stringtranslate.com

Десульфобульбовые

Desulfobulbaceae — это семейство Thermodesulfobacteriota . Они восстанавливают сульфаты до сульфидов для получения энергии и являются анаэробами .

Открытие нитчатых Desulfobulbaceae в 2012 году проливает свет на причину небольших электрических токов, измеренных в верхнем слое морских отложений . [1] Токи были впервые измерены в 2010 году . [2] Эти организмы, называемые « кабельными бактериями », состоят из тысяч клеток, организованных в нити длиной до трех сантиметров. Они переносят электроны из осадка, богатого сероводородом, в богатый кислородом осадок, который контактирует с водой. [1] [3] [4] [5] [6] Более поздние исследования выявили их способность использовать нитрат или нитрит в качестве конечного акцептора электронов при отсутствии кислорода . [7] [8] С момента открытия кабельные бактерии были обнаружены в самых разных отложениях по всему миру. [9] На основе филогенетического анализа генов 16s рРНК и dsrAB было предложено выделить кабельные бактерии в два новых рода-кандидата, а именно Ca. Electrothrix и Ca. Electronema. [10]

Филогения

Принятая в настоящее время таксономия основана на Списке названий прокариот, имеющих постоянное место в номенклатуре (LPSN) [11] и Национальном центре биотехнологической информации (NCBI) [12].

Смотрите также

Примечания

  1. ^ ab Пфеффер С, Ларсен С, Сонг Дж, Донг М, Безенбахер Ф, Мейер РЛ, Кьельдсен К.У., Шрайбер Л., Горби Я., Эль-Наггар М.Ю., Люнг К.М., Шрамм А., Рисгаард-Петерсен Н., Нильсен Л.П. (ноябрь 2012 г.) ). «Нитчатые бактерии переносят электроны на сантиметровые расстояния». Природа . 491 (7423): 218–21. дои : 10.1038/nature11586. ПМИД  23103872.
  2. ^ Нильсен, Ларс Питер; Рисгаард-Петерсен, Нильс; Фоссинг, Хенрик; Кристенсен, Питер Бондо; Саяма, Микио (февраль 2010 г.). «Электрические токи соединяют пространственно разделенные биогеохимические процессы в морских отложениях». Природа . 463 (7284): 1071–1074. дои : 10.1038/nature08790. ISSN  0028-0836. ПМИД  20182510.
  3. ^ Reguera G (ноябрь 2012 г.). «Микробиология: Бактериальные шнуры питания». Nature . 491 (7423): 201–2. doi :10.1038/nature11638. PMID  23103866.
  4. ^ Keim B (24 октября 2012 г.). «Электрические насекомые: новые микробы формируют живые глубоководные силовые кабели». Wired Science . Получено 26 октября 2012 г.
  5. ^ Смит Б. (6 декабря 2014 г.). «Ученые в шоке обнаружили «электрические» бактерии в Ярре». The Age . стр. 15.
  6. ^ Larsen S, Nielsen LP, Schramm A (апрель 2015 г.). «Кабельные бактерии, связанные с дальним переносом электронов в осадочных породах солончаков Новой Англии». Environmental Microbiology Reports . 7 (2): 175–9. doi :10.1111/1758-2229.12216. PMID  25224178.
  7. ^ Marzocchi U, Trojan D, Larsen S, Meyer RL, Revsbech NP, Schramm A, Nielsen LP, Risgaard-Petersen N (август 2014 г.). «Электрическая связь между дистантным восстановлением нитрата и окислением сульфида в морских отложениях». Журнал ISME . 8 (8): 1682–90. doi :10.1038/ismej.2014.19. PMC 4817607. PMID 24577351  . 
  8. ^ Risgaard-Petersen N, Damgaard LR, Revil A, Nielsen LP (2014-08-01). «Картографирование источников и стоков электронов в морской биогеобатаре». Журнал геофизических исследований: Biogeosciences . 119 (8): 1475–1486. ​​doi :10.1002/2014jg002673.
  9. ^ Burdorf LD, Tramper A, Seitaj D, Meire L, Hidalgo-Martinez S, Zetsche EM, Boschker HT, Meysman FJ (2017-02-10). «Транспорт электронов на большие расстояния происходит глобально в морских отложениях». Biogeosciences . 14 (3): 683–701. doi : 10.5194/bg-14-683-2017 .
  10. ^ Trojan D, Schreiber L, Bjerg JT, Bøggild A, Yang T, Kjeldsen KU, Schramm A (июль 2016 г.). «Таксономическая структура для кабельных бактерий и предложение о родах-кандидатах Electrothrix и Electronema». Systematic and Applied Microbiology . 39 (5): 297–306. doi :10.1016/j.syapm.2016.05.006. PMC 4958695. PMID  27324572 . 
  11. ^ AC Parte; et al. "Desulfobulbaceae". Список названий прокариот, имеющих место в номенклатуре (LPSN) . Получено 09.09.2022 .
  12. ^ Sayers; et al. "Desulfobulbaceae". База данных таксономии Национального центра биотехнологической информации (NCBI) . Получено 2022-09-09 .
  13. ^ "The LTP" . Получено 20 ноября 2023 г. .
  14. ^ "Дерево LTP_all в формате newick" . Получено 20 ноября 2023 г. .
  15. ^ "LTP_08_2023 Release Notes" (PDF) . Получено 20 ноября 2023 г.
  16. ^ "GTDB release 08-RS214". База данных таксономии генома . Получено 10 мая 2023 г.
  17. ^ "bac120_r214.sp_label". База данных таксономии генома . Получено 10 мая 2023 г.
  18. ^ "История таксона". База данных таксономии генома . Получено 10 мая 2023 г.

Ссылки


  • в
  • т
  • е