ХНИПУ

Белкокодирующий ген у вида Homo sapiens

Гетерогенный ядерный рибонуклеопротеин U — белок , который у человека кодируется геном HNRNPU . ^{[4] [5]}

Функция

Этот ген принадлежит к подсемейству повсеместно экспрессируемых гетерогенных ядерных рибонуклеопротеинов (hnRNP). hnRNP представляют собой РНК-связывающие белки, которые образуют комплексы с гетерогенной ядерной РНК (hnRNA). Эти белки связаны с пре-мРНК в ядре и, по-видимому, влияют на процессинг пре-мРНК и другие аспекты метаболизма и транспорта мРНК. Хотя все hnRNP присутствуют в ядре, некоторые, по-видимому, перемещаются между ядром и цитоплазмой. Белки hnRNP обладают отличными свойствами связывания нуклеиновых кислот. Белок, кодируемый этим геном, содержит РНК-связывающий домен и специфичный для каркасно-ассоциированной области (SAR) двудольный ДНК-связывающий домен. Считается также, что этот белок участвует в упаковке гнРНК в большие рибонуклеопротеиновые комплексы. Во время апоптоза этот белок расщепляется каспазозависимым способом. Расщепление происходит в сайте SALD, что приводит к потере ДНК-связывающей активности и сопутствующему отсоединению этого белка от структурных участков ядра. Но это расщепление не влияет на функцию кодируемого белка в метаболизме РНК. Для этого гена идентифицированы по крайней мере два альтернативно сплайсированных варианта транскрипта. ^[6]

Взаимодействия

Было показано, что ГНИПУ взаимодействует с:

• ЭП300 , ^[7]
• ГТФ2Ф1 , ^[8]
• Глюкокортикоидный рецептор , ^[9] и
• НДН . ^[10]

Рекомендации

1. GRCh38: выпуск Ensembl 89: ENSG00000153187 - Ensembl , май 2017 г.
2. "Ссылка на Human PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
3. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
4. Факельмайер Ф.О., Рихтер А. (март 1994 г.). «hnRNP-U/SAF-A кодируется двумя дифференциально полиаденилированными мРНК в клетках человека». Биохим Биофиз Акта . 1217 (2): 232–4. дои : 10.1016/0167-4781(94)90044-2. ПМИД  7509195.
5. Факельмайер Ф.О., Рихтер А. (сентябрь 1994 г.). «Очистка двух изоформ hnRNP-U и характеристика их активности связывания нуклеиновых кислот». Биохимия . 33 (34): 10416–22. дои : 10.1021/bi00200a024. ПМИД  8068679.
6. «Ген Энтрез: HNRNPU гетерогенный ядерный рибонуклеопротеин U (фактор прикрепления каркаса A)» .
7. Мартенс Дж. Х., Верлаан М., Калховен Э., Дорсман Дж. К., Зантема А. (апрель 2002 г.). «Элементы области прикрепления каркаса/матрицы взаимодействуют с комплексом фактора А прикрепления каркаса p300 и связываются ацетилированными нуклеосомами». Мол. Клетка. Биол . 22 (8): 2598–606. дои : 10.1128/mcb.22.8.2598-2606.2002. ПМЦ 133732 . ПМИД  11909954. 
8. Ким МК, Никодем ВМ (октябрь 1999 г.). «hnRNP U ингибирует фосфорилирование карбокси-концевого домена с помощью TFIIH и подавляет элонгацию РНК-полимеразы II». Мол. Клетка. Биол . 19 (10): 6833–44. дои : 10.1128/MCB.19.10.6833. ПМК 84680 . ПМИД  10490622. 
9. Эггерт М., Мишель Дж., Шнайдер С., Борнфлет Х., Баниахмад А., Факельмайер Ф.О., Шмидт С., Ренкавиц Р. (ноябрь 1997 г.). «Глюкокортикоидный рецептор связан с РНК-связывающим белком ядерного матрикса hnRNP U». Ж. Биол. Хим . 272 (45): 28471–8. дои : 10.1074/jbc.272.45.28471 . ПМИД  9353307.
10. Таниура Х, Ёсикава К (2002). «Некдин взаимодействует с рибонуклеопротеином hnRNP U в ядерном матриксе». Дж. Селл. Биохим . 84 (3): 545–55. дои : 10.1002/jcb.10047. PMID  11813259. S2CID  5988824.

дальнейшее чтение

• Киледжян М., Дрейфусс Г. (1992). «Первичная структура и связывающая активность белка hnRNP U: связывание РНК через RGG-бокс». ЭМБО Дж . 11 (7): 2655–64. doi :10.1002/j.1460-2075.1992.tb05331.x. ПМК  556741 . ПМИД  1628625.
• Барель М., Бальбо М., Гофр А., Фрад Р. (1995). «Сайты связывания вируса Эпштейна-Барра и рецептора C3d (CR2, CD21) для его трех внутриклеточных лигандов: антионкопротеина p53, кальцийсвязывающего белка p68 и ядерного рибонуклеопротеина p120». Мол. Иммунол . 32 (6): 389–97. дои : 10.1016/0161-5890(95)00005-Y. ПМИД  7753047.
• Сидоренко С.П., Лоу К.Л., Чандран К.А., Кларк Э.А. (1995). «Тирозинкиназа p72Syk селезенки человека ассоциируется с киназой p53/56Lyn семейства Src и фосфопротеином массой 120 кДа». Учеб. Натл. акад. наук. США . 92 (2): 359–63. Бибкод : 1995PNAS...92..359S. дои : 10.1073/pnas.92.2.359 . ПМК  42739 . ПМИД  7831290.
• Джордан П., Хайд Х., Кинзель В., Кюблер Д. (1995). «Основные белковые субстраты эктопротеинкиназы, расположенные на клеточной поверхности, являются гомологами известных ядерных белков». Биохимия . 33 (49): 14696–706. дои : 10.1021/bi00253a007. ПМИД  7993898.
• Лю Ц, Дрейфус Г (1996). «Новая ядерная структура, содержащая белок двигательных нейронов, обеспечивающий выживание». ЭМБО Дж . 15 (14): 3555–65. doi :10.1002/j.1460-2075.1996.tb00725.x. ПМК  451956 . ПМИД  8670859.
• Фудзиока Ю, Матодзаки Т, Ногучи Т, Ивамацу А, Ямао Т, Такахаши Н, Цуда М, Такада Т, Касуга М (1997). «Новый мембранный гликопротеин SHPS-1, который связывает SH2-доменсодержащую протеинтирозинфосфатазу SHP-2 в ответ на митогены и клеточную адгезию». Мол. Клетка. Биол . 16 (12): 6887–99. дои : 10.1128/MCB.16.12.6887. ПМК  231692 . ПМИД  8943344.
• Деннехи К.М., Брозайт Р., Гарнетт Д., Дюргейм Г.А., Спрюйт Л.Л., Бейерс А.Д. (1997). «Активация тимоцитов индуцирует ассоциацию фосфатидилинозитол-3-киназы и pp120 с CD5». Евро. Дж. Иммунол . 27 (3): 679–86. дои : 10.1002/eji.1830270316. PMID  9079809. S2CID  41540340.
• Малик К.Ф., Джаффе Х., Брэди Дж., Янг У.С. (1997). «Фактор POU класса III Brn-4 взаимодействует с другими факторами POU класса III и гетерогенным ядерным рибонуклеопротеином U». Мозговой Рес. Мол. Мозговой Рес . 45 (1): 99–107. дои : 10.1016/S0169-328X(96)00238-0. ПМИД  9105675.
• Эггерт М., Мишель Дж., Шнайдер С., Борнфлет Х., Баниахмад А., Факельмайер Ф.О., Шмидт С., Ренкавиц Р. (1997). «Глюкокортикоидный рецептор связан с РНК-связывающим белком ядерного матрикса hnRNP U». Ж. Биол. Хим . 272 (45): 28471–8. дои : 10.1074/jbc.272.45.28471 . ПМИД  9353307.
• Геринг Ф., Шваб Б.Л., Никотера П., Лейст М., Факельмайер Ф.О. (1998). «Новый SAR-связывающий домен фактора прикрепления каркаса A (SAF-A) является мишенью апоптотического ядерного распада». ЭМБО Дж . 16 (24): 7361–71. дои : 10.1093/emboj/16.24.7361. ПМК  1170336 . ПМИД  9405365.
• Хам Б., Чо ОХ, Ким Дж.Э., Ким Й.К., Ким Дж.Х., О Й.Л., Чан СК (1998). «Белок, связывающий полипиримидиновый тракт, взаимодействует с HnRNP L». ФЭБС Летт . 425 (3): 401–6. Бибкод : 1998FEBSL.425..401H. дои : 10.1016/S0014-5793(98)00269-5 . ПМИД  9563502.
• Мацуи М., Бро В.К., Ивасаки С., Хагивара С., Тамаи Ю., Мори С., Блум М.Л., Джерри М.Б., Эдди Э.М., Такето М.М. (1999). «Сайт интеграции ретровируса Mintb, кодирующий мышиный гомолог hnRNP U.». Дж. Биохим . 125 (6): 1104–14. doi : 10.1093/oxfordjournals.jbchem.a022392. ПМИД  10348913.
• Ким МК, Никодем ВМ (2000). «hnRNP U ингибирует фосфорилирование карбокси-концевого домена с помощью TFIIH и подавляет элонгацию РНК-полимеразы II». Мол. Клетка. Биол . 19 (10): 6833–44. дои : 10.1128/MCB.19.10.6833. ПМК  84680 . ПМИД  10490622.
• Кипп М., Шваб Б.Л., Пшибильски М., Никотера П., Факельмайер Ф.О. (2000). «Апоптотическое расщепление фактора прикрепления каркаса A (SAF-A) каспазой-3 происходит в неканоническом сайте расщепления». Ж. Биол. Хим . 275 (7): 5031–6. дои : 10.1074/jbc.275.7.5031 . ПМИД  10671544.
• Хуси Х., Уорд М.А., Чоудхари Дж.С., Блэксток В.П., Грант С.Г. (2000). «Протеомный анализ сигнальных комплексов рецептор NMDA-адгезивный белок». Нат. Нейроски . 3 (7): 661–9. дои : 10.1038/76615. hdl : 1842/742 . PMID  10862698. S2CID  14392630.
• Таниура Х, Ёсикава К (2002). «Некдин взаимодействует с рибонуклеопротеином hnRNP U в ядерном матриксе». Дж. Селл. Биохим . 84 (3): 545–55. дои : 10.1002/jcb.10047. PMID  11813259. S2CID  5988824.
• Ли Дж., Бедфорд, М.Т. (2002). «PABP1 идентифицирован как субстрат аргининметилтрансферазы с использованием белковых массивов высокой плотности». Представитель ЭМБО . 3 (3): 268–73. doi : 10.1093/embo-reports/kvf052. ПМК  1084016 . ПМИД  11850402.
• Дэвис М., Хацубай А., Андерсен Дж.С., Бен-Шушан Э., Фишер Г.З., Ярон А., Баускин А., Меркурио Ф., Манн М., Бен-Нерия Ю. (2002). «Псевдосубстратная регуляция убиквитинлигазы SCF (бета-TrCP) с помощью hnRNP-U». Генс Дев . 16 (4): 439–51. дои : 10.1101/gad.218702. ПМЦ  155337 . ПМИД  11850407.