Гириста

Тип эукариотических организмов

Gyrista — это тип гетероконтовых протистов , содержащий три различные группы: преимущественно фотосинтезирующие Ochrophyta , паразитические псевдогрибы и недавно описанную группу нанофлагеллят, известную как Bigyromonada . ^[2] Члены этого типа характеризуются наличием спирали или системы двойной спирали/кольца в цилиарной переходной области . ^[1]

Систематика

Таксономическая история

Gyrista была впервые описана в 1998 году протистологом Томасом Кавалье-Смитом в его работе «Пересмотренная система жизни шести царств» , первоначально как супертип , содержащий два типа : Ochrophyta , гетероконтные водоросли ; и Бигира , содержащая тогда вместе с опалинами псевдогрибы и бигиромонады . ^[1] Позже название Bigyra было изменено и теперь включает в себя опалины, бикосоециды и лабиринтуломицеты , в то время как Ochrophyta, Pseudofungi и Bigyromonada остались как группы внутри Gyrista. ^[2]

Молекулярная филогенетика

В 2017 году Gyrista рассматривалась как сестринская группа типа Bigyra , в который входят Sagenista и Opalozoa . Вместе Gyrista и Bigyra образуют супертип Stramenopiles или Heterokonta . ^{[2] [4]}

Филогенетический анализ в 2022 году выявил монофилетическую сестру Bigyromonada Pseudofungi . «Бигира» парафилетична : ^[5]

Классификация

Пересмотренная таксономия Gyrista 2018 года выглядит следующим образом ^[2] с включением новых классов охрофитов , описанных в 2020 году ^[6] и 2021 году: ^[7]

• Подтип Bigyromonada Cavalier-Smith 1998 г.
  • Класс Developea Алеошин и др. бывший Кавальер-Смит 2017 [=Bigyromonadea Cavalier-Smith 1997 ]
  • Класс Пирсонеа Кавальер-Смит 2017 ^[2]
• Подтип Pseudofungi Cavalier-Smith 1986 [=Heterokontimycotina MW Dick 1976 ]
  • Класс Hyphochytrea Cavalier-Smith 1986 [=Hyphochytriomycota Whittaker 1969 ]
  • Класс Oomycetes Зима в Рабенхорсте, 1879 г. [=Oomycota Arx 1967 ; Пероноспоромицеты М.В. Дик 2001 ]
• Подтип Ochrophytina Cavalier-Smith 1995 [=Heterokontophyta van den Hoek et al. 1978 год ; Страменохромы Leipe et al. 1994 ]
  • Инфрафилум Хрисиста Кавальер-Смит 1991 г.
    • Суперкласс Limnistia Cavalier-Smith, исправление 1996 г. 2006 г.
      • Класс Eustigmatophyceae Hibberd & Leedale (1971).
      • Класс Chrysomonadea Saville-Kent 1881 стат. ноябрь Пашер 1910 г., исправление. Кавалер-Смит 2017 [=Chrysophyceae Pascher 1914 ]
      • Класс Picophagea Cavalier-Smith, 2006 г. , поправки. 2017 [= Synchromophyceae Horn et al. 2007 ]
    • Суперкласс Raphidoistia Cavalier-Smith 1986 орт. мут. 2006 г.
      • Класс Raphidomonadea Chadefaud ex Silva 1980 г.
        • Подкласс Raphidophycidae Кавалер-Смит 2013 г.
        • Подкласс Raphopoda Cavalier-Smith 2013 г.
    • Суперкласс Fucistia Cavalier-Smith 1995 г.
      • Класс Aurophyceae Кавалер-Смит 2013 г.
        • Подкласс Aurearenophycidae Kai Yoshii Nakayama & Inouye 2008 (как Aurearenophycidae) ^[8] stat. ноябрь Кавалер-Смит 2013 ^[9]
        • Подкласс Phaeothamniophycidae Andersen & Bailey 1998 (как Phaeothamniophyceae ) стат. ноябрь Кавалер-Смит 2006 г.
      • Класс Chrysomerophyceae Кавальер-Смит 1995 г.
      • Класс Chrysoparadoxophyceae Wetherbee et al. 2019 год
      • Класс Phaeosacciophyceae RAAndersen L.Graf и HSYoon 2020 ^[6]
      • Класс Schizocladiophyceae Генри Окуда и Каваи, 2003 г.
      • Класс Phaeophyceae Kjellman 1891 [=Fucophyceae Warming 1884 ; Melanophyceae Rabenhorst 1863 ]
        • Подкласс Discosporangiophycidae
        • Подкласс Ishigeophycidae Silberfeld F. Rousseau & Reviers 2014 ^[10]
        • Подкласс Dictyotophycidae Silberfeld F. Rousseau & Reviers 2014 ^[10]
        • Подкласс Fucophycidae Кавальер-Смит 1986 г.
      • Класс Xanthophyceae Allorge ex Fritsch 1935 [=Tribophyceae Hibberd 1981 ; ^[11] Гетероконты Лютер 1899 г. ]
  • Infraphylum Diatomista Derelle et al. бывший Кавалер-Смит 2017 г.
    • Суперкласс Hypogyrista Cavalier-Smith 1995 г., стат. ноябрь 2006 г.
      • Класс Dictyochophyceae Silva 1980 [=Dictyochia Haeckel 1894 ; Alophycidae Cavalier-Smith 2006 ]
        • Подкласс Pedinellia Cavalier-Smith, стат 1986 г. ноябрь 2017 [= Actinochrysophyceae Cavalier-Smith 1995 ; Аксолины]
        • Подкласс Pelagophycidae Andersen & Saunders 1993 (как Pelagophyceae ) ex Cavalier-Smith 2006
        • ?Подкласс Sulcophycidae Cavalier-Smith 2013 – ? Сулькохризис ^[а]
      • Класс Pinguiophyceae Kawachi et al. 2002 г.
    • Суперкласс Хакиста Кавальер-Смит 2000 стат. ноябрь 2017 год
      • Класс Bolidophyceae
      • Класс Diatomeae [=Bacillariophyceae]
        • Подкласс Corethrophycidae Round & Crawford 1990 г.
        • Подкласс Rhizosoleniophycidae Round & Crawford 1990 г.
        • Подкласс Eucentricophycidae Cavalier-Smith 2000
        • Подкласс Bacillariophycidae [=Pennatia Pennatia Schütt 1896 ; =Пеннатофициды]
  • Ochrophytina incertae sedis
    • Класс Olisthodiscophyceae Barcytė Eikrem & M. Eliáš 2021 ^[7]

Примечания

1. Кавальер-Смит предположил, что Sulcochrysis , возможно, связан с Olisthodiscus , и сгруппировал оба рода в этот подкласс. ^{[9] [2]} Однако исследование, проведенное в 2021 году, показало, что Olisthodiscales является частью нового класса Olisthodiscophyceae , который включает только род Olisthodiscus . Положение рода Sulcochrysis остается неопределенным из-за отсутствия последовательностей ДНК. ^[7]

Рекомендации

1. Кавальер-Смит Т (август 1998 г.). «Пересмотренная система жизни шести королевств». Biol Rev Camb Philos Soc . 73 (3): 203–266. doi :10.1111/j.1469-185X.1998.tb00030.x. ПМИД  9809012.
2. Кавальер-Смит, Томас (2017). «Королевство Chromista и его восемь типов: новый синтез, подчеркивающий нацеливание на перипластидные белки, эволюцию цитоскелета и перипластид, а также древние расхождения». Протоплазма . 255 (1): 297–357. дои : 10.1007/s00709-017-1147-3 . ПМЦ 5756292 . PMID  28875267. S2CID  254085270. 
3. Сина М. Адл; Дэвид Басс; Кристофер Э. Лейн; и другие. (1 января 2019 г.). «Пересмотр классификации, номенклатуры и разнообразия эукариот». Журнал эукариотической микробиологии . 66 (1): 4–119. дои : 10.1111/JEU.12691. ISSN  1066-5234. ПМК 6492006 . PMID  30257078. Викиданные  Q57086550. 
4. Дерелле Р., Лопес-Гарсиа П., Тимпано Х., Морейра Д. (ноябрь 2016 г.). «Филогеномная основа для изучения разнообразия и эволюции страменопилов (= гетероконтов)». Мол Биол Эвол . 33 (11): 2890–2898. дои : 10.1093/molbev/msw168 . ПМЦ 5482393 . ПМИД  27512113. 
5. Чо А, Тихоненков Д.В., Хехенбергер Э, Карнковска А, Мыльников А.П., Килинг П.Дж. (2022). «Монофилия разнообразных Bigyromonadea и их влияние на филогеномные отношения внутри страменопилей» (PDF) . Молекулярная филогенетика и эволюция . 171 (107468): 107468. doi :10.1016/j.ympev.2022.107468. ISSN  1055-7903. S2CID  247815732.
6. Graf L, Yang EC, Han KY, Küpper FC, Benes KM, Oyadomari JK, Herbert RJH, Verbruggen H, Wetherbee R, Andersen RA, Yoon HS (декабрь 2020 г.). «Мультигенная филогения, морфологические наблюдения и пересмотр литературы привели к описанию Phaeosacciophyceae Classis Nova и четырех новых видов Heterokontophyta SI Clade». Протист . 171 (6): 125781. doi : 10.1016/j.protis.2020.125781 . PMID  33278705. S2CID  227315556.
7. Довиле Барците; Венче Эйкрем; Анетт Энжесмо; Серхио Сеоане; Йенс Вольманн; Алеш Горак; Татьяна Юрченко; Марек Элиаш (2 марта 2021 г.). «Olisthodiscus представляет новый класс Ochrophyta». Журнал психологии . 57 (4): 1094–1118. дои : 10.1111/jpy.13155 . hdl : 10852/86515 . ПМИД  33655496.
8. Кай А., Ёшии Ю., Накаяма Т., Иноуе I (2008). «Aurearenophyceae classis nova, новый класс Heterokontophyta на основе новой морской одноклеточной водоросли Aurearena Crusata gen. et sp. nov., обитающей на песчаных пляжах». Протист . 159 (3): 435–457. doi :10.1016/j.protis.2007.12.003. ISSN  1434-4610. ПМИД  18358776.
9. Кавальер-Смит, Томас; Скобл, Жозефина Маргарет (2012). «Филогения Heterokonta: Incisomonas marina , одноресничный скользящий опалозой, родственный Solenicola (Nanomonadea), и свидетельство того, что Actinophryida произошла от рафидофитов». Европейский журнал протистологии . 49 (3): 328–353. дои : 10.1016/j.ejop.2012.09.002. ПМИД  23219323.
10. Зильберфельд Т., Руссо Ф., де Ревьер Б. (2014). «Обновленная классификация бурых водорослей (Ochrophyta, Phaeophyceae)». Криптогамия, Алгология . 35 (2): 117–156. doi : 10.7872/crya.v35.iss2.2014.117. S2CID  86227768.
11. Хибберд DJ (февраль 1981 г.). «Заметки по таксономии и номенклатуре классов водорослей Eustigmatophyceae и Tribophyceae (синоним Xanthophyceae)». Ботанический журнал Линнеевского общества . 82 (2): 93–119. doi :10.1111/j.1095-8339.1981.tb00954.x.