stringtranslate.com

Галофераковые

Haloferacaceae — семейство галофильных , хемоорганотрофных или гетеротрофных архей в составе порядка Haloferacales . [1] [2] [3] Типовой род этого семейства — Haloferax . [4] Его биохимические характеристики такие же, как у порядка Haloferacales .

Название Haloferacaceae происходит от латинского термина Haloferax, относящегося к типовому роду семейства, и суффикса "-ceae", окончания, используемого для обозначения семейства. Вместе Haloferacaceae относится к семейству, номенклатурным типом которого является род Haloferax .

Таксономия и молекулярные сигнатуры

По состоянию на 2021 год Haloferacaceae содержит 10 валидно опубликованных родов. [4] Это семейство можно молекулярно отличить от других Halobacteria по наличию пяти консервативных сигнатурных белков (CSP) и четырех консервативных сигнатурных инделей (CSI), присутствующих в следующих белках: термосома , рибонуклеаза BN и гипотетические белки. [1]

Филогения

Принятая в настоящее время таксономия основана на Списке названий прокариот, имеющих постоянное место в номенклатуре (LPSN) [5] и Национальном центре биотехнологической информации (NCBI). [6]

Смотрите также

Ссылки

  1. ^ аб Гупта, Рэдхи С.; Наушад, Сохаил; Бейкер, Шеридан (01 марта 2015 г.). «Филогеномный анализ и молекулярные характеристики класса Halobacteria и двух его основных клад: предложение о разделении класса Halobacteria на исправленный порядок Halobacteriales и два новых порядка, Haloferacales ord. nov. и Natrialbales ord. nov., содержащие новые семейства. Семейство Haloferacaceae nov. и Natrialbaceae nov. Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 65 (Ч_3): 1050–1069. дои : 10.1099/ijs.0.070136-0 . ISSN  1466-5026. ПМИД  25428416.
  2. ^ Грант, Уильям Д.; Камекура, Масахиро; МакДженити, Терри Дж.; Вентоза, Антонио (14 сентября 2015 г.). «Класс галобактерий. ноябрь». Руководство Берджи по систематике архей и бактерий : 1. doi : 10.1002/9781118960608.cbm00026. ISBN 9781118960608.
  3. ^ Орен, Аарон (2012-02-01). «Таксономия семейства Halobacteriaceae: парадигма для изменения концепций в систематике прокариот». Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 62 (2): 263–271. doi : 10.1099/ijs.0.038653-0 . ISSN  1466-5026. PMID  22155757.
  4. ^ ab "Семейство: Haloferacaceae". lpsn.dsmz.de . Получено 2021-06-27 .
  5. ^ JP Euzéby. "Haloferacaceae". Список названий прокариот, имеющих место в номенклатуре (LPSN) . Получено 17 ноября 2021 г.
  6. ^ Sayers; et al. "Haloferacaceae". База данных таксономии Национального центра биотехнологической информации (NCBI) . Получено 2022-06-05 .
  7. ^ "The LTP" . Получено 20 ноября 2023 г. .
  8. ^ "Дерево LTP_all в формате newick" . Получено 20 ноября 2023 г.
  9. ^ "LTP_08_2023 Release Notes" (PDF) . Получено 20 ноября 2023 г.
  10. ^ "GTDB release 07-RS207". База данных таксономии генома . Получено 20 июня 2022 г.
  11. ^ "ar53_r207.sp_labels". База данных таксономии генома . Получено 20 июня 2022 г.
  12. ^ "История таксона". База данных таксономии генома . Получено 20 июня 2022 г.