stringtranslate.com

Гаплогруппа E-M75

Гаплогруппа E-M75 — гаплогруппа ДНК Y-хромосомы человека . Наряду с гаплогруппой E-P147 , это одна из двух основных ветвей старшей гаплогруппы E-M96 .

Древняя ДНК

В Африке

Кения

В Преттеджонс-Галли, округ Накуру, Кения , жили два скотовода раннего скотоводческого периода; один нес гаплогруппы E2 (xE2b)/E-M75 и K1a , а другой нес гаплогруппу L3f1b . [2] [3]

В курганах Илкек в округе Накуру, Кения , скотовод пасторального железного века носил гаплогруппы E2 (xE2b)/E-M75 и L0f2a . [2] [3]

На ферме Кисима/C4 в округе Лайкипия , Кения , скотовод пасторального железного века носил гаплогруппы E2 (xE2b)/E-M75 и L3h1a1 . [2] [3]

За пределами Африки

Соединенные Штаты Америки

На месте захоронения на Энсон-стрит в Чарльстоне , Южная Каролина , было найдено 18 афроамериканцев , датированных XVIII веком нашей эры. [4] Кусо, который имел западноафриканское и индейское происхождение, нес гаплогруппы E2b1a-CTS2400 и A2 . [4]

Распределение

Отсортированная таблица частот популяций E-M75+. Обратите внимание, что знак "?" указывает, что подлиния E-M75 либо не проверялась, либо не сообщалось в соответствующем исследовании.

Субклады

Э-М75*

Гаплогруппа E-M75(xM41,M54) обнаружена у 6% (1/18) выборки Дама из Намибии, [5] 4% (1/26) выборки Ганда из Уганды, [5] 3 % (1/39) образца мандинка из Гамбии/Сенегала [5] и 2% (1/49) образца шона из Зимбабве. [5]

Э-М41

Гаплогруппа Е-М41 обнаружена преимущественно в популяциях районов Великих озер и Верхнего Нила Центрально - Восточной Африки, в том числе у 67% (6/9) выборки алур из ДРК, [5] 39% (7/18 ) образца Хемы из ДРК, [5] 17% (15/88) образца из Эфиопии, [9] 8% (2/26) образца Ганда из Уганды, [5] 5% ( 2/40) выборки из Судана, [9] 4% (3/69) выборки хуту из Руанды, [8] 3% (1/29) выборки банту из Кении, [8] и 2% (1/43) выборки иракцев из Танзании. [8] E-M41 также был идентифицирован в заметных количествах среди коммерческих тестеров ДНК с Аравийского полуострова и среди нескольких мужчин -евреев-ашкенази , [14] , а также у мужчин из Ливана . [15]

Э-М54

Гаплогруппа Е-М54 обнаружена у 28% (22/80) выборки коса из Южной Африки, [5] 27% (10/37) выборки римайбе из Буркина-Фасо, [6] 22% (4 /18) выборки даба из северного Камеруна, [6] 21% (6/29) выборки зулусов из Южной Африки, [5] 15% (8/53) выборки некойсанских южноафриканцев , [9] 14% (4/29) выборки банту из Кении, [8] 14% выборки коморского ширази , [10] 11% (1/9) небольшой выборки носителей центральносуданского языка и сахарский языки из северного Камеруна, [6] 9% (3/35) выборки малагасийского языка из Мадагаскара, [12] 8% (3/37) выборки из Центральной Африки, [9] 7% (2/ 28) образца Мандара из северного Камеруна, [5] 6% (2/31) образца Нгумба из южного Камеруна, [5] 6% (4/64) образца !Кунг из Южной Африки, [6] 6% (1/18) образца Дамы из Намибии, [5] 5% (5/100) образца Фона из Бенина, [8] 5% (1/22) образца Амбо из Намибии, [5] 4% (3/69) выборки хуту из Руанды, [8] 4% (4/94) выборки тутси из Руанды, [8] 4% (2/47) выборки мбути из ДРК, [5] 4% (1/26) выборки ганда из Уганды, [5] 4% (1/26) выборки кхве из Южной Африки, [6] 4 % (1/28) выборки сото-тсвана из Южной Африки, [5] 3% (1/33) выборки бакола из южного Камеруна, [5] 3% (1/34) выборки Волоф из Гамбии/Сенегала, [5] 3% (2/72) выборки из Катара, [16] 2% (1/42) выборки кикуйю и камба из Кении, [5] 2% (1/ 55) выборки догонов из Мали, [5] и примерно 2% выборки из 121 араба из Омана. [8]

Было высказано предположение, что Y-хромосомы гаплогруппы E-M85 распространились по странам Африки к югу от Сахары совсем недавно на основании того факта, что микросателлитные гаплотипы Y-STR, связанные с этими хромосомами, демонстрируют низкую степень дифференциации во всем своем широком географическом ареале. Более того, средняя дисперсия STR-аллелей хромосом E-M85 выше у жителей Центральной и Западной Африки, чем у южноафриканских койсанов, что позволяет исследователям предположить, что E-M85 мог участвовать в расширении ареала банту-говорящих народов из Центральной Африки. -Западная Африка в сторону Южной Африки. [6] [7]

E-M98*

E-M98(xM85) был обнаружен у 4% (2/49) образца Мосси из Буркина-Фасо. [6]

Э-М200

E-M200 был обнаружен у 25% (3/12) небольшой выборки мбути из Демократической Республики Конго . [6] Согласно рисунку 4 Cruciani (2002), все три Бамбути, у которых наблюдается мутация M200, имеют одинаковый микросателлитный гаплотип, основанный на семи локусах STR друг с другом и с некоторыми E-M85(xM200) койсанскими (!Kung и/или Хве) особи из Южной Африки. [6]

Филогенетика

Филогенетическая история

До 2002 года в научной литературе существовало как минимум семь систем наименования филогенетического дерева Y-хромосомы. Это привело к значительной путанице. В 2002 году основные исследовательские группы объединились и сформировали Консорциум Y-хромосомы (YCC). Они опубликовали совместный документ, в котором было создано единое новое дерево, которое все согласились использовать. Позже группа гражданских ученых, интересующихся популяционной генетикой и генетической генеалогией, сформировала рабочую группу для создания любительского дерева, стремясь, прежде всего, к своевременности. В таблице ниже собраны все эти работы в знаковом дереве YCC 2002 года. Это позволяет исследователю, просматривающему старую опубликованную литературу, быстро перемещаться между номенклатурами.

Научные публикации

Следующие исследовательские группы в соответствии с их публикациями были представлены при создании дерева YCC.

Филогенетические деревья

Это филогенетическое дерево субкладов гаплогрупп основано на дереве YCC 2008 [17] и последующих опубликованных исследованиях.

Смотрите также

В Wikiquote есть цитаты, связанные с гаплогруппой E-M75 .

Генетика

Субклады Y-ДНК E

Основополагающее дерево Y-ДНК

Рекомендации

  1. ^ ab "E-M75 YTree".
  2. ^ abc Прендергаст, Мэри Э.; и другие. (июль 2019 г.). «Древняя ДНК показывает многоступенчатое распространение первых пастухов в Африке к югу от Сахары». Наука . 365 (6448). Бибкод : 2019Sci...365.6275P. doi : 10.1126/science.aaw6275. ПМК 6827346 . ПМИД  31147405. 
  3. ^ abc Прендергаст, Мэри Э.; и другие. (5 июля 2019 г.). «Дополнительные материалы для древней ДНК показывают многоступенчатое распространение первых пастухов в Африку к югу от Сахары». Наука . 365 (6448): eaaw6275. Бибкод : 2019Sci...365.6275P. doi : 10.1126/science.aaw6275. ПМК 6827346 . ПМИД  31147405. 
  4. ^ аб Флескес, Ракель Э.; и другие. (2023). «Проект древней ДНК, осуществляемый сообществом, раскрывает разнообразное происхождение африканских потомков 18-го века в Чарльстоне, Южная Каролина». Антропология . 120 (3): e2201620120. дои : 10.1073/pnas.2201620120. ПМЦ 9934026 . PMID  36623185. S2CID  255568252. 
  5. ^ abcdefghijklmnopqrstu vwxyz aa ab ac ad ae af ag ah ai aj ak Wood et al. (2005)
  6. ^ abcdefghijklmnop Cruciani et al. (2002)
  7. ^ abcdefghijklmnopqr Берниэль-Ли и др. (2009)
  8. ^ abcdefghijklmn Луис и др. (2004)
  9. ^ abcdefgh Underhill et al. (2000)
  10. ^ аб Мсаиди, Саид; и другие. (2011). «Генетическое разнообразие Коморских островов показывает, что раннее мореплавание стало основным фактором, определяющим биокультурную эволюцию человека в западной части Индийского океана» (PDF) . Европейский журнал генетики человека . 19 (1): 89–94. дои : 10.1038/ejhg.2010.128. ПМК 3039498 . ПМИД  20700146 . Проверено 19 ноября 2016 г. 
  11. ^ аб Стеффлова и др. (2009)
  12. ^ аб Херлс Мэтью Э.; Сайкс Брайан С.; Джоблинг Марк А.; Форстер Питер (май 2005 г.), «Двойное происхождение малагасийцев на островах Юго-Восточной Азии и Восточной Африки: данные по материнской и отцовской линии», Американский журнал генетики человека , 76 (894–901): 894–901, doi : 10.1086 /430051, PMC 1199379 , PMID  15793703 
  13. ^ аб Семино и др. (2004)
  14. ^ Публичное гаплодерево генеалогического древа ДНК, гаплогруппа E-M75
  15. ^ Платт, Д.Э., Артиниан, Х., Музайя, Ф. и др. Аутосомная генетика и гаплогруппа Y-хромосомы L1b-M317 показывают, что марониты Горного Ливана являются постоянно неэмигрирующей популяцией . Eur J Hum Genet 29 , 581–592 (2021). 10.1038/s41431-020-00765-х
  16. ^ Каденас и др. (2007)
  17. ^ Карафет и др. (2008)

Библиография

  1. Берниэль-Ли, Джемма; Калафель, Франческ; Босх, Елена; Привет, Эвелин; Сика, Лукас; Мугиама-Дауда, Патрик; ван дер Вин, Лольке; Омбер, Жан-Мари; и другие. (2009), «Генетические и демографические последствия экспансии банту: данные по отцовским линиям человека», Molecular Biology and Evolution , 26 (7): 1581–9, doi : 10.1093/molbev/msp069 , PMID  19369595
  2. Каденас, Алисия М; Животовский Лев А; Кавалли-Сфорца, Лука Л; Андерхилл, Питер А; Эррера, Рене Дж. (2007), «Разнообразие Y-хромосомы характеризует Оманский залив», European Journal of Human Genetics , 16 (3): 374–86, doi : 10.1038/sj.ejhg.5201934 , PMID  17928816
  3. Кручиани, Фульвио; Сантоламазца, Пьеро; Шен, Пейдун; Маколей, Винсент; Мораль, Педро; Олкерс, Антонель; Модиано, Дэвид; Холмс, Сьюзен; и другие. (2002), «Обратная миграция из Азии в страны Африки к югу от Сахары поддерживается анализом гаплотипов Y-хромосомы человека с высоким разрешением», Американский журнал генетики человека , 70 (5): 1197–214, doi : 10.1086/ 340257, PMC  447595 , PMID  11910562
  4. Херлс, Мэтью Э.; Сайкс, Брайан С.; Джоблинг, Марк А.; Форстер, Питер (2005), «Двойное происхождение малагасийцев на островах Юго-Восточной Азии и Восточной Африки: данные по материнской и отцовской линии», Американский журнал генетики человека , 76 (5): 894–901, doi : 10.1086/ 430051, PMC  1199379 , PMID  15793703
  5. Карафет Татьяна М.; Мендес, Фернандо Л.; Мейлерман, Моника Б.; Андерхилл, Питер А.; Зегура, Стивен Л.; Хаммер, Майкл Ф. (2008), «Новые бинарные полиморфизмы изменяют форму и увеличивают разрешение дерева гаплогруппы Y-хромосомы человека», Genome Research , 18 (5): 830–8, doi : 10.1101/gr.7172008, PMC  2336805 , PMID  18385274
  6. Луис, Дж; Роуолд, Д; Регейро, М; Каейро, Б; Чинниоглу, К; Роузман, К; Андерхилл, П; Каваллисфорса, Л; Эррера, Р. (2004), «Левант против Африканского Рога: доказательства двунаправленных коридоров миграции людей», Американский журнал генетики человека , 74 (3): 532–44, doi : 10.1086/382286, PMC  1182266 , ПМИД  14973781
  7. Семино, Орнелла; Магри, Кьяра; Бенуцци, Джорджия; Лин, Алиса А.; Аль-Захери, Надя; Батталья, Винченца; Макчиони, Лилиана; Триантафиллидис, Костас; и другие. (2004), «Происхождение, распространение и дифференциация гаплогрупп E и J Y-хромосомы: выводы о неолитизации Европы и более поздних миграционных событиях в Средиземноморье», Американский журнал генетики человека , 74 (5): 1023– 34, номер домена : 10.1086/386295, PMC  1181965 , PMID  15069642
  8. Стеффлова, Клара; Дулик, Мэтью С.; Пай, Атма А.; Уокер, Эми Х.; Зейглер-Джонсон, Чарнита М.; Гуйе, Серинь М.; Шурр, Теодор Г.; Реббек, Тимоти Р. (2009), Релетфорд, Джон (редактор), «Оценка группового генетического происхождения популяций из Филадельфии и Дакара в контексте примеси по признаку пола в Америке», PLOS ONE , 4 (11): e7842, Bibcode : 2009PLoSO...4.7842S, doi : 10.1371/journal.pone.0007842 , PMC  2776971 , PMID  19946364
  9. Андерхилл, Питер А.; Шен, Пейдун; Лин, Алиса А.; Джин, Ли; Пассарино, Джузеппе; Ян, Вэй Х.; Кауфман, Эрин; Бонне-Тамир, Батшева; и другие. (2000), «Вариации последовательности Y-хромосомы и история человеческих популяций», Nature Genetics , 26 (3): 358–61, doi : 10.1038/81685, PMID  11062480, S2CID  12893406
  10. Вуд, Элизабет Т; Стовер, Дарин А; Эрет, Кристофер; Дестро-Бисоль, Джованни; Спедини, Габриэлла; Маклеод, Ховард; Луи, Лесли; Бамшад, Майк; и другие. (2005), «Контрастные закономерности вариаций Y-хромосомы и мтДНК в Африке: доказательства демографических процессов, связанных с полом», European Journal of Human Genetics , 13 (7): 867–76, doi : 10.1038/sj.ejhg.5201408 , ПМИД  15856073

Источники таблиц преобразования

Внешние ссылки