stringtranslate.com

Гаплогруппа E-M75

Гаплогруппа E-M75 — гаплогруппа ДНК Y-хромосомы человека . Наряду с гаплогруппой E-P147 она является одной из двух основных ветвей более старой гаплогруппы E-M96 .

Древняя ДНК

В Африке

Кения

В Преттеджонс-Галли, округ Накуру, Кения , проживало два скотовода раннего периода скотоводства; один из них был носителем гаплогрупп E2 (xE2b)/E-M75 и K1a , а другой — носителем гаплогруппы L3f1b . [2] [3]

В курганах Илкек в округе Накуру, Кения , скотовод железного века был носителем гаплогрупп E2 (xE2b)/E-M75 и L0f2a . [2] [3]

На ферме Кисима/C4 в округе Лайкипия , Кения , скотовод пасторального железного века носил гаплогруппы E2 (xE2b)/E-M75 и L3h1a1 . [2] [3]

За пределами Африки

Соединенные Штаты Америки

На месте захоронения на Энсон-стрит в Чарльстоне , Южная Каролина , были найдены останки 18 афроамериканцев , чей возраст датируется XVIII веком н. э. [4] У Кузоу, имевшего западноафриканские и индейские корни, были гаплогруппы E2b1a-CTS2400 и A2 . [4]

Распределение

Сортированная таблица частот популяций E-M75+. Обратите внимание, что «?» указывает на то, что сублиния E-M75 либо не была проверена, либо не была указана в соответствующем исследовании.

Субклады

Э-М75*

Гаплогруппа E-M75(xM41,M54) была обнаружена у 6% (1/18) образца племени дама из Намибии [5] , 4% (1/26) образца племени ганда из Уганды [5] , 3% (1/39) образца племени мандинка из Гамбии/Сенегала [5] и 2% (1/49) образца племени шона из Зимбабве [5] .

Э-М41

Гаплогруппа E-M41 была обнаружена в основном в популяциях регионов Великих озер и Верхнего Нила в Центральной и Восточной Африке, включая 67% (6/9) выборки алур из Демократической Республики Конго [5] , 39% (7/18) выборки хема из Демократической Республики Конго [5], 17% (15/88) выборки из Эфиопии [9] , 8% (2/26) выборки ганда из Уганды [5] , 5% (2/40) выборки из Судана [9] , 4% (3/69) выборки хуту из Руанды [8] , 3% (1/29) выборки банту из Кении [8] и 2% (1/43) выборки иракв из Танзании. [8] E-M41 также был обнаружен в заметных количествах среди коммерческих тестировщиков ДНК с Аравийского полуострова и среди нескольких мужчин -ашкенази , [14] а также у мужчины из Ливана . [15]

Э-М54

Гаплогруппа E-M54 была обнаружена у 28% (22/80) представителей народа коса из Южной Африки [5] , 27% (10/37) представителей народа римаибе из Буркина-Фасо [6] , 22% (4/18) представителей народа даба из северного Камеруна [6] , 21% (6/29) представителей народа зулу из Южной Африки [5] , 15% (8/53) представителей некойсанских южноафриканцев [9], 14% (4/29) представителей банту из Кении [8] , 14% представителей коморских ширази [10], 11 % (1/9) представителей небольшой выборки носителей центральносуданских и сахарских языков из северного Камеруна [6], 9% (3/35) представителей малагасийского языка с Мадагаскара [12] , 8% (3/37) образца из Центральной Африки, [9] 7% (2/28) образца Мандара из северного Камеруна, [5] 6% (2/31) образца Нгумба из южного Камеруна, [5] 6% (4/64) образца !Кунг из Южной Африки, [6] 6% (1/18) образца Дама из Намибии, [5] 5% (5/100) образца Фон из Бенина, [8] 5% (1/22) образца Амбо из Намибии, [5] 4% (3/69) образца Хуту из Руанды, [8] 4% (4/94) образца Тутси из Руанды, [8] 4% (2/47) образца Мбути из ДРК, [5] 4% (1/26) образца Ганда из Уганды, [5] 4% (1/26) выборки кхве из Южной Африки, [6] 4% (1/28) выборки сото-тсвана из Южной Африки, [5] 3% (1/33) выборки бакола из южного Камеруна, [5] 3% (1/34) выборки волоф из Гамбии/Сенегала, [5] 3% (2/72) выборки из Катара, [16] 2% (1/42) выборки кикую и камба из Кении, [5] 2% (1/55) выборки догонов из Мали, [5] и приблизительно 2% выборки из 121 араба из Омана. [8]

Было высказано предположение, что гаплогруппа E-M85 Y-хромосомы распространились по Африке к югу от Сахары совсем недавно, основываясь на том факте, что микросателлитные гаплотипы Y-STR, связанные с этими хромосомами, показывают низкую степень дифференциации на протяжении всего их широкого географического ареала. Более того, средняя дисперсия аллелей STR хромосом E-M85 выше у центрально-западных африканцев, чем у южноафриканских койсанов, что привело исследователей к предположению, что E-M85 могла быть вовлечена в расширение ареала бантуязычных народов из центрально-западной Африки в сторону Южной Африки. [6] [7]

Э-М98*

E-M98(xM85) был обнаружен в 4% (2/49) образца Мосси из Буркина-Фасо. [6]

Э-М200

E-M200 был обнаружен у 25% (3/12) небольшой выборки Мбути из Демократической Республики Конго . [6] Согласно рисунку 4 Кручиани (2002), все три Бамбути, у которых обнаружена мутация M200, имеют идентичный микросателлитный гаплотип, основанный на семи STR-локусах, друг с другом и с некоторыми представителями племени койсанов (!Кунг и/или Кхве) E-M85(xM200) из Южной Африки. [6]

Филогенетика

Филогенетическая история

До 2002 года в академической литературе существовало по крайней мере семь систем наименований для филогенетического дерева Y-хромосомы. Это привело к значительной путанице. В 2002 году основные исследовательские группы объединились и сформировали Консорциум Y-хромосомы (YCC). Они опубликовали совместную статью, в которой было создано единое новое дерево, которое все согласились использовать. Позже группа гражданских ученых, интересующихся популяционной генетикой и генетической генеалогией, сформировала рабочую группу для создания любительского дерева, нацеленного, прежде всего, на своевременность. В таблице ниже собраны все эти работы в точке знакового дерева YCC 2002 года. Это позволяет исследователю, просматривающему более старую опубликованную литературу, быстро перемещаться между номенклатурами.

Научные публикации

В создании дерева YCC приняли участие следующие исследовательские группы в соответствии с их публикациями.

Филогенетические деревья

Это филогенетическое дерево субкладов гаплогрупп основано на дереве YCC 2008 [17] и последующих опубликованных исследованиях.

Смотрите также

В Викицитатнике есть цитаты, связанные с гаплогруппой E-M75 .

Генетика

Y-ДНК E субклады

Y-ДНК остовное дерево

Ссылки

  1. ^ ab "E-M75 YTree".
  2. ^ abc Prendergast, Mary E.; et al. (июль 2019 г.). «Древняя ДНК раскрывает многоэтапное распространение первых скотоводов в странах Африки к югу от Сахары». Science . 365 (6448). Bibcode :2019Sci...365.6275P. doi :10.1126/science.aaw6275. PMC 6827346 . PMID  31147405. 
  3. ^ abc Prendergast, Mary E.; et al. (5 июля 2019 г.). «Дополнительные материалы по древней ДНК раскрывают многоэтапное распространение первых скотоводов в странах Африки к югу от Сахары». Science . 365 (6448): eaaw6275. Bibcode :2019Sci...365.6275P. doi :10.1126/science.aaw6275. PMC 6827346 . PMID  31147405. 
  4. ^ ab Fleskes, Raquel E.; et al. (2023). «Проект по изучению древней ДНК с участием сообщества раскрывает разнообразное происхождение потомков африканцев XVIII века в Чарльстоне, Южная Каролина». Антропология . 120 (3): e2201620120. doi :10.1073/pnas.2201620120. PMC 9934026. PMID 36623185.  S2CID 255568252  . 
  5. ^ abcdefghijklmnopqrstu vwxyz aa ab ac ad ae af ag ah ai aj ak Wood et al. (2005)
  6. ^ abcdefghijklmnop Cruciani et al. (2002)
  7. ^ abcdefghijklmnopqr Берниелл-Ли и др. (2009)
  8. ^ abcdefghijklmn Луис и др. (2004)
  9. ^ abcdefgh Андерхилл и др. (2000)
  10. ^ ab Msaidie, Said; et al. (2011). «Генетическое разнообразие на Коморских островах показывает, что раннее мореплавание является основным фактором биокультурной эволюции человека в западной части Индийского океана» (PDF) . European Journal of Human Genetics . 19 (1): 89–94. doi :10.1038/ejhg.2010.128. PMC 3039498 . PMID  20700146. Архивировано из оригинала (PDF) 7 октября 2016 г. . Получено 19 ноября 2016 г. . 
  11. ^ ab Стеффлова и др. (2009)
  12. ^ ab Hurles Matthew E.; Sykes Bryan C.; Jobling Mark A.; Forster Peter (май 2005 г.), «Двойное происхождение малагасийцев на островах Юго-Восточной Азии и в Восточной Африке: доказательства по материнской и отцовской линиям», American Journal of Human Genetics , 76 (894–901): 894–901, doi : 10.1086/430051, PMC 1199379 , PMID  15793703 
  13. ^ ab Semino и др. (2004)
  14. ^ Публичное гаплодерево генеалогического древа ДНК, гаплогруппа E-M75
  15. ^ Platt, DE, Artinian, H., Mouzaya, F. et al. Аутосомная генетика и гаплогруппа Y-хромосомы L1b-M317 показывают, что марониты Горного Ливана являются устойчиво неэмигрирующей популяцией . Eur J Hum Genet 29 , 581–592 (2021). 10.1038/s41431-020-00765-x
  16. ^ Каденас и др. (2007)
  17. ^ Карафет и др. (2008)

Библиография

  1. Берниэль-Ли, Джемма; Калафель, Франческ; Босх, Елена; Привет, Эвелин; Сика, Лукас; Мугиама-Дауда, Патрик; ван дер Вин, Лольке; Омбер, Жан-Мари; и др. (2009), «Генетические и демографические последствия экспансии банту: данные по отцовским линиям человека», Molecular Biology and Evolution , 26 (7): 1581–9, doi : 10.1093/molbev/msp069 , PMID  19369595
  2. Каденас, Алисия М.; Животовский, Лев А.; Кавалли-Сфорца, Лука Л.; Андерхилл, Питер А.; Эррера, Рене Дж. (2007), «Разнообразие Y-хромосомы характеризует Оманский залив», Европейский журнал генетики человека , 16 (3): 374–86, doi : 10.1038/sj.ejhg.5201934 , PMID  17928816
  3. Cruciani, Fulvio; Santolamazza, Piero; Shen, Peidong; MacAulay, Vincent; Moral, Pedro; Olckers, Antonel; Modiano, David; Holmes, Susan; et al. (2002), «Обратная миграция из Азии в Африку к югу от Сахары подтверждается анализом высокого разрешения гаплотипов Y-хромосомы человека», The American Journal of Human Genetics , 70 (5): 1197–214, doi : 10.1086/340257, PMC  447595 , PMID  11910562
  4. Херлз, Мэтью Э.; Сайкс, Брайан К.; Джоблинг, Марк А.; Форстер, Питер (2005), «Двойное происхождение малагасийцев на островах Юго-Восточной Азии и в Восточной Африке: доказательства по материнской и отцовской линиям», Американский журнал генетики человека , 76 (5): 894–901, doi :10.1086/430051, PMC  1199379 , PMID  15793703
  5. Karafet, Tatiana M.; Mendez, Fernando L.; Meilerman, Monica B.; Underhill, Peter A.; Zegura, Stephen L.; Hammer, Michael F. (2008), «Новые бинарные полиморфизмы изменяют и повышают разрешение древа гаплогруппы Y-хромосомы человека», Genome Research , 18 (5): 830–8, doi :10.1101/gr.7172008, PMC  2336805 , PMID  18385274
  6. Luis, J; Rowold, D; Regueiro, M; Caeiro, B; Cinnioglu, C; Roseman, C; Underhill, P; Cavallisforza, L; Herrera, R (2004), «Левант против Африканского Рога: доказательства двунаправленных коридоров человеческих миграций», The American Journal of Human Genetics , 74 (3): 532–44, doi : 10.1086/382286, PMC  1182266 , PMID  14973781
  7. Semino, Ornella; Magri, Chiara; Benuzzi, Giorgia; Lin, Alice A.; Al-Zahery, Nadia; Battaglia, Vincenza; MacCioni, Liliana; Triantaphyllidis, Costas; et al. (2004), «Происхождение, диффузия и дифференциация гаплогрупп Y-хромосомы E и J: выводы о неолитизации Европы и более поздних миграционных событиях в районе Средиземноморья», The American Journal of Human Genetics , 74 (5): 1023–34, doi : 10.1086/386295, PMC  1181965 , PMID  15069642
  8. Stefflova, Klara; Dulik, Matthew C.; Pai, Athma A.; Walker, Amy H.; Zeigler-Johnson, Charnita M.; Gueye, Serigne M.; Schurr, Theodore G.; Rebbeck, Timothy R. (2009), Relethford, John (ред.), "Оценка группового генетического происхождения популяций из Филадельфии и Дакара в контексте полового смешения в Америке", PLOS ONE , 4 (11): e7842, Bibcode : 2009PLoSO...4.7842S, doi : 10.1371/journal.pone.0007842 , PMC  2776971 , PMID  19946364
  9. Андерхилл, Питер А.; Шен, Пейдун; Лин, Алиса А.; Джин, Ли; Пассарино, Джузеппе; Ян, Вэй Х.; Кауфман, Эрин; Бонне-Тамир, Батшева; и др. (2000), «Вариации последовательности Y-хромосомы и история человеческих популяций», Nature Genetics , 26 (3): 358–61, doi : 10.1038/81685, PMID  11062480, S2CID  12893406
  10. Вуд, Элизабет Т.; Стовер, Дэрин А.; Эрет, Кристофер; Дестро-Бисол, Джованни; Спедини, Габриэлла; Маклеод, Ховард; Луи, Лесли; Бамшад, Майк; и др. (2005), «Контрастные паттерны вариаций Y-хромосомы и мтДНК в Африке: доказательства демографических процессов, обусловленных полом», Европейский журнал генетики человека , 13 (7): 867–76, doi : 10.1038/sj.ejhg.5201408 , PMID  15856073

Источники таблиц преобразования

Внешние ссылки