Гаплогруппа L5

Human mitochondrial DNA grouping indicating common ancestry

Гаплогруппа L5 — это клад митохондриальной ДНК (мтДНК) человека. Ранее была известна как L1e .

Распределение

L5 — небольшая гаплогруппа, сосредоточенная в Восточной Африке . Самая высокая частота у пигмеев Мбути из Восточной Центральной Африки — 15%. ^[3] Она присутствует в относительно небольших количествах в Танзании ( Сандаве и других), Кении, Чаде, Эфиопии, Судане, Нубии, Египте ^{[4] [Примечание 1]} и Саудовской Аравии. ^[5]

Гаплогруппа L5 была обнаружена среди образцов на островном кладбище в Кулубнарти , Судан , которые датируются ранним христианским периодом (550–800 гг. н.э.) ^{[6] .}

Субклады

Дерево

Это филогенетическое дерево субкладов гаплогруппы L5 основано на статье Манниса ван Овена и Манфреда Кайзера « Обновленное всеобъемлющее филогенетическое дерево глобальной вариации митохондриальной ДНК человека» ^[2] и последующих опубликованных исследованиях.

• Самый поздний общий предок (MRCA)
  • Л1-6
    • Л2-6
      • Л5
        • Л5а
          • Л5а1
            • Л5а1а
            • Л5а1б
            • L5a1c
          • Л5а2
        • Л5с
          • Л5с1
          • Л5с2

Ссылки

1. Соарес, П.; Эрмини, Л.; Томсон, Н.; Мормина, М.; Рито, Т.; Рёль, А.; Салас, А.; Оппенгеймер, С.; Маколей, В. (2009). «Коррекция очищающего отбора: улучшенные молекулярные часы митохондрий человека». Американский журнал генетики человека . 84 (6): 740–59. doi :10.1016/j.ajhg.2009.05.001. PMC  2694979. PMID  19500773 .
2. van Oven, Mannis; Manfred Kayser (13 октября 2008 г.). «Обновленное комплексное филогенетическое дерево глобальной вариации митохондриальной ДНК человека». Human Mutation . 30 (2): E386–E394. doi : 10.1002/humu.20921 . PMID  18853457. S2CID  27566749.
3. Сара А. Тишкофф и др. 2007, История населения Африки, говорящего на щелчковом языке, выведенная из мтДНК и генетической изменчивости хромосомы Y. Молекулярная биология и эволюция 2007 24(10):2180-2195
4. Стеванович, А; А. Жиль; Э. Бузаид; Р. Кефи; Ф. Пэрис; Р.П. Гайро; Дж. Л. Спадони; Ф. Эль-Ченави; Э. Беро-Коломб (29 января 2004 г.). «Разнообразие последовательностей митохондриальной ДНК у малоподвижного населения Египта». Анналы генетики человека . 68 (1): 23–39. дои : 10.1046/j.1529-8817.2003.00057.x. PMID  14748828. S2CID  44901197.
5. Абу-Амеро и др. 2008 Февраль. «Структура митохондриальной ДНК на Аравийском полуострове», BMC Evolutionary Biology. 8(45): 52.
6. Сирак, Кендра; Френандес, Даниэль; Новак, Марио; Ван Гервен, Деннис; Пинхаси, Рон (2016). «Книга тезисов Межконгресса IUAES 2016 г. — Разделенное сообщество? Выявление генома(ов) сообщества средневековых кулубнарти с использованием секвенирования следующего поколения». Книга тезисов Межконгресса IUAES 2016 г. IUAES: 115.

Примечания

1. Образец UPE52 относится к субкладу L5a.

Внешние ссылки

• Общий
  • Филодерево Манниса ван Овена
• Гаплогруппа L5
  • Гаплогруппа L5 Яна Логана
  • Гаплогруппа L5 YFull MTree
  • Гаплогруппа L5 MITOMAP