Род архей
В систематике Haloferax (распространенная аббревиатура: Hfx. ) — род галобактерий отряда Haloferacaceae . [2]
Генетический обмен
Клетки H. mediterranei и клетки родственного вида H. volcanii могут подвергаться процессу генетического обмена между двумя клетками, который включает слияние клеток, в результате чего образуется гетеродиплоидная клетка (содержащая две разные хромосомы в одной клетке). [3] Хотя этот генетический обмен обычно происходит между двумя клетками одного и того же вида, он также может происходить с более низкой частотой между клетками H. mediterranei и H. volcani . Эти два вида имеют среднюю идентичность нуклеотидных последовательностей 86,6%. [3] Во время этого процесса обмена формируется диплоидная клетка, содержащая полный генетический репертуар обеих родительских клеток, и облегчается генетическая рекомбинация. Впоследствии клетки разделяются, давая начало рекомбинантным клеткам.
Таксономия
По состоянию на 2022 год к роду Haloferax действительно опубликовано 13 видов . [1]
- Предлагаемые виды
Было предложено несколько видов и новые биномиальные названия, но они официально не опубликованы.
- « Haloferax antrum » Enache et al. 2006 , [4] « Haloferax opilio » Enache et al. 2006 , « Haloferax rutilus » Enache et al. 2006 и « Haloferax viridis » Enache et al. 2006 были выделены из румынских соленых озер и впервые предложены как новые виды в 2006 году. [5] С тех пор были достоверно опубликованы только H. prahovense , предложенные вдоль них.
- « Haloferax berberensis » Kharroub et al. 2005e был выделен в Алжире и предложен как новый вид в 2005 году. [6]
- Haloferaxlitoreum , Haloferax marinizediminis и Haloferax marinum были впервые опубликованы в 2021 году, но не приняты с 2022 года. [7]
- Haloferax marisrubri и Haloferax profundi были впервые опубликованы в 2020 году, но не приняты с 2022 года. [8]
- Haloferax Massilisiensis или Haloferax Massiliense был впервые опубликован в 2016 году, а затем снова в 2018 году как связанный с человеком галофильный архей. По состоянию на 2022 год этот вид не принят. [9]
Филогения
Принятая в настоящее время таксономия основана на Списке названий прокариот, имеющих номенклатуру (LPSN) [1] и Национальном центре биотехнологической информации (NCBI). [2]
Смотрите также
Рекомендации
- ^ abc JP Эзеби. «Галоферакс». Список названий прокариот, имеющих номенклатуру (LPSN) . Проверено 10 октября 2023 г.
- ^ аб Сэйерс; и другие. «Галоферакс». База данных таксономии Национального центра биотехнологической информации (NCBI) . Проверено 10 октября 2023 г.
- ^ Аб Наор А., Лапьер П., Меварех М., Папке РТ, Гофна У (август 2012 г.). «Низкие видовые барьеры у галофильных архей и образование рекомбинантных гибридов». Курс. Биол . 22 (15): 1444–8. дои : 10.1016/j.cub.2012.05.056 . ПМИД 22748314.
- ^ EBA - Европейский архив нуклеотидов , получено 14 июля 2022 г.
- ^ Браузер таксономии NCBI (Haloferax antrum) , получено 14 июля 2022 г.
- ^ Браузер таксономии NCBI (Haloferax berberensis) , получено 14 июля 2022 г.
- ^ "LPSN - Список названий прокариот, имеющих место в номенклатуре" . Deutsche Sammlung von Mikroorganismen und Zellkulturen . Проверено 14 июля 2022 г.
- ^ "LPSN - Список названий прокариот, имеющих место в номенклатуре" . Deutsche Sammlung von Mikroorganismen und Zellkulturen . Проверено 14 июля 2022 г.
- ^ "LPSN - Список названий прокариот, имеющих место в номенклатуре" . Deutsche Sammlung von Mikroorganismen und Zellkulturen . Проверено 14 июля 2022 г.
- ^ "ЛТП" . Проверено 10 мая 2023 г.
- ^ "Дерево LTP_all в формате Ньюика" . Проверено 10 мая 2023 г.
- ^ «Примечания к выпуску LTP_06_2022» (PDF) . Проверено 10 мая 2023 г.
- ^ "Выпуск GTDB 08-RS214" . База данных геномной таксономии . Проверено 10 мая 2023 г.
- ^ "ar53_r214.sp_label". База данных геномной таксономии . Проверено 10 мая 2023 г.
- ^ «История таксона». База данных геномной таксономии . Проверено 10 мая 2023 г.
дальнейшее чтение
- Орен А., Вентоза А. (2000). «Подкомитет Международного комитета по систематической бактериологии по таксономии Halobacteriaceae. Протоколы заседаний, 16 августа 1999 г., Сидней, Австралия». Межд. Дж. Сист. Эвол. Микробиол . 50 (3): 1405–1407. дои : 10.1099/00207713-50-3-1405 . ПМИД 10843089.
- Торребланка М., Родригес-Валера Ф., Хуэс Г., Вентоса А., Камекура М., Кейтс М. (1986). «Классификация неалкалифильных галобактерий на основе числовой систематики и состава полярных липидов, а также описание Haloarcula gen. nov. и Haloferax gen.nov». Сист. Прил. Микробиол . 8 (1–2): 89–99. дои : 10.1016/s0723-2020(86)80155-2.
- Гиббонс, штат Невада (1974). «Семейство V. Halobacteriaceae, сем. Ноябрь». В Р.Е. Бьюкенен; Н. Е. Гиббонс (ред.). Руководство Берджи по детерминативной бактериологии (8-е изд.). Балтимор: ISBN компании Williams & Wilkins Co. 0-683-01117-0.
Внешние ссылки
- Галоферакс в BacDive - базе метаданных по бактериальному разнообразию
- Браузер таксономии NCBI
