stringtranslate.com

Гаплогруппа HV

Гаплогруппа HV — гаплогруппа митохондриальной ДНК (мтДНК) человека.

Источник

Гаплогруппа HV происходит от гаплогруппы R0 , которая в свою очередь происходит от гаплогруппы R. HV также является предковой кладой гаплогрупп H и V. Возможным местом происхождения гаплогруппы HV является регион Западного Ирана, Месопотамии и Южного Кавказа, где была обнаружена самая высокая распространенность HV. [4]

Распределение

Гаплогруппа HV встречается в основном в Западной Азии , Центральной Азии , Южной Европе , Восточной Европе и Северной Африке .

В Африке пик клада приходится на египтян, населяющих оазис Эль-Хайез (14,3%). [5] Субклад HV0 встречается среди мозабитских берберов (8,24%), [6] ливийцев (7,4%), [7] регибате- сахрави (6,48%), [6] берберов зената (5,48%), [6] и алжирцев (4,84% всего; 2,15% -3,75% в Оране ). [6]

В исследовании, опубликованном в 2013 году, гаплогруппа HV(xHV0, H) была обнаружена у большого процента населения в Афганистане : 11,0% (14/127) узбеков (включая 1/127 HV2 и 1/127 HV6), 8,2% (12/146) таджиков (включая 3/146 HV6 и 1/146 HV2), 8,0% (6/75) туркменов (включая 1/75 HV2), 6,4% (5/78) хазарейцев и 5,6% (5/90) пуштунов . [8] Кроме того, гаплогруппа HV0 была обнаружена у 1,4% (2/146) выборки афганских таджиков, но неясно, принадлежат ли они к субкладу гаплогруппы V. [8] Субклад HV1a1a был обнаружен у 1,8% (3/169) якутов в одном исследовании [9] и у 1,2% (5/423) якутов в другом исследовании [10] , опубликованном в 2013 году.

В 2003 году было опубликовано исследование, в котором сообщалось о секвенировании мтДНК костей двух 24 000-летних анатомически современных людей кроманьонского типа из южной Италии . Исследование показало, что один из них имел либо гаплогруппу HV, либо R0. [11] Гаплогруппа HV также была обнаружена среди древнеегипетских мумий, раскопанных на археологическом объекте Абусир-эль-Мелек в Среднем Египте, которые датируются доптолемеевским/поздним периодом Нового царства , птолемеевским и римским периодами. [12]

Гаплогруппа HV была обнаружена в различных окаменелостях, которые были проанализированы на наличие древней ДНК, включая образцы, связанные с культурами линейной керамики Альфёльда (HV, Мезёкёвешд-Мочольяс, 1/3 или 33%), линейно-ленточной керамики (HV0a, Файс-Гарадомб, 1/2 или 50%) и немецкой культуры среднего неолита (HV, Кведлинбург, 1/2 или 50%). [13]

Субклады

Дерево

Это филогенетическое дерево субкладов гаплогруппы HV основано на статье ван Овена (2009) [3] и Малярчука и др. (2008) [14] .

HV0 и HVSI C16298T

Определение мутации C/T в положении 16298 в сегменте I, один из гипервариабельных сегментов обозначен как HV0 по состоянию на 2012 год. Процент людей, у которых был получен положительный результат на вышеуказанную мутацию в исследовании западноевропейских популяций в 2002 году, приведен ниже. [17]

В исследовании, проведенном среди населения России и Польши, процент людей, у которых результаты теста на эту мутацию оказались положительными, составил пять процентов для обеих популяций. [18]

Исследование иракцев обобщило ряд предыдущих исследований, показывающих низкий уровень этой мутации среди населения Ближнего Востока и Италии. [19]

Эта мутация была обнаружена в древней ДНК , полученной из одних из девятнадцати человеческих останков, раскопанных на острове Готланд, Швеция, датируемых 2800–2000 гг. до н. э. и археологически классифицированных как принадлежащие к культуре ямочной керамики . [20]

Популярная культура

Смотрите также

На Викискладе есть медиафайлы по теме Гаплогруппа HV (мтДНК) .

Ссылки

  1. ^ Малярчук и др. (2008): «Основными компонентами среднего верхнего палеолита (26 000 YBP) были HV*, U1, возможно, U2 и U4, а основным компонентом раннего верхнего палеолита (45 000 YBP) была в основном гаплогруппа U5»
  2. ^ Малярчук и др. (2008): «Было высказано предположение, что большинство гаплогрупп HV, в настоящее время обнаруженных в Европе, возникли в регионе Ближнего Востока и Кавказа (Richards et al. 2000; Tambets et al. 2000), но все еще остается много вопросов относительно классификации гаплогрупп, принадлежащих к семейству HV».
  3. ^ ab Ван Овен, Маннис; Кайзер, Манфред (2009). «Обновленное всеобъемлющее филогенетическое дерево глобальной вариации митохондриальной ДНК человека». Человеческая мутация . 30 (2): E386–94. doi : 10.1002/humu.20921 . PMID  18853457. S2CID  27566749.
  4. ^ Шамун-Пур, Мишель; Ли, Миан; Мерриуэзер, Д. Эндрю (14 октября 2019 г.). «Редкие человеческие митохондриальные линии HV распространились с Ближнего Востока и Кавказа во время пост-LGM и неолитических экспансий». Scientific Reports . 9 (1). doi :10.1038/s41598-019-48596-1. eISSN  2045-2322. PMC 6791841 . PMID  31611588. 
  5. ^ Мартина Куянова; Луиза Перейра; Вероника Фернандес; Джоана Б. Перейра; Виктор Черны (2009). «Ближневосточный неолитический генетический вклад в небольшой оазис египетской Западной пустыни». Американский журнал физической антропологии . 140 (2): 336–346. doi :10.1002/ajpa.21078. PMID  19425100.
  6. ^ abcd Асмахан Бекада; Лара Р. Арауна; Тария Деба; Франсеск Калафель; Сорайя Бенхамамух; Дэвид Комас (24 сентября 2015 г.). «Генетическая гетерогенность в алжирских популяциях человека». PLOS ONE . 10 (9): e0138453. Bibcode : 2015PLoSO..1038453B. doi : 10.1371 /journal.pone.0138453 . PMC 4581715. PMID  26402429. ; Таблица S5
  7. ^ Карима Фадхлауи-Зид; Лаура Родригес-Ботиге; Неджиб Науи; Амель Бенаммар-Эльгаайед; Франческ Калафель; Дэвид Комас (май 2011 г.). «Структура митохондриальной ДНК в Северной Африке обнаруживает генетическую неоднородность в долине Нила» (PDF) . Американский журнал физической антропологии . 145 (1): 107–117. дои : 10.1002/ajpa.21472. hdl : 10261/42802 . ПМИД  21312180 . Проверено 20 апреля 2016 г.
  8. ^ аб Ди Кристофаро Дж., Пеннарун Э., Мазьер С., Майрес Н.М., Лин А.А. и др. (2013), «Афганский Гиндукуш: где сходятся потоки генов на Евразийском субконтиненте». PLoS ONE 8(10): e76748. doi:10.1371/journal.pone.0076748
  9. ^ Дагган AT, Уиттен M, Вибе V, Кроуфорд M, Баттхоф A и др. (2013), «Исследование предыстории тунгусских народов Сибири и Амуро-Уссурийского региона с использованием полных последовательностей генома мтДНК и маркеров Y-хромосомы». PLoS ONE 8(12): e83570. doi:10.1371/journal.pone.0083570
  10. ^ Сардана А. Федорова, Маэре Рейдла, Эне Метспалу и др. , «Аутосомные и однородительские портреты коренных популяций Саха (Якутия): последствия для заселения Северо-Восточной Евразии». BMC Evolutionary Biology 2013, 13:127. http://www.biomedcentral.com/1471-2148/13/127
  11. ^ Caramelli, D; Lalueza-Fox, C; Vernesi, C; Lari, M; Casoli, A; Mallegni, F; Chiarelli, B; Dupanloup, I; et al. (2003). «Доказательства генетического разрыва между неандертальцами и 24 000-летними анатомически современными европейцами». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 100 (11): 6593–7. Bibcode : 2003PNAS..100.6593C. doi : 10.1073/pnas.1130343100 . PMC 164492. PMID  12743370 . 
  12. ^ Schuenemann, Verena J.; et al. (2017). «Геномы древних египетских мумий предполагают увеличение африканского происхождения к югу от Сахары в постримский период». Nature Communications . 8 : 15694. Bibcode :2017NatCo...815694S. doi :10.1038/ncomms15694. PMC 5459999 . PMID  28556824. 
  13. ^ Марк Липсон и др. (2017). «Параллельные палеогеномные трансекты раскрывают сложную генетическую историю ранних европейских фермеров». Nature . 551 (7680): 368–372. Bibcode :2017Natur.551..368L. doi :10.1038/nature24476. PMC 5973800 . PMID  29144465 . Получено 15 ноября 2017 г. . 
  14. ^ Malyarchuk, B.; Grzybowski, T.; Derenko, M.; Perkova, M.; Vanecek, T.; Lazur, J.; Gomolcak, P.; Tsybovsky, I. (2008). "Филогения митохондриальной ДНК у восточных и западных славян". Молекулярная биология и эволюция . 25 (8): 1651–8. doi : 10.1093/molbev/msn114 . PMID  18477584.
  15. ^ Гаплогруппа HV Сайт митохондриальной ДНК Яна Логана 2009
  16. ^ Малярчук и др. (2008): «Возраст коалесценции всего HV3, определенный переходом в np 16311, составляет 12 700 ± 1 960 YBP. Однако следует отметить, что HV3 может быть полифилетическим из-за гипервариабельности np 16311. Между тем, подкластеры HV3a и HV3b, вероятно, являются монофилетическими, и их оценки возраста составили 8 200 ± 2 900 и 15 420 ± 4 500 YBP соответственно. Однако HV3b характеризуется высоким соотношением несинонимичных и синонимичных замен, поэтому его возраст коалесценции можно оценить как 11 837 ± 4 460 YBP, используя скорость, предложенную Кивисилдом и др. (2006) (таблица 2). То же самое, вероятно, справедливо и для оценки возраста гаплогруппы HV4».
  17. ^ Гонсалес, AM; Брем, A; Перес, JA; Мака-Мейер, N; Флорес, C; Кабрера, VM (2003). «Сродство митохондриальной ДНК на атлантическом побережье Европы». Американский журнал физической антропологии . 120 (4): 391–404. doi :10.1002/ajpa.10168. PMID  12627534.
  18. ^ Malyarchuk, BA; Grzybowski, T; Derenko, MV; Czarny, J; Woźniak, M; Miścicka-Sliwka, D (2002). "Изменчивость митохондриальной ДНК у поляков и русских". Annals of Human Genetics . 66 (Pt 4): 261–83. doi :10.1046/j.1469-1809.2002.00116.x. PMID  12418968. S2CID  221424344.
  19. ^ Аль-Захери, Н.; Семино, О.; Бенуцци, Г.; Магри, К.; Пассарино, Г.; Торрони, А.; Сантакьяра-Бенересетти, А.С. (2003). «Полиморфизмы Y-хромосомы и мтДНК в Ираке, перекресток раннего расселения людей и постнеолитических миграций». Молекулярная филогенетика и эволюция . 28 (3): 458–72. doi :10.1016/S1055-7903(03)00039-3. PMID  12927131.
  20. ^ Мальмстрём, Хелена; Гилберт, М. Томас П.; Томас, Марк Г.; Брандстрём, Микаэль; Стора, Ян; Молнар, Петра; Андерсен, Пернилле К.; Бендиксен, Кристиан; и др. (2009). «Древняя ДНК обнаруживает отсутствие преемственности между неолитическими охотниками-собирателями и современными скандинавами». Current Biology . 19 (20): 1758–62. doi : 10.1016/j.cub.2009.09.017 . PMID  19781941. S2CID  9487217.
  21. ^ Надин Эпштейн (сентябрь–октябрь 2012 г.). «The Moment Magazine Great DNA Experiment». Moment Magazine . стр. 45 . Получено 24.02.2024 .
  22. ^ Надин Эпштейн (сентябрь–октябрь 2012 г.). «The Moment Magazine Great DNA Experiment». Moment Magazine . стр. 42 . Получено 24.02.2024 .

Внешние ссылки