Штамм бактерий
Escherichia coli O104:H4 — это энтероагрегативное заболевание Escherichia coli, штамм бактерии Escherichia coli , вызвавший вспышку Escherichia coli O104:H4 в 2011 году . [1] Буква «O» в серологической классификации обозначает липополисахаридный антиген клеточной стенки, а буква «H» обозначает антиген жгутиков.
Анализ геномных последовательностей , полученных BGI Shenzhen, показывает, что штамм вспышки O104:H4 представляет собой энтероагрегатный тип E. coli (EAEC или EAggEC), который приобрел гены токсина Шига , предположительно, путем горизонтального переноса генов . [2] [3] [4]
Анализ сборки генома и числа копий подтвердил, что две копии кластера генов профага шига-токсина stx2 являются отличительной характеристикой генома штамма вспышки O104:H4. [5] [6]
Штамм O104:H4 характеризуется следующими генетическими маркерами: [6] [7]
Интегрированный подход Европейской комиссии (ЕК) к безопасности пищевых продуктов [ 8 ] определяет случай диареи, вызванной кишечной палочкой , продуцирующей шига-подобный токсин (STEC), вызванной O104:H4, как острое начало диареи или кровавой диареи вместе с обнаружением шига-токсина 2 (Stx2) или гена шига stx2 . [9]
До вспышки 2011 года был зафиксирован только один случай, идентифицированный как O104:H4, у женщины в Южной Корее в 2005 году. [10]
Патофизиология
E. coli O104 — это кишечная палочка, продуцирующая шига- токсин (STEC). Токсины вызывают заболевание и связанные с ним симптомы, прилипая к клеткам кишечника и раздражая клетки вдоль стенки кишечника. [11] [12] Это, в свою очередь, может вызвать появление кровавого стула. Другим эффектом этой бактериальной инфекции является гемолитико-уремический синдром (ГУС), который представляет собой состояние, характеризующееся разрушением эритроцитов, что в течение длительного периода времени может привести к почечной недостаточности. [13] Некоторые распространенные симптомы ГУС — рвота, кровавый понос и кровь в моче. [12]
Инфекция
Распространенный способ заражения E. coli O104:H4 включает употребление в пищу загрязненной фекалиями пищи; таким образом, заболевание можно считать пищевым заболеванием . Совсем недавно, в 2011 году, вспышка штамма O104:H4 в Германии привела к гибели нескольких человек, сотни были госпитализированы. [14] [15] [12] Немецкие власти проследили инфекцию до ростков пажитника, выращенных из зараженных семян, импортированных из Египта, но эти результаты оспариваются. [ необходима цитата ]
Диагноз
Для диагностики инфекции STEC стул пациента (фекалии) можно проверить в лаборатории на наличие токсина Шига. Используемые методы тестирования включают прямое обнаружение токсина с помощью иммуноферментного анализа или обнаружение гена stx2 или других генов факторов вирулентности с помощью ПЦР . Если инфекция STEC подтверждена, штамм E. coli может быть серотипирован, чтобы определить, присутствует ли O104:H4. [11]
Уход
E. coli O104:H4 трудно поддается лечению, поскольку она устойчива ко многим антибиотикам, хотя и восприимчива к карбапенемам . [14]
Профилактика
Распространение кишечной палочки предотвращается простым мытьем рук с мылом, мытьем и гигиенической подготовкой пищи, а также правильным разогревом/приготовлением пищи, в результате чего бактерии уничтожаются. [16]
Ссылки
- ^ Меллман, Александр; Хармсен, Д.; Каммингс, К.А.; и др. (20 июля 2011 г.). «Проспективная геномная характеристика немецкой энтерогеморрагической вспышки Escherichia coli O104:H4 с помощью технологии быстрого секвенирования следующего поколения». PLoS One . 6 (7): e22751. Bibcode : 2011PLoSO...622751M. doi : 10.1371/journal.pone.0022751 . PMC 3140518. PMID 21799941 .
- ^ "BGI секвенирует геном смертельной E. coli в Германии и обнаруживает новый супертоксичный штамм". BGI . 2011-06-02. Архивировано из оригинала 2011-06-06 . Получено 2011-06-02 .
- ^ Дэвид Трайб (2011-06-02). "Новости о секвенировании BGI: немецкий штамм EHEC — это химера, созданная путем горизонтального переноса генов". Biology Fortified. Архивировано из оригинала 2012-05-27 . Получено 2011-06-02 .
- ^ Maev Kennedy и агентства (2011-06-02). "Вспышка кишечной палочки: ВОЗ заявляет, что бактерия — это новый штамм". Лондон: guardian.co.uk . Получено 2011-06-04 .
- ^ "BGI опубликовала полную карту генома E. coli O104 в Германии и отнесла штамм к категории энтероагрегационных Escherichia coli, продуцирующих шига-токсин (STpEAEC)". BGI . 2011-06-16 . Получено 2011-06-20 .
- ^ ab "Анализ числа копий штамма E. coli EHEC O104:H4, вызвавшего вспышку в Германии". Университет Иоганна Кеплера в Линце . 2011-06-11 . Получено 2011-06-15 .
- ^ "Характеристика EHEC O104:H4" (PDF) . Институт Роберта Коха . 2011-06-03. Архивировано из оригинала (PDF) 2012-03-25 . Получено 2011-06-15 .
- ^ «Комплексный подход ЕС к безопасности пищевых продуктов».
- ^ "Определение случая диареи и гемолитико-уремического синдрома, вызванного O104:H4" (PDF) . Европейская комиссия . 2011-06-03 . Получено 2011-06-16 .
- ^ Bae, WK; Lee, YK; Cho, MS; et al. (30 июня 2006 г.). «Случай гемолитического уремического синдрома, вызванного Escherichia coli O104:H4». Yonsei Medical Journal . 47 (3): 473–479. doi :10.3349/ymj.2006.47.3.437. PMC 2688167. PMID 16807997 .
- ^ ab Frank, C; Werber, D; Cramer, JP; et al. (26 октября 2011 г.). «Эпидемический профиль вспышки Escherichia coli O104:H4, продуцирующей шигатоксин, в Германии». New England Journal of Medicine . 365 (19): 1771–1780. doi : 10.1056/NEJMoa1106483 . PMID 21696328. S2CID 205093464.<http://www.nejm.org/doi/full/10.1056/NEJMoa1106483>
- ^ abc Рейнберг, Стивен. "Немецкий штамм E. Coli, особенно летальный - инфекционные заболевания: причины, типы, профилактика, лечение и факты на MedicineNet.com". Medicinenet.com. MedicineNet Inc, 22 июня 2011 г. Веб. 08 ноября 2011 г. <http://www.medicinenet.com/script/main/art.asp?articlekey=146119 Архивировано 18.01.2012 на Wayback Machine >.
- ^ Европейское агентство по безопасности пищевых продуктов. «Вспышки кишечной палочки, вызывающей шига-токсин (STEC) O104:H4 в 2011 году в Европе:». Журнал EFSA. Европейское агентство по безопасности пищевых продуктов, 3 ноября 2011 г. Веб-сайт. 8 ноября 2011 г. <http://www.efsa.europa.eu/en/efsajournal/pub/2390>.
- ^ ab Gorman, Christine. "E. Coli on the March: Scientific American". Научные новости, статьи и информация | Scientific American. Scientific American, 7 августа 2011 г. Веб-сайт. 8 ноября 2011 г. <http://www.scientificamerican.com/article.cfm?id=e-coli-on-the-march>.
- ^ "8 июля 2011 г.: Вспышка инфекций, вызванных кишечной палочкой E. Coli O104 (STEC O104:H4), продуцирующей шига-токсин, в связи с поездкой в Германию | E. Coli". Центры по контролю и профилактике заболеваний. Центр по контролю и профилактике заболеваний, 8 июля 2011 г. Веб-сайт. 8 ноября 2011 г. <https://www.cdc.gov/ecoli/2011/ecolio104/>.
- ^ "CDC - Escherichia coli O157:H7, Общая информация - NCZVED". Центры по контролю и профилактике заболеваний. Центры по контролю и профилактике заболеваний, 8 июля 2011 г. Веб. 08 ноября 2011 г.