Суперсемейство лиганд-управляемых ионных каналов Cys -loop состоит из никотиновых ацетилхолиновых , GABA A , GABA A -ρ , глициновых , 5-HT 3 и цинк-активируемых (ZAC) рецепторов . Эти рецепторы состоят из пяти белковых субъединиц , которые образуют пентамерное расположение вокруг центральной поры. Обычно имеется 2 альфа-субъединицы и 3 другие бета-, гамма- или дельта-субъединицы (некоторые состоят из 5 альфа-субъединиц). Название семейства относится к характерной петле, образованной 13 высококонсервативными аминокислотами между двумя остатками цистеина (Cys), которые образуют дисульфидную связь [1] вблизи N-концевого внеклеточного домена.
Рецепторы Cys-loop известны только у эукариот , но являются частью более крупного семейства пентамерных лиганд-управляемых ионных каналов. Только клад Cys-loop включает пару мостиковых остатков цистеина. [2] Более крупное суперсемейство включает бактериальные (например, GLIC ), а также не-Cys-loop эукариотические рецепторы и называется «пентамерными лиганд-управляемыми ионными каналами» или «рецепторами Pro-loop». [3]
Все субъединицы состоят из большого консервативного внеклеточного N-концевого домена, трех высококонсервативных трансмембранных доменов, цитоплазматической петли переменного размера и аминокислотной последовательности и четвертой трансмембранной области с относительно коротким и вариабельным внеклеточным C-концевым доменом. Нейротрансмиттеры связываются на интерфейсе между субъединицами во внеклеточном домене .
Каждая субъединица содержит четыре трансмембранные альфа-спирали (M1, M2, M3, M4). Пора образована в основном спиралями M2. [4] Линкер M3-M4 представляет собой внутриклеточный домен, который связывает цитоскелет.
Большая часть знаний о рецепторах cys-loop получена из выводов, сделанных при изучении различных членов семейства. Исследования структур связывающих ацетилхолин белков (AChBP) определили, что сайты связывания состоят из шести петель, причем первые три образуют главную грань, а следующие три образуют дополнительную грань. Последняя петля на главной грани охватывает лиганд в активном рецепторе. Этот сайт также изобилует ароматическими остатками . [5]
Недавняя литература [5] указывает на то, что остаток Trp на петле B имеет решающее значение для связывания как агониста, так и антагониста. Нейротрансмиттер попадает в сайт связывания, где он взаимодействует (через водородную и катионную π-связь ) с аминокислотой, находящейся в ароматической коробке, расположенной на главной поверхности сайта связывания. Другое важное взаимодействие происходит между агонистом и тирозином на петле C. [6] При взаимодействии петля претерпевает конформационные изменения и поворачивается вниз, чтобы закрыть молекулу в сайте связывания.
Благодаря исследованиям никотиновых ацетилхолиновых рецепторов было установлено, что каналы активируются посредством аллостерических взаимодействий между связывающим и затворным доменами. После связывания агониста происходят конформационные изменения (включая перемещение бета-слоя аминоконцевого домена и внешнее движение петель 2, F и цис-петли, которые связаны с линкером M2-M3 и открывают канал). Электронная микроскопия (при 9 Å) показывает, что открытие вызвано вращением в домене M2, но другие исследования кристаллических структур этих рецепторов показали, что открытие может быть результатом наклона M2, что приводит к расширению пор и четвертичному повороту всего пентамерного рецептора. [7]