биология клетки . 18 (3): 899–909. doi :10.1091/mbc.E06-06-0542. PMC 1805106. PMID 17192413.
- ^ «Ген Энтрез: CUL3 куллин 3» .
- ^ Ченг Дж., Го Дж., Ван З., Норт Б.Дж., Тао К., Дай Икс и др. (январь 2018 г.). «Функциональный анализ лигазы Cullin 3 E3 в онкогенезе». Biochimica et Biophysical Acta (BBA) - Обзоры о раке . 1869 (1): 11–28. дои : 10.1016/j.bbcan.2017.11.001. ПМК 7076836 . ПМИД 29128526.
- ^ Sarikas A, Hartmann T, Pan ZQ (2011). «Семейство белков cullin». Genome Biology . 12 (4): 220. doi : 10.1186/gb-2011-12-4-220 . PMC 3218854. PMID 21554755 .
- ^ Дубиэль Д., Бинтиг В., Кане Т., Дубиэль В., Науманн М. (август 2017 г.). «Неддилирование Cul3 имеет решающее значение для постепенного образования липидных капель во время адипогенеза». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Исследования молекулярных клеток . 1864 (8): 1405–1412. дои : 10.1016/j.bbamcr.2017.05.009. ПМИД 28499918.
- ^ Chen HY, Chen RH (2016). "Cullin 3 Ubiquitin Ligases in Cancer Biology: Functions and Therapeutic Implications". Frontiers in Oncology . 6 : 113. doi : 10.3389/fonc.2016.00113 . PMC 4852199. PMID 27200299 .
- ^ Петроски, доктор медицинских наук, Деше Р.Дж. (январь 2005 г.). «Функция и регуляция убиквитинлигазы куллин-RING». Обзоры природы. Молекулярно-клеточная биология . 6 (1): 9–20. дои : 10.1038/nrm1547. PMID 15688063. S2CID 24159190.
- ^ Ченг Дж., Го Дж., Ван З., Норт Б.Дж., Тао К., Дай Икс и др. (январь 2018 г.). «Функциональный анализ лигазы Cullin 3 E3 в онкогенезе». Biochimica et Biophysical Acta (BBA) - Обзоры о раке . 1869 (1): 11–28. дои : 10.1016/j.bbcan.2017.11.001. ПМК 7076836 . ПМИД 29128526.
- ^ Ченг Дж., Го Дж., Ван З., Норт Б.Дж., Тао К., Дай Икс и др. (январь 2018 г.). «Функциональный анализ лигазы Cullin 3 E3 в онкогенезе». Biochimica et Biophysical Acta (BBA) - Обзоры о раке . 1869 (1): 11–28. дои : 10.1016/j.bbcan.2017.11.001. ПМК 7076836 . ПМИД 29128526.
- ^ Булатов Э., Чиулли А. (май 2015 г.). «Нацеливание убиквитинлигаз Cullin-RING E3 для открытия лекарств: структура, сборка и модуляция малых молекул». Биохимический журнал . 467 (3): 365–386. doi : 10.1042/BJ20141450. PMC 4403949. PMID 25886174 .
- ^ Петроски, доктор медицинских наук, Деше Р.Дж. (январь 2005 г.). «Функция и регуляция убиквитинлигазы куллин-RING». Обзоры природы. Молекулярно-клеточная биология . 6 (1): 9–20. дои : 10.1038/nrm1547. PMID 15688063. S2CID 24159190.
- ^ Булатов Э., Чиулли А. (май 2015 г.). «Нацеливание убиквитинлигаз Cullin-RING E3 для открытия лекарств: структура, сборка и модуляция малых молекул». Биохимический журнал . 467 (3): 365–386. doi : 10.1042/BJ20141450. PMC 4403949. PMID 25886174 .
- ^ Chew EH, Hagen T (июнь 2007 г.). «Регулирование неддиляции куллина, опосредованное субстратом». Журнал биологической химии . 282 (23): 17032–17040. doi : 10.1074/jbc.M701153200 . PMID 17439941.
- ^ Soucy TA, Smith PG, Rolfe M (июнь 2009 г.). «Нацеливание лигаз cullin-RING, активируемых NEDD8, для лечения рака». Clinical Cancer Research . 15 (12): 3912–3916. doi :10.1158/1078-0432.CCR-09-0343. PMID 19509147. S2CID 17834925.
- ^ Boyden LM, Choi M, Choate KA, Nelson-Williams CJ, Farhi A, Toka HR и др. (январь 2012 г.). «Мутации в kelch-like 3 и cullin 3 вызывают гипертонию и нарушения электролитного баланса». Nature . 482 (7383): 98–102. doi :10.1038/nature10814. PMC 3278668 . PMID 22266938.
- ^ Ferdaus MZ, McCormick JA (июнь 2016 г.). «Путь CUL3/KLHL3-WNK-SPAK/OSR1 как цель антигипертензивной терапии». American Journal of Physiology. Renal Physiology . 310 (11): F1389–F1396. doi :10.1152/ajprenal.00132.2016. PMC 4935775. PMID 27076645 .
- ^ Ferdaus MZ, McCormick JA (май 2018 г.). «Механизмы и противоречия при мутантной Cul3-опосредованной семейной гиперкалиемической гипертензии». Американский журнал физиологии. Физиология почек . 314 (5): F915–F920. doi :10.1152/ajprenal.00593.2017. PMC 6031903. PMID 29361671 .
- ^ Lin P, Yang J, Wu S, Ye T, Zhuang W, Wang W и др. (2023). «Текущие тенденции гена высокого риска Cul3 при расстройствах нейроразвития». Frontiers in Psychiatry . 14 : 1215110. doi : 10.3389/fpsyt.2023.1215110 . PMC 10416632. PMID 37575562 .
- ^ Haagenson KK, Tait L, Wang J, Shekhar MP, Polin L, Chen W и др. (сентябрь 2012 г.). «Уровни экспрессии белка Cullin-3 коррелируют с прогрессированием рака груди». Cancer Biology & Therapy . 13 (11): 1042–1046. doi :10.4161/cbt.21046. PMC 3461811 . PMID 22825334.
- ^ Min KW, Hwang JW, Lee JS, Park Y, Tamura TA, Yoon JB (май 2003 г.). «TIP120A ассоциируется с куллинами и модулирует активность убиквитинлигазы». Журнал биологической химии . 278 (18): 15905–15910. doi : 10.1074/jbc.M213070200 . PMID 12609982.
- ^ Singer JD, Gurian-West M, Clurman B, Roberts JM (сентябрь 1999 г.). «Cullin-3 нацеливает циклин E на убиквитинирование и контролирует S-фазу в клетках млекопитающих». Genes & Development . 13 (18): 2375–2387. doi :10.1101/gad.13.18.2375. PMC 317026 . PMID 10500095.
- ^ Kim AY, Bommeljé CC, Lee BE, Yonekawa Y, Choi L, Morris LG и др. (ноябрь 2008 г.). «SCCRO (DCUN1D1) является важным компонентом комплекса E3 для неддиляции». Журнал биологической химии . 283 (48): 33211–33220. doi : 10.1074/jbc.M804440200 . PMC 2586271. PMID 18826954 .
- ^ Wang XJ, Sun Z, Chen W, Li Y, Villeneuve NF, Zhang DD (август 2008 г.). «Активация Nrf2 арсенитом и монометиларсоновой кислотой не зависит от Keap1-C151: усиленное взаимодействие Keap1-Cul3». Токсикология и прикладная фармакология . 230 (3): 383–389. doi :10.1016/j.taap.2008.03.003. PMC 2610481. PMID 18417180 .
- ^ Rachakonda G, Xiong Y, Sekhar KR, Stamer SL, Liebler DC, Freeman ML (март 2008 г.). «Ковалентная модификация Cys151 диссоциирует электрофильный сенсор Keap1 от убиквитинлигазы CUL3». Chemical Research in Toxicology . 21 (3): 705–710. doi : 10.1021/tx700302s . PMID 18251510.
- ^ Rondou P, Haegeman G, Vanhoenacker P, Van Craenenbroeck K (апрель 2008 г.). «BTB Protein KLHL12 нацеливает рецептор дофамина D4 на убиквитинирование лигазой E3 на основе Cul3». Журнал биологической химии . 283 (17): 11083–11096. doi : 10.1074/jbc.M708473200 . PMC 2431063. PMID 18303015 .
Дальнейшее чтение
- Andersson B, Wentland MA, Ricafrente JY, Liu W, Gibbs RA (апрель 1996 г.). «Метод «двойного адаптера» для улучшенного построения библиотеки дробовика». Аналитическая биохимия . 236 (1): 107–113. doi :10.1006/abio.1996.0138. PMID 8619474.
- Yu W, Andersson B, Worley KC, Muzny DM, Ding Y, Liu W и др. (апрель 1997 г.). «Крупномасштабное конкатенационное секвенирование ДНК». Genome Research . 7 (4): 353–358. doi :10.1101/gr.7.4.353. PMC 139146 . PMID 9110174.
- Michel JJ, Xiong Y (июнь 1998 г.). «Человеческий CUL-1, но не другие члены семейства куллинов, избирательно взаимодействует с SKP1, образуя комплекс с SKP2 и циклином A». Cell Growth & Differentiation . 9 (6): 435–449. PMID 9663463.
- Du M, Sansores-Garcia L, Zu Z, Wu KK (сентябрь 1998 г.). «Анализ клонирования и экспрессии нового салицилат-супрессируемого гена Hs-CUL-3, члена семейства cullin/Cdc53». Журнал биологической химии . 273 (38): 24289–24292. doi : 10.1074/jbc.273.38.24289 . PMID 9733711.
- Ishikawa K, Nagase T, Suyama M, Miyajima N, Tanaka A, Kotani H и др. (июнь 1998 г.). «Предсказание кодирующих последовательностей неопознанных генов человека. X. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые могут кодировать большие белки in vitro». DNA Research . 5 (3): 169–176. doi : 10.1093/dnares/5.3.169 . PMID 9734811.
- Ohta T, Michel JJ, Schottelius AJ, Xiong Y (апрель 1999 г.). "ROC1, гомолог APC11, представляет собой семейство партнеров куллина с ассоциированной активностью убиквитинлигазы". Molecular Cell . 3 (4): 535–541. doi : 10.1016/S1097-2765(00)80482-7 . PMID 10230407. S2CID 19371828.
- Singer JD, Gurian-West M, Clurman B, Roberts JM (сентябрь 1999 г.). «Cullin-3 нацеливает циклин E на убиквитинирование и контролирует S-фазу в клетках млекопитающих». Genes & Development . 13 (18): 2375–2387. doi :10.1101/gad.13.18.2375. PMC 317026 . PMID 10500095.
- Hori T, Osaka F, Chiba T, Miyamoto C, Okabayashi K, Shimbara N и др. (ноябрь 1999 г.). «Ковалентная модификация всех членов семейства белков человеческого куллина с помощью NEDD8». Oncogene . 18 (48): 6829–6834. doi : 10.1038/sj.onc.1203093 . PMID 10597293.
- Maeda I, Ohta T, Koizumi H, Fukuda M (апрель 2001 г.). «In vitro убиквитинирование циклина D1 с помощью ROC1-CUL1 и ROC1-CUL3». FEBS Letters . 494 (3): 181–185. doi :10.1016/S0014-5793(01)02343-2. PMID 11311237. S2CID 40693441.
- Ляпина С., Коуп Г., Шевченко А., Серино Г., Цугэ Т., Чжоу К. и др. (май 2001 г.). «Продвижение расщепления конъюгата NEDD-CUL1 сигналосомой COP9». Science . 292 (5520): 1382–1385. Bibcode :2001Sci...292.1382L. doi :10.1126/science.1059780. PMID 11337588. S2CID 14224920.
- Min KW, Hwang JW, Lee JS, Park Y, Tamura TA, Yoon JB (май 2003 г.). «TIP120A ассоциируется с куллинами и модулирует активность убиквитинлигазы». Журнал биологической химии . 278 (18): 15905–15910. doi : 10.1074/jbc.M213070200 . PMID 12609982.
- Kobayashi A, Kang MI, Okawa H, Ohtsuji M, Zenke Y, Chiba T и др. (август 2004 г.). «Сенсор окислительного стресса Keap1 функционирует как адаптер для лигазы E3 на основе Cul3 для регулирования протеасомной деградации Nrf2». Молекулярная и клеточная биология . 24 (16): 7130–7139. doi :10.1128/MCB.24.16.7130-7139.2004. PMC 479737. PMID 15282312 .
- Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D, Elias JE, Villén J, Li J, et al. (август 2004 г.). «Крупномасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 101 (33): 12130–12135. Bibcode : 2004PNAS..10112130B. doi : 10.1073/pnas.0404720101 . PMC 514446. PMID 15302935 .
- Rush J, Moritz A, Lee KA, Guo A, Goss VL, Spek EJ и др. (январь 2005 г.). «Иммуноаффинное профилирование фосфорилирования тирозина в раковых клетках». Nature Biotechnology . 23 (1): 94–101. doi :10.1038/nbt1046. PMID 15592455. S2CID 7200157.
- Фурукава М., Сюн И. (январь 2005 г.). «Белок BTB Keap1 нацеливает антиоксидантный фактор транскрипции Nrf2 на убиквитинирование лигазой Куллин 3-Roc1». Молекулярная и клеточная биология . 25 (1): 162–171. doi :10.1128/MCB.25.1.162-171.2005. PMC 538799. PMID 15601839 .
- Hernández-Muñoz I, Lund AH, van der Stoop P, Boutsma E, Muijrers I, Verhoeven E и др. (май 2005 г.). «Стабильная инактивация X-хромосомы включает комплекс PRC1 Polycomb и требует гистона MACROH2A1 и лигазы убиквитина E3 CULLIN3/SPOP». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 102 (21): 7635–7640. doi : 10.1073/pnas.0408918102 . PMC 1140410. PMID 15897469 .
- Lu L, Zhou ZM, Huang XY, Xu M, Yin LL, Wang H и др. (июнь 2005 г.). «Идентификация и характеристика cul-3b, нового варианта транскрипта гоминина CUL-3». Asian Journal of Andrology . 7 (2): 205–211. doi :10.1111/j.1745-7262.2005.00024.x. PMID 15897978.
Внешние ссылки