Гаплогруппа D-M55

Гаплогруппа D-M55 (M64.1/Page44.1), также известная как гаплогруппа D1a2a , представляет собой гаплогруппу Y-хромосомы . Это одна из двух ветвей гаплогруппы D1a. Другой - D1a1 , который с высокой частотой встречается у тибетцев и других тибето-бирманских популяций и географически близких групп. D также распространен с низкой и средней частотой в Центральной Азии , Восточной Азии и материковой части Юго-Восточной Азии .

Гаплогруппа D-M55 встречается примерно у 33% ^{[4] [5] [6] [7] [8]} современных японских мужчин. Он был обнаружен у четырнадцати из шестнадцати выборки, или 87,5% выборки мужчин -айнов в одном исследовании, опубликованном в 2004 году ^[9] , и у трех из выборки из четырех или 75% выборки мужчин-айнов в другом исследовании, опубликованном. в 2005 году, когда некоторые участники исследования 2004 года, возможно, прошли повторное тестирование. ^[5] В настоящее время это наиболее распространенная гаплогруппа Y-ДНК в Японии, если O1-F265 и O2-M122 (TMRCA примерно 30 000 ~ 35 000 лет назад) считаются отдельными гаплогруппами. Гаплогруппа D-M55 могла родиться в Японии в любое время между ее MRCA с D-Y34637 (найденным в современных Онге и Джаравасе ) около 45 000 лет назад и MRCA всех существующих ветвей D-M55 около 21 000 лет назад.

В 2017 году было подтверждено, что японская ветвь гаплогруппы D-M55 отличается и изолирована от других ветвей гаплогруппы D примерно 50 000 лет назад. Раскол в D1a мог произойти недалеко от Тибетского нагорья . ^[10]

История

Путь миграции гаплогруппы D

Путь миграции гаплогрупп Y-ДНК в Восточной Азии

Среди подгрупп гаплогруппы D предок D-M55 отправился на восток, чтобы достичь Японского архипелага. ^[11] По словам Майкла Ф. Хаммера из Университета Аризоны , гаплогруппа D возникла недалеко от Тибетского нагорья и мигрировала в Японию, где в конечном итоге стала D-M55. ^[12] Мицуру Сакитани сообщил, что гаплогруппа D1 пришла из Тибета на север Кюсю через Горный Алтай и Корейский полуостров более чем, а гаплогруппа D-M55 (D1a2a) родилась на Японском архипелаге. ^[11]

Недавние исследования показывают, что D-M55 стал доминирующим в конце периода Дзёмон, незадолго до прихода Яёи, что предполагает демографический бум и спад. ^[13]

Частота

Средняя частота в японском языке составляет около 33%. ^{[4] [5] [7] [8]} Высокие частоты встречаются в различных местах Японии, особенно на Хоккайдо, восточном Хонсю, южном Кюсю и Окинаве .

• Айны : 87,5% (Таджима и др. 2004 ^[9]）
• Асахикава (Хоккайдо): 63,7% (оценка по гаплотипам Y-STR) ^[7]
• Чиба : 45,5% ^[14]
• Токио : 40,4% (21/57 = 36,8% JPT , 23/52 = 44,2% ^[14] )
• Окинава : 37,6% (0/7 Хатерума, ^[15] 1/20 = 5,0% Ириомотэ, ^[15] 8/29 = 27,6% Кацурен, ^[15] 10/32 = 31,3% Ёмитан, ^[15] 16/49 = 32,7% Исигаки , ^[16] 13/38 = 34,2% Мияко , ^[16] 13/36 = 36,1% Хаэбару , ^[16] 7/19 = 36,8% Гусиками, ^[15] 35/87 = 40,2% Окинава рассчитано по Y -STR гаплотипы, ^[7] 38/80 = 47,5% Итоман, ^[15] 25/45 = 55,6% Окинава ^[5] )
• Регион Канто : 37,6% ^[4]
• Кюсю : 35,0% (8/31 = 25,8% префектура Фукуока , ^[17] 29/104 = 27,9% Кюсю, ^[9] 90/300 = 30,0% студенты колледжа Нагасаки , ^[8] 39/129 = 30,2% префектура Сага Тянькан Учащиеся старших классов средней школы , ^[16] 34/102 = 33,3% взрослых мужчин Фукуока , ^[8] 7/21 = 33,3% Префектура Нагасаки , ^[17] 13/37 = 35,1% Префектура Оита , ^[17] 95/270 = 35,2 % Префектура Миядзаки , ^[18] 470/1285 = 36,6% Префектура Миядзаки , ^[17] 58/151 = 38,4% Префектура Кагосима , ^[17] 5/11 = 45,5% Префектура Сага , ^[17] 22/47 = 46,8% Кумамото Префектура ^[17] )
• Нагоя : 34,3% (оценка по гаплотипам Y-STR) ^[7]
• Саппоро : 33,9% (100/302 = 33,1% студентов колледжей Саппоро, ^[8] 72/206 = 35,0% взрослых мужчин Саппоро ^[8] )
• Кавасаки : 33,0% ^[8]
• Сидзуока : 32,8% ^[5]
• Канадзава : 32,6% (97/298 = 32,6%, ^[8] 76/232 = 32,8% ^[8] )
• Аомори : 31,1% (22/79 = 27,8%, ^[16] 11/27 = 40,7% ^[5] )
• Сикоку : 30% (18/70 = 25,7% Токусима , ^[5] 9/31 = 29,0% Сикоку, ^[17] 119/388 = 30,7% студенты колледжа Токусима ^[8]）
• Микронезия : 1/17 = 5,9% (Hammer et al. 2006 ^[5]）
• Южная Корея : 3/75 = 4,0% (Hammer et al. 2006 ^[5] ), 12/317 = 3,8% (оценено по гаплотипам Y-STR), ^[7] 8/506 = 1,6% (Kim et al. 2011 ^[19] )
• Западный Тимор : 1/497 = 0,2% (Tumonggor et al. 2014 ^[20]）

Древняя ДНК

Человек периода Дзёмон, раскопанный из останков Фунадомари (около 3800–3500 лет назад) на острове Ребун на Хоккайдо , принадлежит к гаплогруппе D1a2a2a (D-CTS220). ^[21]

Анализ образца Дзёмон (Икавазу) и древнего образца с Тибетского нагорья (Чохопани, Ch) выявил лишь частично общее происхождение, что указывает на положительное генетическое узкое место в отношении распространения гаплогруппы D от древней популяции, связанной с образцом тибетского Чохопани ( и современные тибето-бирманские группы). ^[22]

Филогенетическое дерево

По дереву ISOGG (Версия: 14.151). ^[23]

• DE (ЯП)
  • Д (CTS3946)
    • D1 (M174/Page30, IMS-JST021355, Гаплогруппа D-M174 )
      • Д1а (CTS11577)　
        • Д1а1 (F6251/Z27276)
          • D1a1a (M15)　Тибет
          • D1a1b (P99)　Тибет , Монголия , Средняя Азия
        • Д1а2 (Z3660)
          • D1a2a (M64.1/Page44.1, M55) 　 Япония ( народ Ямато , народ Рюкюань , народ Айны )
          • D1a2b (Y34637)　Андаманские острова（Народ онге , народ джарава）^{[24] [25]}
      • D1b (L1378) 　 Филиппины ^[26]
    • D2 (A5580.2) 　Нигерия , афроамериканцы , Саудовская Аравия , Сирия ^{[27] [28]}

Рекомендации

1. «Добро пожаловать в FamilyTreeDNA Discover» .
2. YFull Haplogroup YTree v7.02.01 по состоянию на 15 марта 2019 г.
3. «Добро пожаловать в FamilyTreeDNA Discover» .
4. Като, Тору; Мунхбат, Батмунх; Тунай, Кеничи; и другие. (2005). «Генетические особенности монгольских этносов, выявленные с помощью Y-хромосомного анализа». Джин . 346 : 63–70. дои : 10.1016/j.gene.2004.10.023. ПМИД  15716011.
5. Хаммер, Майкл Ф.; Карафет Татьяна М.; Пак, Хваён; Омото, Кэйичи; Харихара, Синдзи; Стоункинг, Марк; Хорай, Сатоши (2006). «Двойное происхождение японцев: общая основа для Y-хромосом охотников-собирателей и фермеров». Журнал генетики человека . 51 (1): 47–58. дои : 10.1007/s10038-005-0322-0 . ПМИД  16328082.
6. ЮИТИ САТО, ТОШИКАЦУ ШИНКА, АШРАФ А. ЭВИС, АЙКО ЯМАУЧИ, ТЕРУАКИ ИВАМОТО, ЮТАКА НАКАХОРИ Обзор генетических вариаций Y-хромосомы современных японских мужчин.
7. Нонака, И.; Минагучи, К.; Такезаки, Н. (2 февраля 2007 г.). «Бинарные гаплогруппы Y-хромосомы у населения Японии и их связь с 16 полиморфизмами Y-STR». Анналы генетики человека . 71 (Часть 4): 480–95. дои : 10.1111/j.1469-1809.2006.00343.x. hdl : 10130/491 . PMID  17274803. S2CID  1041367.
8. Сато Ю, Шинка Т, Эвис А.А., Ямаути А, Ивамото Т, Накахори Ю (2014). «Обзор генетических вариаций Y-хромосомы современных японских мужчин». Антропологическая наука . 122 (3): 131–136. дои : 10.1537/ase.140709 .
9. Тадзима, Ацуши; и другие. (2004). « » (2 марта 2004 г.). «Генетическое происхождение айнов, выведенное на основе комбинированного анализа ДНК материнской и отцовской линии». Журнал генетики человека . 49 (4): 187–193. дои : 10.1007/s10038-004-0131-x . ПМИД  14997363.
10. Мондал, Маюх и Бергстрем, Андерс и Сюэ, Яли и Калафель, Франческ и Лааюни, Хафид и Казальс, Ферран и Маджумдер, Парта и Тайлер-Смит, Крис и Бертранпети, Жауме. (2017). Y-хромосомные последовательности различных индийских популяций и происхождение андаманцев. Генетика человека. 136. 10.1007/s00439-017-1800-0.
11. 崎谷満『DNA・考古・言語の学際研究が示す新・日本列島史』（勉誠出版 2009年) (на японском языке)
12. «Архивная копия» (PDF) . Архивировано из оригинала (PDF) 4 марта 2009 г. Проверено 29 сентября 2017 г.{{cite web}}: CS1 maint: архивная копия в заголовке ( ссылка )
13. Охаси, Джун; Токунага, Кацуши; Хитоми, Юки; Савай, Хироми; Хор, Сейк-Сун; Нака, Идзуми; Ватанабэ, Юсуке (17 июня 2019 г.). «Анализ всей последовательности Y-хромосомы раскрывает историю населения Японии в период Дзёмон». Научные отчеты . 9 (1): 8556. Бибкод : 2019NatSR...9.8556W. дои : 10.1038/s41598-019-44473-z . ISSN  2045-2322. ПМК 6572846 . ПМИД  31209235. 
14. Найто С., Касахара-Нонака I, Минагути К., Намбиар П. (апрель 2013 г.). «Отнесение SNP Y-хромосомы, обнаруженных у японского населения, к дереву гаплогрупп Y-хромосомы». Журнал генетики человека . 58 (4): 195–201. дои : 10.1038/jhg.2012.159 . ПМИД  23389242.
15. Шинка, Тошикацу; Томита, Кейко; Тода, Тацуши; Котлярова Светлана Евгеньевна; Ли, Джувон; Куроки, Йоко; Джин, Дон Гю; Токунага, Кацуши; Накамура, Хидеки; Накахори, Ю. (1999). «Генетические вариации Y-хромосомы у японского населения и последствия для линии Y-хромосомы современного человека». Журнал генетики человека . 44 (4): 240–245. дои : 10.1007/s100380050151 . PMID  10429363. S2CID  9593881.
16. Тоцука, Сёдзи; Сато, Юичи; Танака, Масаси (2016). «Исследование географического распределения гаплогрупп y-хромосомной и митохондриальной ДНК среди населения Японии, проведенное Консорциумом средней школы Super Science (SSH)». Антропологическая наука (японская серия) . 124 (2): 85–91. дои : 10.1537/asj.161018.
17. Хирофуми Нохара, Икуко Маэда, Ринноске Хисадуми, Такето Утияма, Хироко Хирасима, Масахито Наката, Рика Оно, Тетсуро Хасегава и Кенши Симидзу (2021), «Географическое распределение гаплотипов Y-STR и Y-гаплогрупп среди жителей префектуры Миядзаки. " Японский журнал судебной медицины и технологий , Vol. 26, Выпуск 1, с. 17-27. https://doi.org/10.3408/jafst.778
18. И Со, И. Таками, Т. Накаяма и К. Такахама, «Полиморфизмы ДНК Y-хромосомы и их гаплотипы в японском населении». Leg Med (Токио), сентябрь 1999 г.; 1 (3): 145-9. дои: 10.1016/s1344-6223(99)80027-3.
19. Ким, Сун Хи; Ким, Ки-Чоль; Шин, Донг-Джик; Джин, Хан-Джун; Квак, Кён-Дон; Хан, Мён Су; Сон, Джун-Мён; Ким, Вон; Ким, Ук (2011). «Высокие частоты линий гаплогруппы Y-хромосомы O2b-SRY465 в Корее: генетический взгляд на заселение Кореи». Исследовательская генетика . 2011 (2): 10. doi : 10.1186/2041-2223-2-10 . ПМК 3087676 . ПМИД  21463511. 
20. Тумонггор, Мерианн К; Карафет Татьяна М; Дауни, Шон; и другие. (2014). «Изоляция, контакты и социальное поведение сформировали генетическое разнообразие в Западном Тиморе». Журнал генетики человека . 59 (9): 494–503. дои : 10.1038/jhg.2014.62 . ПМЦ 4521296 . ПМИД  25078354. 
21. 神澤ほか(2016)「礼文島船泊縄文人の核ゲノム解析」第70回日本人類学大会 [1] (на японском языке)
22. Бур, Элизабет де; Ян, Мелинда А.; Каваго, Эйлин; Барнс, Джина Л. (2020). «Япония рассматривается с точки зрения гипотезы распространения фермеров/языков». Эволюционные гуманитарные науки . 2 : е13. дои : 10.1017/ehs.2020.7 . ISSN  2513-843X. ПМЦ 10427481 . ПМИД  37588377. 
23. "Дерево гаплогруппы D 2019-2020" .
24. Тангарадж К., Сингх Л., Редди А.Г., Рао В.Р., Сегал СК, Андерхилл П.А., Пирсон М., Фрейм И.Г., Хагельберг Э. (январь 2003 г.). «Генетическое сходство жителей Андаманских островов, исчезающего человеческого населения». Современная биология . 13 (2): 86–93. дои : 10.1016/S0960-9822(02)01336-2 . PMID  12546781. S2CID  12155496.
25. "D YTree". Архивировано из оригинала 31 августа 2019 г. Проверено 2 сентября 2019 г.
26. Гаплогруппа D Y-ДНК и ее субклады - 2014 г.
27. Тайлер-Смит, Крис; Сюэ, Яли; Томас, Марк Г.; Ян, Хуаньмин; Арсьеро, Елена; Асан; Коннелл, Брюс А.; Джонс, Эбигейл Л.; Хабер, Марк (13 июня 2019 г.). «Редкая глубоко укоренившаяся африканская гаплогруппа Y-хромосомы D0 и ее значение для расселения современного человека за пределы Африки». Генетика . 212 (4): 1421–1428. дои : 10.1534/genetics.119.302368 . ISSN  0016-6731. ПМК 6707464 . ПМИД  31196864. 
28. Эстес, Роберта (21 июня 2019 г.). «Захватывающие новые открытия гаплогруппы D ДНК Y!». DNAeXplained — Генетическая генеалогия . Проверено 8 июля 2019 г.