Белкокодирующий ген у вида Homo sapiens
Коробка-вилка D3, также известная как FOXD3, представляет собой белок вилочной головки , который у людей кодируется геном FOXD3 . [5]
Функция
Этот ген принадлежит к семейству транскрипционных факторов белка forkhead , которое характеризуется ДНК-связывающим доменом forkhead . FoxD3 действует как репрессор транскрипции и содержит мотив C-концевой гомологии-1 (eh1), который обеспечивает поверхность взаимодействия с ко-репрессором транскрипции Grg4 (ген-4, родственный Граучо). [6]
Стволовые клетки
Многочисленные исследования предположили участие Foxd3 в переходе от наивных к примированным плюрипотентным стволовым клеткам в развитии эмбриона. Ранее было показано, что Foxd3 необходим для поддержания плюрипотентности эмбриональных стволовых клеток мыши . [7] Недавнее открытие дополнительно показало, что Foxd3 необходим в качестве репрессора при переходе от ESC к эпибластоподобным клеткам (EpiLC). [8] Исследование показало, что Foxd3 связан с инактивацией важных генов наивной плюрипотентности за счет модификации структур хроматина посредством рекрутирования деметилаз гистонов и уменьшения количества активирующих факторов. Другой предложенный механизм, с другой стороны, утверждает, что Foxd3 начинает удаление нуклеосом и индукцию в «праймированное» плюрипотентное состояние путем рекрутирования Brg1 , ремоделера нуклеосом, а затем действует как репрессор максимальной активации этих энхансеров, рекрутируя гистоновые деацетилазы , предполагая комплекс посредническая функция, при которой энхансеры готовятся к некоторому будущему контролируемому моменту времени, а не к немедленной экспрессии. [9] Хотя нет никакой двусмысленности в том, что Foxd3 играет важную роль, регулируя переход от наивного к праймированному состоянию плюрипотентности, две модели демонстрируют разные процессы. Попытки согласовать выводы двух исследований также показали, что Foxd3 функционирует как все вышеперечисленное. [10]
Клетки нервного гребня
FOXD3 играет важную роль в развитии и дифференцировке клеток нервного гребня. [11] В частности, считается, что FOXD3 играет важную роль в контроле переключения развития между предшественниками шванновских клеток и меланоцитами. [11]
Клиническое значение
Мутации в этом гене вызывают витилиго . [12]
Рекомендации
- ^ abc GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000187140 — Ensembl , май 2017 г.
- ^ abc GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000067261 — Ensembl , май 2017 г.
- ^ "Ссылка на Human PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ Громас Р., Мур Дж., Джонстон Т., Соча С., Клемш М. (июнь 1993 г.). «Гомологи дрозофилы вилкоголовки экспрессируются ограниченным по клону образом в гемопоэтических клетках человека». Кровь . 81 (11): 2854–2859. дои : 10.1182/blood.V81.11.2854.2854 . ПМИД 8499623.
- ^ Якличкин С., Штайнер А.Б., Лу К., Кесслер Д.С. (январь 2007 г.). «FoxD3 и Grg4 физически взаимодействуют, подавляя транскрипцию и индуцируя мезодерму у Xenopus». Журнал биологической химии . 282 (4): 2548–2557. дои : 10.1074/jbc.M607412200 . ПМК 1780074 . ПМИД 17138566.
- ^ Ханна Л.А., Бригадир Р.К., Тарасенко И.А., Кесслер Д.С., Лабоски П.А. (октябрь 2002 г.). «Потребность в Foxd3 для поддержания плюрипотентных клеток раннего эмбриона мыши». Гены и развитие . 16 (20): 2650–2661. дои : 10.1101/gad.1020502. ЧВК 187464 . ПМИД 12381664.
- ^ Респуэла П., Николич М., Тан М., Фроммолт П., Чжао Ю., Высоцка Дж., Рада-Иглесиас А. (январь 2016 г.). «Foxd3 способствует выходу из наивной плюрипотентности посредством вывода из эксплуатации энхансера и ингибирования спецификации зародышевой линии». Клеточная стволовая клетка . 18 (1): 118–133. дои :10.1016/j.stem.2015.09.010. ПМК 5048917 . ПМИД 26748758.
- ^ Кришнакумар Р., Чен А.Ф., Пантович М.Г., Даниал М., Парчем Р.Дж., Лабоски П.А., Блеллох Р. (январь 2016 г.). «FOXD3 регулирует потенциал плюрипотентных стволовых клеток, одновременно инициируя и подавляя активность энхансера». Клеточная стволовая клетка . 18 (1): 104–117. дои :10.1016/j.stem.2015.10.003. ПМЦ 4775235 . ПМИД 26748757.
- ^ Планк-Базине Дж.Л., Манделл Н.А. (2016). «Парадокс Foxd3: как он влияет на плюрипотентность и дифференцировку эмбриональных стволовых клеток?». Исследование стволовых клеток . 3 : 73. doi : 10.21037/sci.2016.09.20 . ПМК 5104585 . ПМИД 27868055.
- ^ аб Ницан Э., Пфальцграфф Э.Р., Лабоски П.А., Кальхайм С. (июль 2013 г.). «Меланоциты, происходящие из нервного гребня и предшественников шванновских клеток, представляют собой две пространственно разделенные популяции, аналогичным образом регулируемые Foxd3». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 110 (31): 12709–12714. Бибкод : 2013PNAS..11012709N. дои : 10.1073/pnas.1306287110 . ПМЦ 3732929 . ПМИД 23858437.
- ^ Алхатиб А., Fain PR, Spritz RA (август 2005 г.). «Вариант функционального промотора-кандидата в гене регулятора развития меланобластов FOXD3 при аутосомно-доминантном витилиго». Журнал исследовательской дерматологии . 125 (2): 388–391. дои : 10.1111/j.0022-202X.2005.23822.x . ПМИД 16098053.
дальнейшее чтение
- Го Ю, Коста Р., Рэмси Х., Старнс Т., Вэнс Г., Робертсон К. и др. (март 2002 г.). «Факторы транскрипции эмбриональных стволовых клеток Oct-4 и FoxD3 взаимодействуют, регулируя экспрессию энтодермально-специфического промотора». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 99 (6): 3663–3667. Бибкод : 2002PNAS...99.3663G. дои : 10.1073/pnas.062041099 . ПМК 122580 . ПМИД 11891324.
- Леви Д., Ларсон М.Г., Бенджамин Э.Дж., Ньютон-Че С., Ван Т.Дж., Хван С.Дж. и др. (сентябрь 2007 г.). «Проект Framingham Heart Study 100K: общегеномные связи между артериальным давлением и жесткостью артерий». BMC Медицинская генетика . 8 (Приложение 1): S3. дои : 10.1186/1471-2350-8-S1-S3 . ЧВК 1995621 . ПМИД 17903302.
- Салим Р.А., Банерджи-Басу С., Берри Ф.Б., Баксеванис А.Д., Уолтер М.А. (март 2001 г.). «Анализ влияния болезнетворных миссенс-мутаций на структуру и функцию белка крылатой спирали FOXC1». Американский журнал генетики человека . 68 (3): 627–641. дои : 10.1086/318792. ПМЦ 1274476 . ПМИД 11179011.
- Бюшер Дж.Л., Мартинес Л.Б., Сато С., Окуяма С., Икезу Т. (март 2009 г.). «YY1 и FoxD3 регулируют активацию антиретровирусного промотора белка цинковых пальцев OTK18, индуцированную инфекцией ВИЧ-1». Журнал нейроиммунной фармакологии . 4 (1): 103–115. doi : 10.1007/s11481-008-9139-x. ПМК 2680142 . ПМИД 19034670.